Discussion:Espace Interactions Arbres Microorganismes/Serveurs : Différence entre versions
De Wicri Bois
imported>Jacques Ducloy (→Sur VM LorExplor) |
imported>Jacques Ducloy (→Sur VM LorExplor) |
||
Ligne 71 : | Ligne 71 : | ||
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Willow.storage | cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Willow.storage | ||
− | NlmPubMedExplorCorpus -d | + | NlmPubMedExplorCorpus -d "PhytophthoraEffectorV1" \ |
− | -q | + | -q "phytophthora effector" -s 5000 \ |
-l wicri-bois.fr -p Bois \ | -l wicri-bois.fr -p Bois \ | ||
− | -t "Serveur d'exploration sur | + | -t "Serveur d'exploration sur les effecteurs du phytophthora" |
</source> | </source> |
Version du 17 novembre 2020 à 23:59
Protocole
- définir la séquence d'appel (ci dessous)
- générer le serveur sur machine développement
- installer les pages wikis
- installer les fichiers
- mettre à jour l'en-tête et la page serveur
- mettre à jour Modèle:Wicri Bois lien serveur
Modèle de paramétrage
Sur machine locale (mac)
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Thaumatin.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d ThaumatinV1 \
-q "thaumatin" -s 2000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration Thomatine"
NlmPubMedGetCorpusSize -q '"rust effector*"'
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/RustEffector.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d RustEffectorV1 \
-q '"rust effector*"' -s 2000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration sur les effecteurs de la rouille "
NlmPubMedGetCorpusSize -q phanerochaete
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Phanerochaete.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d PhanerochaeteV1 \
-q Phanerochaete -s 2000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration sur le phanerochaete"
NlmPubMedGetCorpusSize -q "white rot"
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/WhiteRot.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d WhiteRotV1 \
-q "white rot" -s 4000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration sur la pourriture ligneuse"
NlmPubMedGetCorpusSize -q willow
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Willow.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d WillowV1 \
-q willow -s 5000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration sur le saule"
Sur VM LorExplor
NlmPubMedGetCorpusSize -q "phytophthora effector"
cd $WICRI_ROOT/Bois/explor/Willow.storage
NlmPubMedExplorCorpus -d "PhytophthoraEffectorV1" \
-q "phytophthora effector" -s 5000 \
-l wicri-bois.fr -p Bois \
-t "Serveur d'exploration sur les effecteurs du phytophthora"