Serveur d'exploration : Différence entre versions
imported>Jacques Ducloy |
(→Serveurs en cours de migration) |
||
(23 révisions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées) | |||
Ligne 1 : | Ligne 1 : | ||
[[Fichier:WicriIstex.png|right|350px|thumb|Utilisation des outils d'exploration (Explor) par des contributeurs sur le réseau Wicri]] | [[Fichier:WicriIstex.png|right|350px|thumb|Utilisation des outils d'exploration (Explor) par des contributeurs sur le réseau Wicri]] | ||
Un serveur d'exploration est un outil en cours de développement autour du [[réseau Wicri]] (projet [[LorExplor]]) pour donner accès, dans un mode exploratoire, à une large bibliographie sur un sujet donné. | Un serveur d'exploration est un outil en cours de développement autour du [[réseau Wicri]] (projet [[LorExplor]]) pour donner accès, dans un mode exploratoire, à une large bibliographie sur un sujet donné. | ||
− | == | + | ==Principales expérimentations== |
− | * [[Serveur d'exploration sur la visibilité du Luxembourg à la NLM]] | + | ===Dans la dynamique du projet ISTEX=== |
− | * [[Serveur d'exploration sur le déni de grossesse]] | + | Nous avons repris des travaux menés à l'INIST et au LORIA sur les serveurs d'investigation dans les années 1992 - 2005. Citons par exemple le projet MedExplore. |
− | + | ||
+ | Dans la dynamique entrainée par ISTEX, la disponibilité des wikis sémantiques a entrainé une nouvelle série de développements sous la dénomination serveur d'exploration. | ||
+ | |||
+ | En attendant la disponibilité de corpus sur la plateforme ISTEX, des premières expérimentations ont été menées avec PubMed : | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la visibilité du Luxembourg à la NLM]], | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur le déni de grossesse]]. | ||
+ | Puis les travaux en médecine ont porté sur 4 axes principaux : | ||
+ | * La [[Maladie de Parkinson]], | ||
+ | * Le [[Lymphœdème]], | ||
+ | * Le Sida, | ||
+ | * Le patient édenté total. | ||
+ | |||
+ | ===Plateformes multi-bases Autour de la COVID=== | ||
+ | A l'issue du projet ISTEX, le projet Wicri disposait d'un protocole permettant de monter une plateforme de curation et d'exploration en partant de plusieurs sources : un noyau « Pascal ISTEX » complété par HAL et PubMed. | ||
+ | |||
+ | Plusieurs expérimentations de ce type ont été menées dans le contexte de la pandémie COVID : | ||
+ | * [[Serveur d'exploration Covid]], | ||
+ | * [[Serveur d'exploration Covid (26 mars)]], | ||
+ | * [[Serveur d'exploration Chloroquine]] | ||
+ | * [[Serveur d'exploration Tocilizumab]] | ||
+ | * [[Serveur d'exploration H2N2]] | ||
+ | * [[Serveur d'exploration MERS]] | ||
+ | |||
+ | ===Génération rapide sur PubMed=== | ||
+ | Dans les expérimentations précédentes sur la Covid, des améliorations ont été apportées dans l'utilisation de la traduction française du MeSH. Celle-ci compensait notamment l'arrêt de Pascal qui apportait ce multilinguisme. De plus, les éditeurs ont généralement mis en accès public la plupart des documents sur les épidémies grippales. | ||
+ | |||
+ | Nous avons donc développé une procédure simplifiée portant exclusivement sur PubMed. Elle a été testée sur la détection de faits épidémiques. | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne]] | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe en France]] | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne]] (avec les 3 versions initiales) | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil]] (avec les 1 version initiale) | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe au Canada]] (avec les 3 versions initiales) | ||
+ | * [[Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique]] (avec les 4 versions initiales) | ||
+ | |||
+ | Les résultats ont été spectaculaires en termes de réactivité. La génération d'un serveur multi-bases demande plusieurs heures et demande un travail considérable de curation. | ||
+ | |||
+ | Avec la traduction française du MeSH (qui est un véritable thésaurus) il est maintenant possible d'obtenir un serveur explorables en quelques minutes. | ||
+ | |||
+ | Nous avons également montré qu'il était possible de le compléter un un ensemble en plein-texte. | ||
+ | |||
+ | ==Bilan général== | ||
+ | ===Serveurs en cours de migration=== | ||
+ | Suite à un problème de sécurité informatique, l'ensemble du réseau Wicri est en cours de migration. | ||
+ | |||
+ | Cela concerne également les serveurs d'exploration qui ne sont plus accessibles. | ||
+ | |||
+ | Voici les serveurs actuellement accessibles sur ce wiki : | ||
+ | {{#ask: [[Catégorie:Serveurs Démo.Istex]] | ||
+ | | ?A pour taille HAL=HAL | ||
+ | | ?A pour taille ISTEX=ISTEX | ||
+ | | ?A pour taille PubMed = PubMed | ||
+ | | ?A pour taille PubMed Central= PMC | ||
+ | | ?A pour taille Pascal=Pascal | ||
+ | | ?A pour taille Francis=Francis | ||
+ | | ?A pour volumétrie (serveur d'exploration)=Total | ||
+ | | ?A pour volumétrie finale=Total corrigé | ||
+ | }} | ||
''Produit par des moyens automatiques''. | ''Produit par des moyens automatiques''. | ||
+ | |||
+ | ===Liste plus complète des serveurs=== | ||
+ | Cette liste regroupe des serveurs qui ont été réalisés mais qui n'ont pas tous été transportés. | ||
{{Explor récapitulatif serveurs d'exploration}} | {{Explor récapitulatif serveurs d'exploration}} | ||
Version actuelle datée du 27 mars 2021 à 09:11
Un serveur d'exploration est un outil en cours de développement autour du réseau Wicri (projet LorExplor) pour donner accès, dans un mode exploratoire, à une large bibliographie sur un sujet donné.
