Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique/Faits épidémiques

Covid et épidémies grippales / Serveurs / La grippe en Belgique

Espace dédié à un travail pédagogique Cette page détaille quelques actions menées dans un contexte pédagogique sur le Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique voir : Recherche et signalement de faits épidémiques régionaux

Dans une phase d'initiation

Travaux pratiques d'exploration d'index avec Dilib

Imprimer, par ordre alphabétique, la liste des pays ayant publié sur la Belgique...

cd GrippeBelgiqueV2

HfdCat Data/Main/Exploration/AffPays.i.hfd             \
    | SgmlSelect -g idx/kw/1 -g  idx/f/1 -p @g1 -p @g2 \
    | sort

Le résultat attendu :

Allemagne	3
Australie	3
Autriche	2
Belgique	98
Canada	2
Croatie	2
France	5
Japon	1
Nouvelle-Zélande	1
Pays-Bas	5
Portugal	1
Royaume-Uni	4
Suisse	1
Suède	2
Viêt Nam	1
États-Unis	2

Exploitation de texte intégral issu de PubMed Central

Cette partie a été réalisée après le stage

HfdCat Data/Main/Exploration/biblio.hfd \
  | SxmlSelect -g record/TEI/teiHeader/fileDesc/publicationStmt/idno@type=pmc/1 -p@g1  \
  | NlmPmcGetCorpusById > Import/pmc_result.xml

HfdCat Data/Main/Exploration/biblio.hfd   | SxmlSelect -g record/TEI/teiHeader/fileDesc/publicationStmt/idno@type=pmc/1 -p@g1 -p @1 | sort > Input/pmcToRefPubMed.dict

cat Import/pmc_result.xml   \
   | NlmPmc2Sxml   \
   | Utf8FromHexEntity  \
   | SxmlUnIndent        \
   | HcsSxmlRecordPutKey  \
   | NlmPmc2CorpusTei   \
   | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Main/CorpusPmc -c PMC -S Main -s CorpusPmc \
   | HfdBuild -bh Data/Main/Corpus/repositoryPmc

HfdCat Data/Main/Exploration/biblio.hfd \
  | SxmlSelect -g record/TEI/teiHeader/fileDesc/publicationStmt/idno@type=pmc/1 -p@g1 -p @1

HfdCat Data/Main/Corpus/repositoryPmc.hfd |  SxmlSelect -g record/TEI/teiHeader/fileDesc/publicationStmt/idno@type=pmc/1 -p@g1 -p @1  | sort > Input/pmcToRefPmc.dict