Serveur d'exploration Stress et Covid : Différence entre versions
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{{Covid/En-tête|serveur=StressCovidV1}} | {{Covid/En-tête|serveur=StressCovidV1}} | ||
− | = | + | {{Wicri avertissement |
− | + | |texte='''<big>ATTENTION : Site de travail pour spécialistes</big>'''<br/>Ce serveur est un outil de travail destiné aux spécialistes pour les aider à élaborer des résultats synthétiques. La navigation efficace dans cette bibliographie demande une solide formation. | |
+ | |||
+ | Il est ouvert au public pour montrer quels sont les outils sur lesquels travaillent les spécialistes. | ||
+ | |||
+ | '''<big>ATTENTION : Résultats statistiques non significatifs</big>'''<br/>Il repose sur des traitements statistiques relativement simples. Les données accessibles par cette navigation n'ont subi aucune vérification. | ||
+ | |||
+ | De plus, la polysémie du terme stress implique une action conséquente de curation qui n'a pas été réalisée. | ||
+ | |||
+ | Merci au public de ne tirer aucune conclusion d'une corrélation... | ||
+ | }} | ||
+ | {{Wicri travaux|texte=Serveur en cours de mise à jour}} | ||
Cette page introduit le « [[Serveur d'exploration Stress et Covid]] ». | Cette page introduit le « [[Serveur d'exploration Stress et Covid]] ». | ||
Il contient [[A pour volumétrie (serveur d'exploration)::{{StressCovidV1, Explor size|stream=Area|step=Corpus|index=biblio}}]] documents. | Il contient [[A pour volumétrie (serveur d'exploration)::{{StressCovidV1, Explor size|stream=Area|step=Corpus|index=biblio}}]] documents. | ||
− | ==Navigation== | + | ==Critères de recherche== |
+ | ===Polysémie du stress=== | ||
+ | Le stress a une forte fréquence dans les textes scientifiques, exemple dans ISTEX : {{formatnum:2748868}}. | ||
+ | |||
+ | Ici nous cherchons à nous intéresser au stress des personnes ou population confrontées aux épidémies virales, et plus précisément celle du Covid-19. | ||
+ | |||
+ | Or le terme stress peut apparaitre dans au moins 3 contextes (pris sur le serveur SRAS). | ||
+ | * Ce qui est ici recherché : | ||
+ | ** {{Explor lien | ||
+ | |wiki= Sante | ||
+ | |area= SrasV1 | ||
+ | |flux= Main | ||
+ | |étape= Exploration | ||
+ | |type= RBID | ||
+ | |clé= ISTEX:875A7EAFBB081FAADFE2E97154343C7A73D68897 | ||
+ | |texte= Community Under Stress: Trust, Reciprocity, and Community Collective Efficacy During SARS Outbreak | ||
+ | }} | ||
+ | * l'action d'un agent biomoléculaire : | ||
+ | ** {{Explor lien | ||
+ | |wiki= Sante | ||
+ | |area= SrasV1 | ||
+ | |flux= Main | ||
+ | |étape= Exploration | ||
+ | |type= RBID | ||
+ | |clé= PMC:6549181 | ||
+ | |texte= SARS-Coronavirus Open Reading Frame-8b triggers intracellular stress pathways and activates NLRP3 inflammasomes | ||
+ | }} | ||
+ | * Une complication liée à la maladie proprement dite : | ||
+ | ** {{Explor lien | ||
+ | |wiki= Sante | ||
+ | |area= SrasV1 | ||
+ | |flux= Main | ||
+ | |étape= Exploration | ||
+ | |type= RBID | ||
+ | |clé= PMC:7112559 | ||
+ | |texte= Posttraumatic stress disorder in convalescent severe acute respiratory syndrome patients: a 4-year follow-up study☆ | ||
+ | }} | ||
+ | |||
+ | ===Critères utilisés sur cette plateforme du curation et d'exploration=== | ||
+ | :Sur ISTEX :<code> (stress AND covid) OR (stress AND ((sars AND virus) OR (mres AND virus) OR H2N2)) OR (phobia AND virus)</code> | ||
+ | :Sur PubMed :<code> (stress OR phobia) AND (covid OR sars OR h2n2 OR influenza)</code> | ||
+ | :Sur PubMed Central :<code> (stress OR phobia) AND covid </code> | ||
+ | :Sur Pascal/Francis : <code> ( phobie ou ( stress et psych* ) ) et virus</code> | ||
+ | :Sur HAL :<code> ( (stress AND psych*) OR phobie ) AND (virus OR sras OR epidem* OR covid)</code> | ||
+ | |||
+ | ==Navigation experte== | ||
+ | {{boîte déroulante | ||
+ | |titre=Aide à la navigation | ||
+ | |contenu= | ||
+ | {{{!}}class="wikitable" | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | !icône | ||
+ | !signification | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=exploration|area=StressCovidV1|wiki=Santé|path=Main/Exploration/index.html|text=Pour aller directement sur le site d'exploration du serveur de la plateforme StressCovidV1}} | ||
+ | {{!}}Cette icône identifie l'étape qui permet de {{Explor lien | ||
+ | |wiki=Santé | ||
+ | |area=StressCovidV1 | ||
+ | |url=Main/Exploration/index.html | ||
+ | |texte=naviguer dans l'ensemble des {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Main|step=Exploration|index=biblio}}}} notices bibliographiques issues des différents corpus. | ||
+ | }} | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=Explor|area=StressCovidV1|wiki=Santé|text=Pour aller sur la page d'introduction du flux principal de confluence}} | ||
+ | {{!}}Cette icône identifie le [[explor:StressCovidV1/Site/fr/Main/index.html|flux principal (Main)]] d'un serveur d'exploration. Ce flux se compose d'une étape de fusion, suivie d'une de curation pour produire le site d'exploration. Au moment de la rédaction de ce paragraphe, il n'y a pas encore de traitements de curation installés sur ce flux. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=corpus|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=Pmc/Corpus/index.html|text=Pour aller, à titre d'exemple, sur l'étape Corpus du flux PubMed Central}} | ||
+ | {{!}}Cette icône identifie la première étape d'un flux. Cette étape se limite généralement à un reformatage en TEI. A noter sur cette étape, les index AutAff qui regroupent les graphies de personnes ayant même patronyme et même initiale de prénom (et qui liste les affiliation associées) : | ||
+ | * Voir cet index pour les flux {{Explor lien|url=PascalFrancis/Corpus/indexHead.php?index=AutAff.i|wiki=Santé|area=StressCovidV1|texte=PascalFrancis}}, {{Explor lien|url=Pmc/Corpus/indexHead.php?index=AutAff.i|wiki=Santé|area=StressCovidV1|texte=PubMed Central}} | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=merge|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=Main/Merge/index.html|text=Pour aller, à titre d'exemple, sur l'étape de dédoublonnage du flux principal}} | ||
+ | {{!}}Cette icône indique une étape de confluence. Dans le cas du flux nommé NCBI, il s'agit surtout de dédoublonner les notices Medline correspondant à des articles dans PubMed Central. On peut comparer le nombre de documents dans l'étape {{Explor lien|url=Ncbi/Merge/index.html|wiki=Santé|area=StressCovidV1|texte=Merge}}, avec la somme des étapes chackpoint des flux {{Explor lien|url=Pmc/Checkpoint/index.html|wiki=Santé|area=StressCovidV1|texte=PubMed Central}} et {{Explor lien|url=PubMed/Checkpoint/index.html|wiki=Santé|area=StressCovidV1|texte=PubMed}}. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|wiki=Santé|type=curation|area=StressCovidV1|path=PubMed/Curation/index.html|text=Pour aller, par exemple, sur l'étape de curation du flux PubMed}} | ||
+ | {{!}}Cette icône indique une phase de curation. En fait, les actions de curation démarrent sur cette étape pointée par cette icône et se poursuivent sur la suivante. Par exemple, pour le flux ISTEX, comparer par exemple le nombre de villes repérées dans l'étape {{Explor lien|wiki=Santé|url=Istex/Curation/index.html|area=StressCovidV1|texte=Curation}} et dans {{Explor lien|wiki=Santé|url=Istex/Checkpoint/index.html|area=StressCovidV1|texte=Checkpoint}}. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=checkpoint|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=PubMed/Checkpoint/index.html}} | ||
+ | {{!}}Cette icône indique une étape de vérification en fin de traitement d'un flux primaire. En fait, elle permet également une analyse partielle d'une thématique à partir du point de vue privilégié par la source. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=zoom|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=2020/Extraction/index.html}} | ||
+ | {{!}}Cette icône introduit un flux de type Zoom. Ce serveur possède deux zooms : un pour les {{Explor lien|wiki=Santé|url=France/index.html|area=StressCovidV1|texte=publications ayant au moins un auteur français}} et un autre {{Explor lien|wiki=Santé|url=2020/index.html|area=StressCovidV1|texte=pour les publications de 2020}}. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=extraction|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=2020/Extraction/index.html}} | ||
+ | {{!}}Cette icône permet d'atteindre l'étape d'extraction d'un flus Zoom. Sur la page de paramétrage du serveur ([[Wicri:StressCovidV1/Paramètres, data]]), un paragraphe contient des [[Wicri:CovidV1/Paramètres, data#Les Zooms|exemples de critères (encore élémentaires) de sélection]]. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}{{Explor icon link|type=analysis|wiki=Santé|area=StressCovidV1|path=2020/Analysis/index.html|text=Pour aller, par exemple, sur l'étape d'analyse du zoom sur la France}} | ||
+ | {{!}}Cette icône permet d'atteindre l'étape finale d'analyse d'un flux de type Zoom, et donc de permettre une analyse plus fine et comparative. Ici le {{Explor lien|wiki=Santé|url=2020/Analysis/index.html|area=StressCovidV1|texte=zoom 2020 est naturellement fondamental}}. | ||
+ | {{!}}- | ||
+ | {{!}}} | ||
+ | }} | ||
+ | |||
+ | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|- | |- | ||
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|Ce flux fusionne {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Area|step=Checkpoint|index=biblio}}}} références issues des étapes précédentes. | |Ce flux fusionne {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Area|step=Checkpoint|index=biblio}}}} références issues des étapes précédentes. | ||
Ce volume est ramené à {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Main|step=Merge|index=biblio}}}} après dédoublonnage par [[DOI]]. | Ce volume est ramené à {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Main|step=Merge|index=biblio}}}} après dédoublonnage par [[DOI]]. | ||
− | Enfin, il est réduit à {{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Main|step=Exploration|index=biblio}}}} par [[clé de dédoublonnage IDAT]]. | + | Enfin, il est réduit à [[A pour volumétrie finale::{{formatnum:{{StressCovidV1, Explor size|stream=Main|step=Exploration|index=biblio}}}}]] par [[clé de dédoublonnage IDAT]]. |
|- | |- | ||
!Zoom | !Zoom | ||
Ligne 66 : | Ligne 166 : | ||
|Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{StressCovidV1, Explor size|stream=2020|step=Analysis|index=biblio}} références. | |Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{StressCovidV1, Explor size|stream=2020|step=Analysis|index=biblio}} références. | ||
|- | |- | ||
+ | |} | ||
+ | |||
+ | ==Projections géographiques== | ||
+ | {{Début 2 colonnes}} | ||
+ | {{Explor plateforme StressCovidV1/Carte France|taille=400}} | ||
+ | {{saut 2 colonnes}} | ||
+ | {{Explor plateforme StressCovidV1/Carte France Regions 2016|taille=400}} | ||
+ | {{Fin 2 colonnes}} | ||
+ | {{Explor plateforme StressCovidV1/Carte Europe}} | ||
+ | {{Explor plateforme StressCovidV1/Carte Monde Europe réunie}} | ||
+ | {{boîte déroulante | ||
+ | |titre= production mondiale (détail Europe) | ||
+ | |contenu= | ||
+ | {{Explor plateforme StressCovidV1/Carte Monde}} | ||
+ | }} | ||
+ | |||
+ | ==Listes de résultats bruts== | ||
+ | ===Pour le corpus dans sa globalité=== | ||
+ | {{Début 2 colonnes}} | ||
+ | ;Auteurs: | ||
+ | {{Explor lien | ||
+ | |wiki=Sante | ||
+ | |area=StressCovidV1 | ||
+ | |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=Author.i | ||
+ | |texte=Lien vers l'index complet (avec classification) | ||
+ | }} | ||
+ | {{StressCovidV1, include|section=auteurs}} | ||
+ | {{Saut 2 colonnes}} | ||
+ | ;;Affiliations: | ||
+ | {{Explor lien | ||
+ | |wiki=Sante | ||
+ | |area=StressCovidV1 | ||
+ | |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffOrg.i | ||
+ | |texte=Lien vers l'index complet | ||
+ | }} | ||
+ | {{StressCovidV1, include|section=org}} | ||
+ | {{Fin 2 colonnes}} | ||
+ | {{Début 3 colonnes}} | ||
+ | ;Pays: | ||
+ | {{Explor lien | ||
+ | |wiki=Sante | ||
+ | |area=StressCovidV1 | ||
+ | |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffPays.i | ||
+ | |texte=Lien vers l'index complet | ||
+ | }} | ||
+ | {{StressCovidV1, include|section=pays}} | ||
+ | {{Saut 3 colonnes}} | ||
+ | ;Régions: | ||
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+ | |wiki=Sante | ||
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+ | |url=Main/Exploration/indexHead.php?index=AffRegion.i | ||
+ | |texte=Lien vers l'index complet | ||
+ | }} | ||
+ | {{StressCovidV1, include|section=region}} | ||
+ | {{Saut 3 colonnes}} | ||
+ | ;Villes: | ||
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+ | |texte=Lien vers l'index complet | ||
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+ | {{StressCovidV1, include|section=ville}} | ||
+ | {{Fin 3 colonnes}} | ||
+ | {{Début 3 colonnes}} | ||
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+ | |texte=Lien vers l'index complet (avec classification) | ||
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+ | ;Revues (ISSN): | ||
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+ | |wiki=Sante | ||
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+ | {{Explor lien | ||
+ | |wiki=Sante | ||
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+ | {{StressCovidV1, include|section=teeft2020}} | ||
+ | {{Fin 3 colonnes}} | ||
+ | |||
==Paramétrage== | ==Paramétrage== | ||
*[[Wicri:StressCovidV1]] - ''introduction'' | *[[Wicri:StressCovidV1]] - ''introduction'' | ||
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*[[Wicri:StressCovidV1/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques'' | *[[Wicri:StressCovidV1/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques'' | ||
*[[Wicri:StressCovidV1/Paramètres, template include]] - ''génération du modèle d'affichage des résultats bruts'' | *[[Wicri:StressCovidV1/Paramètres, template include]] - ''génération du modèle d'affichage des résultats bruts'' | ||
+ | ==Voir aussi== | ||
+ | {{Wicri voir|dec=serveur d'investigation}} | ||
+ | Ce serveur est également exprimé sur {{Wicri lien|wiki=Psychologie}}. | ||
+ | |||
[[Catégorie:Serveur d'exploration]] | [[Catégorie:Serveur d'exploration]] | ||
+ | [[Catégorie:Serveurs d'exploration]] | ||
+ | [[Catégorie:Serveurs Covid]] | ||
+ | [[Catégorie:Serveurs Démo.Istex|Covid]] | ||
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Version actuelle datée du 28 mars 2021 à 07:42
Cette page introduit le « Serveur d'exploration Stress et Covid ». Il contient 6324 documents.
Sommaire
Critères de recherche
Polysémie du stress
Le stress a une forte fréquence dans les textes scientifiques, exemple dans ISTEX : 2 748 868.
Ici nous cherchons à nous intéresser au stress des personnes ou population confrontées aux épidémies virales, et plus précisément celle du Covid-19.
Or le terme stress peut apparaitre dans au moins 3 contextes (pris sur le serveur SRAS).
