Wicri:ExplorPubmed/Modèles/Paramètres, main
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Révision datée du 25 juillet 2020 à 18:18 par imported>Jacques Ducloy (→Installation de la nouvelle version)
Cette page introduit les aspects techniques de la version %areaCode du « %areaTitle ».
Voir aussi :
- Wicri:%areaCode/Paramètres, data - génération des données
- Wicri:%areaCode/Paramètres, fr - paramètres de navigation.
- Wicri:%areaCode/Paramètres, size - génération des modèles liés aux valeurs numériques
- Wicri:%areaCode/Paramètres, maps - génération de cartes géographiques
- Wicri:%areaCode/Paramètres, include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts
Initialisation
Ce serveur a probablement été initialisé par les commandes :
cd $WICRI_ROOT/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d %areaCode \
-q "%areaQuery" -s 2000 \
-t "%areaTitle"
Installation
Installation des données
Dans tous les cas, sur le site LorExplor, le serveur sera installé sur le répertoire :
$WICRI_ROOT/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
Sur le site LorExplor il n'y a rien à faire à l'issue de la commande NlmPubMedExplorCorpus
Génération à partir d'une machine locale
- Sur la machine locale
tar -cvf %areaCode.tar %areaCode
gzip %areaCode.tar
scp %areaCode.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
- Sur la machine LorExplor
cd $WICRI_ROOT/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
gunzip %areaCode.tar.gz
tar -xvf %areaCode.tar
gzip %areaCode.tar
Définition des liens pour visibilité Web
- Sur la machine LorExplor
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh
cd $WICRI_ROOT/%wikiPath/explor
ln -s %areaGenericName.storage/%areaCode .
cd /applis/lorexplor/www/html/Wicri/%wikiPath/explor
ln -s $WICRI_ROOT/%wikiPath/explor/%areaCode .
Installation des pages wikis
Importer les pages suivantes à partir du répertoire .../Wicri/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
:
- wikiParam.xml, exportSize.xml, exportInclude.xml, exportMaps.xml
Créer la page %areaTitle à partir de :
- mainPage.wiki
Mise à jour
Définition EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage/%areaCode
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Chargement d'une nouvelle version des données
cd $EXPLOR_AREA
mkdir Import/Archive
mv Import/pubmed_result.xml Import/Archive/.
NlmPubMedGetCorpus -q "%areaQuery" -s %areaSize -x > Import/pubmed_result.xml
Restauration complète
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
cat $EXPLOR_AREA/Import/ListeCles.wiki \
| MediaWikiCleanTable \
| MediaWikiTable2SxmlRowCol \
| MediaWikiTableTransformCol -t 123 -T 4 \
> $EXPLOR_AREA/Input/ListKey.xml
ExplorGenerTemplateSize -f $EXPLOR_AREA/Input/ListKeys.xml > $EXPLOR_AREA/exportSize.xml
MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
source $EXPLOR_AREA/FixBin/AreaGenerWikiTemplateMaps.sh >> $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMaps.xml
MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
source $EXPLOR_AREA/FixBin/AreaGenerWikiTemplateInclude.sh >> $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportInclude.xml
Installation de la nouvelle version
- Sur la machine LorExplor
source /applis/lorexplor/Dilib/init.sh
cd /applis/lorexplor/www/html/Wicri/%wikiPath/explor/%areaGenericName.storage
rm %areaCode.tar.gz
Voir aussi
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