Wicri:FoodNanoV2

Cette page introduit les aspects techniques de la version FoodNanoV2 du « Serveur d'exploration alimentation et nanotechnologie ».

Voir aussi :

• Wicri:FoodNanoV2/Paramètres, data - génération des données
• Wicri:FoodNanoV2/Paramètres, fr - génération de l'interface
• Wicri:FoodNanoV2/Paramètres, génération des cartes - génération de cartes géographiques

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Génération des pages wikis

 ExplorGenerAreaPages \
       -g FoodNano   \
       -a FoodNanoV2   \
       -m   \
       -s PubMed   \
       -w wicri-agronomie.fr  \
       -W Wicri/Agronomie   \
       -t "Serveur d'exploration alimentation et nanotechnologie"

Définition $EXPLOR_AREA

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Agronomie/corpus/FoodNano.storage/FoodNanoV2

Initialisation

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Agronomie/corpus/FoodNano.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Récuparation des corpus

NlmPubMedGetCorpus -q ... -x -s1000 > $EXPLOR_AREA/Import/pubmed_result.xml

Importation des paramètres de génération

WicriGetPage -l wicri-agronomie.fr -p "Wicri:FoodNanoV2/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Génération de la plateforme 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk

Importation des paramètres de navigation

WicriGetPage -l wicri-agronomie.fr -p "Wicri:FoodNanoV2/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

Génération de l'interface 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 
rm Import.tar.gz
tar -cvf Import.tar Import
gzip Import.tar

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Agronomie/corpus/FoodNano.storage/FoodNanoV2

Préparation

Création mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Agronomie/corpus/FoodNano.storage cd $WICRI_ROOT/Wicri/Agronomie/corpus mkdir FoodNano.storage/FoodNanoV2 ln -s FoodNano.storage/FoodNanoV2 FoodNanoV2 Transfert par FileZilla Transférer les fichiers Site.tar.gz, Import.tar.gz, Data.tar.gz de FoodNanoV2 (émetteur) vers FoodNanoV2 (cible). Installation cd $EXPLOR_AREA gunzip Site.tar.gz tar -xvf Site.tar gzip Site.tar gunzip Data.tar.gz tar -xvf Data.tar gzip Data.tar

Mise à jour cd FoodNano mkdir FoodNanoV2.new cd FoodNanoV2.new Transfert par FileZilla Transférer les fichiers Site.tar.gz, Import.tar.gz, Data.tar.gz de FoodNanoV2 (émetteur) vers FoodNanoV2.new (cible).

Installation

rm -rf Site/* 
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

rm -rf Data/* 
gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar