Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique
De Wicri Santé
Révision datée du 6 juillet 2020 à 11:23 par imported>Jacques Ducloy (→Dernière version)
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Espace dédié à un travail pédagogique
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Ce serveur sert également à mettre au point une formule simple pour la production de serveurs d'exploration spécialisés.
Cette formule utilise la commande DILIB NlmPubMedExplorCorpus qui cause une erreur dans le version actullement diffusée. |
Sommaire
Critère de sélection
Pour construire un corpus sur les faits épidémiologiques sur la grippe en Belgique, le critère utilisé est le suivant :
(influenza) AND (belgium[MeSH Terms])
Exploration
Ces serveurs donnent accès à 130 références.
Premières versions
Les 2 versions portent sur le même corpus
La version 2 contient plus d'index.
Dernière version
La version 3 améliore légèrement (liens vers Wicri/Santé) l'interface homme machine.
- Tests pour V4
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Installation sur une machine de TP
Installation
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
mkdir $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBelgique.storage
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBelgique.storage
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (belgium[MeSH Terms])" -s 200 -d GrippeBelgiqueV2
Test
Imprimer, par ordre alphabétique, la liste des pays ayant publié sur la Belgique...
cd GrippeBelgiqueV2
HfdCat Data/Main/Exploration/AffPays.i.hfd \
| SgmlSelect -g idx/kw/1 -g idx/f/1 -p @g1 -p @g2 \
| sort
Le résultat attendu :
Allemagne 3 Australie 3 Autriche 2 Belgique 98 Canada 2 Croatie 2 France 5 Japon 1 Nouvelle-Zélande 1 Pays-Bas 5 Portugal 1 Royaume-Uni 4 Suisse 1 Suède 2 Viêt Nam 1 États-Unis 2
expérimentation sur la génération de pages wiki
Un document a été repéré car il présente quelques éléments intéressants pour la génération de pages wikis à partir de notices PubMeb :
Expérimentation sur les faits épidémiologiques régionaux
Deux documents ont été repérés :
- Molecular epidemiological analysis of the transboundary transmission of 2003 highly pathogenic avian influenza H7N7 outbreaks between the Netherlands and Belgium.
- Une épidémie dans une ferme de dindons dans la ville de Westmalle.
- Transbound Emerg Dis (2014) Van Borm
- Community transmission of influenza A (H1N1)v virus at a rock festival in Belgium, 2-5 July 2009.
- Un concert de Rock en 2009 dans la ville de Werchter
- Euro Surveill. (2009) Gutiérrez
Voir aussi
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