Wicri:DeniGrossesseV2

Cette page introduit les aspects techniques de la version DeniGrossesseV2 du « Serveur d'exploration multibase (NCBI) sur le déni de grossesse  ».

Voir aussi :

• Wicri:DeniGrossesseV2/Paramètres, data - génération des données
• Wicri:DeniGrossesseV2/Paramètres, fr - génération de l'interface

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Génération des pages wikis

   ExplorGenerAreaPages -a DeniGrossesseV2 -g DeniGrossesse -w wicri-sante.fr -s Ncbi \
   -t "Serveur d'exploration multibase (NCB) sur le déni de grossesse "

Initialisation

mkdir DeniGrossesseV2
mkdir DeniGrossesseV2/Import

Récuparation des corpus

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/?term=denial+AND+pregnancy

Lien vers DeniGrossesseV1 pour PubMed

Importation des paramètres de génération

WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:DeniGrossesseV2/Paramètres, data"\
      > DeniGrossesseV2/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Importation des paramètres de navigation

WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:DeniGrossesseV2/Paramètres, fr"\
      > DeniGrossesseV2/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

Génération de la plateforme

sh DeniGrossesseV2/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d DeniGrossesseV2
make -f DeniGrossesseV2/bin/area.mk
sh DeniGrossesseV2/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd DeniGrossesseV2
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 
rm Import.tar.gz
tar -cvf Import.tar Import
gzip Import.tar
cd ..

Transfert vers la machine LorExplor

scp Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/DeniGrossesse.storage/DeniGrossesseV2.new
scp Data.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/DeniGrossesse.storage/DeniGrossesseV2.new
scp Import.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/DeniGrossesse.storage/DeniGrossesseV2.new

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

cd ... corpus

Préparation

Création mkdir DeniGrossesse cd DeniGrossesse mkdir DeniGrossesseV2 cd DeniGrossesseV2 Transfert par FileZilla Tranférer les fichiers Site.tar.gz, Import.tar.gz, Data.tar.gz de DeniGrossesseV2 (émétteur) vers DeniGrossesseV2 (cible).

Mise à jour cd DeniGrossesse mkdir DeniGrossesseV2.new cd DeniGrossesseV2.new Transfert par FileZilla Tranférer les fichiers Site.tar.gz, Import.tar.gz, Data.tar.gz de DeniGrossesseV2 (émetteur) vers DeniGrossesseV2.new (cible).

Installation

rm -rf Site/* 
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 
rm -rf Data/* 
gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar