Wicri:WoodDegFungiV1
De Wicri Bois
Cette page introduit les aspects techniques de la version WoodDegFungiV1 du « Serveur d'exploration sur les champignons de dégradation du bois ».
Voir aussi :
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, corpus - création des corpus
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, data - génération des données
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, fr - paramètres de navigation.
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, size - génération des modèles liés aux valeurs numériques
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, maps - génération de cartes géographiques
- Wicri:WoodDegFungiV1/Paramètres, include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts
Initialisation
Ce serveur a probablement été initialisé par la commande NlmPubMedExplorCorpus
avec le script suivant :
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d WoodDegFungiV1 \
-q "wood degradation fungi" -s 2000 \
-l %wicriLink -p wicriPath \
-t "Serveur d'exploration sur les champignons de dégradation du bois"
Installation
Installation des données sur LorExplor, initialisation
Dans tous les cas, sur le site LorExplor, le serveur sera installé sur le répertoire :
$WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
Le protocole d'initialisation est donc le suivant :
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh
mkdir $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
Génération à partir d'une machine locale
A l'issue de la commande NlmPubMedExplorCorpus
.
- Sur la machine locale
tar -cvf WoodDegFungiV1.tar WoodDegFungiV1
gzip WoodDegFungiV1.tar
scp WoodDegFungiV1.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
- Sur la machine LorExplor
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
gunzip WoodDegFungiV1.tar.gz
tar -xvf WoodDegFungiV1.tar
gzip WoodDegFungiV1.tar
Définition des liens pour visibilité Web
- Sur la machine LorExplor
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor
ln -s WoodDegFungi.storage/WoodDegFungiV1 .
cd /applis/lorexplor/www/html/Wicri/Bois/explor
ln -s $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungiV1 .
Mise à jour
Définition EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage/WoodDegFungiV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Chargement d'une nouvelle version des données
cd $EXPLOR_AREA
mkdir Import/Archive
mv Import/pubmed_result.xml Import/Archive/.
NlmPubMedGetCorpus -q "wood degradation fungi" -s 250 -x > Import/pubmed_result.xml
Restauration complète
- Solution 1
cd $EXPLOR_AREA
ExplorAreaRestart -l 3
- En pas à pas
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
cat $EXPLOR_AREA/Import/ListKeys.wiki \
| MediaWikiCleanTable \
| MediaWikiTable2SxmlRowCol \
| MediaWikiTableTransformCol -t 123 -T 4 \
> $EXPLOR_AREA/Input/ListKeys.xml
ExplorGenerTemplateSize -f $EXPLOR_AREA/Input/ListKeys.xml > $EXPLOR_AREA/exportSize.xml
MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
source $EXPLOR_AREA/FixBin/AreaGenerWikiTemplateMaps.sh >> $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
source $EXPLOR_AREA/FixBin/AreaGenerWikiTemplateInclude.sh >> $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
Installation de la nouvelle version
- Sur la machine LorExplor
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
rm WoodDegFungiV1.tar.gz
- Sur la machine de développement
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
rm WoodDegFungiV1.tar.gz
tar -cvf WoodDegFungiV1.tar WoodDegFungiV1
gzip WoodDegFungiV1.tar
scp WoodDegFungiV1.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Bois/explor/WoodDegFungi.storage
Voir aussi
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