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Wicri:CovidV1/Paramètres, data - Historique des versions
2026-05-13T19:02:34Z
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imported>Jacques Ducloy : /* Curation */
2020-03-25T11:17:34Z
<p><span dir="auto"><span class="autocomment">Curation</span></span></p>
<p><b>Nouvelle page</b></p><div>Cette page introduit les paramètres de génération des données de la version [[Wicri:CovidV1|CovidV1]] <br />
du « [[Serveur d'exploration Covid]] ».<br />
<br />
Voir aussi :<br />
* [[Wicri:CovidV1/Paramètres, fr]] - ''paramètres de navigation''.<br />
*[[Wicri:CovidV1/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''<br />
*[[Wicri:CovidV1/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques''<br />
==La table des paramètres==<br />
{| class="wikitable sortable"<br />
|-<br />
!type<br />
!rubrique<br />
!valeur<br />
|-<br />
|areaCode<br />
|Area<br />
|CovidV1<br />
|-<br />
|wikiCode<br />
|Area<br />
|Wicri/Sante<br />
|-<br />
|langs<br />
|Area<br />
|fr<br />
|-<br />
|listStreams<br />
|Area<br />
|Istex ;PubMed ;Pmc ;Ncbi ;Hal ;PascalFrancis ;Main; France ; an2020<br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/Main<br />
|Explor:MainMerge<br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/Istex<br />
|Istex:IstexMulti <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/PubMed<br />
|Nlm:Medline <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/Pmc<br />
|Nlm:Pmc <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/Hal<br />
|Ccsd:HalV3 <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/Ncbi<br />
|Nlm:Ncbi <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/PascalFrancis<br />
|Inist:Stanalyst <br />
|-<br />
|mergingList<br />
|Area/Main<br />
|Istex ; Ncbi ; Hal ; PascalFrancis<br />
|-<br />
|mergingList<br />
|Area/Ncbi<br />
|PubMed ; Pmc <br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/France<br />
|Explor:IndexSelect<br />
|-<br />
|typeStream<br />
|Area/an2020<br />
|Explor:BiblioFilter<br />
|-<br />
|}<br />
<br />
==Les Zooms==<br />
{| class="wikitable sortable"<br />
|-<br />
!type<br />
!étape<br />
!valeur<br />
|-<br />
|selectOrCommand<br />
|Area/France/Extraction<br />
|:AffPays.i ; France<br />
|-<br />
|extractionFilter<br />
|Area/an2020/Extraction<br />
|grep 2020<br />
|-<br />
|}<br />
<br />
==Corpus==<br />
{| class="wikitable sortable"<br />
|-<br />
!type<br />
!rubrique<br />
!valeur<br />
|-<br />
|Istex:linkCorpus<br />
|Area/Istex/Corpus<br />
|$EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.hfd <br />
|-<br />
|importFile<br />
|Area/PubMed/Corpus<br />
|pubmed_result.xml<br />
|-<br />
|importFile<br />
|Area/Pmc/Corpus<br />
|pmc_result.xml<br />
|-<br />
|Ccsd:teiImportFile<br />
|Area/Hal/Corpus<br />
|api.archives-ouvertes.fr.xml<br />
|-<br />
|Inist:standardImportFile<br />
|Area/PascalFrancis/Corpus<br />
|inistStandard.txt<br />
|-<br />
|Inist:serveurImportFile<br />
|Area/PascalFrancis/Corpus<br />
|inistServer.txt<br />
|-<br />
|}<br />
==Curation==<br />
{| class="wikitable sortable"<br />
|-<br />
!type<br />
!étape<br />
!valeur<br />
|-<br />
|persCurationOption<br />
|Area/Istex/Checkpoint<br />
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict <br />
|-<br />
|persCurationOption<br />
|Area/Pmc/Checkpoint<br />
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict <br />
|-<br />
|persCurationOption<br />
|Area/PubMed/Checkpoint<br />
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict<br />
|-<br />
|persCurationOption<br />
|Area/PascalFrancis/Checkpoint<br />
|w $DILIB/data/Wicri/Sante/persSante.dict <br />
|-<br />
|rejectIdnoISSN<br />
|Area/Istex/Curation<br />
|1492-7535 ; 0734-9750 ; 1440-1843 ; 0147-9571<br />
|-<br />
|keepIdnoRBID<br />
|Area/Istex/Curation<br />
|ISTEX:A0350CA0C5CA39A59374D3F246BE11C8BEE5194E ; ISTEX:DA6FBBFF06A86EDD2B2FCCB6905606563BD1AE15 ; ISTEX:B226495B7E963E4FE5AC5D5ECFBDD02352CE15A2 ; ISTEX:50C8CC9F5623C8C51B5B0EA7C3CD05F807C8F3D9 ; ISTEX:2C92AE2A170C54272B7090588770EBDD06820D38 ; ISTEX:15DD49E0ED3C4B260E52012856E849161EB2D3A8 ; ISTEX:3FD782F316CAA92071E955FA8239DEE14E297855 ; ISTEX:15FDA434633898272995DFA1C77BB5EA29AD2DCE ; ISTEX:4E0992394E5C825E6E9103AE9365F8E80E79D3D4 <br />
|-<br />
|}<br />
<br />
==Mise en œuvre==<br />
;Définition $EXPLOR_AREA:<br />
<source lang="sh"><br />
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Sante/explor/Covid.storage/CovidV1<br />
export EXPLOR_AREA<br />
export LC_ALL='C'<br />
</source><br />
;Importation des paramètres de génération:<br />
<source lang="sh"><br />
WicriGetPage -l wicri-sante.fr -p "Wicri:CovidV1/Paramètres, data"\<br />
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki <br />
</source><br />
Si reprise<br />
<source lang="sh"><br />
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh<br />
</source><br />
<source lang="sh"><br />
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA<br />
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk<br />
</source></div>
imported>Jacques Ducloy