Discussion:Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne/Version 3 : Différence entre versions

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imported>Jacques Ducloy
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==Génération des cartes==
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==Génération==
 
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EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Sante/explor/GrippeAllemagne.storage/GrippeAllemagneV2
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NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (germany[MeSH Terms])" -s 2000 \
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    -d GrippeAllemagneV3                                                \
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    -t "Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne"
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tar -cvf GrippeAllemagneV3.tar GrippeAllemagneV3
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gzip GrippeAllemagneV3.tar
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scp GrippeAllemagneV3.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/GrippeAllemagne.storage
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</source>
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;Sur la machine lorexplor:
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<source lang="sh">
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gunzip GrippeAllemagneV3.tar.gz
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tar -xvf GrippeAllemagneV3.tar
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gzip GrippeAllemagneV3.tar
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</source>
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===Génération des cartes===
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<source lang="sh">
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EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeAllemagne.storage/GrippeAllemagneV3
 
export EXPLOR_AREA
 
export EXPLOR_AREA
 
export LC_ALL='C'
 
export LC_ALL='C'
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</source>
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<source lang="sh" ">
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MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml
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 +
HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
 +
  | SxmlCut idx/l        \
 +
  | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB/data/Wicri/Allemagne/localisationLandsAllemagne.dict \
 +
                        -m Allemagne -f "Germany location map.svg" -s 650  \
 +
                        -a GrippeAllemagneV3 -t "Carte Allemagne Lands"                        \
 +
                        -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
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    >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml
 +
 +
HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
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    | SxmlCut idx/l        \
 +
    | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB/data/Wicri/Allemagne/localisationRegionAllemagneNuts2.dict \
 +
                          -m Allemagne -f "Germany (+districts) location map.svg" -s 650  \
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                          -a GrippeAllemagneV3 -t "Carte Allemagne NUTS2"                        \
 +
                          -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
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    >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml
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MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml
 
</source>
 
</source>

Version actuelle datée du 10 août 2020 à 18:04

Génération

NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (germany[MeSH Terms])" -s 2000 \
    -d GrippeAllemagneV3                                                \
    -t "Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne"
tar -cvf GrippeAllemagneV3.tar GrippeAllemagneV3
gzip GrippeAllemagneV3.tar

scp GrippeAllemagneV3.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/GrippeAllemagne.storage
Sur la machine lorexplor
gunzip GrippeAllemagneV3.tar.gz
tar -xvf GrippeAllemagneV3.tar
gzip GrippeAllemagneV3.tar

Génération des cartes

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeAllemagne.storage/GrippeAllemagneV3
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml

HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
   | SxmlCut idx/l        \
   | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB/data/Wicri/Allemagne/localisationLandsAllemagne.dict \
                         -m Allemagne -f "Germany location map.svg" -s 650  \
                         -a GrippeAllemagneV3 -t "Carte Allemagne Lands"                        \
                         -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
     >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml

HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
    | SxmlCut idx/l        \
    | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB/data/Wicri/Allemagne/localisationRegionAllemagneNuts2.dict \
                          -m Allemagne -f "Germany (+districts) location map.svg" -s 650  \
                          -a GrippeAllemagneV3 -t "Carte Allemagne NUTS2"                        \
                           -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
     >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml

MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMapsGermany.xml
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