Wicri:BernheimV1

Cette page introduit les aspects techniques de la version BernheimV1 du « Serveur d'exploration Hippolyte Bernheim ».

Voir aussi :

• Wicri:BernheimV1/Paramètres, data - génération des données
• Wicri:BernheimV1/Paramètres, fr - génération de l'interface
• Wicri:BernheimV1/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques
• Wicri:BernheimV1/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
• Wicri:BernheimV1/Paramètres, template include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis

 IstexGenerAreaPages \
       -a BernheimV1   \
       -m   \
       -g Bernheim   \
       -p Psychologie   \
       -w wicri-psycho.fr  \
       -W Wicri/Psychologie   \
       -s PascalFrancis   \
       -s Hal   \
       -s PubMed   \
       -s Pmc   \
       -s Ncbi   \
       -q "bernheim AND (nancy OR charcot OR salpetriere OR hypno* OR hippolyte)"   \
       -t "Serveur d'exploration Hippolyte Bernheim"

Définition $EXPLOR_AREA

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

Création des répertoires

mkdir $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Sur la machine LorExplor

newgrp wicri
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh

Définition $EXPLOR_AREA

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

Création des répertoires

mkdir $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import
mkdir $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus
mkdir $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import

Construction du Repository ISTEX

En cas de reprise au niveau du téléchargement

rm -rf $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import/IstexRepository.h*

IstexGetCorpus -q "bernheim AND (nancy OR charcot OR salpetriere OR hypno* OR hippolyte)" -s 2000    -l          \
     | IstexGetCorpusById -A                  \
     | SxmlUnIndent                           \
     | HfdBuild -bh    $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import/IstexRepository

Vérification

 cat $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import/IstexRepository.hcs
 HfdCat $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import/IstexRepository.hfd | wc

Construction des métadonnées ISTEX

ISTEX, création du HFD Corpus Biblio

En cas de reprise:

rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*

Construction corpus biblio

HfdCat $WICRI_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.corpus/Import/IstexRepository.hfd   \
  | SgmlFast -c1                                 \
  | IstexToTei                                   \
  | IstexCleanFullText                           \
  | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus  -c ISTEX -s Corpus -S Istex \
  | HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

Préparation transfert

cd $EXPLOR_AREA
tar -cvf Import.tar Import/

Sur la machine de développement

scp $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1/Import.tar .
tar -xvf Import.tar

Téléchargement des autres corpus

PubMed

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Requête :

bernheim AND (nancy OR charcot OR salpetriere OR hypno* OR hippolyte)

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pubmed_result.xml

PubMed Central

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

Requête :

bernheim AND (nancy OR charcot OR salpetriere OR hypno* OR hippolyte)

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pmc_result.xml

PascalFrancis

Site :http://stan2.demo.inist.fr/fr/

Requête :

 ( ab = bernheim ) ou ( ti = bernheim )

Télécharger avec les onglets : Serveur / SGML / SGML / LF

• résultat dans $EXPLOR_AREA/Import

 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistServer.txt 

Télécharger avec les onglets : SGML / SGML / SGML / LF

• résultat dans $EXPLOR_AREA/Import

 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistStandard.txt 

Hal

Sur : https://hal.archives-ouvertes.fr/

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération

WicriGetPage -l wicri-psycho.fr -p "Wicri:BernheimV1/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh

ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk

Importation des paramètres de navigation

WicriGetPage -l wicri-psycho.fr -p "Wicri:BernheimV1/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

Génération de l'interface 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/istexMetadata.hcs Import/istexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar

Transfert vers la machine LorExplor

scp $ISTEX_PAR Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.new
scp $ISTEX_PAR  Data.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.new
scp $ISTEX_PAR  ImportMetadata.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Psychologie/explor/Bernheim.storage/BernheimV1.new

Sur la machine cible

Installation

cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar

gunzip ImportMetadata.tar.gz 
tar -xvf ImportMetadata.tar 
gzip ImportMetadata.tar 

cd Data/Istex/Corpus 
rm biblio.hcs 
rm biblio.hfd 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hcs biblio.hcs 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hfd biblio.hfd