Serveur d'exploration SRAS

Attention, ce site est en cours de développement !
Attention, site généré par des moyens informatiques à partir de corpus bruts.
Les informations ne sont donc pas validées.

Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène

Identifieur interne : 000532 ( PascalFrancis/Curation ); précédent : 000531; suivant : 000533

Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène

Auteurs : A. Goffard [France] ; M. Lazrek [France] ; C. Schanen [France] ; P.-E. Lobert [France] ; L. Bocket [France] ; A. Dewilde [France] ; D. Hober [France]

Source :

RBID : Pascal:06-0461397

Descripteurs français

English descriptors

Abstract

Cette synthèse a pour but de faire le point des connaissances concernant le virus du syndrome respiratoire aigu sévère (Sras) et le virus A/H5N1 hautement pathogène. En cas de suspicion d'infection par SARS-CoV, les recherches virologiques sont réalisées à partir d'une aspiration rhinopharyngée, d'une expectoration, d'un écouvillonnage de gorge ou d'un liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA) mais aussi des selles, des urines voire du sérum d'un patient venant d'une région où le virus du Sras aurait réémergé (ou travaillant dans un laboratoire étudiant le virus du Sras). L'isolement du virus sur culture cellulaire ou l'extraction de l'ARN viral en vue d'une RT-PCR doivent être réalisés dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3 (Biosafety level 3). Une RT-PCR spécifique du virus du Sras permet le diagnostic virologique. En raison de la moindre sensibilité de la RT-PCR spécifique du Sras, l'analyse des échantillons cliniques doit être répétée pendant plusieurs jours. La prise en charge d'échantillons biologiques pour une suspicion d'infection par le virus A/H5N1 hautement pathogène (tableau clinique de grippe chez une personne revenant d'une région où circule le virus A/H5N1), respecte la même procédure. En effet, le diagnostic virologique repose sur la mise en évidence du virus ou de son ARN génomique. Les échantillons biologiques permettant le diagnostic sont des prélèvements respiratoires, des selles, du sérum ou du liquide céphalorachidien (LCR). L'isolement du virus sur culture cellulaire doit être réalisé dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Pour la recherche de l'ARN génomique, l'extraction de l'ARN doit, elle aussi, être réalisée dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Une RT-PCR en temps réel ciblant un fragment du gène de l'hémagglutinine H5 permet un diagnostic spécifique de la grippe A/H5N1. Ces procédures sont actuellement en place dans les laboratoires de virologie afin de diagnostiquer les éventuels premiers cas de grippe à virus A/H5N1 ou la réémergence du virus du Sras.
pA  
A01 01  1    @0 0003-3898
A02 01      @0 ABCLAI
A03   1    @0 Ann. biol. clin. : (Paris)
A05       @2 64
A06       @2 3
A08 01  1  FRE  @1 Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène
A11 01  1    @1 GOFFARD (A.)
A11 02  1    @1 LAZREK (M.)
A11 03  1    @1 SCHANEN (C.)
A11 04  1    @1 LOBERT (P.-E.)
A11 05  1    @1 BOCKET (L.)
A11 06  1    @1 DEWILDE (A.)
A11 07  1    @1 HOBER (D.)
A14 01      @1 Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger @2 Lille @3 FRA @Z 1 aut. @Z 2 aut. @Z 3 aut. @Z 4 aut. @Z 5 aut. @Z 6 aut. @Z 7 aut.
A20       @1 195-208
A21       @1 2006
A23 01      @0 FRE
A24 01      @0 eng
A43 01      @1 INIST @2 1014 @5 354000153186200010
A44       @0 0000 @1 © 2006 INIST-CNRS. All rights reserved.
A45       @0 30 ref.
A47 01  1    @0 06-0461397
A60       @1 P
A61       @0 A
A64 01  1    @0 Annales de biologie clinique : (Paris)
A66 01      @0 FRA
A68 01  1  ENG  @1 Emergent viruses : SARS-associated coronavirus and H5N1 influenza virus
C01 01    FRE  @0 Cette synthèse a pour but de faire le point des connaissances concernant le virus du syndrome respiratoire aigu sévère (Sras) et le virus A/H5N1 hautement pathogène. En cas de suspicion d'infection par SARS-CoV, les recherches virologiques sont réalisées à partir d'une aspiration rhinopharyngée, d'une expectoration, d'un écouvillonnage de gorge ou d'un liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA) mais aussi des selles, des urines voire du sérum d'un patient venant d'une région où le virus du Sras aurait réémergé (ou travaillant dans un laboratoire étudiant le virus du Sras). L'isolement du virus sur culture cellulaire ou l'extraction de l'ARN viral en vue d'une RT-PCR doivent être réalisés dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3 (Biosafety level 3). Une RT-PCR spécifique du virus du Sras permet le diagnostic virologique. En raison de la moindre sensibilité de la RT-PCR spécifique du Sras, l'analyse des échantillons cliniques doit être répétée pendant plusieurs jours. La prise en charge d'échantillons biologiques pour une suspicion d'infection par le virus A/H5N1 hautement pathogène (tableau clinique de grippe chez une personne revenant d'une région où circule le virus A/H5N1), respecte la même procédure. En effet, le diagnostic virologique repose sur la mise en évidence du virus ou de son ARN génomique. Les échantillons biologiques permettant le diagnostic sont des prélèvements respiratoires, des selles, du sérum ou du liquide céphalorachidien (LCR). L'isolement du virus sur culture cellulaire doit être réalisé dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Pour la recherche de l'ARN génomique, l'extraction de l'ARN doit, elle aussi, être réalisée dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Une RT-PCR en temps réel ciblant un fragment du gène de l'hémagglutinine H5 permet un diagnostic spécifique de la grippe A/H5N1. Ces procédures sont actuellement en place dans les laboratoires de virologie afin de diagnostiquer les éventuels premiers cas de grippe à virus A/H5N1 ou la réémergence du virus du Sras.
C02 01  X    @0 002B24
C02 02  X    @0 002B05C02C
C03 01  X  FRE  @0 Maladie émergente @2 NM @5 01
C03 01  X  ENG  @0 Emerging disease @2 NM @5 01
C03 01  X  SPA  @0 Enfermedad emergente @2 NM @5 01
C03 02  X  FRE  @0 Homme @5 02
C03 02  X  ENG  @0 Human @5 02
C03 02  X  SPA  @0 Hombre @5 02
C03 03  X  FRE  @0 Appareil respiratoire @5 03
C03 03  X  ENG  @0 Respiratory system @5 03
C03 03  X  SPA  @0 Aparato respiratorio @5 03
C03 04  X  FRE  @0 Syndrome respiratoire aigu sévère @2 NM @5 05
C03 04  X  ENG  @0 Severe acute respiratory syndrome @2 NM @5 05
C03 04  X  SPA  @0 Síndrome respiratorio agudo severo @2 NM @5 05
C03 05  X  FRE  @0 Pathogène @5 06
C03 05  X  ENG  @0 Pathogenic @5 06
C03 05  X  SPA  @0 Patógeno @5 06
C03 06  X  FRE  @0 Coronavirus @2 NW @5 08
C03 06  X  ENG  @0 Coronavirus @2 NW @5 08
C03 06  X  SPA  @0 Coronavirus @2 NW @5 08
C03 07  X  FRE  @0 Influenzavirus @2 NW @5 09
C03 07  X  ENG  @0 Influenzavirus @2 NW @5 09
C03 07  X  SPA  @0 Influenzavirus @2 NW @5 09
C03 08  X  FRE  @0 Biologie clinique @5 11
C03 08  X  ENG  @0 Clinical biology @5 11
C03 08  X  SPA  @0 Biología clínica @5 11
C03 09  X  FRE  @0 Exploration virologique @5 12
C03 09  X  ENG  @0 Virological exploration @5 12
C03 09  X  SPA  @0 Análisis virológico @5 12
C03 10  X  FRE  @0 Examen laboratoire @5 14
C03 10  X  ENG  @0 Laboratory investigations @5 14
C03 10  X  SPA  @0 Examen laboratorio @5 14
C03 11  X  FRE  @0 Influenzavirus A(H5N1) @4 CD @5 96
C03 11  X  ENG  @0 Influenzavirus A(H5N1) @4 CD @5 96
C03 12  X  FRE  @0 Grippe aviaire @4 CD @5 97
C03 12  X  ENG  @0 Avian influenza @4 CD @5 97
C03 12  X  SPA  @0 Gripe aviar @4 CD @5 97
C07 01  X  FRE  @0 Virose
C07 01  X  ENG  @0 Viral disease
C07 01  X  SPA  @0 Virosis
C07 02  X  FRE  @0 Infection
C07 02  X  ENG  @0 Infection
C07 02  X  SPA  @0 Infección
C07 03  X  FRE  @0 Coronaviridae @2 NW
C07 03  X  ENG  @0 Coronaviridae @2 NW
C07 03  X  SPA  @0 Coronaviridae @2 NW
C07 04  X  FRE  @0 Nidovirales @2 NW
C07 04  X  ENG  @0 Nidovirales @2 NW
C07 04  X  SPA  @0 Nidovirales @2 NW
C07 05  X  FRE  @0 Virus @2 NW
C07 05  X  ENG  @0 Virus @2 NW
C07 05  X  SPA  @0 Virus @2 NW
C07 06  X  FRE  @0 Orthomyxoviridae @2 NW
C07 06  X  ENG  @0 Orthomyxoviridae @2 NW
C07 06  X  SPA  @0 Orthomyxoviridae @2 NW
C07 07  X  FRE  @0 Appareil respiratoire pathologie @5 37
C07 07  X  ENG  @0 Respiratory disease @5 37
C07 07  X  SPA  @0 Aparato respiratorio patología @5 37
C07 08  X  FRE  @0 Poumon pathologie @5 38
C07 08  X  ENG  @0 Lung disease @5 38
C07 08  X  SPA  @0 Pulmón patología @5 38
N21       @1 303

