1367-4803 < 1367-4811 < 1367-5435

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List of bibliographic references indexed by 1367-4811

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Ident.	Authors (with country if any)	Title
000002 (2020)	Jing Xu [République populaire de Chine] ; Han Zhang [République populaire de Chine] ; Jinfang Zheng [États-Unis] ; Philippe Dovoedo [États-Unis] ; Yanbin Yin [États-Unis]	eCAMI: simultaneous classification and motif identification for enzyme annotation.
000039 (2020)	Antoine Limasset [Belgique] ; Jean-François Flot [Belgique] ; Pierre Peterlongo [France]	Toward perfect reads: self-correction of short reads via mapping on de Bruijn graphs.
000081 (2020)	Gaëtan Benoit [France] ; Mahendra Mariadassou [France] ; Stéphane Robin [France] ; Sophie Schbath [France] ; Pierre Peterlongo [France] ; Claire Lemaitre [France]	SimkaMin: fast and resource frugal de novo comparative metagenomics.
000134 (2020)	Jiang Hu [République populaire de Chine] ; Junpeng Fan [République populaire de Chine] ; Zongyi Sun [République populaire de Chine] ; Shanlin Liu [République populaire de Chine]	NextPolish: a fast and efficient genome polishing tool for long-read assembly.
000187 (2020)	Jouni Sirén [États-Unis] ; Erik Garrison [Royaume-Uni] ; Adam M. Novak [États-Unis] ; Benedict Paten [États-Unis] ; Richard Durbin [Royaume-Uni]	Haplotype-aware graph indexes.
000195 (2020)	Christopher Pockrandt [États-Unis] ; Mai Alzamel [Royaume-Uni] ; Costas S. Iliopoulos [Royaume-Uni] ; Knut Reinert [Allemagne]	GenMap: Ultra-fast Computation of Genome Mappability.
000318 (2019)	Peng Jiang [République populaire de Chine] ; Jie Luo [République populaire de Chine] ; Yiqi Wang [République populaire de Chine] ; Pingji Deng [République populaire de Chine] ; Bertil Schmidt ; Xiangjun Tang [République populaire de Chine] ; Ningjiang Chen [République populaire de Chine] ; Limsoon Wong [Singapour] ; Liang Zhao [République populaire de Chine]	kmcEx: memory-frugal and retrieval-efficient encoding of counted k-mers.
000397 (2019)	Dennis C. Wylie [États-Unis] ; Hans A. Hofmann [États-Unis] ; Boris V. Zemelman [États-Unis]	SArKS: de novo discovery of gene expression regulatory motif sites and domains by suffix array kernel smoothing.
000411 (2019)	Benjamin Linard [France] ; Krister Swenson [France] ; Fabio Pardi [France]	Rapid alignment-free phylogenetic identification of metagenomic sequences.
000492 (2019)	Subrata Saha [États-Unis] ; Jethro Johnson [États-Unis] ; Soumitra Pal [États-Unis] ; George M. Weinstock [États-Unis] ; Sanguthevar Rajasekaran [États-Unis]	MSC: a metagenomic sequence classification algorithm.
000500 (2019)	Guillaume Marçais [États-Unis] ; Dan Deblasio [États-Unis] ; Prashant Pandey [États-Unis] ; Carl Kingsford [États-Unis]	Locality-sensitive hashing for the edit distance
000507 (2019)	Sebastian Deorowicz [Pologne] ; Adam Gudys [Pologne] ; Maciej Dlugosz [Pologne] ; Marek Kokot [Pologne] ; Agnieszka Danek [Pologne]	Kmer-db: instant evolutionary distance estimation.
000570 (2019)	Yuansheng Liu [Australie] ; Leo Yu Zhang [Australie] ; Jinyan Li [Australie]	Fast detection of maximal exact matches via fixed sampling of query K-mers and Bloom filtering of index K-mers.
000633 (2019)	Abdurrahman Elbasir [Qatar] ; Balasubramanian Moovarkumudalvan [Qatar] ; Khalid Kunji [Qatar] ; Prasanna R. Kolatkar [Qatar] ; Raghvendra Mall [Qatar] ; Halima Bensmail [Qatar]	DeepCrystal: a deep learning framework for sequence-based protein crystallization prediction.
000688 (2019)	Sridevi Maharaj [États-Unis] ; Brennan Tracy [États-Unis] ; Wayne B. Hayes [États-Unis]	BLANT-fast graphlet sampling tool.
000804 (2018)	Prashant Pandey [États-Unis] ; Michael A. Bender [États-Unis] ; Rob Johnson [États-Unis] ; Rob Patro [États-Unis] ; Bonnie Berger	Squeakr: an exact and approximate k-mer counting system.
000A57 (2018)	Guillaume Marçais [États-Unis] ; Dan Deblasio [États-Unis] ; Carl Kingsford [États-Unis]	Asymptotically optimal minimizers schemes
000A98 (2018)	Dilip A. Durai [Allemagne] ; Marcel H. Schulz [Allemagne]	In silico read normalization using set multi-cover optimization
000B08 (2017)	Anuj Gupta [États-Unis] ; I King Jordan [États-Unis] ; Lavanya Rishishwar [États-Unis]	stringMLST: a fast k-mer based tool for multilocus sequence typing.
000B09 (2017)	Hamid Mohamadi [Canada] ; Hamza Khan [Canada] ; Inanc Birol [Canada]	ntCard: a streaming algorithm for cardinality estimation in genomics data
000B10 (2017)	Jochen Kruppa ; Erhard Van Der Vries ; Wendy K. Jo ; Alexander Postel [Allemagne] ; Paul Becher [Allemagne] ; Albert Osterhaus ; Klaus Jung	kmerPyramid: an interactive visualization tool for nucleobase and k-mer frequencies.

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