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Wicri:LrgpV1

De Wicri Lorraine

Cette page introduit les aspects techniques de la version LrgpV1 du « Serveur d'exploration sur le LRGP ».

Voir aussi :

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis
source IstexGetCorpusSize -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp OR ensic)"
 IstexGenerAreaPages \
       -a LrgpV1   \
       -m   \
       -g Lrgp   \
       -p Wicri/Lorraine   \
       -w wicri-lor.fr  \
       -W Wicri/Lorraine   \
       -s PascalFrancis   \
       -s Hal   \
       -s PubMed   \
       -s Pmc   \
       -s Ncbi   \
       -z UK   \
       -z USA   \
       -z Allemagne   \
       -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp)"   \
       -t "Serveur d'exploration sur le LRGP"
Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Europe/France/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Définition $EXPLOR_AREA sur machine LorExplor
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Europe/France/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1.new
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Création des répertoires
mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Lorraine/corpus/Lrgp.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Construction du Repository ISTEX

En cas de reprise au niveau du téléchargement 

rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.h*

IstexGetCorpus -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp)" -s 2500 -A  -i $ISTEX_ID -p $ISTEX_PASS   \
     | IstexToSxml     \
     | HfdBuild -bh    $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository

IstexGetCorpus -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp)" -s 2500 -A    \
     | IstexToSxml     \
     | HfdBuild -bh    $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository

Vérification 

HfdCat  $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd | wc
Dans les locaux de l'INIST
IstexGetCorpus -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp OR ensic)" -s 3000 -A   \
     | IstexToSxml     \
     | HfdBuild -bh    $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository
Sur la machine LorExplor

En cas de reprise au niveau du téléchargement 

rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.h*

time IstexGetCorpus -q "(lsgc OR dcpr OR ltmp OR gemico OR lrgp OR ensic)" -s 3000 -l \
    | IstexGetCorpusById -A                  \
     | SxmlUnIndent                            \
     | HfdBuild -bh    $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository
Vérification
SxmlSelect -g hfd/nrec/1 -p @g1 < $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hcs

HfdCat Import/IstexRepository.hfd | SxmlIndent | grep "</istex>" | wc
Création FTP
tar -cvf repository.tar Import/IstexRepository.*
gzip repository.tar

Récupération repository

scp $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Europe/France/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1.new/repository.tar.gz  .

gunzip repository.tar.gz
tar -xvf repository.tar

Construction des métadonnées ISTEX

ISTEX, création du HFD Corpus Biblio
En cas de reprise:
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*
Construction corpus biblio
HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd   \
  | SgmlFast -c1                                 \
  | IstexToTei                                   \
  | IstexCleanFullText                           \
  | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus  -c ISTEX -s Corpus -S Istex \
  | HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

Téléchargement des autres corpus

PubMed

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Requête :

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pubmed_result.xml

PubMed Central

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

Requête :

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pmc_result.xml

PascalFrancis

Site :http://stan2.demo.inist.fr/fr/

Requête :

Télécharger avec les onglets : Serveur / SGML / SGML / LF

  • résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistServer.txt

Télécharger avec les onglets : SGML / SGML / SGML / LF

  • résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistStandard.txt
Hal

Sur : https://hal.archives-ouvertes.fr/

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-lor.fr -p "Wicri:LrgpV1/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh

ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
Importation des paramètres de navigation
WicriGetPage -l wicri-lor.fr -p "Wicri:LrgpV1/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
Génération de l'interface 
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/istexMetadata.hcs Import/istexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar

Transfert vers la machine LorExplor

Transfert par scp
scp $ISTEX_PAR Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Europe/France/GrandEst/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1.new
scp Data.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Europe/France/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1.new
scp ImportMetadata.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Europe/France/Lorraine/explor/Lrgp.storage/LrgpV1.new

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible 

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Lorraine/corpus/Lrgp.storage/LrgpV1.20160624

Si nouveau code générique : 

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Lorraine/corpus/Lrgp.storage

Création du répertoire plateforme 

mkdir $EXPLOR_AREA
Transfert par FileZilla

Transférer les fichiers Site.tar.gz, Data.tar.gz de LrgpV1 (émetteur) vers LrgpV1 (cible).

Installation
cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar

gunzip ImportMetadata.tar.gz 
tar -xvf ImportMetadata.tar 
gzip ImportMetadata.tar 

cd Data/Istex/Corpus 
rm biblio.hcs 
rm biblio.hfd 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hcs biblio.hcs 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hfd biblio.hfd
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