Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique : Différence entre versions

De Wicri Santé
imported>Jacques Ducloy
(→‎Exploration)
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Version du 28 juin 2020 à 17:27

Ce tableau de Albert Anker illustre une activité à caractère pédagogique sur une page Espace dédié à un travail pédagogique
Ce serveur a été installé pour des raisons essentiellement pédagogiques.
logo travaux Ce serveur sert également à mettre au point une formule simple pour la production de serveurs d'exploration spécialisés.

Cette formule utilise la commande DILIB NlmPubMedExplorCorpus qui cause une erreur dans le version actullement diffusée.

Critère de sélection

Pour construire un corpus sur les faits épidémiologiques sur la grippe en Belgique, le critère utilisé est le suivant :

(influenza) AND (belgium[MeSH Terms])

Exploration

Les 2 versions portent sur le même corpus

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

La version 2 contient plus d'index.

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ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

La version 3 améliore légèrement (liens vers Wicri/Santé) l'interface homme machine.

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale


Auteurs

Lien vers l'index complet (avec classification)

  1. Niel Hens (8)
  2. Thierry Van Den Berg (6)
  3. Samuel Coenen (6)
  4. T. Van Den Berg (5)
  5. R. Snacken (5)
  6. Philippe Beutels (5)
  7. Isabelle Thomas (5)
  8. Barbara Michiels (5)
  9. B. Lambrecht (5)
  10. V. Van Casteren (4)
  11. Paul Van Royen (4)
  12. P. Houdart (4)
  13. M. Mombaerts-Servais (4)
  14. J. Desmyter (4)
  15. I. Thomas (4)
  
Affiliations

Lien vers l'index complet

  1. Université d'Anvers (13)
  2. Université de Gand (5)
  3. Université libre de Bruxelles (4)
  4. Université de Liège (4)
  5. Katholieke Universiteit Leuven (3)
  6. Université catholique de Louvain (2)
  7. Université de Cambridge (1)
  8. Université Paris-Descartes (1)
  9. Université McGill (1)
  10. Université Johann Wolfgang Goethe de Francfort-sur-le-Main (1)


  1. Bruxelles (37)
  2. Anvers (13)
  3. Louvain (6)
  4. Gand (5)
  5. Liège (4)
  6. Sydney (3)
  7. Londres (3)
  8. Vienne (Autriche) (2)
  9. Utrecht (2)
  10. Stockholm (2)
  11. Paris (2)
  12. Lyon (2)
  13. Amsterdam (2)
  14. Tübingen (1)
  15. Rotterdam (1)

Installation sur une machine de TP

Installation

source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
mkdir $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBelgique.storage
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBelgique.storage
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (belgium[MeSH Terms])" -s 200 -d GrippeBelgiqueV2

Test

Imprimer, par ordre alphabétique, la liste des pays ayant publié sur la Belgique... 

cd GrippeBelgiqueV2

HfdCat Data/Main/Exploration/AffPays.i.hfd             \
    | SgmlSelect -g idx/kw/1 -g  idx/f/1 -p @g1 -p @g2 \
    | sort

Le résultat attendu : 

Allemagne	3
Australie	3
Autriche	2
Belgique	98
Canada	2
Croatie	2
France	5
Japon	1
Nouvelle-Zélande	1
Pays-Bas	5
Portugal	1
Royaume-Uni	4
Suisse	1
Suède	2
Viêt Nam	1
États-Unis	2

expérimentation sur la génération de pages wiki

Un document a été repéré car il présente quelques éléments intéressants pour la génération de pages wikis à partir de notices PubMeb :

Expérimentation sur les faits épidémiologiques régionaux

Deux documents ont été repérés :

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