| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000221 (2020) |
Bei Li [République populaire de Chine] ; Hao-Rui Si [République populaire de Chine] ; Yan Zhu [République populaire de Chine] ; Xing-Lou Yang [République populaire de Chine] ; Danielle E. Anderson [Singapour] ; Zheng-Li Shi [République populaire de Chine] ; Lin-Fa Wang [Singapour] ; Peng Zhou [République populaire de Chine] | Discovery of Bat Coronaviruses through Surveillance and Probe Capture-Based Next-Generation Sequencing |
| 000571 (2019) |
John A. Lees [États-Unis] ; Simon R. Harris [Royaume-Uni] ; Gerry Tonkin-Hill [Royaume-Uni] ; Rebecca A. Gladstone [Royaume-Uni] ; Stephanie W. Lo [Royaume-Uni] ; Jeffrey N. Weiser [États-Unis] ; Jukka Corander [Royaume-Uni] ; Stephen D. Bentley [Royaume-Uni] ; Nicholas J. Croucher [Royaume-Uni] | Fast and flexible bacterial genomic epidemiology with PopPUNK. |
| 000615 (2019) |
Ian H. Mendenhall ; Aslan A. Kerimbayev ; Vitaliy M. Strochkov ; Kulyaisan T. Sultankulova ; Syrym K. Kopeyev ; Yvonne C. F. Su ; Gavin J. D. Smith [Singapour, États-Unis] ; Mukhit B. Orynbayev | Discovery and Characterization of Novel Bat Coronavirus Lineages from Kazakhstan |
| 000682 (2019) |
Yi Fan [République populaire de Chine] ; Kai Zhao [République populaire de Chine] ; Zheng-Li Shi [République populaire de Chine] ; Peng Zhou [République populaire de Chine] | Bat Coronaviruses in China |
| 000822 (2018) |
Meriadeg Ar Gouilh [France] ; Sébastien J. Puechmaille [Allemagne, Irlande (pays), France] ; Laure Diancourt [France] ; Mathias Vandenbogaert [France] ; Jordi Serra-Cobo [Espagne] ; Marc Lopez Roïg [Espagne] ; Paul Brown [France] ; François Moutou [France] ; Valérie Caro [France] ; Astrid Vabret [France] ; Jean-Claude Manuguerra [France] | SARS-CoV related Betacoronavirus and diverse Alphacoronavirus members found in western old-world☆ |
| 000868 (2018) |
Jie Cui ; Fang Li [États-Unis] ; Zheng-Li Shi | Origin and evolution of pathogenic coronaviruses |
| 000877 (2018) |
Martin Sauk [Estonie] ; Olga Žilina [Estonie] ; Ants Kurg [Estonie] ; Eva-Liina Ustav [Estonie] ; Maire Peters [Estonie] ; Priit Paluoja [Estonie] ; Anne Mari Roost [Estonie] ; Hindrek Teder [Estonie] ; Priit Palta [Estonie] ; Nathalie Brison [Belgique] ; Joris R. Vermeesch [Belgique] ; Kaarel Krjutškov [Estonie, Suède, Finlande] ; Andres Salumets [Estonie, Finlande] ; Lauris Kaplinski [Estonie] | NIPTmer: rapid k-mer-based software package for detection of fetal aneuploidies |
| 000917 (2018) |
Daniel K. W. Chu [République populaire de Chine] ; Kenrie P. Y. Hui [République populaire de Chine] ; Ranawaka A. P. M. Perera [République populaire de Chine] ; Eve Miguel [France] ; Daniela Niemeyer [Allemagne] ; Jincun Zhao [République populaire de Chine] ; Rudragouda Channappanavar ; Gytis Dudas ; Jamiu O. Oladipo [République populaire de Chine, Nigeria] ; Amadou Traoré [Burkina Faso] ; Ouafaa Fassi-Fihri [Maroc] ; Abraham Ali [Éthiopie] ; Getnet F. Demissié [Éthiopie] ; Doreen Muth [Allemagne] ; Michael C. W. Chan [République populaire de Chine] ; John M. Nicholls [République populaire de Chine] ; David K. Meyerholz ; Sulyman A. Kuranga [Nigeria] ; Gezahegne Mamo [Éthiopie] ; Ziqi Zhou [République populaire de Chine] ; Ray T. Y. So [République populaire de Chine] ; Maged G. Hemida [Arabie saoudite, Égypte] ; Richard J. Webby ; Francois Roger [France, Thaïlande] ; Andrew Rambaut [Royaume-Uni] ; Leo L. M. Poon [République populaire de Chine] ; Stanley Perlman ; Christian Drosten [Allemagne] ; Veronique Chevalier [France, Cambodge] ; Malik Peiris [République populaire de Chine] | MERS coronaviruses from camels in Africa exhibit region-dependent genetic diversity |
| 000A76 (2018) |
Jonas Andreas Sibbesen [Danemark] ; Lasse Maretty [Danemark] ; Anders Krogh [Danemark] | Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs. |
| 000A85 (2018) |
Marike Geldenhuys [Afrique du Sud] ; Marinda Mortlock [Afrique du Sud] ; Jacqueline Weyer [Afrique du Sud] ; Oliver Bezuidt [Afrique du Sud] ; Ernest C. J. Seamark [Afrique du Sud] ; Teresa Kearney [Afrique du Sud] ; Cheryl Gleasner [États-Unis] ; Tracy H. Erkkila [États-Unis] ; Helen Cui [États-Unis] ; Wanda Markotter [Afrique du Sud] | A metagenomic viral discovery approach identifies potential zoonotic and novel mammalian viruses in Neoromicia bats within South Africa |
| 000A88 (2018) |
Magali Jaillard [France] ; Leandro Lima [France] ; Maud Tournoud [France] ; Pierre Mahé [France] ; Alex Van Belkum [France] ; Vincent Lacroix [France] ; Laurent Jacob [France] | A fast and agnostic method for bacterial genome-wide association studies: Bridging the gap between k-mers and genetic events |
| 000B36 (2017) |
Qian Xie [République populaire de Chine] ; Yujuan Cao [République populaire de Chine] ; Juan Su [République populaire de Chine] ; Jie Wu [République populaire de Chine] ; Xianbo Wu [République populaire de Chine] ; Chengsong Wan [République populaire de Chine] ; Mingliang He [République populaire de Chine] ; Changwen Ke [République populaire de Chine] ; Bao Zhang [République populaire de Chine] ; Wei Zhao [République populaire de Chine] | Two deletion variants of Middle East respiratory syndrome coronavirus found in a patient with characteristic symptoms |
| 000B71 (2017) |
Ying Tao [États-Unis] ; Mang Shi [Australie] ; Christina Chommanard [États-Unis] ; Krista Queen [États-Unis] ; Jing Zhang [États-Unis] ; Wanda Markotter [Afrique du Sud] ; Ivan V. Kuzmin [États-Unis] ; Edward C. Holmes [Australie] ; Suxiang Tong | Surveillance of Bat Coronaviruses in Kenya Identifies Relatives of Human Coronaviruses NL63 and 229E and Their Recombination History. |
| 000B84 (2017) |
Xiaoyan Lu [Géorgie (pays)] ; Lori A. Rowe [Géorgie (pays)] ; Michael Frace [Géorgie (pays)] ; James Stevens [Géorgie (pays)] ; Glen R. Abedi [Géorgie (pays)] ; Osman Elnile [Arabie saoudite] ; Taleb Banassir [Arabie saoudite] ; Malak Al-Masri [Arabie saoudite] ; John T. Watson [Géorgie (pays)] ; Abdullah Assiri [Arabie saoudite] ; Dean D. Erdman [Géorgie (pays)] | Spike gene deletion quasispecies in serum of patient with acute MERS-CoV infection. |
| 000B89 (2017) |
Francisco Vargas-Albores [Mexique] ; Luis Enrique Ortiz-Suárez [Mexique] ; Enrique Villalpando-Canchola [Mexique] ; Marcel Martínez-Porchas [Mexique] | Size-variable zone in V3 region of 16S rRNA. |
| 000C29 (2017) |
Peilin Liu [République populaire de Chine] ; Lei Shi [République populaire de Chine] ; Wei Zhang [République populaire de Chine] ; Jianan He [République populaire de Chine] ; Chunxiao Liu [République populaire de Chine] ; Chunzhong Zhao [République populaire de Chine] ; Siu Kai Kong ; Jacky Fong Chuen Loo ; Dayong Gu [République populaire de Chine] ; Longfei Hu [République populaire de Chine] | Prevalence and genetic diversity analysis of human coronaviruses among cross-border children |
| 000D51 (2017) |
Elodie Monchatre-Leroy ; Franck Boué ; Jean-Marc Boucher ; Camille Renault ; François Moutou ; Meriadeg Ar Gouilh [France] ; Gérald Umhang | Identification of Alpha and Beta Coronavirus in Wildlife Species in France: Bats, Rodents, Rabbits, and Hedgehogs |
| 000D73 (2017) |
Biao He [République populaire de Chine] ; Xiaohong Huang [République populaire de Chine] ; Fuqiang Zhang [République populaire de Chine] ; Weilong Tan [République populaire de Chine] ; Jelle Matthijnssens [Belgique] ; Shaomin Qin [République populaire de Chine] ; Lin Xu [République populaire de Chine] ; Zihan Zhao [République populaire de Chine] ; Ling'En Yang [République populaire de Chine] ; Quanxi Wang [République populaire de Chine] ; Tingsong Hu [République populaire de Chine] ; Xiaolei Bao [République populaire de Chine] ; Jianmin Wu [Oman] ; Changchun Tu [Oman] | Group A Rotaviruses in Chinese Bats: Genetic Composition, Serology, and Evidence for Bat-to-Human Transmission and Reassortment. |
| 000D77 (2017) |
Saemi Lee [Corée du Sud] ; Seong-Deok Jo [Corée du Sud] ; Kidong Son [Corée du Sud] ; Injung An [Corée du Sud] ; Jipseol Jeong [Corée du Sud] ; Seung-Jun Wang [Corée du Sud] ; Yongkwan Kim [Corée du Sud] ; Weonhwa Jheong [Corée du Sud] ; Jae-Ku Oem [Corée du Sud] | Genetic Characteristics of Coronaviruses from Korean Bats in 2016 |
| 000E23 (2017) |
Mohammed Farouk Yusof ; Krista Queen [États-Unis] ; Yassir Mohammed Eltahir ; Clinton R. Paden [États-Unis] ; Zulaikha Mohamed Abdel Hameed Al Hammadi ; Ying Tao [États-Unis] ; Yan Li [États-Unis] ; Abdelmalik Ibrahim Khalafalla ; Mang Shi [Australie] ; Jing Zhang [États-Unis] ; Muzammil Sayed Ahmed Elhaj Mohamed ; Mahmud Hamed Abd Elaal Ahmed ; Ihsaan Abdulwahab Azeez ; Oum Keltoum Bensalah ; Ziyada Swar Eldahab ; Farida Ismail Al Hosani ; Susan I. Gerber [États-Unis] ; Aron J. Hall [États-Unis] ; Suxiang Tong [États-Unis] ; Salama Suhail Al Muhairi | Diversity of Middle East respiratory syndrome coronaviruses in 109 dromedary camels based on full-genome sequencing, Abu Dhabi, United Arab Emirates |
| 000E36 (2017) |
Jérôme Audoux [France] ; Nicolas Philippe [France] ; Rayan Chikhi [France] ; Mikaël Salson [France] ; Mélina Gallopin [France] ; Marc Gabriel [France] ; Jérémy Le Coz [France] ; Emilie Drouineau [France] ; Thérèse Commes [France] ; Daniel Gautheret [France] | DE-kupl: exhaustive capture of biological variation in RNA-seq data through k-mer decomposition |
