Serveur d'exploration H2N2

Attention, ce site est en cours de développement !
Attention, site généré par des moyens informatiques à partir de corpus bruts.
Les informations ne sont donc pas validées.

Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus

Identifieur interne : 001886 ( Istex/Corpus ); précédent : 001885; suivant : 001887

Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus

Auteurs : Andrzej Kowalczyk ; Kinga Urbaniak ; Iwona Markowska-Daniel

Source :

RBID : ISTEX:4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3

English descriptors

Abstract

Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.

Url:
DOI: 10.2478/v10213-012-0074-5

Links to Exploration step

ISTEX:4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3

Le document en format XML

<record>
<TEI wicri:istexFullTextTei="biblStruct">
<teiHeader>
<fileDesc>
<titleStmt>
<title xml:lang="en">Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
<author>
<name sortKey="Kowalczyk, Andrzej" sort="Kowalczyk, Andrzej" uniqKey="Kowalczyk A" first="Andrzej" last="Kowalczyk">Andrzej Kowalczyk</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Urbaniak, Kinga" sort="Urbaniak, Kinga" uniqKey="Urbaniak K" first="Kinga" last="Urbaniak">Kinga Urbaniak</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Markowska Daniel, Iwona" sort="Markowska Daniel, Iwona" uniqKey="Markowska Daniel I" first="Iwona" last="Markowska-Daniel">Iwona Markowska-Daniel</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
</titleStmt>
<publicationStmt>
<idno type="wicri:source">ISTEX</idno>
<idno type="RBID">ISTEX:4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3</idno>
<date when="2012" year="2012">2012</date>
<idno type="doi">10.2478/v10213-012-0074-5</idno>
<idno type="url">https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/fulltext.pdf</idno>
<idno type="wicri:Area/Istex/Corpus">001886</idno>
<idno type="wicri:explorRef" wicri:stream="Istex" wicri:step="Corpus" wicri:corpus="ISTEX">001886</idno>
</publicationStmt>
<sourceDesc>
<biblStruct>
<analytic>
<title level="a" type="main">Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
<author>
<name sortKey="Kowalczyk, Andrzej" sort="Kowalczyk, Andrzej" uniqKey="Kowalczyk A" first="Andrzej" last="Kowalczyk">Andrzej Kowalczyk</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Urbaniak, Kinga" sort="Urbaniak, Kinga" uniqKey="Urbaniak K" first="Kinga" last="Urbaniak">Kinga Urbaniak</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
<author>
<name sortKey="Markowska Daniel, Iwona" sort="Markowska Daniel, Iwona" uniqKey="Markowska Daniel I" first="Iwona" last="Markowska-Daniel">Iwona Markowska-Daniel</name>
<affiliation>
<mods:affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</mods:affiliation>
</affiliation>
</author>
</analytic>
<monogr></monogr>
<series>
<title level="j" type="abbrev">Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy</title>
<idno type="ISSN">0042-4870</idno>
<imprint>
<publisher>Versita</publisher>
<date type="published">2012</date>
<date type="e-published">2013</date>
<biblScope unit="vol">56</biblScope>
<biblScope unit="issue">4</biblScope>
<biblScope unit="page" from="419">419</biblScope>
<biblScope unit="page" to="662">662</biblScope>
</imprint>
<idno type="ISSN">0042-4870</idno>
</series>
</biblStruct>
</sourceDesc>
<seriesStmt>
<idno type="ISSN">0042-4870</idno>
</seriesStmt>
</fileDesc>
<profileDesc>
<textClass>
<keywords scheme="Teeft" xml:lang="en">
<term>Abortus</term>
<term>Absorbance</term>
<term>Absorption spectrometry</term>
<term>Accession</term>
<term>Acetonitrile</term>
<term>Acta</term>
<term>Acute phase proteins</term>
<term>Adenovirus</term>
<term>Adenovirus infection</term>
<term>Adenovirus infections</term>
<term>Adenovirus strain</term>
<term>Adenovirus strains</term>
<term>Agalactia</term>
<term>Agalactiae</term>
<term>Agalactiae antibodies</term>
<term>Agar</term>
<term>Agarose</term>
<term>American foulbrood</term>
<term>Amino</term>
<term>Amplification</term>
<term>Anaerobe</term>
<term>Anaerobe bacteria</term>
<term>Anal</term>
<term>Analyse</term>
<term>Analyser</term>
<term>Analysing</term>
<term>Analytes</term>
<term>Analytical methods</term>
<term>Anat</term>
<term>Andrzej</term>
<term>Anim</term>
<term>Animal feed</term>
<term>Animal health</term>
<term>Animal origin</term>
<term>Animal species</term>
<term>Animal tissues</term>
<term>Antibacterial</term>
<term>Antibacterial activity</term>
<term>Antibacterial substances</term>
<term>Antibiotic</term>
<term>Antibody</term>
<term>Antigenic</term>
<term>Antimicrobial</term>
<term>Antimicrobial peptides</term>
<term>Antimicrobial resistance</term>
<term>Antiparasitic</term>
<term>Aoac</term>
<term>Apiary</term>
<term>Appl</term>
<term>Appl environ microbiol</term>
<term>Arabian</term>
<term>Arabian horses</term>
<term>Arch virol</term>
<term>Assay</term>
<term>Assoc</term>
<term>Atcc</term>
<term>Atrophic rhinitis</term>
<term>Atypical</term>
<term>August</term>
<term>Aureus</term>
<term>Aureus cells</term>
<term>Austria turkey</term>
<term>Autopodium</term>
<term>Average concentration</term>
<term>Avermectins</term>
<term>Avian</term>
<term>Avian adenoviruses</term>
<term>Avian pathol</term>
<term>Ayling</term>
<term>Azotaemia</term>
<term>Azotaemic</term>
<term>Babesia</term>
<term>Babesia canis</term>
<term>Babesiosis</term>
<term>Bacteria</term>
<term>Bacteriological</term>
<term>Bacteriological examination</term>
<term>Bacterium</term>
<term>Bataviae</term>
<term>Bfrz</term>
<term>Bfrz gene</term>
<term>Bialka</term>
<term>Biochem</term>
<term>Biol</term>
<term>Biol trace elem</term>
<term>Biological materials</term>
<term>Biological samples</term>
<term>Biometric</term>
<term>Biotechnology</term>
<term>Biotoxins</term>
<term>Biotype</term>
<term>Biphasic</term>
<term>Bivalve</term>
<term>Bivalve molluscs</term>
<term>Bizec</term>
<term>Blank muscle sample</term>
<term>Blood cell count</term>
<term>Blood cells</term>
<term>Blood concentrations</term>
<term>Blood platelets</term>
<term>Blood samples</term>
<term>Blood serum</term>
<term>Blue mussel</term>
<term>Blue mussels</term>
<term>Boar</term>
<term>Body weight</term>
<term>Bone density</term>
<term>Bone length</term>
<term>Bone resistance</term>
<term>Bordetella</term>
<term>Bordetella bronchiseptica</term>
<term>Bordetella pertussis</term>
<term>Bovine</term>
<term>Bovine brucellosis</term>
<term>Bovine urine samples</term>
<term>Bovis</term>
<term>Bovis antigen</term>
<term>Bovis infection</term>
<term>Bratislava</term>
<term>Breeder</term>
<term>Broiler</term>
<term>Broiler chickens</term>
<term>Broiler meat</term>
<term>Broiler parts</term>
<term>Bromide</term>
<term>Bronchiseptica</term>
<term>Brucella</term>
<term>Brucella abortus</term>
<term>Brucella antibodies</term>
<term>Brucella infections</term>
<term>Brucella suis</term>
<term>Brucellae</term>
<term>Brucellosis</term>
<term>Bulk containers</term>
<term>Burnetii</term>
<term>Bursa</term>
<term>Cadf</term>
<term>Cadf gene</term>
<term>Cadmium</term>
<term>Cadmium retention</term>
<term>Campylobacter</term>
<term>Campylobacter coli</term>
<term>Campylobacter jejuni</term>
<term>Campylobacteriosis</term>
<term>Campylobacters</term>
<term>Canicola</term>
<term>Canine</term>
<term>Canine babesiosis</term>
<term>Canis</term>
<term>Canonical discriminant analysis</term>
<term>Caprine</term>
<term>Capsid</term>
<term>Capsid protein</term>
<term>Cattle population</term>
<term>Cattle sera</term>
<term>Cbpp</term>
<term>Cell lines</term>
<term>Cell populations</term>
<term>Celledoni</term>
<term>Central part</term>
<term>Central region</term>
<term>Centre</term>
<term>Characterised</term>
<term>Chem</term>
<term>Chemical elements</term>
<term>Chloramphenicol</term>
<term>Choroid</term>
<term>Choroid cells</term>
<term>Chromatogr</term>
<term>Chromatogram</term>
<term>Chromium</term>
<term>Chromium content</term>
<term>Ciliary</term>
<term>Ciliary cells</term>
<term>Ciliary ganglion</term>
<term>Ciprofloxacin</term>
<term>Circumference</term>
<term>Classical swine</term>
<term>Clin</term>
<term>Clin microbiol</term>
<term>Clinical cases</term>
<term>Clinical signs</term>
<term>Clinical symptoms</term>
<term>Clostridium</term>
<term>Clostridium perfringens</term>
<term>Cochran</term>
<term>Cochran test</term>
<term>Cockle</term>
<term>Coefficient</term>
<term>Coldblood</term>
<term>Coldblood horses</term>
<term>Coli</term>
<term>Colonisation</term>
<term>Colony variant</term>
<term>Colostrum</term>
<term>Colour</term>
<term>Colour changes</term>
<term>Colour parameters</term>
<term>Commission decision</term>
<term>Commission regulation</term>
<term>Commun</term>
<term>Comp</term>
<term>Comp pathol</term>
<term>Competitive elisa</term>
<term>Complement fixation test</term>
<term>Concentration</term>
<term>Confirmatory</term>
<term>Congenital toxoplasmosis</term>
<term>Contagious</term>
<term>Contagious agalactia</term>
<term>Contam</term>
<term>Contamination</term>
<term>Control animals</term>
<term>Control group</term>
<term>Copper region</term>
<term>Copy number</term>
<term>Corpuscular volume</term>
<term>Correlation coefficient</term>
<term>Cortex layer</term>
<term>Cortical area</term>
<term>Cortical thickness</term>
<term>Council directive</term>
<term>Coxal tuber</term>
<term>Coxiella</term>
<term>Coxiella burnetii</term>
<term>Coxiella burnetii antibodies</term>
<term>Cpb2</term>
<term>Cpb2 gene</term>
<term>Cpb2 genes</term>
<term>Crassostrea</term>
<term>Creatinine</term>
<term>Croup</term>
<term>Crt_a</term>
<term>Cruciferous</term>
<term>Cruciferous plants</term>
<term>Cuticule</term>
<term>Cytokine</term>
<term>Cytotoxic</term>
<term>Cytotoxicity</term>
<term>Czech</term>
<term>Czech republic</term>
<term>Dachshund</term>
<term>Dachshund varieties</term>
<term>December</term>
<term>Decision limit</term>
<term>Denaturation</term>
<term>Densitometric</term>
<term>Densitometric analysis</term>
<term>Derivative</term>
<term>Detection</term>
<term>Detection capability</term>
<term>Diagnostic tests</term>
<term>Diagnostics</term>
<term>Different countries</term>
<term>Different farms</term>
<term>Different health status</term>
<term>Different letters</term>
<term>Different subtypes</term>
<term>Directive</term>
<term>Disc diffusion</term>
<term>Disease outbreaks</term>
<term>Disease virus</term>
<term>Disease virus infection</term>
<term>Distal metaphysis</term>
<term>Domestic animals</term>
<term>Domestic duck</term>
<term>Domestic ducks</term>
<term>Domestic turkey</term>
<term>Domestic turkeys</term>
<term>Domoic acid</term>
<term>Doneness</term>
<term>Doramectin</term>
<term>Dos</term>
<term>Doubtful result</term>
<term>Doubtful results</term>
<term>Drinking water</term>
<term>Duodenum</term>
<term>Duration time</term>
<term>East region</term>
<term>Eastern poland</term>
<term>Echinococcus</term>
<term>Echinococcus multilocularis</term>
<term>Echinococcus tapeworms</term>
<term>Edulis</term>
<term>Efsa</term>
<term>Ehrlichia</term>
<term>Ehrlichiosis</term>
<term>Electrocardiogram</term>
<term>Electrocardiographic</term>
<term>Electrophoresis</term>
<term>Elem</term>
<term>Elisa</term>
<term>Embryo</term>
<term>Emphasised</term>
<term>Encoding</term>
<term>Endo_c</term>
<term>Endocortical</term>
<term>Endocortical circumference</term>
<term>Endocortical circumferences</term>
<term>Endogenous</term>
<term>Enrofloxacin</term>
<term>Enterica</term>
<term>Enteritis</term>
<term>Enterocolitica</term>
<term>Enterocolitica strains</term>
<term>Entire experiment</term>
<term>Enumeration</term>
<term>Environ</term>
<term>Environmental conditions</term>
<term>Epidemiol</term>
<term>Epidemiological</term>
<term>Epidemiological situation</term>
<term>Epidemiology</term>
<term>Epitope</term>
<term>Epizootic</term>
<term>Epizootic situation</term>
<term>Eprinomectin</term>
<term>Equine</term>
<term>Escherichia</term>
<term>Escherichia coli</term>
<term>Ethidium</term>
<term>Ethidium bromide</term>
<term>European centre</term>
<term>European countries</term>
<term>European food safety authority</term>
<term>European pigs</term>
<term>European union</term>
<term>European union summary report</term>
<term>Euthyroid</term>
<term>Ewe</term>
<term>Experimental group</term>
<term>Experimental groups</term>
<term>Exudate</term>
<term>Fabricius</term>
<term>Fadv</term>
<term>Faecal</term>
<term>Faecal contamination</term>
<term>Faecal samples</term>
<term>Faeces</term>
<term>Farm animals</term>
<term>Fatteners</term>
<term>Feed materials</term>
<term>Feed ration</term>
<term>Fermentas</term>
<term>Fever treatment</term>
<term>Fibre</term>
<term>Field strain</term>
<term>Field trial</term>
<term>Fimbria</term>
<term>Final temperature</term>
<term>Finland</term>
<term>First treatment</term>
<term>Fixation</term>
<term>Flaa</term>
<term>Flock</term>
<term>Fluorescence detection</term>
<term>Fluorescence polarisation assay</term>
<term>Fluorescence polarization assay</term>
<term>Foni</term>
<term>Food addit contam</term>
<term>Food chem</term>
<term>Food chem toxicol</term>
<term>Food microbiol</term>
<term>Food products</term>
<term>Food safety</term>
<term>Foodborne</term>
<term>Foodborne diseases</term>
<term>Foodborne pathog</term>
<term>Forester</term>
<term>Forestry workers</term>
<term>Foulbrood</term>
<term>Fowl</term>
<term>Fowl adenovirus</term>
<term>Fowl adenoviruses</term>
<term>Fpsr</term>
<term>Further studies</term>
<term>Ganglion</term>
<term>Ganglionic</term>
<term>Ganglionic cells</term>
<term>Ganglionic neurocytes</term>
<term>Gastrointestinal tract</term>
<term>Gene</term>
<term>Genebank database</term>
<term>Genetic</term>
<term>Genetic diversity</term>
<term>Genome</term>
<term>Genotype</term>
<term>Genotypic</term>
<term>Geometric parameters</term>
<term>Geometrical</term>
<term>Geometrical parameters</term>
<term>Gerbier</term>
<term>Giant platelets</term>
<term>Gizzard</term>
<term>Goat</term>
<term>Goat sera</term>
<term>Gondii</term>
<term>Graphite furnace</term>
<term>Great britain</term>
<term>Great scallops</term>
<term>Grilling</term>
<term>Grippotyphosa</term>
<term>Guard hair</term>
<term>Guard hairs</term>
<term>Haemagglutinin</term>
<term>Haematocrit</term>
<term>Haematocrit value</term>
<term>Haematological</term>
<term>Haematological parameters</term>
<term>Haemoglobin</term>
<term>Haemoglobin concentration</term>
<term>Haemolysis</term>
<term>Hair coat</term>
<term>Hair guard hair</term>
<term>Haptoglobin</term>
<term>Hardjo</term>
<term>Health risk</term>
<term>Health status</term>
<term>Healthy animals</term>
<term>Healthy pigs</term>
<term>Heart rate</term>
<term>Heat treatment</term>
<term>Hebdomadis</term>
<term>Hepatoma</term>
<term>Hepatoma cell lines</term>
<term>Hepg2</term>
<term>Hepg2 cells</term>
<term>Herbal</term>
<term>Herbal extracts</term>
<term>Herbal mixture</term>
<term>Herpesvirus</term>
<term>Hess</term>
<term>Heterogeneity</term>
<term>Hexon</term>
<term>Hexon gene</term>
<term>High content</term>
<term>High degree</term>
<term>High level</term>
<term>High levels</term>
<term>High number</term>
<term>High percentage</term>
<term>High prevalence</term>
<term>High risk</term>
<term>High similarity</term>
<term>Higher number</term>
<term>Higher values</term>
<term>Highest number</term>
<term>Highest percentage</term>
<term>Histological</term>
<term>Histological structure</term>
<term>Histopathological</term>
<term>Histopathological changes</term>
<term>Histopathological examination</term>
<term>Homogeneity</term>
<term>Homogeneity study</term>
<term>Homogenised</term>
<term>Homology</term>
<term>Honey samples</term>
<term>Horizontal method</term>
<term>Horse serum</term>
<term>Host organism</term>
<term>Household members</term>
<term>Hplc</term>
<term>Human brucellosis</term>
<term>Human health</term>
<term>Human influenza</term>
<term>Human viruses</term>
<term>Humoral</term>
<term>Hungary turkey</term>
<term>Husband wife</term>
<term>Hydrochloric acid</term>
<term>Hydropericardium</term>
<term>Hydropericardium syndrome</term>
<term>Hypericum perforatum</term>
<term>Hypoderma</term>
<term>Hypoderma bovis</term>
<term>Hypoderma lineatum</term>
<term>Ictv</term>
<term>Ictv classification</term>
<term>Immun</term>
<term>Immune</term>
<term>Immune parameters</term>
<term>Immune response</term>
<term>Immune system</term>
<term>Immunodominant</term>
<term>Immunodominant epitope</term>
<term>Immunoglobulin</term>
<term>Immunol</term>
<term>Immunol immunopathol</term>
<term>Immunological</term>
<term>Immunopathol</term>
<term>Immunosuppression</term>
<term>Inclusion body hepatitis</term>
<term>Independent experiments</term>
<term>Indirect elisa</term>
<term>Individual animals</term>
<term>Individual bands</term>
<term>Infection</term>
<term>Inflammation</term>
<term>Inflammatory</term>
<term>Influenza</term>
<term>Influenza viruses</term>
<term>Inst</term>
<term>Inst pulawy</term>
<term>Internal organs</term>
<term>Internal temperature</term>
<term>International trade</term>
<term>Intestinal</term>
<term>Intestine</term>
<term>Intracellular</term>
<term>Intracellular parasites</term>
<term>Ivermectin</term>
<term>Iwaniak</term>
<term>Jacek</term>
<term>Janow</term>
<term>Janow podlaski</term>
<term>Japanese carpet shell</term>
<term>Jejuni</term>
<term>Jejuni strains</term>
<term>July</term>
<term>June</term>
<term>Kelly</term>
<term>Kielce</term>
<term>Krzysztof</term>
<term>Kwiatek</term>
<term>Laboratory diagnosis</term>
<term>Laboratory test</term>
<term>Lactones</term>
<term>Lampreave</term>
<term>Large number</term>
<term>Larva</term>
<term>Larvae infection</term>
<term>Larvae spores</term>
<term>Last years</term>
<term>Lentiviruses</term>
<term>Leptospira</term>
<term>Leptospira serovars</term>
<term>Leptospiral</term>
<term>Leptospires</term>
<term>Leptospirosis</term>
<term>Leukocyte</term>
<term>Libitum</term>
<term>Life sciences</term>
<term>Lightness</term>
<term>Lineage</term>
<term>Lineatum</term>
<term>Liquid chromatography</term>
<term>Logarithmic</term>
<term>Long time</term>
<term>Longhaired</term>
<term>Longhaired dachshund</term>
<term>Longissimus</term>
<term>Longissimus thoracis</term>
<term>Lubelskie</term>
<term>Lubelskie province</term>
<term>Lublin province</term>
<term>Lung samples</term>
<term>Lymph</term>
<term>Lymph node samples</term>
<term>Lymph nodes</term>
<term>Lymphocyte</term>
<term>Lymphoid</term>
<term>Lysis</term>
<term>Macrocyclic</term>
<term>Macrocyclic lactones</term>
<term>Magnesium</term>
<term>Magnesium supplementation</term>
<term>Malopolskie province</term>
<term>Mammal</term>
<term>Manila clams</term>
<term>Many years</term>
<term>Marine biotoxins</term>
<term>Marker</term>
<term>Matrix</term>
<term>Mazowieckie</term>
<term>Medulla</term>
<term>Medycyna</term>
<term>Melissa officinalis</term>
<term>Melitensis</term>
<term>Metaphysis</term>
<term>Metatarsus</term>
<term>Meth</term>
<term>Methanol</term>
<term>Methodology</term>
<term>Methods animals</term>
<term>Metric</term>
<term>Metric features</term>
<term>Metronidazole</term>
<term>Mgcl2</term>
<term>Michalow</term>
<term>Michalski</term>
<term>Microbiol</term>
<term>Microbiological</term>
<term>Microbiology</term>
<term>Microorganism</term>
<term>Microscopic agglutination test</term>
<term>Milk samples</term>
<term>Mini</term>
<term>Mmmsc</term>
<term>Mmmsc antibodies</term>
<term>Molecular characterization</term>
<term>Molecular investigations</term>
<term>Molecular methods</term>
<term>Mollusc</term>
<term>Morphology</term>
<term>Morphometric</term>
<term>Morphometric analysis</term>
<term>Moxidectin</term>
<term>Mpcr</term>
<term>Mudzki</term>
<term>Muffle furnace</term>
<term>Multilocularis</term>
<term>Multilocularis tapeworms</term>
<term>Multilocularis worms</term>
<term>Multiplex</term>
<term>Muscle samples</term>
<term>Mussel</term>
<term>Mycoides</term>
<term>Mycoplasma</term>
<term>Mycoplasma agalactiae</term>
<term>Mycoplasma bovis</term>
<term>Mycoplasma bovis infection</term>
<term>Mycoplasma mycoides subsp</term>
<term>Myfa</term>
<term>Myoglobin</term>
<term>Mytilus</term>
<term>Mytilus edulis</term>
<term>Nasal</term>
<term>Nasal swabs</term>
<term>National institute</term>
<term>National residue control plan</term>
<term>Native electrophoresis</term>
<term>Negative control</term>
<term>Neonatal</term>
<term>Netherlands</term>
<term>Neuraminidase</term>
<term>Neurocytes</term>
<term>Nielsen</term>
<term>Nitric</term>
<term>Nitric acid</term>
<term>Nitrocellulose</term>
<term>Nitrocellulose membrane</term>
<term>Nitroimidazoles</term>
<term>Node</term>
<term>Nonthyroidal illness syndrome</term>
<term>Norway</term>
<term>November</term>
<term>Nucleotide</term>
<term>Nucleotide primers</term>
<term>Nucleotide sequence</term>
<term>Nucleotide sequences</term>
<term>Nutritional status</term>
<term>October</term>
<term>Oculomotor nerve</term>
<term>Officinalis</term>
<term>Olsen</term>
<term>Oocysts</term>
<term>Opolskie</term>
<term>Optical density</term>
<term>Ornidazole</term>
<term>Other authors</term>
<term>Other countries</term>
<term>Other hand</term>
<term>Other provinces</term>
<term>Other researchers</term>
<term>Other species</term>
<term>Other studies</term>
<term>Outbreak</term>
<term>Overall difference</term>
<term>Ovine</term>
<term>Oxoid</term>
<term>Oxytetracycline</term>
<term>Paenibacillus</term>
<term>Paenibacillus larvae spores</term>
<term>Paenibacillus larvae subsp</term>
<term>Pancreas</term>
<term>Parahaemolyticus</term>
<term>Paralytic shellfish poisoning</term>
<term>Parameter</term>
<term>Parasite</term>
<term>Parasitol</term>
<term>Parasitology</term>
<term>Particular dachshund varieties</term>
<term>Particular hair fractions</term>
<term>Parturition</term>
<term>Pastern bones</term>
<term>Pathogen</term>
<term>Pathogenesis</term>
<term>Pathogenic</term>
<term>Pathogenic bacteria</term>
<term>Pathogenicity</term>
<term>Pathol</term>
<term>Pejsak</term>
<term>Pelvis</term>
<term>Peptide</term>
<term>Percentage content</term>
<term>Perfringens</term>
<term>Perfringens type</term>
<term>Periosteal</term>
<term>Periosteal circumference</term>
<term>Peripheral blood</term>
<term>Pfge</term>
<term>Pfge profiles</term>
<term>Pfge typing</term>
<term>Phalange</term>
<term>Phase protein</term>
<term>Phylogenetic</term>
<term>Phylogenetic analyses</term>
<term>Phylogenetic analysis</term>
<term>Phylogenetic tree</term>
<term>Pig</term>
<term>Piglet</term>
<term>Plasmid</term>
<term>Platelet</term>
<term>Platelet aggregates</term>
<term>Platelet cytotoxicity</term>
<term>Pleuropneumonia</term>
<term>Podkarpackie</term>
<term>Podkarpackie province</term>
<term>Podlaski</term>
<term>Podlaskie</term>
<term>Poisoning</term>
<term>Poland</term>
<term>Poland food</term>
<term>Poland turkey</term>
<term>Polarisation</term>
<term>Polymerase</term>
<term>Pomona</term>
<term>Porcine</term>
<term>Porcine brucellosis</term>
<term>Positive animals</term>
<term>Positive control</term>
<term>Positive correlation</term>
<term>Positive result</term>
<term>Positive results</term>
<term>Positive samples</term>
<term>Positive sera</term>
<term>Positiveness degree</term>
<term>Postnatal</term>
<term>Potential source</term>
<term>Poultry</term>
<term>Poultry exudate</term>
<term>Poultry exudates</term>
<term>Poultry meat</term>
<term>Poultry parts</term>
<term>Powdered milk</term>
<term>Poznan</term>
<term>Pract</term>
<term>Predominant</term>
<term>Pregnant women</term>
<term>Present study</term>
<term>Prevalence</term>
<term>Previous study</term>
<term>Primer</term>
<term>Probiotic</term>
<term>Proficiency</term>
<term>Proficiency test</term>
<term>Proficiency testing</term>
<term>Profile groups</term>
<term>Programme</term>
<term>Protein</term>
<term>Province</term>
<term>Proximal</term>
<term>Proximal metaphysis</term>
<term>Proximal phalanges</term>
<term>Public health</term>
<term>Pulawy</term>
<term>Qiagen</term>
<term>Quality control</term>
<term>Quantification</term>
<term>Rapd</term>
<term>Rapd type</term>
<term>Rapd typing</term>
<term>Rapeseed meal</term>
<term>Reaction mixture</term>
<term>Reagent</term>
<term>Reassortant</term>
<term>Reassortant viruses</term>
<term>Reassortants</term>
<term>Reassortment</term>
<term>Recent years</term>
<term>Receptor</term>
<term>Reeth</term>
<term>Reference laboratory</term>
<term>Reference material</term>
<term>Reference materials</term>
<term>Reference strain</term>
<term>Reference strains</term>
<term>Reference values</term>
<term>Renal</term>
<term>Repeatability</term>
<term>Replication</term>
<term>Reproducibility</term>
<term>Research institute</term>
<term>Respiratory tract</term>
<term>Rhinitis</term>
<term>Risk factors</term>
<term>Ronidazole</term>
<term>Room temperature</term>
<term>Rrna</term>
<term>Ruminant</term>
<term>Rural communities</term>
<term>Rural community</term>
<term>Rural environment</term>
<term>Rural population</term>
<term>Saintpaul</term>
<term>Salmonella</term>
<term>Salmonella enterica serovar saintpaul</term>
<term>Salmonella saintpaul</term>
<term>Same time</term>
<term>Sample</term>
<term>Scallop</term>
<term>Scapula</term>
<term>Schoolgirl</term>
<term>Scientific opinion</term>
<term>Second elisa</term>
<term>Second examination</term>
<term>Sectional</term>
<term>Sectional area</term>
<term>Separate branch</term>
<term>September</term>
<term>Sequence analysis</term>
<term>Sequencing</term>
<term>Serological</term>
<term>Serological diagnosis</term>
<term>Serological examination</term>
<term>Serological examinations</term>
<term>Serological reactions</term>
<term>Serological results</term>
<term>Serological survey</term>
<term>Serological tests</term>
<term>Seronegative</term>
<term>Seropositive</term>
<term>Seropositive animals</term>
<term>Seropositive results</term>
<term>Seropositive samples</term>
<term>Seropositivity</term>
<term>Seroprevalence</term>
<term>Serotype</term>
<term>Serotypes</term>
<term>Serovar</term>
<term>Serovars</term>
<term>Serum</term>
<term>Serum amyloid</term>
<term>Serum concentration</term>
<term>Serum concentrations</term>
<term>Serum dilutions</term>
<term>Serum levels</term>
<term>Serum samples</term>
<term>Serum urea</term>
<term>Several countries</term>
<term>Shellfish</term>
<term>Shorthaired</term>
<term>Shorthaired dachshund</term>
<term>Sigma</term>
<term>Sigma aldrich</term>
<term>Significant decrease</term>
<term>Significant difference</term>
<term>Significant differences</term>
<term>Significant effect</term>
<term>Significant increase</term>
<term>Significant reduction</term>
<term>Simultaneous infections</term>
<term>Singh</term>
<term>Sivs</term>
<term>Skeletal muscle</term>
<term>Skeletal muscles</term>
<term>Slaughterhouse</term>
<term>Slight decrease</term>
<term>Slovakia</term>
<term>Slovakia turkey</term>
<term>Small rumin</term>
<term>Small ruminant lentiviruses</term>
<term>Small ruminants</term>
<term>Sodium chloride</term>
<term>Software</term>
<term>Songer</term>
<term>Sorf</term>
<term>Soybean meal</term>
<term>Specific antibodies</term>
<term>Spectrometry</term>
<term>Spleen</term>
<term>Spore</term>
<term>Srlvs</term>
<term>Sroka</term>
<term>Sscp</term>
<term>Standard deviation</term>
<term>Standard solutions</term>
<term>Staphylococci</term>
<term>Staphylococcus</term>
<term>Staphylococcus aureus</term>
<term>Statistica</term>
<term>Statistica software</term>
<term>Statistical analysis</term>
<term>Strain</term>
<term>Stud farm</term>
<term>Stud farms</term>
<term>Subgroup</term>
<term>Subsp</term>
<term>Subtype</term>
<term>Subtypes</term>
<term>Sufficient homogeneity test</term>
<term>Suis</term>
<term>Supernatant</term>
<term>Suppl</term>
<term>Supplementation</term>
<term>Surface area</term>
<term>Swab</term>
<term>Swine</term>
<term>Swine diseases</term>
<term>Swine industry</term>
<term>Swine influenza</term>
<term>Swine influenza virus</term>
<term>Swine influenza viruses</term>
<term>Swine virus</term>
<term>Swine viruses</term>
<term>Syndrome</term>
<term>Szulowski</term>
<term>Tapeworm</term>
<term>Terrestrial animals</term>
<term>Test results</term>
<term>Test samples</term>
<term>Test strips</term>
<term>Tetracycline</term>
<term>Thoracic</term>
<term>Thoracic limbs</term>
<term>Thrombocyte</term>
<term>Thrombocyte counts</term>
<term>Thyreostatic</term>
<term>Thyreostats</term>
<term>Thyroid hormones</term>
<term>Thyroxin</term>
<term>Tinidazole</term>
<term>Titre</term>
<term>Tomography</term>
<term>Tot_a</term>
<term>Total bone area</term>
<term>Total environ</term>
<term>Total number</term>
<term>Toxicity</term>
<term>Toxicol</term>
<term>Toxicological</term>
<term>Toxicology</term>
<term>Toxin</term>
<term>Toxin genes</term>
<term>Toxoplasma</term>
<term>Toxoplasma gondii</term>
<term>Toxoplasmosis</term>
<term>Trab_a</term>
<term>Trabecular</term>
<term>Trabecular area</term>
<term>Trace elements</term>
<term>Transgenic</term>
<term>Trivalent chromium</term>
<term>Trypanosoma</term>
<term>Tuber</term>
<term>Turkey</term>
<term>Turkey flocks</term>
<term>Turkey meat</term>
<term>Underhair</term>
<term>Unidentified</term>
<term>Urea</term>
<term>Urine</term>
<term>Urine samples</term>
<term>Usir</term>
<term>Vaccinated</term>
<term>Vaccine</term>
<term>Validation</term>
<term>Various kinds</term>
<term>Vast majority</term>
<term>Vbmd</term>
<term>Vbmd tot_a</term>
<term>Veterinary</term>
<term>Veterinary medicine</term>
<term>Vibrio</term>
<term>Virol</term>
<term>Virology</term>
<term>Virulence</term>
<term>Virulence factors</term>
<term>Virulence genes</term>
<term>Virus</term>
<term>Volumetric bone mineral density</term>
<term>Wang</term>
<term>Warmblood</term>
<term>Warmblood horses</term>
<term>Weiner</term>
<term>Whole blood</term>
<term>Wiad parazytol</term>
<term>Wide distribution</term>
<term>Wild animals</term>
<term>Wirehaired</term>
<term>Wirehaired dachshund</term>
<term>Withers</term>
<term>Wojciech</term>
<term>World organisation</term>
<term>Worldwide</term>
<term>Wroclaw</term>
<term>Wroclaw university</term>
<term>Xbai</term>
<term>Yada</term>
<term>Yersinia</term>
<term>Yersinia enterocolitica</term>
<term>Yersinia enterocolitica serotype</term>
<term>Ysta</term>
<term>Ystb</term>
<term>Zhang</term>
<term>Zool</term>
<term>Zoonosis</term>
<term>Zoonotic</term>
<term>Zoonotic agents</term>
</keywords>
</textClass>
</profileDesc>
</teiHeader>
<front>
<div type="abstract" xml:lang="en">Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.</div>
</front>
</TEI>
<istex>
<corpusName>degruyter-journals</corpusName>
<keywords>
<teeft>
<json:string>adenovirus</json:string>
<json:string>apiary</json:string>
<json:string>pulawy</json:string>
<json:string>larva</json:string>
<json:string>campylobacter</json:string>
<json:string>enterocolitica</json:string>
<json:string>microbiol</json:string>
<json:string>bovis</json:string>
<json:string>brucella</json:string>
<json:string>ganglion</json:string>
<json:string>ciliary</json:string>
<json:string>elisa</json:string>
<json:string>inst</json:string>
<json:string>exudate</json:string>
<json:string>primer</json:string>
<json:string>inst pulawy</json:string>
<json:string>mollusc</json:string>
<json:string>serotype</json:string>
<json:string>platelet</json:string>
<json:string>coli</json:string>
<json:string>salmonella</json:string>
<json:string>spore</json:string>
<json:string>mycoplasma</json:string>
<json:string>colour</json:string>
<json:string>jejuni</json:string>
<json:string>magnesium</json:string>
<json:string>shellfish</json:string>
<json:string>saintpaul</json:string>
<json:string>perfringens</json:string>
<json:string>yersinia</json:string>
<json:string>piglet</json:string>
<json:string>brucellosis</json:string>
<json:string>assay</json:string>
<json:string>research institute</json:string>
<json:string>ciliary ganglion</json:string>
<json:string>ruminant</json:string>
<json:string>phylogenetic</json:string>
<json:string>bivalve</json:string>
<json:string>significant differences</json:string>
<json:string>positive results</json:string>
<json:string>avian</json:string>
<json:string>bordetella</json:string>
<json:string>mussel</json:string>
<json:string>seropositive</json:string>
<json:string>serovars</json:string>
<json:string>anim</json:string>
<json:string>poland turkey</json:string>
<json:string>toxin</json:string>
<json:string>tapeworm</json:string>
<json:string>herbal</json:string>
<json:string>multilocularis</json:string>
<json:string>gondii</json:string>
<json:string>clin</json:string>
<json:string>serovar</json:string>
<json:string>hexon</json:string>
<json:string>porcine</json:string>
<json:string>characterised</json:string>
<json:string>pathogen</json:string>
<json:string>canis</json:string>
<json:string>antimicrobial</json:string>
<json:string>coxiella</json:string>
<json:string>serotypes</json:string>
<json:string>genotype</json:string>
<json:string>burnetii</json:string>
<json:string>toxoplasmosis</json:string>
<json:string>aureus</json:string>
<json:string>rapd</json:string>
<json:string>echinococcus</json:string>
<json:string>phalange</json:string>
<json:string>bone length</json:string>
<json:string>immune</json:string>
<json:string>dachshund</json:string>
<json:string>antigenic</json:string>
<json:string>medycyna</json:string>
<json:string>other hand</json:string>
<json:string>turkey meat</json:string>
<json:string>microbiological</json:string>
<json:string>podlaski</json:string>
<json:string>babesiosis</json:string>
<json:string>spectrometry</json:string>
<json:string>toxicol</json:string>
<json:string>encoding</json:string>
<json:string>parasitol</json:string>
<json:string>urine</json:string>
<json:string>leptospirosis</json:string>
<json:string>hair coat</json:string>
<json:string>cytotoxicity</json:string>
<json:string>bivalve molluscs</json:string>
<json:string>virol</json:string>
<json:string>november</json:string>
<json:string>immunol</json:string>
<json:string>epitope</json:string>
<json:string>swine</json:string>
<json:string>efsa</json:string>
<json:string>proximal phalanges</json:string>
<json:string>histological</json:string>
<json:string>epidemiology</json:string>
<json:string>babesia</json:string>
<json:string>environ</json:string>
<json:string>pfge</json:string>
<json:string>serum samples</json:string>
<json:string>serological</json:string>
<json:string>densitometric</json:string>
<json:string>bfrz</json:string>
<json:string>histopathological</json:string>
<json:string>thyroxin</json:string>
<json:string>wirehaired</json:string>
<json:string>morphometric</json:string>
<json:string>programme</json:string>
<json:string>underhair</json:string>
<json:string>influenza</json:string>
<json:string>parasite</json:string>
<json:string>leptospira</json:string>
<json:string>seroprevalence</json:string>
<json:string>appl</json:string>
<json:string>ganglionic</json:string>
<json:string>biotoxins</json:string>
<json:string>abortus</json:string>
<json:string>bacteriological</json:string>
<json:string>choroid</json:string>
<json:string>chem</json:string>
<json:string>michalow</json:string>
<json:string>bronchiseptica</json:string>
<json:string>bialka</json:string>
<json:string>plasmid</json:string>
<json:string>campylobacter coli</json:string>
<json:string>probiotic</json:string>
<json:string>control group</json:string>
<json:string>suis</json:string>
<json:string>macrocyclic</json:string>
<json:string>zoonosis</json:string>
<json:string>statistical analysis</json:string>
<json:string>supplementation</json:string>
<json:string>lactones</json:string>
<json:string>campylobacters</json:string>
<json:string>neurocytes</json:string>
<json:string>shorthaired</json:string>
<json:string>slovakia</json:string>
<json:string>faeces</json:string>
<json:string>janow</json:string>
<json:string>yersinia enterocolitica</json:string>
<json:string>srlvs</json:string>
<json:string>reassortant</json:string>
<json:string>antibiotic</json:string>
<json:string>cadmium</json:string>
<json:string>immunoglobulin</json:string>
<json:string>bovine brucellosis</json:string>
<json:string>honey samples</json:string>
<json:string>foulbrood</json:string>
<json:string>arabian horses</json:string>
<json:string>other authors</json:string>
<json:string>pathogenicity</json:string>
<json:string>ysta</json:string>
<json:string>agar</json:string>
<json:string>larvae spores</json:string>
<json:string>clin microbiol</json:string>
<json:string>subtypes</json:string>
<json:string>blood samples</json:string>
<json:string>animal origin</json:string>
<json:string>intestinal</json:string>
<json:string>urine samples</json:string>
<json:string>toxoplasma</json:string>
<json:string>multiplex</json:string>
<json:string>polymerase</json:string>
<json:string>forester</json:string>
<json:string>biol</json:string>
<json:string>acta</json:string>
<json:string>bovine</json:string>
<json:string>intestine</json:string>
<json:string>parahaemolyticus</json:string>
<json:string>chloramphenicol</json:string>
<json:string>creatinine</json:string>
<json:string>hypoderma</json:string>
<json:string>microbiology</json:string>
<json:string>positive samples</json:string>
<json:string>serological examination</json:string>
<json:string>node</json:string>
<json:string>lubelskie</json:string>
<json:string>nielsen</json:string>
<json:string>coxiella burnetii</json:string>
<json:string>agalactiae</json:string>
<json:string>parturition</json:string>
<json:string>broiler</json:string>
<json:string>coldblood</json:string>
<json:string>present study</json:string>
<json:string>accession</json:string>
<json:string>june</json:string>
<json:string>hepg2</json:string>
<json:string>thrombocyte</json:string>
<json:string>phylogenetic analysis</json:string>
<json:string>fpsr</json:string>
<json:string>campylobacteriosis</json:string>
<json:string>immunodominant</json:string>
<json:string>szulowski</json:string>
<json:string>adenovirus strains</json:string>
<json:string>atcc</json:string>
<json:string>metronidazole</json:string>
<json:string>bordetella bronchiseptica</json:string>
<json:string>serum concentration</json:string>
<json:string>mmmsc</json:string>
<json:string>infection</json:string>
<json:string>haptoglobin</json:string>
<json:string>podkarpackie</json:string>
<json:string>grippotyphosa</json:string>
<json:string>software</json:string>
<json:string>coldblood horses</json:string>
<json:string>edulis</json:string>
<json:string>december</json:string>
<json:string>experimental group</json:string>
<json:string>ronidazole</json:string>
<json:string>toxicity</json:string>
<json:string>swab</json:string>
<json:string>bacterium</json:string>
<json:string>haematological</json:string>
<json:string>warmblood</json:string>
<json:string>hexon gene</json:string>
<json:string>longhaired</json:string>
<json:string>standard deviation</json:string>
<json:string>macrocyclic lactones</json:string>
<json:string>fowl</json:string>
<json:string>czech</json:string>
<json:string>genome</json:string>
<json:string>cpb2</json:string>
<json:string>lentiviruses</json:string>
<json:string>denaturation</json:string>
<json:string>high level</json:string>
<json:string>poland food</json:string>
<json:string>capsid</json:string>
<json:string>mytilus</json:string>
<json:string>iwaniak</json:string>
<json:string>paenibacillus</json:string>
<json:string>antibacterial</json:string>
<json:string>native electrophoresis</json:string>
<json:string>july</json:string>
<json:string>clinical symptoms</json:string>
<json:string>influenza viruses</json:string>
<json:string>comp</json:string>
<json:string>ewe</json:string>
<json:string>vaccine</json:string>
<json:string>pig</json:string>
<json:string>blood serum</json:string>
<json:string>moxidectin</json:string>
<json:string>biotype</json:string>
<json:string>echinococcus multilocularis</json:string>
<json:string>usir</json:string>
<json:string>vibrio</json:string>
<json:string>fowl adenoviruses</json:string>
<json:string>methanol</json:string>
<json:string>intracellular</json:string>
<json:string>canine babesiosis</json:string>
<json:string>soybean meal</json:string>
<json:string>pleuropneumonia</json:string>
<json:string>fatteners</json:string>
<json:string>pathol</json:string>
<json:string>biochem</json:string>
<json:string>pomona</json:string>
<json:string>ornidazole</json:string>
<json:string>diagnostic tests</json:string>
<json:string>nasal swabs</json:string>
<json:string>anaerobe</json:string>
<json:string>sorf</json:string>
<json:string>sivs</json:string>
<json:string>bratislava</json:string>
<json:string>foodborne</json:string>
<json:string>gene</json:string>
<json:string>metric</json:string>
<json:string>porcine brucellosis</json:string>
<json:string>haemoglobin</json:string>
<json:string>yada</json:string>
<json:string>sscp</json:string>
<json:string>lineatum</json:string>
<json:string>trabecular</json:string>
<json:string>mycoides</json:string>
<json:string>repeatability</json:string>
<json:string>fluorescence detection</json:string>
<json:string>public health</json:string>
<json:string>staphylococci</json:string>
<json:string>wroclaw</json:string>
<json:string>ivermectin</json:string>
<json:string>mycoplasma bovis</json:string>
<json:string>horse serum</json:string>
<json:string>vbmd</json:string>
<json:string>domestic animals</json:string>
<json:string>fadv</json:string>
<json:string>staphylococcus</json:string>
<json:string>ciliary cells</json:string>
<json:string>serological tests</json:string>
<json:string>lymphocyte</json:string>
<json:string>diagnostics</json:string>
<json:string>grilling</json:string>
<json:string>duodenum</json:string>
<json:string>agarose</json:string>
<json:string>significant increase</json:string>
<json:string>clostridium</json:string>
<json:string>prevalence</json:string>
<json:string>reference material</json:string>
<json:string>liquid chromatography</json:string>
<json:string>weiner</json:string>
<json:string>stud farms</json:string>
<json:string>fixation</json:string>
<json:string>reference strains</json:string>
<json:string>geometric parameters</json:string>
<json:string>subsp</json:string>
<json:string>bromide</json:string>
<json:string>poultry exudates</json:string>
<json:string>rrna</json:string>
<json:string>ictv</json:string>
<json:string>endocortical</json:string>
<json:string>swine influenza</json:string>
<json:string>experimental groups</json:string>
<json:string>food microbiol</json:string>
<json:string>nitrocellulose</json:string>
<json:string>jacek</json:string>
<json:string>ganglionic neurocytes</json:string>
<json:string>total number</json:string>
<json:string>janow podlaski</json:string>
<json:string>statistica</json:string>
<json:string>negative control</json:string>
<json:string>council directive</json:string>
<json:string>toxicology</json:string>
<json:string>cadf</json:string>
<json:string>hardjo</json:string>
<json:string>internal temperature</json:string>
<json:string>surface area</json:string>
<json:string>campylobacter jejuni</json:string>
<json:string>quantification</json:string>
<json:string>enterica</json:string>
<json:string>zoonotic</json:string>
<json:string>outbreak</json:string>
<json:string>validation</json:string>
<json:string>turkey</json:string>
<json:string>clostridium perfringens</json:string>
<json:string>sectional</json:string>
<json:string>sroka</json:string>
<json:string>choroid cells</json:string>
<json:string>brucella abortus</json:string>
<json:string>andrzej</json:string>
<json:string>life sciences</json:string>
<json:string>flaa</json:string>
<json:string>animal tissues</json:string>
<json:string>positive control</json:string>
<json:string>bovis infection</json:string>