Links toward previous steps (curation, corpus...)


Links to Exploration step

Pascal:06-0461397

Le document en format XML

<record>
<TEI>
<teiHeader>
<fileDesc>
<titleStmt>
<title xml:lang="fr" level="a">Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène</title>
<author>
<name sortKey="Goffard, A" sort="Goffard, A" uniqKey="Goffard A" first="A." last="Goffard">A. Goffard</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Lazrek, M" sort="Lazrek, M" uniqKey="Lazrek M" first="M." last="Lazrek">M. Lazrek</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Schanen, C" sort="Schanen, C" uniqKey="Schanen C" first="C." last="Schanen">C. Schanen</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Lobert, P E" sort="Lobert, P E" uniqKey="Lobert P" first="P.-E." last="Lobert">P.-E. Lobert</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Bocket, L" sort="Bocket, L" uniqKey="Bocket L" first="L." last="Bocket">L. Bocket</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Dewilde, A" sort="Dewilde, A" uniqKey="Dewilde A" first="A." last="Dewilde">A. Dewilde</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Hober, D" sort="Hober, D" uniqKey="Hober D" first="D." last="Hober">D. Hober</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
</titleStmt>
<publicationStmt>
<idno type="wicri:source">INIST</idno>
<idno type="inist">06-0461397</idno>
<date when="2006">2006</date>
<idno type="stanalyst">PASCAL 06-0461397 INIST</idno>
<idno type="RBID">Pascal:06-0461397</idno>
<idno type="wicri:Area/PascalFrancis/Corpus">000458</idno>
<idno type="wicri:Area/PascalFrancis/Curation">000532</idno>
</publicationStmt>
<sourceDesc>
<biblStruct>
<analytic>
<title xml:lang="fr" level="a">Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène</title>
<author>
<name sortKey="Goffard, A" sort="Goffard, A" uniqKey="Goffard A" first="A." last="Goffard">A. Goffard</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Lazrek, M" sort="Lazrek, M" uniqKey="Lazrek M" first="M." last="Lazrek">M. Lazrek</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Schanen, C" sort="Schanen, C" uniqKey="Schanen C" first="C." last="Schanen">C. Schanen</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Lobert, P E" sort="Lobert, P E" uniqKey="Lobert P" first="P.-E." last="Lobert">P.-E. Lobert</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Bocket, L" sort="Bocket, L" uniqKey="Bocket L" first="L." last="Bocket">L. Bocket</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Dewilde, A" sort="Dewilde, A" uniqKey="Dewilde A" first="A." last="Dewilde">A. Dewilde</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Hober, D" sort="Hober, D" uniqKey="Hober D" first="D." last="Hober">D. Hober</name>
<affiliation wicri:level="1">
<inist:fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</inist:fA14>
<country>France</country>
</affiliation>
</author>
</analytic>
<series>
<title level="j" type="main">Annales de biologie clinique : (Paris)</title>
<title level="j" type="abbreviated">Ann. biol. clin. : (Paris)</title>
<idno type="ISSN">0003-3898</idno>
<imprint>
<date when="2006">2006</date>
</imprint>
</series>
</biblStruct>
</sourceDesc>
<seriesStmt>
<title level="j" type="main">Annales de biologie clinique : (Paris)</title>
