Voir la source de JIE (1999) Nauer

{{Titre page article
 |titre= De l'importance de la normalisation en bibliométrie
}}
{{JIE header 1999}}
{{JIE boîte bibliographique
 |texte=
;Titre: [[A pour titre::De l'importance de la normalisation en bibliométrie]]
;Auteur:[[A pour premier auteur::Emmanuel Nauer]]
;Affiliation:[[A pour affiliation auteur::Laboratoire lorrain de recherche en informatique et ses applications|Loria]], [[A pour affiliation auteur::Orpailleur (Loria)|équipe Orpailleur]] – CNRS : UMR7503 – [[[[A pour affiliation auteur::Université Henri Poincaré]] - Nancy I – Université Nancy II – Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL) France ]]
;En ligne: [http://crrm.u-3mrs.fr/sfba/ile-rousse/1999/articles/nauer.pdf site du CRM]
::
}}
;Résumé:Si la consultation de multiples sources d'information garantit une meilleure couverture du sujet, elle nécessite -en parallèle- de prendre en compte l'hétérogénéité des données. En effet, comme chaque producteur d'information possède son propre modèle de document, on obtient des représentations différentes d'une même information. Cette hétérogénéité occasionne deux problèmes majeurs pour la bibliométrie qui faussent statistiques et analyses. Ces difficultés concernent : • la présence de variations pour représenter une même information (auteurs, descripteurs, affiliation, etc.) ; • la présence de doublons (c'est-à-dire plusieurs représentations de la même référence bibliographique). Dans cet article, nous proposons une approche visant à pallier ces problèmes. Nous discutons tout d'abord les choix retenus en terme de normalisation et de dédoublonnage.
__TOC__
{{clr}}
{{JIE début corps}}
==Introduction==
L’interrogation de plusieurs banques de données est une nécessité dans la constitution d’une
bibliographie exhaustive sur un sujet pluridisciplinaire {{VSST citation|Gehanno 1998}}. Or, si la consultation de
multiples sources d’information garantit une meilleure couverture du sujet, elle nécessite -en
parallèle- de prendre en compte l’hétérogénéité des données. En effet, comme chaque producteur
d’information possède son propre modèle de document, on obtient des représentations différentes
d’une même information. Cette hétérogénéité occasionne deux problèmes majeurs pour la
bibliométrie qui faussent statistiques et analyses. Ces difficultés concernent :
*la présence de variations pour représenter une même information (auteurs, descripteurs, affiliation, etc.) ;
*la présence de doublons (c’est-à-dire plusieurs représentations de la même référence bibliographique).
Dans cet article, nous proposons une approche visant à pallier ces problèmes. Nous
discutons tout d’abord les choix retenus en terme de normalisation et de dédoublonnage.

Nous présentons ensuite la chaîne de traitement mise en place dans le but de fusionner de
multiples sources. Cette chaîne repose sur une structure pivot de représentation des documents en
SGML<ref>Standard Generalized Markup Language {{VSST citation|ISO 8879:1986}}</ref> et inclut la normalisation des structures et des contenus. Nous détaillons ici plus
particulièrement nos travaux sur la normalisation des auteurs et des descripteurs, ainsi que sur le
dédoublonnage des notices. Pour cela, nous décrivons une méthode générale pour établir des
équivalences (d’auteurs, de descripteurs, de notices, etc.) et présentons l’algorithme que nous
avons utilisé pour la normalisation des auteurs, des descripteurs et pour le dédoublonnage.

Nous insisterons, au fil de cet article, sur le caractère essentiel de la normalisation et du
dédoublonnage dans le domaine de la bibliométrie, à travers une étude menée en collaboration
avec l’INRS<ref>Institut National de Recherche et Sécurité</ref> Cette étude porte sur un corpus 
documentaire concernant le stress professionnel et
contenant 26251 références bibliographiques provenant de l’interrogation de 8 sources différentes
(Medline, Embase, Biosis, Psyclit, NIOSHTIC, Cisilo, INRS-B et Pascal). Nous montrons
également comment nous avons utilisé le thésaurus de l’UMLS<ref>Unified Medical Language System</ref> pour normaliser les descripteurs.

