| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000001 (2016) |
Marco Fondi [Italie] ; Antti Karkman [Finlande] ; Manu V. Tamminen [Suisse] ; Emanuele Bosi [Italie] ; Marko Virta [Finlande] ; Renato Fani [Italie] ; Eric Alm [États-Unis] ; James O. Mcinerney [Irlande (pays), Royaume-Uni] | “Every Gene Is Everywhere but the Environment Selects”: Global Geolocalization of Gene Sharing in Environmental Samples through Network Analysis |
| 000019 (2016) |
Jeanine S. Morey [États-Unis] ; Marion G. Neely [États-Unis] ; Denise Lunardi [Italie] ; Paul E. Anderson [États-Unis] ; Lori H. Schwacke [États-Unis] ; Michelle Campbell ; Frances M. Van Dolah [États-Unis] | RNA-Seq analysis of seasonal and individual variation in blood transcriptomes of healthy managed bottlenose dolphins |
| 000025 (2016) |
Robert Buels [États-Unis] ; Eric Yao [États-Unis] ; Colin M. Diesh ; Richard D. Hayes [États-Unis] ; Monica Munoz-Torres [États-Unis] ; Gregg Helt [États-Unis] ; David M. Goodstein [États-Unis] ; Christine G. Elsik ; Suzanna E. Lewis [États-Unis] ; Lincoln Stein ; Ian H. Holmes [États-Unis] | JBrowse: a dynamic web platform for genome visualization and analysis |
| 000040 (2016) |
Peter A. Meyer [États-Unis] ; Stephanie Socias [États-Unis] ; Jason Key [États-Unis] ; Elizabeth Ransey [États-Unis] ; Emily C. Tjon [États-Unis] ; Alejandro Buschiazzo [Uruguay, France] ; Ming Lei [République populaire de Chine] ; Chris Botka [États-Unis] ; James Withrow [États-Unis] ; David Neau [États-Unis] ; Kanagalaghatta Rajashankar [États-Unis] ; Karen S. Anderson [États-Unis] ; Richard H. Baxter [États-Unis] ; Stephen C. Blacklow [États-Unis] ; Titus J. Boggon [États-Unis] ; Alexandre M. J. J. Bonvin [Pays-Bas] ; Dominika Borek [États-Unis] ; Tom J. Brett [États-Unis] ; Amedeo Caflisch [Suisse] ; Chung-I Chang [Taïwan] ; Walter J. Chazin [États-Unis] ; Kevin D. Corbett [États-Unis] ; Michael S. Cosgrove [États-Unis] ; Sean Crosson [États-Unis] ; Sirano Dhe-Paganon [États-Unis] ; Enrico Di Cera [États-Unis] ; Catherine L. Drennan [États-Unis] ; Michael J. Eck [États-Unis] ; Brandt F. Eichman [États-Unis] ; Qing R. Fan [États-Unis] ; Adrian R. Ferré-D'Amaré [États-Unis] ; J. Christopher Fromme [États-Unis] ; K. Christopher Garcia [États-Unis] ; Rachelle Gaudet [États-Unis] ; Peng Gong [République populaire de Chine] ; Stephen C. Harrison [États-Unis] ; Ekaterina E. Heldwein [États-Unis] ; Zongchao Jia [Canada] ; Robert J. Keenan [États-Unis] ; Andrew C. Kruse [États-Unis] ; Marc Kvansakul [Australie] ; Jason S. Mclellan [États-Unis] ; Yorgo Modis [Royaume-Uni] ; Yunsun Nam [États-Unis] ; Zbyszek Otwinowski [États-Unis] ; Emil F. Pai [Canada] ; Pedro José Barbosa Pereira [Portugal] ; Carlo Petosa [France] ; C. S. Raman [États-Unis] ; Tom A. Rapoport [États-Unis] ; Antonina Roll-Mecak [États-Unis] ; Michael K. Rosen [États-Unis] ; Gabby Rudenko [États-Unis] ; Joseph Schlessinger [États-Unis] ; Thomas U. Schwartz [États-Unis] ; Yousif Shamoo [États-Unis] ; Holger Sondermann [États-Unis] ; Yizhi J. Tao [États-Unis] ; Niraj H. Tolia [États-Unis] ; Oleg V. Tsodikov [États-Unis] ; Kenneth D. Westover [États-Unis] ; Hao Wu [États-Unis] ; Ian Foster [États-Unis] ; James S. Fraser [États-Unis] ; Filipe R. N C. Maia [Suède, États-Unis] ; Tamir Gonen [États-Unis] ; Tom Kirchhausen [États-Unis] ; Kay Diederichs [Allemagne] ; Mercè Crosas [États-Unis] ; Piotr Sliz [États-Unis] | Data publication with the structural biology data grid supports live analysis |
| 000047 (2016) |
John La Salle [Australie] ; Kristen J. Williams [Australie] ; Craig Moritz [Australie] | Biodiversity analysis in the digital era |
| 000052 (2016) |
Tereza Šev Ková [République tchèque] ; Vladimír Klimeš [République tchèque] ; Veronika Zbránková [République tchèque] ; Hynek Strnad [République tchèque] ; Miluše Hroudová [République tchèque] ; Estmír Vl Ek [République tchèque] ; Marek Eliáš [République tchèque] | A Comparative Analysis of Mitochondrial Genomes in Eustigmatophyte Algae |
| 000074 (2015) |
Maksudul Alam [États-Unis] ; Xinwei Deng [États-Unis] ; Casandra Philipson [États-Unis] ; Josep Bassaganya-Riera [États-Unis] ; Keith Bisset [États-Unis] ; Adria Carbo [États-Unis] ; Stephen Eubank [États-Unis] ; Raquel Hontecillas [États-Unis] ; Stefan Hoops [États-Unis] ; Yongguo Mei [États-Unis] ; Vida Abedi [États-Unis] ; Madhav Marathe [États-Unis] | Sensitivity Analysis of an ENteric Immunity SImulator (ENISI)-Based Model of Immune Responses to Helicobacter pylori Infection |
| 000086 (2015) |
Zasha Weinberg [États-Unis] ; Peter B. Kim [États-Unis] ; Tony H. Chen [États-Unis] ; Sanshu Li [États-Unis] ; Kimberly A. Harris [États-Unis] ; Christina E. Lünse [États-Unis] ; Ronald R. Breaker [États-Unis] | New classes of self-cleaving ribozymes revealed by comparative genomics analysis |
| 000088 (2015) |
Mohan A. V. S. K. Katta [Inde] ; Aamir W. Khan [Inde] ; Dadakhalandar Doddamani [Inde] ; Mahendar Thudi [Inde] ; Rajeev K. Varshney [Inde, Australie] | NGS-QCbox and Raspberry for Parallel, Automated and Rapid Quality Control Analysis of Large-Scale Next Generation Sequencing (Illumina) Data |
| 000092 (2015) |
Daniel S. Jones ; Beverly E. Flood ; Jake V. Bailey | Metatranscriptomic Analysis of Diminutive Thiomargarita-Like Bacteria (“Candidatus Thiopilula” spp.) from Abyssal Cold Seeps of the Barbados Accretionary Prism |
| 000104 (2015) |
Asher Haug-Baltzell [États-Unis] ; Erich D. Jarvis [États-Unis] ; Fiona M. Mccarthy [États-Unis] ; Eric Lyons [États-Unis] | Identification of dopamine receptors across the extant avian family tree and analysis with other clades uncovers a polyploid expansion among vertebrates |
| 000107 (2015) |
Kranthi K. Mandadi ; Karen-Beth G. Scholthof | Genome-Wide Analysis of Alternative Splicing Landscapes Modulated during Plant-Virus Interactions in Brachypodium distachyon |
| 000143 (2015) |
Irina Makarevitch ; Cameo Frechette ; Natalia Wiatros | Authentic Research Experience and “Big Data” Analysis in the Classroom: Maize Response to Abiotic Stress |
| 000151 (2015) |
Natalya Yutin [États-Unis] ; Sofiya Shevchenko [États-Unis] ; Vladimir Kapitonov [États-Unis] ; Mart Krupovic [France] ; Eugene V. Koonin [États-Unis] | A novel group of diverse Polinton-like viruses discovered by metagenome analysis |
| 000191 (2014) |
Sandra Appelt [France] ; Fabrice Armougom [France] ; Matthieu Le Bailly [France] ; Catherine Robert [France] ; Michel Drancourt [France] | Polyphasic Analysis of a Middle Ages Coprolite Microbiota, Belgium |
| 000209 (2014) |
L. Rouli [France] ; M. Mbengue [Sénégal] ; C. Robert [France] ; M. Ndiaye [Sénégal] ; B. La Scola [France] ; D. Raoult [France] | Genomic analysis of three African strains of Bacillus anthracisdemonstrates that they are part of the clonal expansion of an exclusively pathogenic
bacterium |
| 000228 (2014) |
Krishna Madhavan ; Niklas Elmqvist ; Mihaela Vorvoreanu ; Xin Chen ; Yuetling Wong ; Hanjun Xian ; Zhihua Dong ; Aditya Johri | DIA2: Web-based Cyberinfrastructure for Visual Analysis of Funding Portfolios. |
| 000233 (2014) |
Derrick Scott ; Bert Ely | Comparison of genome sequencing technology and assembly methods for the analysis of a GC-rich bacterial genome |
| 000236 (2014) |
Amy E. Koid ; Zhenfeng Liu ; Ramon Terrado ; Adriane C. Jones ; David A. Caron ; Karla B. Heidelberg | Comparative Transcriptome Analysis of Four Prymnesiophyte Algae |
| 000245 (2014) |
| Behavior Change Techniques Implemented in Electronic Lifestyle Activity Monitors: A Systematic Content Analysis |
| 000252 (2014) |
Claudia Knief | Analysis of plant microbe interactions in the era of next generation sequencing technologies |
| 000253 (2014) |
Thomas J. Sharpton | An introduction to the analysis of shotgun metagenomic data |
| 000258 (2014) |
Adam L. Bazinet [États-Unis] ; Derrick J. Zwickl [États-Unis] ; Michael P. Cummings [États-Unis] | A Gateway for Phylogenetic Analysis Powered by Grid Computing Featuring GARLI 2.0 |
| 000261 (2014) |
W. Tang [États-Unis] ; M. Jia [États-Unis] | Global sensitivity analysis of a large agent-based model of spatial opinion exchange : a heterogeneous multi-GPU acceleration approach |
| 000314 (2013) |
Juan A. Ugalde [États-Unis] ; Maria J. Gallardo [Chili] ; Camila Belmar [Chili] ; Práxedes Mu Oz [Chili] ; Nathaly Ruiz-Tagle [Chili] ; Sandra Ferrada-Fuentes [Chili] ; Carola Espinoza [Chili] ; Eric E. Allen [États-Unis] ; Victor A. Gallardo [Chili] | Microbial Life in a Fjord: Metagenomic Analysis of a Microbial Mat in Chilean Patagonia |
| 000356 (2013) |
Sarah Hunter [Royaume-Uni] ; Matthew Corbett [Royaume-Uni] ; Hubert Denise [Royaume-Uni] ; Matthew Fraser [Royaume-Uni] ; Alejandra Gonzalez-Beltran [Royaume-Uni] ; Christopher Hunter [Royaume-Uni] ; Philip Jones [Royaume-Uni] ; Rasko Leinonen [Royaume-Uni] ; Craig Mcanulla [Royaume-Uni] ; Eamonn Maguire [Royaume-Uni] ; John Maslen [Royaume-Uni] ; Alex Mitchell [Royaume-Uni] ; Gift Nuka [Royaume-Uni] ; Arnaud Oisel [Royaume-Uni] ; Sebastien Pesseat [Royaume-Uni] ; Rajesh Radhakrishnan [Royaume-Uni] ; Philippe Rocca-Serra [Royaume-Uni] ; Maxim Scheremetjew [Royaume-Uni] ; Peter Sterk [Royaume-Uni] ; Daniel Vaughan [Royaume-Uni] ; Guy Cochrane [Royaume-Uni] ; Dawn Field [Royaume-Uni] ; Susanna-Assunta Sansone [Royaume-Uni] | EBI metagenomics—a new resource for the analysis and archiving of metagenomic data |
| 000359 (2013) |
Dany Doiron [Canada] ; Paul Burton [Royaume-Uni] ; Yannick Marcon [Canada] ; Amadou Gaye [Royaume-Uni] ; Bruce H R. Wolffenbuttel [Pays-Bas] ; Markus Perola [Finlande] ; Ronald P. Stolk [Pays-Bas] ; Luisa Foco [Italie] ; Cosetta Minelli [Royaume-Uni] ; Melanie Waldenberger [Allemagne] ; Rolf Holle [Allemagne] ; Kirsti Kval Y [Norvège] ; Hans L. Hillege [Pays-Bas] ; Anne-Marie Tassé [Canada] ; Vincent Ferretti [Canada] ; Isabel Fortier [Canada] | Data harmonization and federated analysis of population-based studies: the BioSHaRE project |
| 000363 (2013) |
Amanda J. Waters ; Paul Bilinski ; Steven R. Eichten ; Matthew W. Vaughn ; Jeffrey Ross-Ibarra ; Mary Gehring ; Nathan M. Springer | Comprehensive analysis of imprinted genes in maize reveals allelic variation for imprinting and limited conservation with other species |
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Yingjie Xia [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jia Hu [États-Unis] ; Michael D. Fontaine [États-Unis] | A Cyber-ITS Framework for Massive Traffic Data Analysis Using Cyber Infrastructure |
| 000407 (2013) |
Jan Šev K [République tchèque] ; David Kasp K [République tchèque] ; Andrea T Thová [République tchèque] | Molecular phylogeny of fungus gnats (Diptera: Mycetophilidae) revisited: position of Manotinae, Metanepsiini, and other enigmatic taxa as inferred from multigene analysis |
| 000413 (2013) |
Youngseek Kim [États-Unis] ; Jeffrey M. Stanton [États-Unis] | Institutional and individual influences on scientists' data sharing behaviors: A multilevel analysis |
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| 000440 (2013) |
Andrea T Thová [République tchèque] ; Rudolf Rozkošn [République tchèque] ; Lloyd Knutson [Italie] ; Sujatha Narayanan Kutty [Singapour] ; Brian M. Wiegmann [États-Unis] ; Rudolf Meier [Singapour] | A phylogenetic analysis of Sciomyzidae (Diptera) and some related genera |
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Richard Fry ; Robert Berry ; Gary Higgs ; Scott Orford ; Sam Jones | The WISERD Geoportal: A Tool for the Discovery, Analysis and Visualization of Socio‐economic (Meta‐) Data for Wales |
| 000567 (2012) |
D. Bourilkov [États-Unis] ; P. Avery [États-Unis] ; M. Cheng [États-Unis] ; Y. Fu [États-Unis] ; B. Kim [États-Unis] ; J. Palencia [États-Unis] ; R. Budden [États-Unis] ; K. Benninger [États-Unis] ; J L Rodriquez [États-Unis] ; J. Dilascio [États-Unis] ; D. Dykstra [États-Unis] ; N. Seenu [États-Unis] | Secure wide area network access to CMS analysis data using the Lustre filesystem |
| 000591 (2012) |
A. Baudoux [États-Unis] ; R. W. Hendrix [États-Unis] ; G. C. Lander [États-Unis] ; X. Bailly [France] ; S. Podell [États-Unis] ; C. Paillard [France] ; J. E. Johnson [États-Unis] ; C. S. Potter [États-Unis] ; B. Carragher [États-Unis] ; F. Azam [États-Unis] | Genomic and functional analysis of Vibrio phage SIO‐2 reveals novel insights into ecology and evolution of marine siphoviruses |