<title level="j" type="abbreviated">Ann. biol. clin. : (Paris)</title>
<idno type="ISSN">0003-3898</idno>
</seriesStmt>
</fileDesc>
<profileDesc>
<textClass>
<keywords scheme="KwdEn" xml:lang="en">
<term>Avian influenza</term>
<term>Clinical biology</term>
<term>Coronavirus</term>
<term>Emerging disease</term>
<term>Human</term>
<term>Influenzavirus</term>
<term>Influenzavirus A(H5N1)</term>
<term>Laboratory investigations</term>
<term>Pathogenic</term>
<term>Respiratory system</term>
<term>Severe acute respiratory syndrome</term>
<term>Virological exploration</term>
</keywords>
<keywords scheme="Pascal" xml:lang="fr">
<term>Maladie émergente</term>
<term>Homme</term>
<term>Appareil respiratoire</term>
<term>Syndrome respiratoire aigu sévère</term>
<term>Pathogène</term>
<term>Coronavirus</term>
<term>Influenzavirus</term>
<term>Biologie clinique</term>
<term>Exploration virologique</term>
<term>Examen laboratoire</term>
<term>Influenzavirus A(H5N1)</term>
<term>Grippe aviaire</term>
</keywords>
<keywords scheme="Wicri" type="topic" xml:lang="fr">
<term>Homme</term>
</keywords>
</textClass>
</profileDesc>
</teiHeader>
<front>
<div type="abstract" xml:lang="fr">Cette synthèse a pour but de faire le point des connaissances concernant le virus du syndrome respiratoire aigu sévère (Sras) et le virus A/H5N1 hautement pathogène. En cas de suspicion d'infection par SARS-CoV, les recherches virologiques sont réalisées à partir d'une aspiration rhinopharyngée, d'une expectoration, d'un écouvillonnage de gorge ou d'un liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA) mais aussi des selles, des urines voire du sérum d'un patient venant d'une région où le virus du Sras aurait réémergé (ou travaillant dans un laboratoire étudiant le virus du Sras). L'isolement du virus sur culture cellulaire ou l'extraction de l'ARN viral en vue d'une RT-PCR doivent être réalisés dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3 (Biosafety level 3). Une RT-PCR spécifique du virus du Sras permet le diagnostic virologique. En raison de la moindre sensibilité de la RT-PCR spécifique du Sras, l'analyse des échantillons cliniques doit être répétée pendant plusieurs jours. La prise en charge d'échantillons biologiques pour une suspicion d'infection par le virus A/H5N1 hautement pathogène (tableau clinique de grippe chez une personne revenant d'une région où circule le virus A/H5N1), respecte la même procédure. En effet, le diagnostic virologique repose sur la mise en évidence du virus ou de son ARN génomique. Les échantillons biologiques permettant le diagnostic sont des prélèvements respiratoires, des selles, du sérum ou du liquide céphalorachidien (LCR). L'isolement du virus sur culture cellulaire doit être réalisé dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Pour la recherche de l'ARN génomique, l'extraction de l'ARN doit, elle aussi, être réalisée dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Une RT-PCR en temps réel ciblant un fragment du gène de l'hémagglutinine H5 permet un diagnostic spécifique de la grippe A/H5N1. Ces procédures sont actuellement en place dans les laboratoires de virologie afin de diagnostiquer les éventuels premiers cas de grippe à virus A/H5N1 ou la réémergence du virus du Sras.</div>
</front>
</TEI>
<inist>
<standard h6="B">
<pA>
