Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, data : Différence entre versions
De Wicri Santé
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| − | *[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, | + | *[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, maps]] - ''génération de cartes géographiques'' |
*[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques'' | *[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques'' | ||
==La table des paramètres== | ==La table des paramètres== | ||
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|MaghrebDataLibMedV2 | |MaghrebDataLibMedV2 | ||
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| − | | | + | |fr |
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| − | | | + | |wikiCode |
|Area | |Area | ||
| − | | | + | |Wicri/Sante |
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|listStreams | |listStreams | ||
|Area | |Area | ||
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|mergingList | |mergingList | ||
|Area/Main | |Area/Main | ||
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| + | |} | ||
| + | ==Curation== | ||
| + | {| class="wikitable sortable" | ||
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| + | |||
==Corpus== | ==Corpus== | ||
{| class="wikitable sortable" | {| class="wikitable sortable" | ||
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!rubrique | !rubrique | ||
!valeur | !valeur | ||
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|importFile | |importFile | ||
| − | |Area/PubMed/Corpus | + | |Area/PubMed/Corpus |
| − | |pubmed_result.xml | + | |pubmed_result.xml |
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| − | |Area/Pmc/Corpus | + | |Area/Pmc/Corpus |
|pmc_result.xml | |pmc_result.xml | ||
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|} | |} | ||
| + | |||
==Mise en œuvre== | ==Mise en œuvre== | ||
;Définition $EXPLOR_AREA: | ;Définition $EXPLOR_AREA: | ||
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ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA | ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA | ||
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk | make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk | ||
| + | </source> | ||
| + | ;Importation des paramètres de navigation: | ||
| + | <source lang="sh"> | ||
| + | WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr"\ | ||
| + | > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki | ||
| + | </source> | ||
| + | <source lang="sh"> | ||
| + | sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh | ||
</source> | </source> | ||
Version actuelle datée du 30 juin 2021 à 18:23
Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version MaghrebDataLibMedV2 du « Serveur sur les données et bibliothèques médicales au Maghreb (version finale)».
Voir aussi :
- Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr - paramètres de navigation.
- Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, maps - génération de cartes géographiques
- Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, templates size - paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques
La table des paramètres
| type | rubrique | valeur |
|---|---|---|
| areaCode | Area | MaghrebDataLibMedV2 |
| langs | Area | fr |
| wikiCode | Area | Wicri/Sante |
| listStreams | Area | PubMed ; Pmc ; Main |
| typeStream | Area/PubMed | Nlm:Medline |
| typeStream | Area/Pmc | Nlm:Pmc |
| typeStream | Area/Main | Nlm:NcbiMain |
| mergingList | Area/Main | PubMed ; Pmc |
Curation
| type | rubrique | valeur |
|---|---|---|
| persCurationOption | Area/PubMed/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| persCurationOption | Area/Pmc/Checkpoint | w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict |
| rejectIdnoRBID | Area/PubMed/Curation | pubmed:24797575 ; pubmed:25059949 ; pubmed:33798514 ; pubmed:27031105 |
| rejectIdnoRBID | Area/Pmc/Curation | PMC:4816507 |
Corpus
| type | rubrique | valeur |
|---|---|---|
| importFile | Area/PubMed/Corpus | pubmed_result.xml |
| importFile | Area/Pmc/Corpus | pmc_result.xml |
Mise en œuvre
- Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/MaghrebDataLibMed.storage/MaghrebDataLibMedV2
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
- Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, data"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki
Si reprise
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
- Importation des paramètres de navigation
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