- Ce qui est ici recherché :
- l'action d'un agent biomoléculaire :
- Une complication liée à la maladie proprement dite :
Critères utilisés sur cette plateforme du curation et d'exploration
- Sur ISTEX :
(stress AND covid) OR (stress AND ((sars AND virus) OR (mres AND virus) OR H2N2)) OR (phobia AND virus)
- Sur PubMed :
(stress OR phobia) AND (covid OR sars OR h2n2 OR influenza)
- Sur PubMed Central :
(stress OR phobia) AND covid
- Sur Pascal/Francis :
( phobie ou ( stress et psych* ) ) et virus
- Sur HAL :
( (stress AND psych*) OR phobie ) AND (virus OR sras OR epidem* OR covid)
icône | signification |
---|---|
Cette icône identifie l'étape qui permet de naviguer dans l'ensemble des 5 969 notices bibliographiques issues des différents corpus. | |
Cette icône identifie le flux principal (Main) d'un serveur d'exploration. Ce flux se compose d'une étape de fusion, suivie d'une de curation pour produire le site d'exploration. Au moment de la rédaction de ce paragraphe, il n'y a pas encore de traitements de curation installés sur ce flux. | |
Cette icône identifie la première étape d'un flux. Cette étape se limite généralement à un reformatage en TEI. A noter sur cette étape, les index AutAff qui regroupent les graphies de personnes ayant même patronyme et même initiale de prénom (et qui liste les affiliation associées) :
| |
Cette icône indique une étape de confluence. Dans le cas du flux nommé NCBI, il s'agit surtout de dédoublonner les notices Medline correspondant à des articles dans PubMed Central. On peut comparer le nombre de documents dans l'étape Merge, avec la somme des étapes chackpoint des flux PubMed Central et PubMed. | |
Cette icône indique une phase de curation. En fait, les actions de curation démarrent sur cette étape pointée par cette icône et se poursuivent sur la suivante. Par exemple, pour le flux ISTEX, comparer par exemple le nombre de villes repérées dans l'étape Curation et dans Checkpoint. | |
Cette icône indique une étape de vérification en fin de traitement d'un flux primaire. En fait, elle permet également une analyse partielle d'une thématique à partir du point de vue privilégié par la source. | |
Cette icône introduit un flux de type Zoom. Ce serveur possède deux zooms : un pour les publications ayant au moins un auteur français et un autre pour les publications de 2020. | |
Cette icône permet d'atteindre l'étape d'extraction d'un flus Zoom. Sur la page de paramétrage du serveur (Wicri:StressCovidV1/Paramètres, data), un paragraphe contient des exemples de critères (encore élémentaires) de sélection. | |
Cette icône permet d'atteindre l'étape finale d'analyse d'un flux de type Zoom, et donc de permettre une analyse plus fine et comparative. Ici le zoom 2020 est naturellement fondamental. |
Ce flux donne accès 3573 documents ISTEX (et 3445 après curation). | |||
Ce flux traite 1145 références ou documents provenance de l'archive PubMed (MEDLINE). Après curation le volume est réduit à 1142. | |||
Ce flux traite 1000 références ou documents provenance de l'archive PubMed Central. Après curation le volume est réduit à 1000. | |||
Ce flux traite 2142 références, Après curation le volume est réduit à 2090. | |||
Ce flux traite 224 références téléchargées de HAL. Après curation le volume est réduit à 223. | |||
Ce flux traite 382 références, dont 88 venant de Francis, et 294 venant de Pascal.
Après curation le volume est réduit à 303. | |||
Flux principal | Ce flux fusionne 6 061 références issues des étapes précédentes.
Ce volume est ramené à 5 988 après dédoublonnage par DOI. Enfin, il est réduit à 5 969 par clé de dédoublonnage IDAT. | ||
Zoom | France | Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 350 références ayant au moins un auteur avec une affiliation française. | |
Zoom | 2020 | Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 854 références. |
Projections géographiques
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Listes de résultats bruts
Pour le corpus dans sa globalité
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Lien vers l'index complet (avec classification)
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Sur le Zoom France
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Sur le Zoom 2020
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Paramétrage
- Wicri:StressCovidV1 - introduction
- Wicri:StressCovidV1/Paramètres, data - génération des données
- Wicri:StressCovidV1/Paramètres, fr - génération de l'interface
- Wicri:StressCovidV1/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques
- Wicri:StressCovidV1/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
- Wicri:StressCovidV1/Paramètres, template include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts
Voir aussi
- Dans le réseau Wicri :
Ceci est la page de référence de « Serveur d'exploration Stress et Covid »
Ce serveur est également exprimé sur Wicri/Psychologie.