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Transcriptional Activation < Transcriptome < Transducers  Facettes :

List of bibliographic references

Number of relevant bibliographic references: 14.
Ident.Authors (with country if any)Title
000708 (2019) Lisa K. Johnson [États-Unis] ; Harriet Alexander [États-Unis] ; C Titus Brown [États-Unis]Re-assembly, quality evaluation, and annotation of 678 microbial eukaryotic reference transcriptomes.
000751 (2018) Swati C. Manekar [Inde] ; Shailesh R. Sathe [Inde]A benchmark study of k-mer counting methods for high-throughput sequencing.
000782 (2018) Peter A. Noble [États-Unis] ; Alexander E. Pozhitkov [États-Unis]Cryptic sequence features in the active postmortem transcriptome.
000824 (2018) Igor Saggese [Italie] ; Elisa Bona [Italie] ; Max Conway [Royaume-Uni] ; Francesco Favero [Italie] ; Marco Ladetto [Italie] ; Pietro Li [Royaume-Uni] ; Giovanni Manzini [Italie] ; Flavio Mignone [Italie]STAble: a novel approach to de novo assembly of RNA-seq data and its application in a metabolic model network based metatranscriptomic workflow.
000861 (2018) Samuel M D. Seaver [États-Unis] ; Claudia Lerma-Ortiz [États-Unis] ; Neal Conrad [États-Unis] ; Arman Mikaili [États-Unis] ; Avinash Sreedasyam [États-Unis] ; Andrew D. Hanson [États-Unis] ; Christopher S. Henry [États-Unis]PlantSEED enables automated annotation and reconstruction of plant primary metabolism with improved compartmentalization and comparative consistency.
000945 (2018) Chen Sun [États-Unis] ; Robert S. Harris [États-Unis] ; Rayan Chikhi [France] ; Paul Medvedev [États-Unis]AllSome Sequence Bloom Trees.
000A36 (2017) Jérôme Audoux [France] ; Nicolas Philippe [France] ; Rayan Chikhi [France] ; Mikaël Salson [France] ; Mélina Gallopin [France] ; Marc Gabriel [France] ; Jérémy Le Coz [France] ; Emilie Drouineau [France] ; Thérèse Commes [France] ; Daniel Gautheret [France]DE-kupl: exhaustive capture of biological variation in RNA-seq data through k-mer decomposition.
000B01 (2017) Chang Sik Kim [Royaume-Uni] ; Martyn D. Winn [Royaume-Uni] ; Vipin Sachdeva [États-Unis] ; Kirk E. Jordan [États-Unis]K-mer clustering algorithm using a MapReduce framework: application to the parallelization of the Inchworm module of Trinity.
000C95 (2017) You Li [États-Unis] ; Tayla B. Heavican [États-Unis] ; Neetha N. Vellichirammal [États-Unis] ; Javeed Iqbal [États-Unis] ; Chittibabu Guda [États-Unis]ChimeRScope: a novel alignment-free algorithm for fusion transcript prediction using paired-end RNA-Seq data.
000F13 (2017) Christopher M. Coleman [États-Unis] ; Jeanne M. Sisk [États-Unis] ; Gabor Halasz [États-Unis] ; Jixin Zhong [États-Unis] ; Sarah E. Beck [États-Unis] ; Krystal L. Matthews [États-Unis] ; Thiagarajan Venkataraman [États-Unis] ; Sanjay Rajagopalan [États-Unis] ; Christos A. Kyratsous [États-Unis] ; Matthew B. Frieman [États-Unis]CD8+ T Cells and Macrophages Regulate Pathogenesis in a Mouse Model of Middle East Respiratory Syndrome.
001127 (2016) Hyungtaek Jung [Australie] ; Byung-Ha Yoon [Corée du Sud] ; Woo-Jin Kim [Corée du Sud] ; Dong-Wook Kim [Corée du Sud] ; David A. Hurwood [Australie] ; Russell E. Lyons [Australie] ; Krishna R. Salin [Thaïlande] ; Heui-Soo Kim [Corée du Sud] ; Ilseon Baek [Corée du Sud] ; Vincent Chand [Australie] ; Peter B. Mather [Australie]Optimizing Hybrid de Novo Transcriptome Assembly and Extending Genomic Resources for Giant Freshwater Prawns (Macrobrachium rosenbergii): The Identification of Genes and Markers Associated with Reproduction.
001239 (2016) Nerea Irigoyen [Royaume-Uni] ; Andrew E. Firth [Royaume-Uni] ; Joshua D. Jones [Royaume-Uni] ; Betty Y-W Chung [Royaume-Uni] ; Stuart G. Siddell [Royaume-Uni] ; Ian Brierley [Royaume-Uni]High-Resolution Analysis of Coronavirus Gene Expression by RNA Sequencing and Ribosome Profiling.
001A66 (2014) Keng-See Chow [Malaisie] ; Ahmad-Kamal Ghazali ; Chee-Choong Hoh ; Zainorlina Mohd-ZainuddinRNA sequencing read depth requirement for optimal transcriptome coverage in Hevea brasiliensis.
001D54 (2012) Joel Berendzen [États-Unis] ; William J. Bruno ; Judith D. Cohn ; Nicolas W. Hengartner ; Cheryl R. Kuske ; Benjamin H. Mcmahon ; Murray A. Wolinsky ; Gary XieRapid phylogenetic and functional classification of short genomic fragments with signature peptides.

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