Serveur d'exploration : Différence entre versions

De Wicri Santé
imported>Jacques Ducloy
(Autour de la COVID)
(Serveurs en cours de migration)
 
(2 révisions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées)
Ligne 28 : Ligne 28 :
  
 
===Génération rapide sur PubMed===
 
===Génération rapide sur PubMed===
 +
Dans les expérimentations précédentes sur la Covid, des améliorations ont été apportées dans l'utilisation de la traduction française du MeSH. Celle-ci compensait notamment l'arrêt de Pascal qui apportait ce multilinguisme. De plus, les éditeurs ont généralement mis en accès public la plupart des documents sur les épidémies grippales.
 +
 +
Nous avons donc développé une procédure simplifiée portant exclusivement sur PubMed. Elle a été testée sur la détection de faits épidémiques.
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne]]
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne]]
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en France]]
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en France]]
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne]] (avec les 3 versions initiales)
+
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne]] (avec les 3 versions initiales)
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil]] (avec les 1 version initiale)
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil]] (avec les 1 version initiale)
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe au Canada]] (avec les 3 versions initiales)
 
* [[Serveur d'exploration sur la grippe au Canada]] (avec les 3 versions initiales)
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique]] (avec les 4 versions initiales)
+
* [[Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique]] (avec les 4 versions initiales)
  
 +
Les résultats ont été spectaculaires en termes de réactivité. La génération d'un serveur multi-bases demande plusieurs heures et demande un travail considérable de curation.
  
 +
Avec la traduction française du MeSH (qui est un véritable thésaurus) il est maintenant possible d'obtenir un serveur explorables en quelques minutes.
  
 +
Nous avons également montré qu'il était possible de le compléter un un ensemble en plein-texte.
  
 +
==Bilan général==
 +
===Serveurs en cours de migration===
 +
Suite à un problème de sécurité informatique, l'ensemble du réseau Wicri est en cours de migration.
  
==Bilan général==
+
Cela concerne également les serveurs d'exploration qui ne sont plus accessibles.
 +
 
 +
Voici les serveurs actuellement accessibles sur ce wiki :
 +
{{#ask: [[Catégorie:Serveurs Démo.Istex]]
 +
| ?A pour taille HAL=HAL
 +
| ?A pour taille ISTEX=ISTEX
 +
| ?A pour taille PubMed = PubMed
 +
| ?A pour taille PubMed Central= PMC
 +
| ?A pour taille Pascal=Pascal
 +
| ?A pour taille Francis=Francis
 +
| ?A pour volumétrie (serveur d'exploration)=Total
 +
| ?A pour volumétrie finale=Total corrigé
 +
}}
 
''Produit par des moyens automatiques''.
 
''Produit par des moyens automatiques''.
 +
 +
===Liste plus complète des serveurs===
 +
Cette liste regroupe des serveurs qui ont été réalisés mais qui n'ont pas tous été transportés.
 
{{Explor récapitulatif serveurs d'exploration}}
 
{{Explor récapitulatif serveurs d'exploration}}
  

Version actuelle datée du 27 mars 2021 à 09:11

Utilisation des outils d'exploration (Explor) par des contributeurs sur le réseau Wicri

Un serveur d'exploration est un outil en cours de développement autour du réseau Wicri (projet LorExplor) pour donner accès, dans un mode exploratoire, à une large bibliographie sur un sujet donné.

Principales expérimentations

Dans la dynamique du projet ISTEX

Nous avons repris des travaux menés à l'INIST et au LORIA sur les serveurs d'investigation dans les années 1992 - 2005. Citons par exemple le projet MedExplore.

Dans la dynamique entrainée par ISTEX, la disponibilité des wikis sémantiques a entrainé une nouvelle série de développements sous la dénomination serveur d'exploration.

En attendant la disponibilité de corpus sur la plateforme ISTEX, des premières expérimentations ont été menées avec PubMed :

Puis les travaux en médecine ont porté sur 4 axes principaux :

Plateformes multi-bases Autour de la COVID

A l'issue du projet ISTEX, le projet Wicri disposait d'un protocole permettant de monter une plateforme de curation et d'exploration en partant de plusieurs sources : un noyau « Pascal ISTEX » complété par HAL et PubMed.

Plusieurs expérimentations de ce type ont été menées dans le contexte de la pandémie COVID :

Génération rapide sur PubMed

Dans les expérimentations précédentes sur la Covid, des améliorations ont été apportées dans l'utilisation de la traduction française du MeSH. Celle-ci compensait notamment l'arrêt de Pascal qui apportait ce multilinguisme. De plus, les éditeurs ont généralement mis en accès public la plupart des documents sur les épidémies grippales.

Nous avons donc développé une procédure simplifiée portant exclusivement sur PubMed. Elle a été testée sur la détection de faits épidémiques.

Les résultats ont été spectaculaires en termes de réactivité. La génération d'un serveur multi-bases demande plusieurs heures et demande un travail considérable de curation.

Avec la traduction française du MeSH (qui est un véritable thésaurus) il est maintenant possible d'obtenir un serveur explorables en quelques minutes.

Nous avons également montré qu'il était possible de le compléter un un ensemble en plein-texte.

Bilan général

Serveurs en cours de migration

Suite à un problème de sécurité informatique, l'ensemble du réseau Wicri est en cours de migration.

Cela concerne également les serveurs d'exploration qui ne sont plus accessibles.

