Aide:Serveur d'exploration : Différence entre versions
De Wicri Santé
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* Définir un identifiant générique, (''idGénérique'') exemple : CovidChloro | * Définir un identifiant générique, (''idGénérique'') exemple : CovidChloro | ||
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor | cd $WICRI_ROOT/Sante/explor | ||
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mkdir ''idGénérique''.storage | mkdir ''idGénérique''.storage | ||
mkdir CovidChloro.storage | mkdir CovidChloro.storage | ||
| + | cd ''idGénérique''.storage | ||
| + | cd CovidChloro.storage | ||
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| + | ;Test query: | ||
| + | Vérifier la compatibilité | ||
| + | * PubMed (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/) | ||
| + | * NlmPubMedGetCorpusSize -q " ... " | ||
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| + | ;Création du serveur sur machine de dévéloppement. | ||
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| + | Sur ce wiki, de nombreux paramètres sont implicites, la création se réduit à : | ||
| + | NlmPubMedExplorCorpus -d directory -q query -s size -t "Serveur d'exploration ... " | ||
| + | exemple : | ||
| + | NlmPubMedExplorCorpus -d CovidChloroV1 -s 3000 -q "covid and hydroxychloroquine" -t "Serveur d'exploration COVID et hydrochloroquine" | ||
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| + | Vérifier la cohérence des phases de création biblio (nombre de notices) | ||
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| + | ;Sur le wiki Wicri/Santé: | ||
| + | * importer le fichier : exportwiki.xml sous ''idGénérique''.storage/'idGénérique''V1 | ||
Version actuelle datée du 22 mai 2021 à 17:19
Serveur rapide PubMed sur ce wiki
Documentation :
- wicri-outils.fr:Dilib, module Nlm, Commande NlmPubMedGetCorpusSize
- wicri-outils.fr:Dilib, module Nlm, Commande NlmPubMedExplorCorpus
- Machine développement, création directory
- Définir un identifiant générique, (idGénérique) exemple : CovidChloro
cd $WICRI_ROOT/Sante/explor
mkdir idGénérique.storage
mkdir CovidChloro.storage
cd idGénérique.storage
cd CovidChloro.storage
- Test query
Vérifier la compatibilité
- PubMed (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/)
- NlmPubMedGetCorpusSize -q " ... "
- Création du serveur sur machine de dévéloppement.
Sur ce wiki, de nombreux paramètres sont implicites, la création se réduit à :
NlmPubMedExplorCorpus -d directory -q query -s size -t "Serveur d'exploration ... " exemple : NlmPubMedExplorCorpus -d CovidChloroV1 -s 3000 -q "covid and hydroxychloroquine" -t "Serveur d'exploration COVID et hydrochloroquine"
Vérifier la cohérence des phases de création biblio (nombre de notices)
- Sur le wiki Wicri/Santé
- importer le fichier : exportwiki.xml sous idGénérique.storage/'idGénériqueV1
