Serveur d'exploration sur la grippe au Canada/Version 3 : Différence entre versions

De Wicri Santé
imported>Jacques Ducloy
(Voir aussi)
imported>Jacques Ducloy
 
(18 révisions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées)
Ligne 1 : Ligne 1 :
 
{{Covid/En-tête|serveur=GrippeCanadaV1}}
 
{{Covid/En-tête|serveur=GrippeCanadaV1}}
{{Wicri tp|texte=Ce serveur a été installé pour des raisons essentiellement pédagogiques.}}
+
{{Wicri tp|texte=Ce serveur a été installé pour des raisons essentiellement pédagogiques.
 +
* voir : [[Recherche et signalement de faits épidémiques régionaux]]}}
 
{{Wicri travaux|texte=Ce serveur sert également à mettre au point une formule simple pour la production de serveurs d'exploration spécialisés.}}  
 
{{Wicri travaux|texte=Ce serveur sert également à mettre au point une formule simple pour la production de serveurs d'exploration spécialisés.}}  
 
==Critère de sélection==
 
==Critère de sélection==
 
Pour construire un corpus sur les faits épidémiologiques sur la grippe au [[Canada]], le critère utilisé est le suivant :
 
Pour construire un corpus sur les faits épidémiologiques sur la grippe au [[Canada]], le critère utilisé est le suivant :
 
:<code>(influenza) AND (canada<nowiki>[</nowiki>MeSH Terms])</code>
 
:<code>(influenza) AND (canada<nowiki>[</nowiki>MeSH Terms])</code>
 +
 +
Les premières versions sont rangées sur la page [[Serveur d'exploration sur la grippe au Canada/Versions 1 et 2]]
  
 
==Exploration==
 
==Exploration==
Ces serveurs donnent accès à [[A pour taille PubMed::1386]] références.
+
Ces serveurs donnent accès à [[A pour taille PubMed::1387]] références.
<span style="display: none;">[[A pour volumétrie (serveur d'exploration)::1386]] [[A pour volumétrie finale::1386]]</span>
+
<span style="display: none;">[[A pour volumétrie (serveur d'exploration)::1387]] [[A pour volumétrie finale::1387]]</span>
===Version 1===
+
{{Explor bandeau flux|type=PubMedSolo|code=Main|path= GrippeCanadaV3}}
{{Explor bandeau flux|type=PubMedSolo|code=Main|path=GrippeCanadaV1}}
+
{{Explor plateforme GrippeCanadaV3/Carte Provinces Canada}}
===Version 2===
+
{{Explor plateforme GrippeCanadaV3/Carte Europe}}
{{Explor bandeau flux|type=PubMedSolo|code=Main|path= GrippeCanadaV2}}
 
{{Explor plateforme GrippeCanadaV2/Carte Europe}}
 
 
{{Début 2 colonnes}}
 
{{Début 2 colonnes}}
 
;Auteurs:
 
;Auteurs:
 
{{Explor lien
 
{{Explor lien
 
   |wiki=Sante
 
   |wiki=Sante
  |area=GrippeCanadaV2
+
  |area=GrippeCanadaV3
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=Author.i
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=Author.i
 
  |texte=Lien vers l'index complet (avec classification)  
 
  |texte=Lien vers l'index complet (avec classification)  
 
}}
 
}}
{{GrippeCanadaV2, include|section=auteurs}}
+
{{GrippeCanadaV3, include|section=auteurs}}
 
{{Saut 2 colonnes}}
 
{{Saut 2 colonnes}}
 
;;Affiliations:
 
;;Affiliations:
 
{{Explor lien
 
{{Explor lien
 
   |wiki=Sante
 
   |wiki=Sante
  |area=GrippeCanadaV2
+
  |area=GrippeCanadaV3
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffOrg.i
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffOrg.i
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
}}
 
}}
{{GrippeCanadaV2, include|section=org}}
+
{{GrippeCanadaV3, include|section=org}}
 
{{Fin 2 colonnes}}
 
{{Fin 2 colonnes}}
 
{{Début 3 colonnes}}
 
{{Début 3 colonnes}}
Ligne 37 : Ligne 38 :
 
{{Explor lien
 
{{Explor lien
 
   |wiki=Sante
 
   |wiki=Sante
  |area=GrippeCanadaV2
+
  |area=GrippeCanadaV3
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffPays.i
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffPays.i
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
}}
 
}}
{{GrippeCanadaV2, include|section=pays}}
+
{{GrippeCanadaV3, include|section=pays}}
 
{{Saut 3 colonnes}}
 
{{Saut 3 colonnes}}
 
;Régions:
 
;Régions:
 
{{Explor lien
 
{{Explor lien
 
   |wiki=Sante
 
   |wiki=Sante
  |area=GrippeCanadaV2
+
  |area=GrippeCanadaV3
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffRegion.i
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffRegion.i
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
}}
 
}}
{{GrippeCanadaV2, include|section=region}}
+
{{GrippeCanadaV3, include|section=region}}
 
{{Saut 3 colonnes}}
 
{{Saut 3 colonnes}}
 
;Villes:
 
;Villes:
 
{{Explor lien
 
{{Explor lien
 
   |wiki=Sante
 
   |wiki=Sante
  |area=GrippeCanadaV2
+
  |area=GrippeCanadaV3
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffVille.i
 
  |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffVille.i
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
  |texte=Lien vers l'index complet  
 
}}
 
}}
{{GrippeCanadaV2, include|section=ville}}
+
{{GrippeCanadaV3, include|section=ville}}
 +
{{Fin 3 colonnes}}
 +
 
 +
;{{Début 2 colonnes}}
 +
;;MeSH (anglais):
 +
{{Explor lien
 +
  |wiki=Sante
 +
|area=GrippeCanadaV3
 +
|url=Main/Exploration/indexHead.php?index=Mesh.i
 +
|texte=Lien vers l'index complet
 +
}}
 +
{{GrippeCanadaV3, include|section=Mesh}}
 +
{{Saut 2 colonnes}}
 +
;;MeSH (français):
 +
{{Explor lien
 +
  |wiki=Sante
 +
|area=GrippeCanadaV3
 +
|url=Main/Exploration/indexHead.php?index=MeshFr.i
 +
|texte=Lien vers l'index complet
 +
}}
 +
{{GrippeCanadaV3, include|section=MeshFr}}
 +
{{Fin 2 colonnes}}
 +
 
 +
{{Début 3 colonnes}}
 +
;Mots des abstracts:
 +
{{Explor lien
 +
  |wiki=Sante
 +
|area=GrippeCanadaV3
 +
|url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AbsEn.i
 +
|texte=Lien vers l'index complet
 +
}}
 +
{{GrippeCanadaV3, include|section=abstract}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Mots des titres:
 +
{{Explor lien
 +
  |wiki=Sante
 +
|area=GrippeCanadaV3
 +
|url=Main/Exploration/indexHead.php?index=Title.i
 +
|texte=Lien vers l'index complet (avec classification)
 +
}}
 +
{{GrippeCanadaV3, include|section=title}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Revues (ISSN):
 +
{{Explor lien
 +
  |wiki=Sante
 +
|area=GrippeCanadaV3
 +
|url=Main/Exploration/indexHead.php?index=ISSN.i
 +
|texte=Lien vers l'index complet
 +
}}
 +
{{GrippeCanadaV3, include|section=ISSN}}
 
{{Fin 3 colonnes}}
 
{{Fin 3 colonnes}}
  
Ligne 68 : Ligne 118 :
 
mkdir $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
 
mkdir $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
 
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
 
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (canada[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeCanadaV1
+
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (canada[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeCanadaV3
 
</source>
 
</source>
  
Ligne 93 : Ligne 143 :
 
}}
 
}}
 
**Épidémie d'oiseaux migrateurs en Chine.
 
**Épidémie d'oiseaux migrateurs en Chine.
 +
*{{Explor lien
 +
  |wiki=    Wicri/Sante
 +
  |area=    GrippeCanadaV2
 +
  |flux=    Main
 +
  |étape=  Exploration
 +
  |type=    RBID
 +
  |clé=    pubmed:30873724
 +
  |texte=  Respiratory viruses identified in western Canadian beef cattle by metagenomic sequencing and their association with bovine respiratory disease.
 +
}}
 +
**[[Transbound Emerg Dis (2019) Zhang]]
 +
 +
* {{Explor lien
 +
  |wiki=    Wicri/Sante
 +
  |area=    GrippeCanadaV3
 +
  |flux=    Main
 +
  |étape=  Exploration
 +
  |type=    RBID
 +
  |clé=    pubmed:12715302
 +
  |texte=  Large summertime influenza A outbreak among tourists in Alaska and the Yukon Territory.
 +
}}
 +
 +
* {{Explor lien
 +
  |wiki=    Wicri/Sante
 +
  |area=    GrippeCanadaV3
 +
  |flux=    Main
 +
  |étape=  Exploration
 +
  |type=    RBID
 +
  |clé=    pubmed:22030007
 +
  |texte=  The 2009 H1N1 pandemic response in remote First Nation communities of Subarctic Ontario: barriers and improvements from a health care services perspective.
 +
}}
 +
 
==Voir aussi==
 
==Voir aussi==
 +
{{Wicri voir|dec=serveur d'exploration}}
 +
 +
Ce serveur est également exprimé sur {{Wicri lien|wiki=Canada}}.
  
 
__SHOWFACTBOX__
 
__SHOWFACTBOX__
  
[[Catégorie:Serveurs Covid]]
+
[[Catégorie:Serveurs Covid|Grippe Canada]]
 +
[[Catégorie:Serveur d'exploration|Grippe Canada]]
 +
[[Catégorie:Serveurs d'exploration|Grippe Canada]]
 +
[[Catégorie:Canada]]

Version actuelle datée du 5 août 2020 à 16:44

Ce tableau de Albert Anker illustre une activité à caractère pédagogique sur une page Espace dédié à un travail pédagogique
Ce serveur a été installé pour des raisons essentiellement pédagogiques.
logo travaux Ce serveur sert également à mettre au point une formule simple pour la production de serveurs d'exploration spécialisés.

Critère de sélection

Pour construire un corpus sur les faits épidémiologiques sur la grippe au Canada, le critère utilisé est le suivant :

(influenza) AND (canada[MeSH Terms])

Les premières versions sont rangées sur la page Serveur d'exploration sur la grippe au Canada/Versions 1 et 2

Exploration

Ces serveurs donnent accès à 1387 références. 1387 1387

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Auteurs

Lien vers l'index complet (avec classification)

  1. Jeffrey C. Kwong (60)
  2. Yan Li (51)
  3. Danuta M. Skowronski (51)
  4. Gaston De Serres (49)
  5. Allison Mcgeer (35)
  6. Nathalie Bastien (33)
  7. Jonathan B. Gubbay (33)
  8. Natasha S. Crowcroft (32)
  9. Anne-Luise Winter (31)
  10. Mark Loeb (30)
  11. Steven J. Drews (28)
  12. Kevin Fonseca (26)
  13. David L. Buckeridge (26)
  14. Martin Petric (24)
  15. Laura C. Rosella (23)
 
Affiliations

Lien vers l'index complet

  1. Université de Toronto (114)
  2. Université du Manitoba (44)
  3. Université McMaster (41)
  4. Université de Calgary (40)
  5. Université McGill (22)
  6. Université du Maryland (2)
  7. Université de Sydney (2)
  8. Université de Zhejiang (1)
  9. Université de Washington (1)
  10. Université de São Paulo (1)
  11. Université de Princeton (1)
  12. Université de Pittsburgh (1)
  13. Université de Melbourne (1)
  14. Université de Manchester (1)
  15. Université de Londres (1)
Pays

Lien vers l'index complet

  1. Canada (780)
  2. États-Unis (100)
  3. Royaume-Uni (18)
  4. Belgique (11)
  5. Australie (11)
  6. France (7)
  7. République populaire de Chine (6)
  8. Pays-Bas (6)
  9. Suède (3)
  10. Oman (3)
  11. Espagne (3)
  12. Singapour (2)
  13. Italie (2)
  14. Géorgie (pays) (2)
  15. Chili (2)
 
Régions

Lien vers l'index complet

  1. Ontario (170)
  2. Manitoba (44)
  3. Alberta (40)
  4. Québec (25)
  5. Angleterre (14)
  6. Maryland (12)
  7. Tennessee (11)
  8. Grand Londres (11)
  9. Pennsylvanie (10)
  10. Massachusetts (10)
  11. Californie (7)
  12. Wisconsin (6)
  13. Géorgie (États-Unis) (6)
  14. État de New York (5)
  15. Washington (État) (5)
 
Villes

Lien vers l'index complet

  1. Toronto (114)
  2. Winnipeg (44)
  3. Hamilton (Ontario) (41)
  4. Calgary (40)
  5. Montréal (26)
  6. Londres (11)
  7. Utrecht (3)
  8. Sydney (3)
  9. Pékin (3)
  10. Paris (3)
  11. Bruxelles (3)
  12. Barcelone (3)
  13. Melbourne (2)
  14. College Park (Maryland) (2)
  15. Édimbourg (1)
MeSH (anglais)

Lien vers l'index complet

  1. Humans (1249)
  2. Influenza, Human (1006)
  3. Canada (773)
  4. Female (578)
  5. Male (513)
  6. Influenza Vaccines (485)
  7. Adult (469)
  8. Middle Aged (426)
  9. Aged (396)
  10. Adolescent (356)
  11. Influenza A Virus, H1N1 Subtype (351)
  12. Disease Outbreaks (346)
  13. Child (334)
  14. Ontario (302)
  15. Child, Preschool (281)
  16. Infant (235)
  17. Influenza A virus (217)
  18. Young Adult (214)
  19. Vaccination (208)
  20. Animals (206)
 
MeSH (français)

Lien vers l'index complet

  1. Humains (1249)
  2. Grippe humaine (1006)
  3. Canada (773)
  4. Femelle (578)
  5. Mâle (513)
  6. Vaccins antigrippaux (485)
  7. Adulte (469)
  8. Adulte d'âge moyen (426)
  9. Sujet âgé (396)
  10. Adolescent (356)
  11. Sous-type H1N1 du virus de la grippe A (351)
  12. Flambées de maladies (346)
  13. Enfant (334)
  14. Ontario (302)
  15. Enfant d'âge préscolaire (281)
  16. Nourrisson (235)
  17. Virus de la grippe A (217)
  18. Jeune adulte (214)
  19. Vaccination (208)
  20. Animaux (206)
Mots des abstracts

Lien vers l'index complet

  1. influenza (1043)
  2. results (547)
  3. canada (465)
  4. methods (412)
  5. were (316)
  6. pandemic (310)
  7. background (302)
  8. conclusions (283)
  9. virus (256)
  10. study (256)
  11. health (250)
  12. vaccination (249)
  13. during (238)
  14. vaccine (228)
  15. canadian (212)
 
Mots des titres

Lien vers l'index complet (avec classification)

  1. influenza (924)
  2. canada (314)
  3. pandemic (257)
  4. vaccination (193)
  5. vaccine (151)
  6. virus (140)
  7. canadian (138)
  8. ontario (124)
  9. health (114)
  10. care (114)
  11. during (109)
  12. respiratory (105)
  13. immunization (104)
  14. season (101)
  15. surveillance (81)
 
Revues (ISSN)

Lien vers l'index complet

  1. 0008-4263 (79)
  2. 1188-4169 (67)
  3. 1488-2329 (66)
  4. PLoS ONE (58)
  5. 0820-3946 (51)
  6. 1873-2518 (48)
  7. 1471-2458 (41)
  8. 1750-2659 (36)
  9. 0382-232X (33)
  10. 0008-4409 (28)
  11. 1481-8531 (26)
  12. Emerging infectious diseases (23)
  13. The Canadian Veterinary Journal (23)
  14. 1701-2163 (17)
  15. 2164-554X (16)

Installation sur une machine de TP

Installation

source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
mkdir $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeCanada.storage
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (canada[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeCanadaV3

Expérimentation sur les faits épidémiologiques régionaux

Document(s) repéré(s) :

Voir aussi

Dans le réseau Wicri :

Ceci est la page de référence de « Serveur d'exploration sur la grippe au Canada/Version 3 »

Ce serveur est également exprimé sur Wicri/Canada.