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Serveur d'exploration Perca fluviatilis : Différence entre versions

De Wicri Eau
imported>Jacques Ducloy
(Test ProdInra)
(Base de test pour ProdInra)
 
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Cette page introduit le « [[Serveur d'exploration Perca fluviatilis]] » ([[Perche commune]]).
 
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{{Wicri travaux|texte=Ce serveur a été porté, depuis le site de l'Université de Lorraine, dans son état initial, sans mise à niveau technique. En particulier les liens géographiques ne fonctionnent pas}}
 
{{Wicri démonstration
 
{{Wicri démonstration
 
  | texte=L'expression ''Perca fluviatilis'' s'avérant assez précise en recherche d'information, ce sujet est utilisé, dans les projets ISTEX et LorEplor, pour constituer une application test d'enrichissement de corpus.
 
  | texte=L'expression ''Perca fluviatilis'' s'avérant assez précise en recherche d'information, ce sujet est utilisé, dans les projets ISTEX et LorEplor, pour constituer une application test d'enrichissement de corpus.
  
Cette expérience complète une application de même type autour d'une revue medicale (voir la plateforme [[wicri-sante.fr:Movement Disorders (revue)|Movement Disorders sir Wicri/Santé]]).   
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Cette expérience complète une application de même type autour d'une revue medicale (voir la plateforme [[wicri-sante.fr:Movement Disorders (revue)|Movement Disorders sur Wicri/Santé]]).   
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Vous trouverez sur cette page 4 étapes dans ce travail d’enrichissement :
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* La première ([[#Plateforme Istex seul|PercaFluV1 - Istex seul]] - juin 2015) repose exclusivement sur ISTEX. Elle intègre des fonctions d'homogénéisation d'éléments géographiques (pays, régions).
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* La deuxième (PercaFluV2 - 5 décembre 2015) fusionne un ensemble de flux. Elle met en évidence 2 limitations : un nombre important de doublons et une faible présence des archives ouvertes françaises à partir de HAL/CCSD.
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* La troisième ([[#Test de faisabilité ProdInra|PercaFluV3 - test ProdInra]] - 17 et 27 décembre 2015) est un simple test de faisabilité pour traiter des documents provenant des archives ouvertes de l'INRA (ProdInra).
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* La quatrième ([[#Version multibase dédoublonnée avec un flux INRA|PercaFluV4 - 6 sources d'information dont ProInra]] - créée le 22 décembre 2015 et mise à jour la 8 janvier 2016) intègre la composante PoodInra et introduit des fonctions de dédoublonnage.
 
}}
 
}}
==Plateforme Istex seul==
 
===Navigation===
 
La boîte ci dessous donne accès au serveur d'exploration proprement dit et aux serveurs intermédiaires de curation.
 
le corpus contient [[A pour taille ISTEX::2953]]  [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
 
{| class="wikitable"
 
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{{Explor bandeau flux|type=IstexSolo |code=Main|path=PercaFluV1}}
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===Version finale===
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''multibase avec un flux amont INRA''
===Projections géographiques===
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*[[Wicri:PercaFluV4]] - ''introduction''
{{Explor plateforme PercaFluV1/Carte France}}
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{{Explor plateforme PercaFluV1/Carte Europe}}
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Le volume initial est de 6695 documents.
{{Explor plateforme PercaFluV1/Carte Monde}}
 
===Aspects techniques===
 
*[[Wicri:PercaFluV1]] - ''introduction''
 
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, data]] - ''génération des données''
 
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
 
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
 
==En préparation PercaFluV2 (multibase)==
 
===Navigation===
 
{{Wicri travaux|texte=première installation terminée, affinage navigation en cours}}
 
 
{| class="wikitable"
 
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{{Explor bandeau flux|type=IstexMulti|code=Istex|path=PercaFluV2}}
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|Ce flux contient [[A pour taille ISTEX::2790]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
 
|Ce flux contient [[A pour taille ISTEX::2790]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
 
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|Ce flux traite un ensemble de [[A pour taille Pascal::777]] notices extraites de la base [[A pour base utilisée::Pascal (base de données)|Pascal]] et [[A pour taille Francis::1|une seule]] notice issue de [[A pour base utilisée::Francis (base de données)|Francis]]
 
|Ce flux traite un ensemble de [[A pour taille Pascal::777]] notices extraites de la base [[A pour base utilisée::Pascal (base de données)|Pascal]] et [[A pour taille Francis::1|une seule]] notice issue de [[A pour base utilisée::Francis (base de données)|Francis]]
 
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!{{Explor icon number|n=3}}
 
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|Ce flux traite [[A pour taille HAL::1|un]] seul article issu de Hal (CCSD).</ref>.
|Ce flux traite [[A pour taille HAL::1|un]] seul article issu de Hal<ref>D'autres références sont disponibles sur le site de l'INRA.</ref>.
 
 
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|Ce flux traite [[A pour taille HAL INRA::213]] articles issu de ProdInra (HAL - INRA).
 
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!{{Explor icon number|n=5}}
 
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|Ce flux traite [[A pour taille PubMed::1492]] documents en provenance de la base [[A pour base utilisée::PubMed (MEDLINE)]].
 
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!{{Explor icon number|n=6}}
 
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|Ce flux traite [[A pour taille PubMed Central:: 1421]] documents en provenance de la base [[A pour base utilisée::PubMed Central]].
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!{{Explor icon number|n=5}}{{Explor icon number|n=6}}
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{{Explor bandeau flux|type=Ncbi|code=Ncbi|path=PercaFluV4}}
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|Ce flux permet de réduire les doublons entre PubMed et PubMed Central. 17 notices PMC sont ainsi enrichies par l'indexation MEDLINE.
 
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!{{Explor icon number|n=7}}Flux principal
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!{{Explor icon number|n=8}}Flux principal
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+
!{{Explor icon number|n=1}}{{Explor icon number|n=2}}{{Explor icon number|n=3}}{{Explor icon number|n=4}}{{Explor icon number|n=7}}
|{{Explor bandeau flux|type=MainMerge|code=Main|path=PercaFluV2}}
+
|{{Explor bandeau flux|type=MainMerge|code=Main|path=PercaFluV4}}
|La volumétrie finale actuelle est de 9154 documents.
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|La volumétrie finale actuelle est de 6037 documents.
 
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!France
 
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!UK
 
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!USA
 
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!Allemagne
 
!Allemagne
 
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=Allemagne|path=PercaFluV2}}
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=Allemagne|path=PercaFluV4}}
 
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|}
 
|}
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;Projections géographiques:
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 +
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{{Saut 2 colonnes}}
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{{Explor plateforme PercaFluV4/Carte France Regions 2016|taille=400}}
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{{Fin 2 colonnes}}
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{{Explor plateforme PercaFluV4/Carte Europe}}
 +
{{Explor plateforme PercaFluV4/Carte Monde}}
  
===Aspects techniques===
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==Plateformes initiales==
*[[Wicri:PercaFluV2]] - ''introduction''
+
===Plateforme Istex mono-flux===
*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, data]] - ''génération des données''
+
;navigation:
*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
+
La boîte ci dessous donne accès au serveur d'exploration proprement dit et aux serveurs intermédiaires de curation.
*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
+
le corpus contient [[A pour taille ISTEX::2953]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
===Test ProdInra===
 
''base de test pour ProdInra''
 
{{Wicri travaux|texte=A partir de ce point, simples tests de faisabilité.}}
 
*[[Wicri:PercaFluV3]] - ''introduction''
 
 
{| class="wikitable"
 
{| class="wikitable"
 
|-
 
|-
  
 
|
 
|
{{Explor bandeau flux|type=HalInraSolo |code=Main|path=PercaFluV3}}
+
{{Explor bandeau flux|type=IstexSolo |code=Main|path=PercaFluV1}}
 
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|}
 
|}
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;Projections géographiques:
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 +
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}}
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{{boîte déroulante
 +
  |titre=Production scientifique en France
 +
  |contenu=
 +
{{Explor plateforme PercaFluV1/Carte Europe}}
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}}
 +
{{boîte déroulante
 +
  |titre=Production scientifique dans le Monde
 +
  |contenu=
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{{Explor plateforme PercaFluV1/Carte Monde}}
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}}
 +
;Aspects techniques:
 +
*[[Wicri:PercaFluV1]] - ''introduction''
 +
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, data]] - ''génération des données''
 +
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
 +
*[[Wicri:PercaFluV1/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
  
===Multibase INRA===
+
===Version intermédiaire PercaFluV2 (multibase)===
''multibase avec un flux amont INRA''
+
Cette plateforme est une version intermédiaire qui regroupe des corpus sans dédoublonnage.
*[[Wicri:PercaFluV4]] - ''introduction''
+
;Navigation:
 
{| class="wikitable"
 
{| class="wikitable"
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!{{Explor icon number|n=1}}
 
!{{Explor icon number|n=1}}
 
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+
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|Ce flux contient [[A pour taille ISTEX::2790]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
 
|Ce flux contient [[A pour taille ISTEX::2790]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]].
 
