Wicri:CheneBelgiqueV2

Cette page introduit les aspects techniques de la version CheneBelgiqueV2 du « Serveur d'exploration sur le chêne en Belgique ».

Voir aussi :

• Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, data - génération des données
• Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, fr - génération de l'interface
• Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques
• Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
• Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, template include - génération du modèle d'affichage des résultats bruts
• Wicri:CheneBelgiqueV1

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis

Les pages wikis ont en fait été initialisées à partir de Wicri:CheneBelgiqueV1 en remplaçant V1 par V2.

Génération des pages wikis

 IstexGenerAreaPages \
       -a CheneBelgiqueV2   \
       -m   \
       -g CheneBelgique   \
       -p Wicri/Bois   \
       -w wicri-bois.fr  \
       -W Wicri/Bois   \
       -s PascalFrancis   \
       -s Hal   \
       -s PubMed   \
       -s Pmc   \
       -s Ncbi   \
       -z France   \
       -z Allemagne   \
       -q "quercus AND belg*"   \
       -t "Serveur d'exploration sur le chêne en Belgique"

Quelques explications Cette partie sert simplement à installer sur la machine Unix le répertoire qui va contenir la plateforme. Pour les informaticiens, la variable d'environnement EXPLOR_AREA sera utilisée pour repérer ce répertoire.

Définition $EXPLOR_AREA

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Bois/corpus/CheneBelgique.storage/CheneBelgiqueV2
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

Création des répertoires

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Bois/corpus/CheneBelgique.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Récupération des corpus

Les corpus sont les mêmes que ceux de la version Wicri:CheneBelgiqueV1. Le répertoire Import est réalisé par des liens.

cd $EXPLOR_AREA/Import
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/IstexRepository.hcs .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/IstexRepository.hfd .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/inistServer.txt .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/inistStandard.txt .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/api.archives-ouvertes.fr.xml .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/pmc_result.xml .
ln -s ../../CheneBelgiqueV1/Import/pubmed_result.xml .

Construction des métadonnées ISTEX

ISTEX, création du HFD Corpus Biblio

En cas de reprise:

rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*

Construction corpus biblio

HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd   \
  | IstexCleanFullText                           \
  | SgmlFast -c1                                 \
  | IstexToTei                                   \
  | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus  -c ISTEX -s Corpus -S Istex \
  | HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération

WicriGetPage -l wicri-bois.fr -p "Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh

ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk

Importation des paramètres de navigation

WicriGetPage -l wicri-bois.fr -p "Wicri:CheneBelgiqueV2/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

Génération de l'interface 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/IstexMetadata.hcs Import/IstexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar

Transfert vers la machine LorExplor

Transfert par scp

scp $ISTEX_PAR Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Bois/explor/CheneBelgique.storage/CheneBelgiqueV2

scp $ISTEX_PAR Data.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Bois/explor/CheneBelgique.storage/CheneBelgiqueV2

scp $ISTEX_PAR ImportMetadata.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Bois/explor/CheneBelgique.storage/CheneBelgiqueV2

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Bois/corpus/CheneBelgique.storage/CheneBelgiqueV2.20170220

Si nouveau code générique :

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Bois/corpus/CheneBelgique.storage

Création du répertoire plateforme

mkdir $EXPLOR_AREA

Transfert par FileZilla

Transférer les fichiers Site.tar.gz, Data.tar.gz de CheneBelgiqueV2 (émetteur) vers CheneBelgiqueV2 (cible).

Installation

cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar

gunzip ImportMetadata.tar.gz 
tar -xvf ImportMetadata.tar 
gzip ImportMetadata.tar 

cd Data/Istex/Corpus 
rm biblio.hcs 
rm biblio.hfd 
ln -s ../../../Import/IstexMetadata.hcs biblio.hcs 
ln -s ../../../Import/IstexMetadata.hfd biblio.hfd