Voici les serveurs actuellement accessibles sur ce wiki :

 HALISTEXPubMedPMCPascalFrancisTotalTotal corrigé
Serveur d'exploration Chloroquine2624 5007011 12510406 6926 435
Serveur d'exploration Covid131 0527678147112 7182 451
Serveur d'exploration Covid (26 mars)131 0521 4211 1447113 7023 214
Serveur d'exploration Covid et maladies cardiovasculaires408408408
Serveur d'exploration H2N23402 5086651 45414005 1074 660
Serveur d'exploration MERS254 0004 3262 049118110 5198 450
Serveur d'exploration SDRA et décubitus ventral671671671
Serveur d'exploration SRAS2033 7075 3592 563989612 82710 380
Serveur d'exploration Santé et pratique musicale3 1993 1993 199
Serveur d'exploration Stress et Covid2243 5731 1451 000294886 3245 969
Serveur d'exploration Tocilizumab862 2643 0191 82526317 4596 869
Serveur d'exploration sur l'automédication dans le monde francophone3 2993 2993 299
Serveur d'exploration sur la COVID chez les séniors1 0001 0001 000
Serveur d'exploration sur la COVID en France2 4932 4932 493
Serveur d'exploration sur la Covid et les espaces publics250250250
Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil386386386
Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil (version V1)378378378
Serveur d'exploration sur la grippe au Canada1 3951 3951 395
Serveur d'exploration sur la grippe aux Pays-Bas582582582
Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne639639639
Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne/Version 3635635635
Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique131131131
Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne779779779
Serveur d'exploration sur la grippe en France803803803
Serveur d'exploration sur le Covid à Stanford864864864
Serveur d'exploration sur le confinement (PubMed)4 1354 1354 135
Serveur d'exploration sur les variants du Covid331331331
Serveur d'explorations sur les aspects psychologiques du Covid1 4001 4001 400

Produit par des moyens automatiques.

Liste plus complète des serveurs

Cette liste regroupe des serveurs qui ont été réalisés mais qui n'ont pas tous été transportés.

 HALISTEXPubMedPMCPascalFrancisTotal
Cyberinfrastructure19819721721237221 911
Danse-thérapie et Parkinson4275134064828
Joseph Jankovic2 6313502133 532
La maladie de Parkinson au Canada (serveur d'exploration)44 3292 9421 2921 79011310 470
La maladie de Parkinson en France (serveur d'exploration)1 2993 7272 4899962 79116911 473
Le SIDA au Ghana (serveur d'exploration)1 000956528160302 674
Le SIDA en Afrique subsaharienne (serveur d'exploration)378 3182 9384 74899714217 181
Movement Disorders (revue)707 0528 1324705 902821 634
Movement Disorders (revue)/V12 0762 076
Serveur d'exploration COVID et hydrochloroquine2 6662 666
Serveur d'exploration Chloroquine2624 5007011 12510406 692
Serveur d'exploration Covid131 0527678147112 718
Serveur d'exploration Covid (26 mars)131 0521 4211 1447113 702
Serveur d'exploration Covid et maladies cardiovasculaires408408
Serveur d'exploration H2N23402 5086651 45414005 107
Serveur d'exploration Hippolyte Bernheim2321 7762722128182 302
Serveur d'exploration MERS254 0004 3262 049118110 519
Serveur d'exploration Posturo2 4582 458
Serveur d'exploration SDRA et décubitus ventral671671
Serveur d'exploration SRAS2033 7075 3592 563989612 827
Serveur d'exploration Santé et chant choral292292
Serveur d'exploration Santé et pratique musicale3 1993 199
Serveur d'exploration Stress et Covid2243 5731 1451 000294886 324
Serveur d'exploration Tocilizumab862 2643 0191 82526317 459
Serveur d'exploration biomatériau et biomimétisme213 9412 1223 824701110 610
Serveur d'exploration sur ChatGPT en France dans Pubmed6161
Serveur d'exploration sur l'automédication dans le monde francophone3 2993 299
Serveur d'exploration sur l'eugénisme1 4631 463
Serveur d'exploration sur l'immunologie des muqueuses et le covid144144
Serveur d'exploration sur la COVID chez les séniors1 0001 000
Serveur d'exploration sur la COVID en France2 4932 493
Serveur d'exploration sur la Covid et les espaces publics250250
Serveur d'exploration sur la e-cigarette1 5421 542
Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil386386
Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil (version V1)378378
Serveur d'exploration sur la grippe au Canada1 3951 395
Serveur d'exploration sur la grippe au Canada/Version 31 3871 387
Serveur d'exploration sur la grippe aux Pays-Bas582582
Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne639639
Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne/Version 3635635
Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique131131
Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique/Version 4130130
Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne779779
Serveur d'exploration sur la grippe en France803803
Serveur d'exploration sur la maladie de Parkinson5 0005 000
Serveur d'exploration sur la paléopathologie452 4692 0524221982735 459
Serveur d'exploration sur la santé et le chant choral (version intermédiaire)291291
Serveur d'exploration sur la visibilité du Luxembourg à la NLM8262144
Serveur d'exploration sur la voix et les aérosols170170
Serveur d'exploration sur le Covid à Stanford864864
… autres résultats

Voir aussi

Sur ce wiki
Dans le réseau Wicri :

La page de référence « Serveur d'exploration » est sur le wiki Wicri/Outils.