Genome Biology (2008) Hodis

Proteopedia - a scientific 'wiki' bridging the rift between three-dimensional structure and function of biomacromolecules

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Cet article introduit le site et projet Proteopedia.

Titre Proteopedia - a scientific wiki bridging the rift between 3D structure and function of biomacromolecules Auteurs Hodis, Eran (1,2,7), Jaime Prilusky(3), Eric Martz(4), Israel Silman, John Moult and Joel L. Sussman. Affiliations (1) Department of Structural Biology, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel (2) The Israel Structural Proteomics Center, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel (3) Biological Services Unit, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel (4) Department of Microbiology, Université du Massachusetts, Amherst, MA 01003, USA (5) Neurobiology Department, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel (6) Center for Advanced Research in Biotechnology, University of Maryland Biotechnology Institute, Rockville, MD 20850, USA (7) Current Address: Department of Computer Science and Applied Mathematics, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israël In Genome Biology (2008) 2008, doi:10.1186/gb-2008-9-8-r121. From http://genomebiology.com/2008/9/8/R121

Résumé

De nombreux scientifiques n'ont pas les moyens d'exploiter pleinement la richesse des biomacromolécule avec leurs structures tridimensionnelles . Ils ont donc besoin d'un service permettant de présenter les relations entre structure et fonction, d'une manière conviviale destinée à un large public scientifique. Proteopedia (http://www.proteopedia.org) est un outil interactif, un wiki, et plus précisément un site Web dont les pages contiennent des structures tridimensionnelles interactives. Elles sont complétées par un texte descriptif contenant des liens hypertextes qui modifient l'apparence (vue, représentations, couleurs, étiquettes) des trois dimensions de la structure présentée afin de refléter le concept expliqué dans le texte.

Abstract

Many scientists lack the background to fully utilize the wealth of solved three-dimensional biomacromolecule structures. Thus, a resource is needed to present structure/function information in a user-friendly manner to a broad scientific audience. Proteopedia http://www.proteopedia.org webcite is an interactive, wiki web-resource whose pages have embedded three-dimensional structures surrounded by descriptive text containing hyperlinks that change the appearance (view, representations, colors, labels) of the adjacent three-dimensional structure to reflect the concept explained in the text.