==Normalisation des données==
L’approche que nous avons adoptée consiste à fédérer les multiples sources d’information
avec un souci d’homogénéisation, afin de prendre en compte les diversités de représentation des
informations, et afin d’aboutir à un modèle cohérent de représentation capable d’unifier les
différents contenus.

Pour cela, nous avons défini un modèle de données vers lequel nous avons fait converger les
différents modèles initiaux. La chaîne de traitement mise en place opère tout d’abord une
normalisation de la structure des notices, puis une normalisation du contenu de chacun des
champs, comme le préconise {{VSST citation|Dou 91}}.

Nous décrivons les principales étapes nécessaires à la normalisation et renvoyons à {{VSST citation|Jolibois 1999}} pour une revue détaillée des normes.
===Normalisation de la structure===
Chaque base dispose d’une structure spécifique, constituée d’un nombre variable de
champs. Si certains champs sont communs à toutes les bases (Auteurs, Titre, Date de publication,
etc.), d’autres sont spécifiques à une ou deux bases seulement (les tags<ref>Les tags sont des descripteurs génériques qui renseignent sur le type de population (mâle, femelle, animal, etc.) ou la tranche d’âge (enfant, adulte, etc.), le type de publication (étude de cas, etc.), l’aire géographique, etc.</ref>, par exemple, sont
uniquement proposés par Medline, Embase et Psyclit). D’autres enfin apparaissent sous des
formes différentes selon qu’ils sont fusionnés ou non. A titre d’exemple, le Titre du périodique, le
Volume, le Fascicule et la Pagination apparaissent dans Medline PubMed dans un unique champ
Source.

La normalisation de la structure peut être possible en utilisant des normes préexistantes.

Celles-ci concernent la structure logique (de quelles informations une référence est-elle
constituée ?) et la structure physique (quel format informatique utiliser pour gérer les
références ?).

La normalisation de la structure logique peut reposer sur l’utilisation de différentes normes :
:• des normes de catalogage, comme l’[ISBD 1992] (General International Standard Bibliographic Description) , l’[AACR2:1988] (Anglo-American Cataloguing Rules 2nd edition) ;
:et/ou
:• des normes éditoriales, comme l’[ISO 690:1987], le style de Vancouver [ICMJE 1997], qui fait autorité en médecine, etc.

Après avoir pris en compte les différentes normes citées ci-dessus, nous avons défini un
modèle de données homogène comprenant un ensemble bien défini de champs (structure logique),
et avons opté pour l’utilisation de la norme SGML (structure physique) pour bénéficier des
nombreux outils de manipulation de données SGML disponibles gratuitement.

Pour uniformiser les données provenant de différentes bases, il a donc été nécessaire :

• de supprimer des champs jugés non pertinents par rapport aux besoins de la bibliométrie (numéros de contrôle, date d’entrée et de mise à jour dans la base originale, CODEN<ref>Le CODEN est un code alphanumérique d’identification des périodiques, qui tend à disparaître au profit de l’ISSN.</ref>, cote, etc.) ;
• d’éclater certains champs afin de ventiler leur contenu dans des champs plus précis, dans le but de les exploiter directement. Par exemple le champ Source de Medline a été éclaté en Titre de périodique, Volume, Fascicule, Pagination, Lieu de publication, Editeur, Date de publication ;
• de créer de nouveaux champs, absents de certaines bases. Par exemple, dans le NIOSHTIC, le Type de publication n’est (initialement) pas un champ, mais l’information apparaît parmi les descripteurs ;
• de normaliser les intitulés des champs retenus (Auteurs, Titre, Descripteurs, etc.).

===Normalisation des contenus===
Une fois les structures de notices uniformisées, il est nécessaire de normaliser les contenus
des champs les plus importants pour l’exploitation bibliométrique du corpus. Cela concerne les
auteurs, l’affiliation de l’auteur principal, le pays d’affiliation de l’auteur principal, le type de
publication, la date de publication, la langue de publication, le titre de périodique et les
descripteurs.

