Wicri:CovidV2/Paramètres, data
De Wicri Santé
Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version CovidV2 du « Serveur d'exploration Covid (26 mars) ».
Voir aussi :
- Wicri:CovidV2/Paramètres, fr - paramètres de navigation.
- Wicri:CovidV2/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques
- Wicri:CovidV2/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
La table des paramètres
| type | rubrique | valeur |
|---|---|---|
| areaCode | Area | CovidV2 |
| wikiCode | Area | Wicri/Sante |
| langs | Area | fr |
| listStreams | Area | Istex ;PubMed ;Pmc ;Ncbi ;Hal ;PascalFrancis ;Main; France ; an2020 ; new |
| typeStream | Area/Main | Explor:MainMerge |
| typeStream | Area/Istex | Istex:IstexMulti |
| typeStream | Area/PubMed | Nlm:Medline |
| typeStream | Area/Pmc | Nlm:Pmc |
| typeStream | Area/Hal | Ccsd:HalV3 |
| typeStream | Area/Ncbi | Nlm:Ncbi |
| typeStream | Area/PascalFrancis | Inist:Stanalyst |
| mergingList | Area/Main | Istex ; Ncbi ; Hal ; PascalFrancis |
| mergingList | Area/Ncbi | PubMed ; Pmc |
| typeStream | Area/France | Explor:IndexSelect |
| typeStream | Area/an2020 | Explor:BiblioFilter |
| typeStream | Area/new | Explor:BiblioFilter |
Les Zooms
| type | étape | valeur |
|---|---|---|
| selectOrCommand | Area/France/Extraction | :AffPays.i ; France |
| extractionFilter | Area/an2020/Extraction | grep 2020 |
| extractionFilter | Area/new/Extraction | NlmNcbiFindNew -b ../CovidV1 |
Corpus
| type | rubrique | valeur |
|---|---|---|
| Istex:linkCorpus | Area/Istex/Corpus | $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.hfd |
| importFile | Area/PubMed/Corpus | pubmed_result.xml |
| importFile | Area/Pmc/Corpus | pmc_result.xml |
| Ccsd:teiImportFile | Area/Hal/Corpus | api.archives-ouvertes.fr.xml |
| Inist:standardImportFile | Area/PascalFrancis/Corpus | inistStandard.txt |
| Inist:serveurImportFile | Area/PascalFrancis/Corpus | inistServer.txt |
Curation
| type | étape | valeur |
|---|---|---|
| persCurationOption | Area/Istex/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| persCurationOption | Area/Pmc/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| persCurationOption | Area/PubMed/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| persCurationOption | Area/PascalFrancis/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| rejectIdnoISSN | Area/Istex/Curation | 1492-7535 ; 0734-9750 ; 1440-1843 ; 0147-9571 |
| keepIdnoRBID | Area/Istex/Curation | ISTEX:A0350CA0C5CA39A59374D3F246BE11C8BEE5194E ; ISTEX:DA6FBBFF06A86EDD2B2FCCB6905606563BD1AE15 ; ISTEX:B226495B7E963E4FE5AC5D5ECFBDD02352CE15A2 ; ISTEX:50C8CC9F5623C8C51B5B0EA7C3CD05F807C8F3D9 ; ISTEX:2C92AE2A170C54272B7090588770EBDD06820D38 ; ISTEX:15DD49E0ED3C4B260E52012856E849161EB2D3A8 ; ISTEX:3FD782F316CAA92071E955FA8239DEE14E297855 ; ISTEX:15FDA434633898272995DFA1C77BB5EA29AD2DCE ; ISTEX:4E0992394E5C825E6E9103AE9365F8E80E79D3D4 |
Mise en œuvre
- Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Sante/explor/Covid.storage/CovidV2
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
- Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:CovidV2/Paramètres, data"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki
Si reprise
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
