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Index « KwdFr.i » - entrée « Alignement de séquences () »
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List of bibliographic references indexed by Alignement de séquences ()

Number of relevant bibliographic references: 31.
[0-20] [0 - 20][0 - 31][20-30][20-40]
Ident.Authors (with country if any)Title
000539 (2019) Chris Durden [États-Unis] ; Seth Sullivant [États-Unis]Identifiability of Phylogenetic Parameters from k-mer Data Under the Coalescent.
000862 (2018) Raúl Martin Amado Cattáneo [Argentine] ; Luis Diambra [Argentine] ; Andrés Norman Mccarthy [Argentine]Phylogenomics of tomato chloroplasts using assembly and alignment-free method.
000A37 (2018) Han Li [États-Unis] ; Fengzhu Sun [États-Unis, République populaire de Chine]Comparative studies of alignment, alignment-free and SVM based approaches for predicting the hosts of viruses based on viral sequences
000B29 (2017) Dirk D. Dolle [Royaume-Uni] ; Zhicheng Liu [Royaume-Uni] ; Matthew Cotten [Royaume-Uni] ; Jared T. Simpson [Canada] ; Zamin Iqbal [Royaume-Uni] ; Richard Durbin [Royaume-Uni] ; Shane A. Mccarthy [Royaume-Uni] ; Thomas M. Keane [Royaume-Uni]Using reference-free compressed data structures to analyze sequencing reads from thousands of human genomes.
000B53 (2017) Meznah Almutairy ; Eric TorngThe effects of sampling on the efficiency and accuracy of k−mer indexes: Theoretical and empirical comparisons using the human genome
000E63 (2017) You Li [États-Unis, République populaire de Chine] ; Tayla B. Heavican [États-Unis] ; Neetha N. Vellichirammal [États-Unis] ; Javeed Iqbal [États-Unis] ; Chittibabu Guda [États-Unis]ChimeRScope: a novel alignment-free algorithm for fusion transcript prediction using paired-end RNA-Seq data
000E71 (2017) Pegah Tootoonchi Afshar [États-Unis] ; Wing Hung Wong [États-Unis]COSINE: non-seeding method for mapping long noisy sequences
001307 (2016) Troy Hernandez [République populaire de Chine] ; Jie YangDescriptive Statistics of the Genome: Phylogenetic Classification of Viruses.
001732 (2015) Sebastian Deorowicz [Pologne] ; Marek Kokot [Pologne] ; Szymon Grabowski [Pologne] ; Agnieszka Debudaj-Grabysz [Pologne]KMC 2: fast and resource-frugal k-mer counting.
001B32 (2014) Emanuel Weitschek [Italie] ; Daniele Santoni [Italie] ; Giulia Fiscon [Italie] ; Maria Cristina De Cola [Italie] ; Paola Bertolazzi [Italie] ; Giovanni Felici [Italie]Next generation sequencing reads comparison with an alignment-free distance
001C04 (2014) Derrick E. Wood [États-Unis] ; Steven L. Salzberg [États-Unis]Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments
002601 (2010) Se-Ran Jun [États-Unis] ; Gregory E. Sims ; Guohong A. Wu ; Sung-Hou KimWhole-proteome phylogeny of prokaryotes by feature frequency profiles: An alignment-free method with optimal feature resolution.
002641 (2010) Xiaohong Zhao [États-Unis] ; Lance E. Palmer ; Randall Bolanos ; Cristian Mircean ; Dan Fasulo ; Gayle M. WittenbergEDAR: an efficient error detection and removal algorithm for next generation sequencing data.
002961 (2008) Sören Sonnenburg [Allemagne] ; Alexander Zien [Allemagne] ; Petra Philips ; Gunnar R TschPOIMs: positional oligomer importance matrices—understanding support vector machine-based signal detectors
002970 (2008) Zefeng Zhang [République populaire de Chine] ; Hao Lin ; Ming LiMango: multiple alignment with N gapped oligos.
002B49 (2007) Zefeng Zhang [République populaire de Chine] ; Hao Lin ; Ming LiMANGO: a new approach to multiple sequence alignment.
002C98 (2006) Thomas Lingner [Allemagne] ; Peter MeinickeRemote homology detection based on oligomer distances.
002D06 (2006) Eugene Fratkin [États-Unis] ; Brian T. Naughton ; Douglas L. Brutlag ; Serafim BatzoglouMotifCut: regulatory motifs finding with maximum density subgraphs.
002D20 (2006) Giuseppe D'Auria [Espagne] ; Ravindra Pushker ; Francisco Rodriguez-ValeraIWoCS: analyzing ribosomal intergenic transcribed spacers configuration and taxonomic relationships.
002D31 (2006) Tobias P. Mann [États-Unis] ; William Stafford NobleEfficient identification of DNA hybridization partners in a sequence database.
002E87 (2005) Rui Kuang [États-Unis] ; Eugene Ie ; Ke Wang ; Kai Wang ; Mahira Siddiqi ; Yoav Freund ; Christina LeslieProfile-based string kernels for remote homology detection and motif extraction.

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