Sommaire
Principales expérimentations
Dans la dynamique du projet ISTEX
Nous avons repris des travaux menés à l'INIST et au LORIA sur les serveurs d'investigation dans les années 1992 - 2005. Citons par exemple le projet MedExplore.
Dans la dynamique entrainée par ISTEX, la disponibilité des wikis sémantiques a entrainé une nouvelle série de développements sous la dénomination serveur d'exploration.
En attendant la disponibilité de corpus sur la plateforme ISTEX, des premières expérimentations ont été menées avec PubMed :
- Serveur d'exploration sur la visibilité du Luxembourg à la NLM,
- Serveur d'exploration sur le déni de grossesse.
Puis les travaux en médecine ont porté sur 4 axes principaux :
- La Maladie de Parkinson,
- Le Lymphœdème,
- Le Sida,
- Le patient édenté total.
Plateformes multi-bases Autour de la COVID
A l'issue du projet ISTEX, le projet Wicri disposait d'un protocole permettant de monter une plateforme de curation et d'exploration en partant de plusieurs sources : un noyau « Pascal ISTEX » complété par HAL et PubMed.
Plusieurs expérimentations de ce type ont été menées dans le contexte de la pandémie COVID :
- Serveur d'exploration Covid,
- Serveur d'exploration Covid (26 mars),
- Serveur d'exploration Chloroquine
- Serveur d'exploration Tocilizumab
- Serveur d'exploration H2N2
- Serveur d'exploration MERS
Génération rapide sur PubMed
Dans les expérimentations précédentes sur la Covid, des améliorations ont été apportées dans l'utilisation de la traduction française du MeSH. Celle-ci compensait notamment l'arrêt de Pascal qui apportait ce multilinguisme. De plus, les éditeurs ont généralement mis en accès public la plupart des documents sur les épidémies grippales.
Nous avons donc développé une procédure simplifiée portant exclusivement sur PubMed. Elle a été testée sur la détection de faits épidémiques.
- Serveur d'exploration sur la grippe en Espagne
- Serveur d'exploration sur la grippe en France
- Serveur d'exploration sur la grippe en Allemagne (avec les 3 versions initiales)
- Serveur d'exploration sur la grippe au Brésil (avec les 1 version initiale)
- Serveur d'exploration sur la grippe au Canada (avec les 3 versions initiales)
- Serveur d'exploration sur la grippe en Belgique (avec les 4 versions initiales)
Les résultats ont été spectaculaires en termes de réactivité. La génération d'un serveur multi-bases demande plusieurs heures et demande un travail considérable de curation.
Avec la traduction française du MeSH (qui est un véritable thésaurus) il est maintenant possible d'obtenir un serveur explorables en quelques minutes.
Nous avons également montré qu'il était possible de le compléter un un ensemble en plein-texte.
Bilan général
Serveurs en cours de migration
Suite à un problème de sécurité informatique, l'ensemble du réseau Wicri est en cours de migration.
Cela concerne également les serveurs d'exploration qui ne sont plus accessibles.
Voici les serveurs actuellement accessibles sur ce wiki :
Produit par des moyens automatiques.
Liste plus complète des serveurs
Cette liste regroupe des serveurs qui ont été réalisés mais qui n'ont pas tous été transportés.
Voir aussi
- Sur ce wiki
- Dans le réseau Wicri :
La page de référence « Serveur d'exploration » est sur le wiki Wicri/Outils.