<fA01 i1="01" i2="1">
<s0>0003-3898</s0>
</fA01>
<fA02 i1="01">
<s0>ABCLAI</s0>
</fA02>
<fA03 i2="1">
<s0>Ann. biol. clin. : (Paris)</s0>
</fA03>
<fA05>
<s2>64</s2>
</fA05>
<fA06>
<s2>3</s2>
</fA06>
<fA08 i1="01" i2="1" l="FRE">
<s1>Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène</s1>
</fA08>
<fA11 i1="01" i2="1">
<s1>GOFFARD (A.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="02" i2="1">
<s1>LAZREK (M.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="03" i2="1">
<s1>SCHANEN (C.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="04" i2="1">
<s1>LOBERT (P.-E.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="05" i2="1">
<s1>BOCKET (L.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="06" i2="1">
<s1>DEWILDE (A.)</s1>
</fA11>
<fA11 i1="07" i2="1">
<s1>HOBER (D.)</s1>
</fA11>
<fA14 i1="01">
<s1>Service de virologie, UPRES-EA3610, CHRU Lille, Faculté de Médecine, Université Lille 2, Bâtiment P. Boulanger</s1>
<s2>Lille</s2>
<s3>FRA</s3>
<sZ>1 aut.</sZ>
<sZ>2 aut.</sZ>
<sZ>3 aut.</sZ>
<sZ>4 aut.</sZ>
<sZ>5 aut.</sZ>
<sZ>6 aut.</sZ>
<sZ>7 aut.</sZ>
</fA14>
<fA20>
<s1>195-208</s1>
</fA20>
<fA21>
<s1>2006</s1>
</fA21>
<fA23 i1="01">
<s0>FRE</s0>
</fA23>
<fA24 i1="01">
<s0>eng</s0>
</fA24>
<fA43 i1="01">
<s1>INIST</s1>
<s2>1014</s2>
<s5>354000153186200010</s5>
</fA43>
<fA44>
<s0>0000</s0>
<s1>© 2006 INIST-CNRS. All rights reserved.</s1>
</fA44>
<fA45>
<s0>30 ref.</s0>
</fA45>
<fA47 i1="01" i2="1">
<s0>06-0461397</s0>
</fA47>
<fA60>
<s1>P</s1>
</fA60>
<fA61>
<s0>A</s0>
</fA61>
<fA64 i1="01" i2="1">
<s0>Annales de biologie clinique : (Paris)</s0>
</fA64>
<fA66 i1="01">
<s0>FRA</s0>
</fA66>
<fA68 i1="01" i2="1" l="ENG">
<s1>Emergent viruses : SARS-associated coronavirus and H5N1 influenza virus</s1>
</fA68>
<fC01 i1="01" l="FRE">
<s0>Cette synthèse a pour but de faire le point des connaissances concernant le virus du syndrome respiratoire aigu sévère (Sras) et le virus A/H5N1 hautement pathogène. En cas de suspicion d'infection par SARS-CoV, les recherches virologiques sont réalisées à partir d'une aspiration rhinopharyngée, d'une expectoration, d'un écouvillonnage de gorge ou d'un liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA) mais aussi des selles, des urines voire du sérum d'un patient venant d'une région où le virus du Sras aurait réémergé (ou travaillant dans un laboratoire étudiant le virus du Sras). L'isolement du virus sur culture cellulaire ou l'extraction de l'ARN viral en vue d'une RT-PCR doivent être réalisés dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3 (Biosafety level 3). Une RT-PCR spécifique du virus du Sras permet le diagnostic virologique. En raison de la moindre sensibilité de la RT-PCR spécifique du Sras, l'analyse des échantillons cliniques doit être répétée pendant plusieurs jours. La prise en charge d'échantillons biologiques pour une suspicion d'infection par le virus A/H5N1 hautement pathogène (tableau clinique de grippe chez une personne revenant d'une région où circule le virus A/H5N1), respecte la même procédure. En effet, le diagnostic virologique repose sur la mise en évidence du virus ou de son ARN génomique. Les échantillons biologiques permettant le diagnostic sont des prélèvements respiratoires, des selles, du sérum ou du liquide céphalorachidien (LCR). L'isolement du virus sur culture cellulaire doit être réalisé dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Pour la recherche de l'ARN génomique, l'extraction de l'ARN doit, elle aussi, être réalisée dans un laboratoire de niveau de confinement BSL3. Une RT-PCR en temps réel ciblant un fragment du gène de l'hémagglutinine H5 permet un diagnostic spécifique de la grippe A/H5N1. Ces procédures sont actuellement en place dans les laboratoires de virologie afin de diagnostiquer les éventuels premiers cas de grippe à virus A/H5N1 ou la réémergence du virus du Sras.</s0>
</fC01>
<fC02 i1="01" i2="X">
<s0>002B24</s0>
</fC02>
<fC02 i1="02" i2="X">
<s0>002B05C02C</s0>
</fC02>
<fC03 i1="01" i2="X" l="FRE">
<s0>Maladie émergente</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>01</s5>
</fC03>
<fC03 i1="01" i2="X" l="ENG">
<s0>Emerging disease</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>01</s5>
</fC03>
<fC03 i1="01" i2="X" l="SPA">
<s0>Enfermedad emergente</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>01</s5>
</fC03>
<fC03 i1="02" i2="X" l="FRE">
<s0>Homme</s0>
<s5>02</s5>
</fC03>
<fC03 i1="02" i2="X" l="ENG">
<s0>Human</s0>
<s5>02</s5>
</fC03>
<fC03 i1="02" i2="X" l="SPA">
<s0>Hombre</s0>
<s5>02</s5>
</fC03>
<fC03 i1="03" i2="X" l="FRE">
<s0>Appareil respiratoire</s0>
<s5>03</s5>
</fC03>
<fC03 i1="03" i2="X" l="ENG">
<s0>Respiratory system</s0>
<s5>03</s5>
</fC03>
<fC03 i1="03" i2="X" l="SPA">
<s0>Aparato respiratorio</s0>
<s5>03</s5>
</fC03>
<fC03 i1="04" i2="X" l="FRE">
<s0>Syndrome respiratoire aigu sévère</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>05</s5>
</fC03>
<fC03 i1="04" i2="X" l="ENG">
<s0>Severe acute respiratory syndrome</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>05</s5>
</fC03>
<fC03 i1="04" i2="X" l="SPA">
<s0>Síndrome respiratorio agudo severo</s0>
<s2>NM</s2>
<s5>05</s5>
</fC03>
<fC03 i1="05" i2="X" l="FRE">
<s0>Pathogène</s0>
<s5>06</s5>
</fC03>
<fC03 i1="05" i2="X" l="ENG">
<s0>Pathogenic</s0>
<s5>06</s5>
</fC03>
<fC03 i1="05" i2="X" l="SPA">
<s0>Patógeno</s0>
<s5>06</s5>
</fC03>
<fC03 i1="06" i2="X" l="FRE">
<s0>Coronavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>08</s5>
</fC03>
<fC03 i1="06" i2="X" l="ENG">
<s0>Coronavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>08</s5>
</fC03>
<fC03 i1="06" i2="X" l="SPA">
<s0>Coronavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>08</s5>
</fC03>
<fC03 i1="07" i2="X" l="FRE">
<s0>Influenzavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>09</s5>
</fC03>
<fC03 i1="07" i2="X" l="ENG">
<s0>Influenzavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>09</s5>
</fC03>
<fC03 i1="07" i2="X" l="SPA">
<s0>Influenzavirus</s0>
<s2>NW</s2>
<s5>09</s5>
</fC03>
<fC03 i1="08" i2="X" l="FRE">
<s0>Biologie clinique</s0>
<s5>11</s5>
</fC03>
<fC03 i1="08" i2="X" l="ENG">
<s0>Clinical biology</s0>
<s5>11</s5>
</fC03>
<fC03 i1="08" i2="X" l="SPA">
<s0>Biología clínica</s0>
<s5>11</s5>
</fC03>
<fC03 i1="09" i2="X" l="FRE">
<s0>Exploration virologique</s0>
<s5>12</s5>
</fC03>
<fC03 i1="09" i2="X" l="ENG">
<s0>Virological exploration</s0>
<s5>12</s5>
</fC03>
<fC03 i1="09" i2="X" l="SPA">
<s0>Análisis virológico</s0>
<s5>12</s5>
</fC03>
<fC03 i1="10" i2="X" l="FRE">
<s0>Examen laboratoire</s0>
<s5>14</s5>
</fC03>
<fC03 i1="10" i2="X" l="ENG">
<s0>Laboratory investigations</s0>
<s5>14</s5>
</fC03>
<fC03 i1="10" i2="X" l="SPA">
<s0>Examen laboratorio</s0>
<s5>14</s5>
</fC03>
<fC03 i1="11" i2="X" l="FRE">
<s0>Influenzavirus A(H5N1)</s0>
<s4>CD</s4>
<s5>96</s5>
</fC03>
<fC03 i1="11" i2="X" l="ENG">
<s0>Influenzavirus A(H5N1)</s0>
<s4>CD</s4>
<s5>96</s5>
</fC03>
<fC03 i1="12" i2="X" l="FRE">
<s0>Grippe aviaire</s0>
<s4>CD</s4>
<s5>97</s5>
</fC03>
<fC03 i1="12" i2="X" l="ENG">
<s0>Avian influenza</s0>
<s4>CD</s4>
<s5>97</s5>
</fC03>
<fC03 i1="12" i2="X" l="SPA">
<s0>Gripe aviar</s0>
<s4>CD</s4>
<s5>97</s5>
</fC03>
<fC07 i1="01" i2="X" l="FRE">
<s0>Virose</s0>
</fC07>
<fC07 i1="01" i2="X" l="ENG">
<s0>Viral disease</s0>
</fC07>
<fC07 i1="01" i2="X" l="SPA">
<s0>Virosis</s0>
</fC07>
<fC07 i1="02" i2="X" l="FRE">
<s0>Infection</s0>
</fC07>
<fC07 i1="02" i2="X" l="ENG">
<s0>Infection</s0>
</fC07>
<fC07 i1="02" i2="X" l="SPA">
<s0>Infección</s0>
</fC07>
<fC07 i1="03" i2="X" l="FRE">
<s0>Coronaviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="03" i2="X" l="ENG">
<s0>Coronaviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="03" i2="X" l="SPA">
<s0>Coronaviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="04" i2="X" l="FRE">
<s0>Nidovirales</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="04" i2="X" l="ENG">
<s0>Nidovirales</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="04" i2="X" l="SPA">
<s0>Nidovirales</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="05" i2="X" l="FRE">
<s0>Virus</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="05" i2="X" l="ENG">
<s0>Virus</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="05" i2="X" l="SPA">
<s0>Virus</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="06" i2="X" l="FRE">
<s0>Orthomyxoviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="06" i2="X" l="ENG">
<s0>Orthomyxoviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="06" i2="X" l="SPA">
<s0>Orthomyxoviridae</s0>
<s2>NW</s2>
</fC07>
<fC07 i1="07" i2="X" l="FRE">
<s0>Appareil respiratoire pathologie</s0>
<s5>37</s5>
</fC07>
<fC07 i1="07" i2="X" l="ENG">
<s0>Respiratory disease</s0>
<s5>37</s5>
</fC07>
<fC07 i1="07" i2="X" l="SPA">
<s0>Aparato respiratorio patología</s0>
<s5>37</s5>
</fC07>
<fC07 i1="08" i2="X" l="FRE">
<s0>Poumon pathologie</s0>
<s5>38</s5>
</fC07>
<fC07 i1="08" i2="X" l="ENG">
<s0>Lung disease</s0>
<s5>38</s5>
</fC07>
<fC07 i1="08" i2="X" l="SPA">
<s0>Pulmón patología</s0>
<s5>38</s5>
</fC07>
<fN21>
<s1>303</s1>
</fN21>
</pA>
</standard>
</inist>
</record>

Pour manipuler ce document sous Unix (Dilib)

EXPLOR_STEP=$WICRI_ROOT/Sante/explor/SrasV1/Data/PascalFrancis/Curation
HfdSelect -h $EXPLOR_STEP/biblio.hfd -nk 000532 | SxmlIndent | more

Ou

HfdSelect -h $EXPLOR_AREA/Data/PascalFrancis/Curation/biblio.hfd -nk 000532 | SxmlIndent | more

Pour mettre un lien sur cette page dans le réseau Wicri

{{Explor lien
   |wiki=    Sante
   |area=    SrasV1
   |flux=    PascalFrancis
   |étape=   Curation
   |type=    RBID
   |clé=     Pascal:06-0461397
   |texte=   Virus respiratoires émergents : virus du sras et virus influenza A/H5N1 hautement pathogène
}}

Wicri

This area was generated with Dilib version V0.6.33.
Data generation: Tue Apr 28 14:49:16 2020. Site generation: Sat Mar 27 22:06:49 2021