Wicri:TitanToxFraV1

Cette page introduit la partie technique d'un serveur d'exploration sur la recherche française sur la toxicité du titane.

• Pour accéder au serveur

Voir aussi :

• Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, data - génération des données
• Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, fr - génération de l'interface
• Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques
• Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
• Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, template include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis

 ExplorGenerAreaPages \
       -g TitanToxFra   \
       -a TitanToxFraV1   \
       -m   \
       -p Wicri/France   \
       -w wicri-france.fr  \
       -W Wicri/France   \
       -s Pmc   \
       -t "Serveur d'exploration sur la toxicité du titane"

Définition $EXPLOR_AREA

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/France/corpus/TitanToxFra.storage/TitanToxFraV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

Récupération des corpus

Il s'agit d'un mini corpus d'entrainement (83 documents).

Critère de recherche sur PubMed Central :

(France[Affiliation]) AND titanium AND toxicity

Les paramètres de génération sont décrits dans les pages :

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération

WicriGetPage -l wicri-france.fr -p "Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh

ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk

Importation des paramètres de navigation

WicriGetPage -l wicri-france.fr -p "Wicri:TitanToxFraV1/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

Génération de l'interface 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

génération des FTP

cd TitanToxFraV1
rm Data.tar.gz
rm Site.tar.gz
rm Import.tar.gz

tar -cvf Data.tar Data
tar -cvf Site.tar Site
tar -cvf Import.tar Import

gzip Data.tar
gzip Site.tar
gzip Import.tar

cd ..

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/France/corpus/TitanToxFra.storage/TitanToxFraV1.20161013

Si nouveau code générique :

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/France/corpus/TitanToxFra.storage

Création du répertoire plateforme

mkdir $EXPLOR_AREA

Transfert par FileZilla

Transférer les fichiers Site.tar.gz, Import.tar.gz, Data.tar.gz de TitanToxFraV1 (émetteur) vers TitanToxFraV1 (cible).

Installation

cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar