Dilib, module Nlm, flux Pmc

Bibliothèque Dilib (ressources numériques) Module Nlm

Cette page introduit les outils utilisés relatifs à des flux de données provenant la base Medline de la NLM (interface PubMed), et plus particulièrement pour un espace d'exploration (Dilib, module Explor).

Liste des modules Dilib Noyau Unix... CharSet, Buffer, , RegExp, StrDict, Utf8 Modules SRI, infométrie Explor, Hfd, Infometrics, Index, Tei Modules Sxml SxmlNode, SxmlProc, SxPath, SgmlFast Flux de données ArXiv, Atilf, BnF, Ccsd, Getty, Inist, Inra, Istex, Loria, Marc, Nlm, Wicri Interfaces avec logiciels MediaWiki Installation, versions... Dilib V0.6.3, DilibMake, installation et compilation   Module Nlm Paramétrage flux MEDLINE/PubMed data, en, fr Paramétrage flux PubMed Central data, en, fr Paramétrage flux NCBI data, en, fr Dilib, module Nlm, outils MEDLINE/PubMed NlmPubMedGetCorpus, NlmPubMedGetCorpusSize, NlmPubMedGetCorpusById, NlmPubMedFlashCorpus, NlmPubMedExplorCorpus, NlmPubMedExplorCorpusWithPmc, NlmPubMed2Wicri PubMed Central NlmPmcResultSelect, NlmPmcGetCorpusById, NlmPmcAffiliationSetPays Medical Subject Headings (MeSH) NlmMeshFreToWicri

Import de données

Téléchargement

Pour décharger un corpus PubMed Central, il faut utiliser l'interface suivante sur le site du NCBI :

• http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

Lorsque le corpus est prêt, il faut utiliser l'onglet « Send To » (en haut à droite) et choisir le mode File avec le format XML.

Conversion vers les serveurs

Pour convertir en Stream Xml, les commandes Utf8FromHexEntity et SxmlUnIndent sont disponibles.

   | NlmPmc2Sxml   \
   | Utf8FromHexEntity  \
   | SxmlUnIndent  \

Conversion vers les wikis

• NlmPmc2Wicri