Wicri:TocilizumabV1/Paramètres, data

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Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version TocilizumabV1 du « Serveur d'exploration Tocilizumab ».

Voir aussi :

La table des paramètres

type rubrique valeur
areaCode Area TocilizumabV1
wikiCode Area Sante
langs Area fr
listStreams Area Istex ;PubMed ;Pmc ;Ncbi ;Hal ;PascalFrancis ;Main; France ; 2020
typeStream Area/Main Explor:MainMerge
typeStream Area/Istex Istex:IstexMulti
typeStream Area/PubMed Nlm:Medline
typeStream Area/Pmc Nlm:Pmc
typeStream Area/Hal Ccsd:HalV3
typeStream Area/Ncbi Nlm:Ncbi
typeStream Area/PascalFrancis Inist:Stanalyst
mergingList Area/Main Istex ; Ncbi ; Hal ; PascalFrancis
mergingList Area/Ncbi PubMed ; Pmc
typeStream Area/France Explor:IndexSelect
typeStream Area/2020 Explor:BiblioFilter

Corpus

type rubrique valeur
Istex:linkCorpus Area/Istex/Corpus $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.hfd
importFile Area/PubMed/Corpus pubmed_result.xml
importFile Area/Pmc/Corpus pmc_result.xml
Ccsd:teiImportFile Area/Hal/Corpus api.archives-ouvertes.fr.xml
Inist:standardImportFile Area/PascalFrancis/Corpus inistStandard.txt
Inist:serveurImportFile Area/PascalFrancis/Corpus inistServer.txt

Les Zooms

type étape valeur
selectOrCommand Area/France/Extraction :AffPays.i ; France
extractionFilter Area/2020/Extraction grep 2020

Curation

type étape valeur
persCurationOption Area/Istex/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
persCurationOption Area/Pmc/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
persCurationOption Area/PubMed/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
persCurationOption Area/PascalFrancis/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict

Mise en œuvre

Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/Tocilizumab.storage/TocilizumabV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:TocilizumabV1/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
Mise à jour partielle (ajout de zoom...)
ExplorAreaDataUpdate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk