Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version ParkinsonFranceV1
du Serveur d'exploration « La maladie de Parkinson en France (serveur d'exploration) ».
Voir aussi :
La table des paramètres
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Quelques explications
- Cette première table contient les paramètres décrivant le réseau de corpus à fédérer
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| type
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rubrique
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valeur
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| areaCode
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Area
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ParkinsonFranceV1
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| wikiCode
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Area
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Wicri/Sante
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| langs
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Area
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fr
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| listStreams
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Area
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Istex ; PascalFrancis ;PubMed ;Pmc ;Ncbi ;Hal ;Main; Allemagne ; UK ; USA
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| typeStream
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Area/Main
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Explor:MainMerge
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| typeStream
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Area/Istex
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Istex:IstexMulti
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| typeStream
|
Area/PubMed
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Nlm:Medline
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| typeStream
|
Area/Pmc
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Nlm:Pmc
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| typeStream
|
Area/Hal
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Ccsd:HalV3
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| typeStream
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Area/Ncbi
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Nlm:Ncbi
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| typeStream
|
Area/PascalFrancis
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Inist:Stanalyst
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| mergingList
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Area/Main
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Istex ; PascalFrancis ; Ncbi ; Hal
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| mergingList
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Area/Ncbi
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PubMed ; Pmc
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| typeStream
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Area/Allemagne
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Explor:IndexSelect
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| typeStream
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Area/UK
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Explor:IndexSelect
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| typeStream
|
Area/USA
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Explor:IndexSelect
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Corpus
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Quelques explications
- Cette première table décrit les corpus (fichiers) à utiliser.
A noter, pour Hal, 4 corpus ont été téléchargés, compte tenu de la volumétrie.
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| type
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rubrique
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valeur
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| Istex:linkCorpus
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Area/Istex/Corpus
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$EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.hfd
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| importFile
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Area/PubMed/Corpus
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pubmed_result.xml
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| importFile
|
Area/Pmc/Corpus
|
pmc_result.xml
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| Ccsd:teiImportFile
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Area/Hal/Corpus
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api.archives-ouvertes2000.fr.xml ; api.archives-ouvertes2010.fr.xml ; api.archives-ouvertes2005.fr.xml ; api.archives-ouvertes2014.fr.xml
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| Inist:standardImportFile
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Area/PascalFrancis/Corpus
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inistStandard.txt
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| Inist:serveurImportFile
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Area/PascalFrancis/Corpus
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inistServer.txt
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Les Zooms
| type
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étape
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valeur
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| selectOrCommand
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Area/Allemagne/Extraction
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:AffPays.i ; Allemagne
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| selectOrCommand
|
Area/USA/Extraction
|
:AffPays.i ; États-Unis
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| selectOrCommand
|
Area/UK/Extraction
|
:AffPays.i ; Royaume-Uni
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Curation
| type
|
étape
|
valeur
|
| rejectIdnoRBID
|
Area/Pmc/Curation
|
PMC:4835977 ; PMC:4896275 ; PMC:4814584 ; PMC:3404883
|
| rejectIdnoRBID
|
Area/PubMed/Curation
|
pubmed:25679885 ; pubmed:25723210 ; pubmed:26274411 ; pubmed:26799652 ; pubmed:27770180
|
| rejectIdnoRBID
|
Area/Hal/Curation
|
Hal:hal-01407396 ; Hal:hal-01409603 ; Hal:insu-01362303 ; Hal:insu-01362128 ; Hal:insu-01360302
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| rejectIdnoISSN
|
Area/Hal/Curation
|
0031-9007 ; 0067-0049 ; 0305-4616 ; 0370-2693 ; 0550-3213 ; 0927-6505 ; 1126-6708 ; 1433-8351 ; 1434-6044 ; 1550-7998 ; 1367-2630
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| rejectIdnoISSN
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Area/PubMed/Curation
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1434-6044 ; 1079-7114
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| rejectIdnoRBID
|
Area/Istex/Curation
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ISTEX:57D601E1C4978D0ADE15DB2C6C537EC065714984 ; ISTEX:2A973538353DB1DC3FC2FF0EFC7B8F8163BEF138 ; ISTEX:2A973538353DB1DC3FC2FF0EFC7B8F8163BEF138
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Mise en œuvre
- Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Sante/corpus/ParkinsonFrance.storage/ParkinsonFranceV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
- Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:ParkinsonFranceV1/Paramètres, data"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki
Si reprise
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
