Discussion:Serveur d'exploration sur la grippe en France : Différence entre versions
De Wicri Santé
imported>Jacques Ducloy |
imported>Jacques Ducloy (→Génération) |
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| Ligne 14 : | Ligne 14 : | ||
tar -xvf GrippeFranceV1.tar | tar -xvf GrippeFranceV1.tar | ||
gzip GrippeFranceV1.tar | gzip GrippeFranceV1.tar | ||
| + | </source> | ||
| + | ===Génération des cartes=== | ||
| + | <source lang="sh"> | ||
| + | EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeFrance.storage/GrippeFranceV1 | ||
| + | export EXPLOR_AREA | ||
| + | export LC_ALL='C' | ||
| + | </source> | ||
| + | |||
| + | <source lang="sh" "> | ||
| + | MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMapsFrance.xml | ||
| + | |||
| + | HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \ | ||
| + | | SxmlCut idx/l \ | ||
| + | | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB_ROOT/Data/Wicri/Canada/localisationProvincesCanada.dict \ | ||
| + | -m Canada -f "Canada location map.svg" -s 650 \ | ||
| + | -a GrippeCanadaV3 -t "Carte Provinces Canada" \ | ||
| + | -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \ | ||
| + | >> $EXPLOR_AREA/exportMapsCanada.xml | ||
| + | |||
| + | MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMapsCanada.xml | ||
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</source> | </source> | ||
Version du 7 juillet 2020 à 16:16
Génération
NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (france[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeFranceV1
tar -cvf GrippeFranceV1.tar GrippeFranceV1
gzip GrippeFranceV1.tar
scp GrippeFranceV1.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/GrippeFrance.storage
- Sur la machine lorexplor
gunzip GrippeFranceV1.tar.gz
tar -xvf GrippeFranceV1.tar
gzip GrippeFranceV1.tar
Génération des cartes
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeFrance.storage/GrippeFranceV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMapsFrance.xml
HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
| SxmlCut idx/l \
| MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB_ROOT/Data/Wicri/Canada/localisationProvincesCanada.dict \
-m Canada -f "Canada location map.svg" -s 650 \
-a GrippeCanadaV3 -t "Carte Provinces Canada" \
-h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
>> $EXPLOR_AREA/exportMapsCanada.xml
MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMapsCanada.xml
