Aide:Serveur d'exploration : Différence entre versions

De Wicri Santé
(Serveur rapide PubMed sur ce wiki)
 
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==Serveur rapide PubMed sur ce wiki==
 
==Serveur rapide PubMed sur ce wiki==
Documentation : [[wicri-outils.fr:Dilib, module Nlm, commande NlmPubMedExplorCorpus]]
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Documentation :  
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* [[wicri-outils.fr:Dilib, module Nlm, Commande NlmPubMedGetCorpusSize]]
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* [[wicri-outils.fr:Dilib, module Nlm, Commande NlmPubMedExplorCorpus]]
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;Machine développement, création directory :
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* Définir un identifiant générique, (''idGénérique'') exemple : CovidChloro
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  cd $WICRI_ROOT/Sante/explor
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  mkdir ''idGénérique''.storage
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        mkdir CovidChloro.storage
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  cd ''idGénérique''.storage
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        cd CovidChloro.storage
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;Test query:
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Vérifier la compatibilité
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* PubMed (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/)
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* NlmPubMedGetCorpusSize  -q " ... "
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;Création du serveur sur machine de dévéloppement.
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Sur ce wiki, de nombreux paramètres sont implicites, la création se réduit à :
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NlmPubMedExplorCorpus -d directory -q query -s size -t "Serveur d'exploration ... "
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  exemple :
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    NlmPubMedExplorCorpus -d CovidChloroV1 -s 3000 -q "covid and hydroxychloroquine" -t "Serveur d'exploration COVID et hydrochloroquine"
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Vérifier la cohérence des phases de création biblio (nombre de notices)
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;Sur le wiki Wicri/Santé:
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* importer le fichier : exportwiki.xml sous ''idGénérique''.storage/'idGénérique''V1

Version actuelle datée du 22 mai 2021 à 16:19

Serveur rapide PubMed sur ce wiki

Documentation :


Machine développement, création directory 
  • Définir un identifiant générique, (idGénérique) exemple : CovidChloro
 cd $WICRI_ROOT/Sante/explor
 mkdir idGénérique.storage
        mkdir CovidChloro.storage
 cd idGénérique.storage
        cd CovidChloro.storage
Test query

Vérifier la compatibilité

Création du serveur sur machine de dévéloppement.

Sur ce wiki, de nombreux paramètres sont implicites, la création se réduit à :

NlmPubMedExplorCorpus -d directory -q query -s size -t "Serveur d'exploration ... "
 exemple :
   NlmPubMedExplorCorpus -d CovidChloroV1 -s 3000 -q "covid and hydroxychloroquine" -t "Serveur d'exploration COVID et hydrochloroquine"

Vérifier la cohérence des phases de création biblio (nombre de notices)

Sur le wiki Wicri/Santé
  • importer le fichier : exportwiki.xml sous idGénérique.storage/'idGénériqueV1