Discussion:Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil (version V1)

Covid et épidémies grippales / Serveurs / La grippe au Brésil

Génération

NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (brazil[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeBresilV1
tar -cvf GrippeBresilV1.tar GrippeBresilV1
gzip GrippeBresilV1.tar

scp GrippeBresilV1.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Sante/explor/GrippeBresil.storage

Sur la machine lorexplor

gunzip GrippeBresilV1.tar.gz
tar -xvf GrippeBresilV1.tar
gzip GrippeBresilV1.tar

Génération des cartes

EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Sante/explor/GrippeBresil.storage/GrippeBresilV1
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'

MediaWikiExportCommand -c fileBegin > $EXPLOR_AREA/exportMapsBresil.xml

HfdCat $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/AffRegion.i.hfd \
    | SxmlCut idx/l        \
    | MediaWikiGeoStatMap -o w -g $DILIB//data/Wicri/Bresil/localisationEtatsBresil.dict  \
            -m Brésil -f "Brazil location map.svg" -s 650  \
            -a GrippeBresilV1 -t "Carte Brésil états"                 \
            -h https://lorexplor.istex.fr/Wicri/Sante/explor \
     >> $EXPLOR_AREA/exportMapsBresil.xml

MediaWikiExportCommand -c fileEnd >> $EXPLOR_AREA/exportMapsBresil.xml

Version V2

NlmPubMedExplorCorpus -q "(influenza) AND (brazil[MeSH Terms])" -s 2000 -d GrippeBresilV2 -t "Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil"