Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, data : Différence entre versions

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du « [[Serveur d'exploration test]] ».
+
du « [[Serveur sur les données et bibliothèques médicales au Maghreb (version finale)]]».
  
 
Voir aussi :
 
Voir aussi :
 
* [[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr]] - ''paramètres de navigation''.
 
* [[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr]] - ''paramètres de navigation''.
−
*[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
+
*[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, maps]] - ''génération de cartes géographiques''
 
*[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques''
 
*[[Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques''
 
==La table des paramètres==
 
==La table des paramètres==
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|MaghrebDataLibMedV2
 
|MaghrebDataLibMedV2
 
|-
 
|-
−
|wikiCode
+
|langs
 
|Area
 
|Area
−
|Sante
+
|fr
 
|-
 
|-
−
|langs
+
|wikiCode
 
|Area
 
|Area
−
|fr
+
|Wicri/Sante
 
|-
 
|-
 
|listStreams
 
|listStreams
 
|Area
 
|Area
−
|Istex ;PubMed ;Pmc ;Main
+
|PubMed ; Pmc ; Main
 
|-
 
|-
 
|typeStream
 
|typeStream
−
|Area/Main
+
|Area/PubMed
−
|Explor:MainMerge
+
|Nlm:Medline
 
|-
 
|-
 
|typeStream
 
|typeStream
−
|Area/Istex
+
|Area/Pmc
−
|Istex:IstexMulti
+
|Nlm:Pmc
 
|-
 
|-
 
|typeStream
 
|typeStream
−
|Area/PubMed
+
|Area/Main
−
|Nlm:Medline
+
|Nlm:NcbiMain
−
|-
 
−
|typeStream
 
−
|Area/Pmc
 
−
|Nlm:Pmc
 
 
|-
 
|-
 
|mergingList
 
|mergingList
 
|Area/Main
 
|Area/Main
−
|Istex ; PubMed ; Pmc
+
|PubMed ; Pmc
 +
|-
 +
|}
 +
==Curation==
 +
{| class="wikitable sortable"
 +
|-
 +
!type
 +
!rubrique
 +
!valeur
 +
|-
 +
|persCurationOption
 +
|Area/PubMed/Checkpoint
 +
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
 +
|-
 +
|persCurationOption
 +
|Area/Pmc/Checkpoint
 +
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
 +
|-
 +
|rejectIdnoRBID
 +
|Area/PubMed/Curation
 +
|pubmed:24797575 ; pubmed:25059949 ; pubmed:33798514 ; pubmed:27031105
 +
|-
 +
|rejectIdnoRBID
 +
|Area/Pmc/Curation
 +
|PMC:4816507
 
|-
 
|-
 
|}
 
|}
 +
 
==Corpus==
 
==Corpus==
 
{| class="wikitable sortable"
 
{| class="wikitable sortable"
Ligne 56 : Ligne 77 :
 
!rubrique
 
!rubrique
 
!valeur
 
!valeur
−
|-
 
−
|Istex:linkCorpus
 
−
|Area/Istex/Corpus
 
−
|$EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.hfd
 
 
|-
 
|-
 
|importFile
 
|importFile
−
|Area/PubMed/Corpus
+
|Area/PubMed/Corpus  
−
|pubmed_result.xml
+
|pubmed_result.xml  
 
|-
 
|-
 
|importFile
 
|importFile
−
|Area/Pmc/Corpus
+
|Area/Pmc/Corpus  
 
|pmc_result.xml
 
|pmc_result.xml
 
|-
 
|-
 
|}
 
|}
 +
 
==Mise en œuvre==
 
==Mise en œuvre==
 
;Définition $EXPLOR_AREA:
 
;Définition $EXPLOR_AREA:
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ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
 
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
 
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
 
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
 +
</source>
 +
;Importation des paramètres de navigation:
 +
<source lang="sh">
 +
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr"\
 +
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
 +
</source>
 +
<source lang="sh">
 +
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
 
</source>
 
</source>

Version actuelle datée du 30 juin 2021 à 17:23

Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version MaghrebDataLibMedV2 du « Serveur sur les données et bibliothèques médicales au Maghreb (version finale)».

Voir aussi :

La table des paramètres

type rubrique valeur
areaCode Area MaghrebDataLibMedV2
langs Area fr
wikiCode Area Wicri/Sante
listStreams Area PubMed ; Pmc ; Main
typeStream Area/PubMed Nlm:Medline
typeStream Area/Pmc Nlm:Pmc
typeStream Area/Main Nlm:NcbiMain
mergingList Area/Main PubMed ; Pmc

Curation

type rubrique valeur
persCurationOption Area/PubMed/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
persCurationOption Area/Pmc/Checkpoint w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict
rejectIdnoRBID Area/PubMed/Curation pubmed:24797575 ; pubmed:25059949 ; pubmed:33798514 ; pubmed:27031105
rejectIdnoRBID Area/Pmc/Curation PMC:4816507

Corpus

type rubrique valeur
importFile Area/PubMed/Corpus pubmed_result.xml
importFile Area/Pmc/Corpus pmc_result.xml

Mise en œuvre

Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/MaghrebDataLibMed.storage/MaghrebDataLibMedV2
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise 

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh

ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
Importation des paramètres de navigation
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:MaghrebDataLibMedV2/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
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