Wicri:PercaFluV4

De Wicri Eau

Cette page introduit les aspects techniques de la version PercaFluV4 du « Serveur d'exploration Perca fluviatilis ».

Voir aussi :

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis
source IstexGetCorpusSize -q "perca AND fluviatilis"
  IstexGenerAreaPages \
       -a PercaFluV4   \
       -m   \
       -g PercaFlu   \
       -p Wicri/Eau   \
       -w wicri-eau.fr  \
       -W Wicri/Eau   \
       -s PascalFrancis   \
       -s Hal   \
       -s HalInra      \
       -s PubMed   \
       -s Pmc   \
       -s Ncbi   \
       -z France   \
       -z UK   \
       -z USA   \
       -z Allemagne   \
       -t "Serveur d'exploration Perca fluviatilis"
Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/PercaFlu.storage/PercaFluV4
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Création des répertoires
mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/PercaFlu.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Récupération des corpus

Téléchargement ISTEX

Voir Wicri:PercaFluV2

cd $EXPLOR_AREA/Import
ln -s ../../PercaFluV2/Import/IstexRepository.hfd .
ln -s ../../PercaFluV2/Import/IstexRepository.hcs .
En cas de reprise
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*
Construction corpus biblio
HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd   \
  | IstexCleanFullText                           \
  | SgmlFast -c1                                 \
  | IstexToTei                                   \
  | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus \
  | HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

Autres corpus

Toujours à partir du répertoire PercaFluV4

PubMed
ln -s ../../PercaFluV2/Import/pubmed_result.xml .
PubMed Central
ln -s ../../PercaFluV2/Import/pmc_result.xml .
PascalFrancis
ln -s ../../PercaFluV2/Import/inistServer.txt .
ln -s ../../PercaFluV2/Import/inistStandard.txt .
Hal
ln -s ../../PercaFluV2/Import/api.archives-ouvertes.fr.xml .
HalInra
ln -s ../../PercaFluV3/Import/PRD_201512201742.xml .
ln -s ../../PercaFluV3/Import/PRD_201512201743.xml .

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-eau.fr -p "Wicri:PercaFluV4/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
Importation des paramètres de navigation
WicriGetPage -l wicri-eau.fr -p "Wicri:PercaFluV4/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
Génération de l'interface 
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/istexMetadata.hcs Import/istexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar

Sur la machine cible

Transfert par scp
scp $ISTEX_PAR Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/PercaFlu.storage/PercaFluV4

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/PercaFlu.storage/PercaFluV4.20151207

Si nouveau code générique :

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/PercaFlu.storage

Création du répertoire plateforme

mkdir $EXPLOR_AREA
Transfert par FileZilla

Transférer les fichiers Site.tar.gz, Data.tar.gz de PercaFluV4 (émetteur) vers PercaFluV4 (cible).

Installation
cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar
gunzip ImportMetadata.tar.gz 
tar -xvf ImportMetadata.tar 
gzip ImportMetadata.tar 

cd Data/Istex/Corpus 
rm biblio.hcs 
rm biblio.hfd 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hcs biblio.hcs 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hfd biblio.hfd