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Index « KwdFr.i » - entrée « Bases de données génétiques »
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List of bibliographic references indexed by Bases de données génétiques

Number of relevant bibliographic references: 37.
[0-20] [0 - 20][0 - 37][20-36][20-40]
Ident.Authors (with country if any)Title
000484 (2019) Jia Qian ; Matteo CominMetaCon: unsupervised clustering of metagenomic contigs with probabilistic k-mers statistics and coverage
000756 (2018) Md Rafsan Jani [Bangladesh] ; Md Toha Khan Mozlish [Bangladesh] ; Sajid Ahmed [Bangladesh] ; Niger Sultana Tahniat [Bangladesh] ; Dewan Md Farid [Bangladesh] ; Swakkhar Shatabda [Bangladesh]iRecSpot-EF: Effective sequence based features for recombination hotspot prediction.
000809 (2018) Olga V. Matveeva [États-Unis] ; Aleksey Y. Ogurtsov [États-Unis] ; Nafisa N. Nazipova [Russie] ; Svetlana A. Shabalina [États-Unis]Sequence characteristics define trade-offs between on-target and genome-wide off-target hybridization of oligoprobes
000837 (2018) Lisa K. Johnson [États-Unis] ; Harriet Alexander [États-Unis] ; C Titus Brown [États-Unis]Re-assembly, quality evaluation, and annotation of 678 microbial eukaryotic reference transcriptomes
000853 (2018) Pierre Mahé ; Maud TournoudPredicting bacterial resistance from whole-genome sequences using k-mers and stability selection
000964 (2018) Jessime M. Kirk [États-Unis] ; Susan O. Kim [États-Unis] ; Kaoru Inoue [États-Unis] ; Matthew J. Smola [États-Unis] ; David M. Lee [États-Unis] ; Megan D. Schertzer [États-Unis] ; Joshua S. Wooten [États-Unis] ; Allison R. Baker [États-Unis] ; Daniel Sprague [États-Unis] ; David W. Collins [États-Unis] ; Christopher R. Horning [États-Unis] ; Shuo Wang [États-Unis] ; Qidi Chen [États-Unis] ; Kevin M. Weeks [États-Unis] ; Peter J. Mucha [États-Unis] ; J Mauro Calabrese [États-Unis]Functional classification of long non-coding RNAs by k-mer content.
000A18 (2018) Peter A. Noble [États-Unis] ; Alexander E. Pozhitkov [États-Unis]Cryptic sequence features in the active postmortem transcriptome
000A88 (2018) Magali Jaillard [France] ; Leandro Lima [France] ; Maud Tournoud [France] ; Pierre Mahé [France] ; Alex Van Belkum [France] ; Vincent Lacroix [France] ; Laurent Jacob [France]A fast and agnostic method for bacterial genome-wide association studies: Bridging the gap between k-mers and genetic events
000A92 (2018) Swati C. Manekar [Inde] ; Shailesh R. Sathe [Inde]A benchmark study of k-mer counting methods for high-throughput sequencing
000B23 (2017) Qian Zhang [États-Unis] ; Se-Ran Jun [États-Unis] ; Michael Leuze [États-Unis] ; David Ussery [États-Unis] ; Intawat Nookaew [États-Unis]Viral Phylogenomics Using an Alignment-Free Method: A Three-Step Approach to Determine Optimal Length of k-mer
000B53 (2017) Meznah Almutairy ; Eric TorngThe effects of sampling on the efficiency and accuracy of k−mer indexes: Theoretical and empirical comparisons using the human genome
000B89 (2017) Francisco Vargas-Albores [Mexique] ; Luis Enrique Ortiz-Suárez [Mexique] ; Enrique Villalpando-Canchola [Mexique] ; Marcel Martínez-Porchas [Mexique]Size-variable zone in V3 region of 16S rRNA.
000D00 (2017) Dinghua Li [Hong Kong] ; Yukun Huang [Hong Kong] ; Chi-Ming Leung [Hong Kong] ; Ruibang Luo [Hong Kong] ; Hing-Fung Ting [Hong Kong] ; Tak-Wah Lam [Hong Kong]MegaGTA: a sensitive and accurate metagenomic gene-targeted assembler using iterative de Bruijn graphs
000F57 (2016) Eneida L. Hatcher ; Sergey A. Zhdanov ; Yiming Bao ; Olga Blinkova ; Eric P. Nawrocki ; Yuri Ostapchuck ; Alejandro A. Sch Ffer ; J. Rodney BristerVirus Variation Resource – improved response to emergent viral outbreaks
001080 (2016) Qiang Yu [République populaire de Chine] ; Hongwei Huo [République populaire de Chine] ; Dazheng Feng [République populaire de Chine]PairMotifChIP: A Fast Algorithm for Discovery of Patterns Conserved in Large ChIP-seq Data Sets
001371 (2016) Veronika B. Dubinkina [Russie] ; Dmitry S. Ischenko [Russie] ; Vladimir I. Ulyantsev [Russie] ; Alexander V. Tyakht [Russie] ; Dmitry G. Alexeev [Russie]Assessment of k-mer spectrum applicability for metagenomic dissimilarity analysis
001570 (2015) Karel B Inda [France] ; Maciej Sykulski [France] ; Gregory Kucherov [France]Spaced seeds improve k-mer-based metagenomic classification.
001583 (2015) Ramin Karimi ; Andras HajduSRIdent: A novel pipeline for real-time identification of species from high-throughput sequencing reads in Metagenomics and clinical diagnostic assays.
001602 (2015) Ezzeddin Kamil Mohamed Hashim [Malaisie] ; Rosni Abdullah [Malaisie]Rare k-mer DNA: Identification of sequence motifs and prediction of CpG island and promoter.
001833 (2015) Brian Cleary [États-Unis] ; Ilana Lauren Brito [États-Unis] ; Katherine Huang [États-Unis] ; Dirk Gevers [États-Unis] ; Terrance Shea [États-Unis] ; Sarah Young [États-Unis] ; Eric J. Alm [États-Unis]Detection of low-abundance bacterial strains in metagenomic datasets by eigengenome partitioning.
001860 (2015) Jolanta Kawulok ; Sebastian DeorowiczCoMeta: Classification of Metagenomes Using k-mers

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