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Index « PmcKwd.i » - entrée « Metagenomics »
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Metagenomic data binning < Metagenomics < Metagenomics classification  Facettes :

List of bibliographic references

Number of relevant bibliographic references: 13.
Ident.Authors (with country if any)Title
000246 (2019) Nathan Lapierre [États-Unis] ; Serghei Mangul [États-Unis] ; Mohammed Alser [Suisse] ; Igor Mandric [États-Unis] ; Nicholas C. Wu ; David Koslicki [États-Unis] ; Eleazar Eskin [États-Unis]MiCoP: microbial community profiling method for detecting viral and fungal organisms in metagenomic samples
000248 (2019) Jia Qian ; Matteo CominMetaCon: unsupervised clustering of metagenomic contigs with probabilistic k-mers statistics and coverage
000318 (2019) Kui Hua [République populaire de Chine] ; Xuegong Zhang [République populaire de Chine]Estimating the total genome length of a metagenomic sample using k-mers
000395 (2019) Javier Tamames ; Marta Cobo-Sim N ; Fernando Puente-SánchezAssessing the performance of different approaches for functional and taxonomic annotation of metagenomes
000551 (2018) F. P. Breitwieser [États-Unis] ; D. N. Baker [États-Unis] ; S. L. Salzberg [États-Unis]KrakenUniq: confident and fast metagenomics classification using unique k-mer counts
000793 (2017) Dinghua Li [Hong Kong] ; Yukun Huang [Hong Kong] ; Chi-Ming Leung [Hong Kong] ; Ruibang Luo [Hong Kong] ; Hing-Fung Ting [Hong Kong] ; Tak-Wah Lam [Hong Kong]MegaGTA: a sensitive and accurate metagenomic gene-targeted assembler using iterative de Bruijn graphs
000935 (2017) Robin Kobus [Allemagne] ; Christian Hundt [Allemagne] ; André Müller [Allemagne] ; Bertil Schmidt [Allemagne]Accelerating metagenomic read classification on CUDA-enabled GPUs
000C79 (2016) Ivan Gregor [Allemagne] ; Johannes Dröge [Allemagne] ; Melanie Schirmer [États-Unis] ; Christopher Quince [Royaume-Uni] ; Alice C. Mchardy [Allemagne]PhyloPythiaS+: a self-training method for the rapid reconstruction of low-ranking taxonomic bins from metagenomes
000D39 (2015) Florian Plaza Onate [France] ; Jean-Michel Batto [France] ; Catherine Juste [France] ; Jehane Fadlallah [France] ; Cyrielle Fougeroux [France] ; Doriane Gouas [France] ; Nicolas Pons [France] ; Sean Kennedy [France] ; Florence Levenez [France] ; Joel Dore [France] ; S Dusko Ehrlich [France] ; Guy Gorochov [France] ; Martin Larsen [France]Quality control of microbiota metagenomics by k-mer analysis
000E53 (2015) Ruichang Zhang [République populaire de Chine] ; Zhanzhan Cheng [République populaire de Chine] ; Jihong Guan [République populaire de Chine] ; Shuigeng Zhou [République populaire de Chine]Exploiting topic modeling to boost metagenomic reads binning
000F01 (2015) Rachid Ounit ; Steve Wanamaker ; Timothy J. Close ; Stefano LonardiCLARK: fast and accurate classification of metagenomic and genomic sequences using discriminative k-mers
001280 (2012) Olga Tanaseichuk [États-Unis] ; James Borneman [États-Unis] ; Tao Jiang [États-Unis]Separating metagenomic short reads into genomes via clustering
001310 (2012) Susan Higashi [Brésil] ; André Da Motta Salles Barreto [Brésil] ; Maurício Egidio Cantão [Brésil] ; Ana Tereza Ribeiro De Vasconcelos [Brésil]Analysis of composition-based metagenomic classification

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