Là aussi, on peut se référer à différentes normes déjà définies. On peut citer
l’{{VSST citation|ISO 3166:1997}} pour les codes de pays, l’[ISO 639:1988] pour les codes de langues,
l’{{VSST citation|ISO 8601:1998}} pour les dates, etc. Nous avons choisi de détailler, ci-après, nos travaux sur les
auteurs et les descripteurs, deux champs fondamentaux pour les analyses bibliométriques, plutôt
que de décrire l’approche mise en place pour la normalisation de l’ensemble des champs.
La description des auteurs subit de nombreuses variations [Degez 1998]. Le nom précède
généralement le prénom, mais parfois c’est l’inverse. Le prénom est complet ou abrégé, ou bien
seul le premier prénom apparaît en entier et le second est abrégé. Les noms peuvent être
composés et présenter des particules (de, von, van, etc.). A ces variations s’en ajoutent d’autres,
comme celles liées à des séparateurs (tiret, apostrophe, virgule) ou à la casse. Par exemple,
l’auteur le plus référencé dans notre corpus documentaire sur le stress professionnel, Cary L
Cooper apparaît représenté sous 10 formes différentes<ref>le nombre entre parenthèses représente la fréquence d’occurence de chacune des formes</ref> : 
::*"Cooper,-Cary-L."(54), 
::*"Cooper-CL" (42), 
::*"Cooper CL" (34),
::*"C. L. Cooper" (8), 
::* "Cooper C.L." (7), 
::*"COOPER CL" (5), 
::* "Cooper, C. L." (3), 
::*"COOPER-C-L" (2), 
::*"Cooper-C-L" (2), 
::*"Cooper,-C.-L" (1).

Les règles de catalogage (AACR2, {{VSST citation|AFNOR NF Z 44-001:1995}}) préconisent le rejet des
particules selon les pratiques du pays auquel appartient l’auteur. Ainsi, un auteur français,
espagnol ou portugais verra sa particule "de" rejetée (ex. : Roux, Jean de) tandis qu’un américain
ou un italien la conservera en tête (De Sicca, Giovanni). Les noms composés sans espace sont
classés au premier élément lorsqu’il s’agit de français, d’allemands, d’espagnols (ex. : Garcia
Lorca, Federico), au dernier élément lorsqu’il s’agit d’américains ou de portugais (ex. : Mill, John
Stuart). Ces règles sont difficilement automatisables. Aussi avons-nous opté pour un format plus
simple qui ne procède à aucun rejet : le nom complet de l’auteur apparaît suivi des initiales de ses
prénoms, sans point ; les noms composés sont classés au premier élément et les éléments sont
systématiquement séparés par un trait d’union. Il est alors possible de mettre en place - pour
chaque base - des règles de transformation qui établissent la correspondance entre les auteurs tels
qu’ils sont représentés dans le format de la base, et le format cible.

Considérer les différentes formes d’un même concept comme étant des concepts différents
est lourd de conséquences en statistique. Sur l’exemple précédent, le fait de normaliser les
différentes formes de l’auteur, en une forme commune, a pour conséquence de quasiment tripler
le nombre de travaux relatifs à cet auteur, en passant de 54 (fréquence de sa forme la plus
occurente) à 158 (la somme des occurences des différentes formes). De même, l’extraction des
collèges invisibles (collaboration d’auteurs) est fortement biaisée (rendue principalement
incomplète) par cette même hétérogénéité des dénominations. Il est donc clairement primordial de
normaliser les différentes formes de représentation pour une même information. Voyons maintenant en détail comment gérer cette hétérogénéité lorsqu’elle concerne les descripteurs.

==Les descripteurs==
Les différentes bases interrogées représentent les documents de différentes manières. La
liberté de chaque base en matière d’indexation engendre de nombreux problèmes pour la fusion de
données. Les variations peuvent concerner :
#le vocabulaire utilisé : pour la représentation d’un même concept, le vocabulaire employé varie d’une base à l’autre (exemple : ''Antidepressive Agents'' et ''Antidepressants'' représentent le concept d’''antidépresseurs'') ;
#l’étendue de l’indexation : chaque source représente l’information qui l’intéresse et utilise du vocabulaire spécialisé dépendant du domaine d’intérêt (Psyclit représente les documents prioritairement selon leur aspect psychologique ; Pascal a une vocation plus générale) ;
# la complexité de l’indexation : la majorité des bases utilise, en matière de description, de simples groupes nominaux. Cependant, certaines bases utilisent une indexation à facettes, c’est-à-dire qu’un descripteur ne représentera pas simplement un concept, mais il associera un certain point de vue à ce concept (exemple : ''Stress'', ''Psychological_Epidemiology'' indiquera qu’il est question du stress psychologique, abordé ici d’un point de vue épidémiologique).
# la répartition de l’information dans différents champs : la plupart des bases fournissent pour chaque document un champ mots-clés dans lequel le contenu du document est représenté à l’aide de descripteurs. Certaines bases utilisent toutefois plusieurs champs pour représenter des aspects complémentaires à la description du document (type de document, population d’expérimentation, nom de pays, titre de périodique, divers mots-outils, etc.). D’autres bases fusionnent ces différentes informations dans un seul champ (on peut également noter ici, la difficulté de segmentation de l’information dans différents champs tant les limites ne sont pas évidentes entre les différentes parties d’information).

Nous exposons ci-après nos solutions qui prennent en compte ces difficultés.


===Les descripteurs initiaux===
L’ensemble des descripteurs initiaux sur le stress comprend 49597 formes très diverses :
{|class="wikitable"
|-
!Exemples de descripteurs 
!Source 
!Commentaire
|-
|Human, Animal 
|Pascal
|
|-
|HUMAN, FATIGUE- 
|Biosis,Psyclit
|
|-
|CAS 7439-92-1 
|Cisilo 
|Données propres à Cisilo
|-
|<nowiki>*</nowiki>stress-, sleep-disorder-etiology,<br/>human- (888), male- (41)
|Embase 
|Descripteurs à facette, mais pas de marqueur spécifique pour la facette (impossibilité de les détecter automatiquement) ; codes de classification en addition aux descripteurs
|-
|<nowiki>*</nowiki>Epinephrine_Pharmacology--PD,<br/>Corticosterone_Blood--BL,<br/>Stress, Psychological:CO
|Medline 
|Descripteurs à facette avec facettes détectables automatiquement en toutes lettres et/ou en abrégé
|-
|Humans, Mental stress,<br/>NIOSH Contract, NIOSH Publication,<br/>WOSTEH,<br/>137586, 59461
|Nioshtic 
|Mots courants et données propres au Nioshtic&nbsp;:
* descripteurs comprenant "NIOSH" ;
* codes de journaux comme WOSTEH qui correspondant à la revue "Work and Stress" ;
* codes de classification.
|}

Par ailleurs, il est important de noter que :
* le seul dédoublonnage des notices (suppresion des notices apparaissant plusieurs fois alors qu’elles représentent un même document, cf 3.) a éliminé 3762 formes initiales (!?) ; les descripteurs différents ne sont donc plus qu’au nombre de 45835 ;
* l’indexation d’un même document, dans différentes bases, varie fortement [Nauer 1999]. Par exemple, le document d’Arnetz BB, Techno-stress: A prospective psychophysiological study of the impact of a controlled stress-reduction program in advanced telecommunication systems design work, est indexé comme suit dans différentes bases de données :
{|class="wikitable"
|-
!Cisilo 
|TELECOMMUNICATIONS | RELAXATION EXERCISES | STRESS FACTORS | SUBJECTIVE ASSESSMENT | MENTAL WORKLOAD | MENTAL STRESS | BIOLOGICAL EFFECTS SERUM CHANGES | BLOOD PRESSURE | THROMBOCYTE COUNT
|-
!Psyclit 
|Psychosocial Factors | Cardiovascular Disorders | Job Characteristics | Surgeons | Occupational Stress | Adulthood | At Risk Populations | General Practitioners | Human | Adult
|-
!Medline
| *Telecommunications | Hemodynamics/physiology | Job Satisfaction | Workload|Human | Program Evaluation | Support, Non-U.S. Gov’t | Occupational Diseases/blood/prevention & control/physiopathology | Prolactin/blood | Prospective Studies | Questionnaires |Social Support | Stress, Psychological/blood/prevention & control/physiopathology
|}
==Notes==
<references/>

==Bibliographie==
{{VSST biblio
 |id=AACR2:1988
 |auteur=American Library Association 
 |texte=Anglo-American Cataloguing Rules, 2nd edition, 1988.}}
{{VSST biblio
 |id=AFNOR NF Z 44-001:1995
 |texte=Technologies de l’information - Classement alphabétique des dénominations. AFNOR, 1995.}}
{{VSST biblio
 |id=Desrichard 1997
 |auteur=Y. Desrichard
 |texte=Le dédoublonnage des banques de données bibliographiques : un état de l’art. Documentaliste - Sciences de l’information, 34(2):82-89, 1997. }}
{{VSST biblio
 |id=ICJME 1997
 |auteur=International Commitee of Medical Journals Editors
 |texte= Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals. JAMA, 277:927-934, 1997. }}
{{VSST biblio
 |id=ISBD 1988
 |auteur=ISBD(G). General International Standard Bibliographic Description
 |texte= Annotated text, 1988.}}
{{VSST biblio
 |id=ISO 639:1988
 |auteur=International Organization for Standardization
 |texte= ISO 639. Code for the representation of names of languages, 1988.}}
{{VSST biblio
 |id=ISO 690:1987
 |auteur=International Organization for Standardization
 |texte= ISO 690. Information and Documentation - Bibliographic references - Content, form and structure, 1987.}}
{{VSST biblio
 |id=ISO 3166:1997
 |auteur=International Organization for Standardization
 |texte= ISO 3166. (revision of 1988) Code for the representation of names of countries, 1997.}}
{{VSST biblio
 |id=ISO 8601:1988
 |auteur=International Organization for Standardization
 |texte= ISO 8601. Data elements and interchange formats -- Information interchange -- Representation od dates and times, 1988.}}
{{VSST biblio
 |id=ISO 8879:1986
 |auteur=International Organization for Standardization
 |texte= ISO 8879. Information processing -- Text and Office Systems -- Standard Generalized Markup Language (SGML), 1986. }}
{{VSST biblio
 |id=Grivel 99
 |auteur=Luc Grivel
 |texte= Hélène Fagherazzi, Philippe Fourneret, Alain Zerouki. La conception de bases de données infométriques hybrides : analyse de la pratique de trois observatoires européens. In Les systèmes d’information élaborées, SFBA, Ile Rousse, septembre 99.}}
{{VSST biblio
 |id=Jolibois 1999
 |auteur=Samuel Jolibois
 |auteur 2=Emmanuel Nauer
 |auteur 3=Dominique Chouanière
 |auteur 4=Jacques Ducloy
 |texte= Françoise Grandjean, and Marc Mouzé-Amady. Adaptation des normes et formats documentaires à la gestion informatisée de corpus bibliographiques. Bulletin des Bibliothèques de France, 1999. A paraître.}}
{{VSST biblio
 |id=Laisiepen 1980
 |auteur=K. Laisiepen
 |texte= E. Lutterbeck, and K.H. Meyer-Uhlenried. Grundlagen der praktischen. Information und Dokumentation. Saur, 1980.}}
{{VSST biblio
 |id=MARC 1999
 |auteur=Library of Congress 
 |texte=(LC). MARC Standards, 1999. <br/>Available from http://lcweb.loc.gov/marc/marc.html.
}}
{{VSST biblio
 |id=Nauer 1999
 |auteur=Emmanuel Nauer
 |texte= Les problèmes de variations terminologiques dans l’indexation de références bibliographiques. In Journées Internationales de Linguistique Appliquée (JILA’99). LILLA - Université de Nice, juin 1999.}}
{{VSST biblio
 |id=Polanco 95
 |auteur=Xavier Polanco
 |texte= Jean Royauté, Luc Grivel et Alain Courgey. Une approche linguistico-infométrique au service de la veille scientifique et technologique. In Les systèmes d’information élaborées, SFBA, Ile Rousse, juin 1995.}}
{{VSST biblio
 |id=TEI 1994
 |auteur=Electronic Text Center (ETC). TEI Guidelines for Electronic Text Encoding
 |texte= 1994. Available from http ://etext.virginia.edu/TEI.html. }}

{{JIE fin corps}}
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