Dilib, module Nlm, flux Medline, Explor data
De Wicri Outils
  Module Nlm |
Cette page introduit les paramètres de génération des données d'un espace d'exploration (Dilib, module Explor) relatifs à des flux de données provenant la base Medline de la NLM (interface PubMed).
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Liste des modules Dilib
Module Nlm
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Les flux de données
- MedLineSolo convient pour des applications à un seul flux (exemple : wicri-lor.fr:Wicri:MetzPubMedV1}
Définitions
| type | item | value |
|---|---|---|
| list#listSteps | Nlm:MedlineSolo | Corpus ; Curation ; Exploration |
| list#listSteps | Nlm:Medline | Corpus ; Curation ; Checkpoint |
| list#listSteps | Nlm:PubMedBig | Corpus ; Curation ; Checkpoint |
| list#listSteps | Nlm:MedlineSoloBig | Corpus ; Curation ; Exploration |
| list#listIndexes | Nlm:Medline/Corpus | ISSN.i ; RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i; AutAff.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSolo/Corpus | ISSN.i ; RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i; AutAff.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSoloBig/Corpus | RBID.i ; ISSN.i ; Author.i ; MedMesh.i; AutAff.i |
| list#listIndexes | Nlm:PubMedBig/Corpus | RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i; AutAff.i |
| list#listIndexes | Nlm:Medline/Curation | RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i ; AffPays.i ; AffPaysInc.i ; AffRegion.i ; AffVille.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSolo/Curation | RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i ; AffPays.i ; AffPaysInc.i ; AffRegion.i ; AffVille.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSoloBig/Curation | RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i ; AffPays.i ; AffPaysInc.i ; AffRegion.i ; AffVille.i |
| list#listIndexes | Nlm:PubMedBig/Curation | RBID.i ; Author.i ; MedMesh.i ; AffPays.i ; AffPaysInc.i |
| list#listIndexes | Nlm:PubMedBig/Checkpoint | RBID.i ; PMID.i ; ISSN.i ; Author.i ; AffPays.i ; MedMesh.i ; Mesh.i ; AffRegion.i ; AffVille.i ; AffOrg.i ; AffRegInc.i |
| list#listIndexes | Nlm:Medline/Checkpoint | RBID.i ; PMID.i ; ISSN.i ; Author.i ; AffPays.i ; MedMesh.i ; Mesh.i ; AffRegion.i ; AffVille.i ; AffOrg.i ; AffRegInc.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSolo/Exploration | RBID.i ; ISSN.i ; Author.i ; AffPays.i ; AffRegion.i ; AffVille.i ; AffOrg.i ; Mesh.i ; KwdEn.i ; MeshFr.i ; KwdFr.i ; Title.i ; AbsEn.i ; AffRegInc.i |
| list#listIndexes | Nlm:MedlineSoloBig/Exploration | RBID.i ; ISSN.i ; Author.i ; AffPays.i ; MedMesh.i ; Mesh.i ; KwdEn.i ; AffRegion.i ; AffVille.i ; AffOrg.i ; AffRegInc.i |
| list#listAssoc | Nlm:Medline/Analysis | Author.a |
| list#listCluster | Nlm:Medline/Analysis | Author.cf ; Author.cc |
| list#listAssoc | Nlm:MedlineSolo/Exploration | Author.a ; TitleEn.a ; KwdFr.a |
| list#listCluster | Nlm:MedlineSolo/Exploration | Author.cc ; Author.cf ; TitleEn.cc ; TitleEn.cf ; KwdFr.cc ; KwdFr.cf |
| hasType | Nlm:Medline/*/MedMesh.i | Nlm:MedMesh |
| hasType | Nlm:MedlineSolo/*/MedMesh.i | Nlm:MedMesh |
| hasType | Nlm:MedlineSoloBig/*/MedMesh.i | Nlm:MedMesh |
| hasType | Nlm:PubMedBig/*/MedMesh.i | Nlm:MedMesh |
| hasType | Nlm/Corpus/AutAff.i | Nlm:AutAff |
| hasType | */*/Mesh.i | Nlm:Mesh |
| hasType | */*/MeshFr.i | Nlm:MeshFr |
| list#indexType | Nlm:MedMesh | sxPath ; record/pubmed/MedlineCitation/MeshHeadingList/MeshHeading/DescriptorName/1 |
| list#indexType | Nlm:Mesh | sxPath ; record/TEI/teiHeader/profileDesc/textClass/keywords@scheme=MESH@xml:lang=en/term/1 |
| list#indexType | Nlm:MeshFr | sxPath ; record/TEI/teiHeader/profileDesc/textClass/keywords@scheme=MESH@xml:lang=fr/term/1 |
| list#indexType | Nlm:AutAff | builtin |
Paramètres pour le fonctionnement du générateur
Génération des shells et pages Html ou php
| type | item | value |
|---|---|---|
| generDataShells | Nlm:Medline | NlmMedlineExplorDataShells |
| generSiteHtmlPhp | Nlm:Medline | NlmMedlineExplorSiteHtmlPhp |
| generSiteShell | Nlm:Medline | NlmMedlineExplorSiteShell |
| generDataShells | Nlm:MedlineSolo | NlmMedlineExplorDataShells |
| generSiteHtmlPhp | Nlm:MedlineSolo | NlmMedlineExplorSiteHtmlPhp |
| generSiteShell | Nlm:MedlineSolo | NlmMedlineExplorSiteShell |
| generDataShells | Nlm:MedlineSoloBig | NlmMedlineExplorDataShells |
| generSiteHtmlPhp | Nlm:MedlineSoloBig | NlmMedlineExplorSiteHtmlPhp |
| generSiteShell | Nlm:MedlineSoloBig | NlmMedlineExplorSiteShell |
| generDataShells | Nlm:PubMedBig | NlmMedlineExplorDataShells |
| generSiteShell | Nlm:PubMedBig | NlmMedlineExplorSiteShell |
| generSiteHtmlPhp | Nlm:PubMedBig | NlmMedlineExplorSiteHtmlPhp |
Déclaration des tables d'options multilingues
| type | item | value |
|---|---|---|
| langTable/en | Nlm:Medline | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.en.tab |
| langTable/fr | Nlm:Medline | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.fr.tab |
| langTable/en | Nlm:MedlineSolo | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.en.tab |
| langTable/fr | Nlm:MedlineSoloBig | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.fr.tab |
| langTable/en | Nlm:MedlineSoloBig | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.en.tab |
| langTable/fr | Nlm:MedlineSolo | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.fr.tab |
| langTable/en | Nlm:PubMedBig | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.en.tab |
| langTable/fr | Nlm:PubMedBig | $DILIB/data/Nlm/MedlineExplorParam.fr.tab |
Operations
WicriGetPage -l wicri-outils.fr -p "Dilib, module Nlm, flux Medline, Explor data" \
> $DILIB_IMPORT/Nlm/Data/NlmMedlineExplorParam.data.wiki
Voir aussi
- Sur ce wiki
- Bases test dans le réseau Wicri
- wicri-sarre.fr:Serveur d'exploration sur la Sarre dans PubMed - 130 documents
- wicri-bois.fr:Wicri:FraxinusV2 - 600 documents
- wicri-lor.fr:Wicri:MetzPubMedV1 - version monoflux
- wicri-europe.fr:Wicri:KazakhstanV2 - en association avec Pascal