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|-
 
!{{Explor icon number|n=2}}
 
!{{Explor icon number|n=2}}
 
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{{Explor bandeau flux|type=Stanalyst |code=PascalFrancis|path=PercaFluV2}}
 
|Ce flux traite un ensemble de [[A pour taille Pascal::777]] notices extraites de la base [[A pour base utilisée::Pascal (base de données)|Pascal]] et [[A pour taille Francis::1|une seule]] notice issue de [[A pour base utilisée::Francis (base de données)|Francis]]
 
|Ce flux traite un ensemble de [[A pour taille Pascal::777]] notices extraites de la base [[A pour base utilisée::Pascal (base de données)|Pascal]] et [[A pour taille Francis::1|une seule]] notice issue de [[A pour base utilisée::Francis (base de données)|Francis]]
 
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!{{Explor icon number|n=3}}
 
!{{Explor icon number|n=3}}
 
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|Ce flux traite [[A pour taille HAL::1|un]] seul article issu de Hal<ref>D'autres références sont disponibles sur le site de l'INRA.</ref>.
 
|Ce flux traite [[A pour taille HAL::1|un]] seul article issu de Hal<ref>D'autres références sont disponibles sur le site de l'INRA.</ref>.
 
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!{{Explor icon number|n=4}}
 
!{{Explor icon number|n=4}}
 
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{{Explor bandeau flux|type=Medline |code=PubMed|path=PercaFluV2}}
|Ce flux traite [[A pour taille HAL::1|un]] seul article issu de Hal<ref>D'autres références sont disponibles sur le site de l'INRA.</ref>.
+
|Ce flux traite 1492 documents en provenance de la base [[A pour base utilisée::PubMed (MEDLINE)]].
 
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!{{Explor icon number|n=5}}
 
!{{Explor icon number|n=5}}
 
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|colspan=2|
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!{{Explor icon number|n=6}}
 
|colspan=2|
 
|colspan=2|
  
{{Explor bandeau flux|type=Pmc|code=Pmc|path=PercaFluV4}}
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!{{Explor icon number|n=7}}
+
!{{Explor icon number|n=7}}Flux principal
!{{Explor icon number|n=5}}{{Explor icon number|n=6}}
+
!{{Explor icon number|n=1}}{{Explor icon number|n=2}}{{Explor icon number|n=3}}{{Explor icon number|n=6}}
|
+
|{{Explor bandeau flux|type=MainMerge|code=Main|path=PercaFluV2}}
{{Explor bandeau flux|type=Ncbi|code=Ncbi|path=PercaFluV4}}
 
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!{{Explor icon number|n=8}}Flux principal
 
!{{Explor icon number|n=1}}{{Explor icon number|n=2}}{{Explor icon number|n=3}}{{Explor icon number|n=4}}{{Explor icon number|n=7}}
 
|{{Explor bandeau flux|type=MainMerge|code=Main|path=PercaFluV4}}
 
 
|La volumétrie finale actuelle est de 9154 documents.
 
|La volumétrie finale actuelle est de 9154 documents.
 
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=France|path=PercaFlu/PercaFluV4}}
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=Allemagne|path=PercaFluV4}}
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;Aspects techniques:
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*[[Wicri:PercaFluV2]] - ''introduction''
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*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, data]] - ''génération des données''
 +
*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
 +
*[[Wicri:PercaFluV2/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
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===Base de test pour ProdInra===
 +
{{Wicri travaux|texte=Simple test de faisabilité.}}
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*[[Wicri:PercaFluV3]] - ''introduction''
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{| class="wikitable"
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{{Explor bandeau flux|type=HalInraSolo |code=Main|path=PercaFluV3}}
 
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Ce flux s'avère intéressant pour identifier les unités de l'INRA actives sur l'aquaculture, et notamment :
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* [[Animal et fonctionnalités des produits animaux (UR)|Animal et fonctionnalités des produits animaux (UR)]] (AFPA), -  [[Jean-Noël Gardeur‎]]
 +
* [[Centre alpin de recherche sur les réseaux trophiques des écosystèmes limniques]] (CARRTEL), [[Jean Guillard]]
 +
* [[Physiologie de la reproduction et des comportements (UR)|Physiologie de la Reproduction et des Comportements]] - [[Philippe Chemineau]]
  
 
==Voir aussi==
 
==Voir aussi==

Version actuelle datée du 8 mars 2024 à 16:08

Cette page introduit le « Serveur d'exploration Perca fluviatilis » (Perche commune).

logo travaux Ce serveur a été porté, depuis le site de l'Université de Lorraine, dans son état initial, sans mise à niveau technique. En particulier les liens géographiques ne fonctionnent pas
Théorème de Pythagore Démonstration Wicri
L'expression Perca fluviatilis s'avérant assez précise en recherche d'information, ce sujet est utilisé, dans les projets ISTEX et LorEplor, pour constituer une application test d'enrichissement de corpus.

Cette expérience complète une application de même type autour d'une revue medicale (voir la plateforme Movement Disorders sur Wicri/Santé).

Vous trouverez sur cette page 4 étapes dans ce travail d’enrichissement :

  • La première (PercaFluV1 - Istex seul - juin 2015) repose exclusivement sur ISTEX. Elle intègre des fonctions d'homogénéisation d'éléments géographiques (pays, régions).
  • La deuxième (PercaFluV2 - 5 décembre 2015) fusionne un ensemble de flux. Elle met en évidence 2 limitations : un nombre important de doublons et une faible présence des archives ouvertes françaises à partir de HAL/CCSD.
  • La troisième (PercaFluV3 - test ProdInra - 17 et 27 décembre 2015) est un simple test de faisabilité pour traiter des documents provenant des archives ouvertes de l'INRA (ProdInra).
  • La quatrième (PercaFluV4 - 6 sources d'information dont ProInra - créée le 22 décembre 2015 et mise à jour la 8 janvier 2016) intègre la composante PoodInra et introduit des fonctions de dédoublonnage.


Version finale

multibase avec un flux amont INRA

Le volume initial est de 6695 documents.

Logo Paris tram ligne1.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux ISTEX

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux contient 2790 documents ISTEX.
Logo Paris tram ligne2.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux Pascal / Francis

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite un ensemble de 777 notices extraites de la base Pascal et une seule notice issue de Francis
Logo Paris tram ligne3.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux Hal Ccsd

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite un seul article issu de Hal (CCSD).</ref>.
Logo Paris tram ligne4.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux HAL INRA

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 213 articles issu de ProdInra (HAL - INRA).
Logo Paris tram ligne5.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 1492 documents en provenance de la base PubMed (MEDLINE).
Logo Paris tram ligne6.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 1421 documents en provenance de la base PubMed Central.
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Logo Paris tram ligne5.svg
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DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux permet de réduire les doublons entre PubMed et PubMed Central. 17 notices PMC sont ainsi enrichies par l'indexation MEDLINE.
Logo Paris tram ligne8.svg
Flux principal
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Logo Paris tram ligne2.svg
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Logo Paris tram ligne4.svg
Logo Paris tram ligne7.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux de convergence qui donne accès au serveur

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

La volumétrie finale actuelle est de 6037 documents.
Zoom France

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom UK

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ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom USA

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom Allemagne

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Projections géographiques
 

Plateformes initiales

Plateforme Istex mono-flux

navigation

La boîte ci dessous donne accès au serveur d'exploration proprement dit et aux serveurs intermédiaires de curation. le corpus contient 2953 documents ISTEX.

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux ISTEX

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Projections géographiques
Aspects techniques

Version intermédiaire PercaFluV2 (multibase)

Cette plateforme est une version intermédiaire qui regroupe des corpus sans dédoublonnage.

Navigation
Logo Paris tram ligne1.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux ISTEX

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux contient 2790 documents ISTEX.
Logo Paris tram ligne2.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux Pascal / Francis

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite un ensemble de 777 notices extraites de la base Pascal et une seule notice issue de Francis
Logo Paris tram ligne3.svg

DilibExplorGabarit1.png

ExplorGabarit1Arrow.png

Pour aller sur le flux Hal Ccsd

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite un seul article issu de Hal[1].
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Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 1492 documents en provenance de la base PubMed (MEDLINE).
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Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

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Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

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Flux principal
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Pour aller sur le flux de convergence qui donne accès au serveur

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

La volumétrie finale actuelle est de 9154 documents.
Zoom France

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Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

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Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom UK

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Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom USA

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Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Zoom Allemagne

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Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Aspects techniques

Base de test pour ProdInra

logo travaux Simple test de faisabilité.

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Pour aller sur le flux HAL INRA

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux s'avère intéressant pour identifier les unités de l'INRA actives sur l'aquaculture, et notamment :

Voir aussi

Notes
  1. D'autres références sont disponibles sur le site de l'INRA.