Dilib, module Nlm, commande NlmPubMed2Wicri

Bibliothèque Dilib (ressources numériques) Module Nlm

Cette commande permet de générer des pages wikis à partir de notices PubMed .

Liste des modules Dilib Noyau Unix... CharSet, Buffer, , RegExp, StrDict, Utf8 Modules SRI, infométrie Explor, Hfd, Infometrics, Index, Tei Modules Sxml SxmlNode, SxmlProc, SxPath, SgmlFast Flux de données ArXiv, Atilf, BnF, Ccsd, Getty, Inist, Inra, Istex, Loria, Marc, Nlm, Wicri Interfaces avec logiciels MediaWiki Installation, versions... Dilib V0.6.3, DilibMake, installation et compilation   Module Nlm Paramétrage flux MEDLINE/PubMed data, en, fr Paramétrage flux PubMed Central data, en, fr Paramétrage flux NCBI data, en, fr Dilib, module Nlm, outils MEDLINE/PubMed NlmPubMedGetCorpus, NlmPubMedGetCorpusSize, NlmPubMedGetCorpusById, NlmPubMedFlashCorpus, NlmPubMedExplorCorpus, NlmPubMedExplorCorpusWithPmc, NlmPubMed2Wicri PubMed Central NlmPmcResultSelect, NlmPmcGetCorpusById, NlmPmcAffiliationSetPays Medical Subject Headings (MeSH) NlmMeshFreToWicri

Synopsis

NlmPubMed2Wicri -a area [ -w wiki ] [-t traceLevel ]

Exemples

Avec le serveur sur la grippe en Belgique

Contexte : voir wicri-sante.fr:Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique <source lang="sh"> EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBelgique.storage/GrippeBelgiqueV2

echo $EXPLOR_AREA ls $EXPLOR_AREA

HfdIndexSelect -h $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/RBID.i \

               -Sk "pubmed:22994451" \
        | HfdSelect -Kh $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/biblio.hfd \
        | ./testDilib/NlmPubMed2Wicri -a BelgiqueV2

Voir aussi

La création du code source a été faite en ligne, voir :

• Wicri:Dilib source, module Nlm, commande NlmPubMed2Wicri