<json:string>european countries</json:string>
<json:string>giant platelets</json:string>
<json:string>swine influenza virus</json:string>
<json:string>guard hair</json:string>
<json:string>cytokine</json:string>
<json:string>seronegative</json:string>
<json:string>tot_a</json:string>
<json:string>october</json:string>
<json:string>bovis antigen</json:string>
<json:string>positive sera</json:string>
<json:string>herpesvirus</json:string>
<json:string>pastern bones</json:string>
<json:string>analysing</json:string>
<json:string>opolskie</json:string>
<json:string>mpcr</json:string>
<json:string>podlaskie</json:string>
<json:string>healthy pigs</json:string>
<json:string>periosteal</json:string>
<json:string>american foulbrood</json:string>
<json:string>anal</json:string>
<json:string>ayling</json:string>
<json:string>immun</json:string>
<json:string>longissimus</json:string>
<json:string>immunosuppression</json:string>
<json:string>receptor</json:string>
<json:string>broiler chickens</json:string>
<json:string>same time</json:string>
<json:string>myoglobin</json:string>
<json:string>confirmatory</json:string>
<json:string>virology</json:string>
<json:string>brucella suis</json:string>
<json:string>metatarsus</json:string>
<json:string>homology</json:string>
<json:string>subgroup</json:string>
<json:string>faecal</json:string>
<json:string>withers</json:string>
<json:string>escherichia</json:string>
<json:string>terrestrial animals</json:string>
<json:string>pancreas</json:string>
<json:string>epidemiol</json:string>
<json:string>tinidazole</json:string>
<json:string>clinical cases</json:string>
<json:string>libitum</json:string>
<json:string>proximal</json:string>
<json:string>nucleotide</json:string>
<json:string>mammal</json:string>
<json:string>arabian</json:string>
<json:string>ganglionic cells</json:string>
<json:string>emphasised</json:string>
<json:string>slaughterhouse</json:string>
<json:string>august</json:string>
<json:string>biotechnology</json:string>
<json:string>veterinary medicine</json:string>
<json:string>sectional area</json:string>
<json:string>ehrlichiosis</json:string>
<json:string>ystb</json:string>
<json:string>reeth</json:string>
<json:string>suppl</json:string>
<json:string>sequencing</json:string>
<json:string>lymph nodes</json:string>
<json:string>cytotoxic</json:string>
<json:string>pract</json:string>
<json:string>brucella antibodies</json:string>
<json:string>biphasic</json:string>
<json:string>room temperature</json:string>
<json:string>lymphoid</json:string>
<json:string>bacteriological examination</json:string>
<json:string>anat</json:string>
<json:string>marine biotoxins</json:string>
<json:string>scallop</json:string>
<json:string>czech republic</json:string>
<json:string>metaphysis</json:string>
<json:string>tuber</json:string>
<json:string>hebdomadis</json:string>
<json:string>gizzard</json:string>
<json:string>mytilus edulis</json:string>
<json:string>seropositivity</json:string>
<json:string>biometric</json:string>
<json:string>electrocardiographic</json:string>
<json:string>agalactia</json:string>
<json:string>contagious agalactia</json:string>
<json:string>clinical signs</json:string>
<json:string>domestic turkey</json:string>
<json:string>proficiency testing</json:string>
<json:string>warmblood horses</json:string>
<json:string>hplc</json:string>
<json:string>humoral</json:string>
<json:string>canicola</json:string>
<json:string>colostrum</json:string>
<json:string>feed materials</json:string>
<json:string>logarithmic</json:string>
<json:string>morphometric analysis</json:string>
<json:string>transgenic</json:string>
<json:string>haemolysis</json:string>
<json:string>assoc</json:string>
<json:string>euthyroid</json:string>
<json:string>european food safety authority</json:string>
<json:string>parasitology</json:string>
<json:string>ethidium</json:string>
<json:string>medulla</json:string>
<json:string>high number</json:string>
<json:string>nitroimidazoles</json:string>
<json:string>caprine</json:string>
<json:string>homogeneity study</json:string>
<json:string>reassortants</json:string>
<json:string>austria turkey</json:string>
<json:string>slovakia turkey</json:string>
<json:string>trabecular area</json:string>
<json:string>avermectins</json:string>
<json:string>chromium content</json:string>
<json:string>internal organs</json:string>
<json:string>escherichia coli</json:string>
<json:string>equine</json:string>
<json:string>parameter</json:string>
<json:string>virus</json:string>
<json:string>epidemiological</json:string>
<json:string>canine</json:string>
<json:string>analytes</json:string>
<json:string>turkey flocks</json:string>
<json:string>animal health</json:string>
<json:string>farm animals</json:string>
<json:string>leptospiral</json:string>
<json:string>chromatogr</json:string>
<json:string>xbai</json:string>
<json:string>hepg2 cells</json:string>
<json:string>swine viruses</json:string>
<json:string>thyreostatic</json:string>
<json:string>hepatoma</json:string>
<json:string>qiagen</json:string>
<json:string>doneness</json:string>
<json:string>final temperature</json:string>
<json:string>fibre</json:string>
<json:string>polarisation</json:string>
<json:string>foni</json:string>
<json:string>healthy animals</json:string>
<json:string>cbpp</json:string>
<json:string>immunological</json:string>
<json:string>melitensis</json:string>
<json:string>croup</json:string>
<json:string>scapula</json:string>
<json:string>acetonitrile</json:string>
<json:string>toxicological</json:string>
<json:string>complement fixation test</json:string>
<json:string>immunopathol</json:string>
<json:string>immunol immunopathol</json:string>
<json:string>health status</json:string>
<json:string>absorbance</json:string>
<json:string>thoracic</json:string>
<json:string>homogenised</json:string>
<json:string>lampreave</json:string>
<json:string>singh</json:string>
<json:string>acute phase proteins</json:string>
<json:string>reaction mixture</json:string>
<json:string>krzysztof</json:string>
<json:string>epizootic</json:string>
<json:string>nitrocellulose membrane</json:string>
<json:string>heat treatment</json:string>
<json:string>doramectin</json:string>
<json:string>reassortment</json:string>
<json:string>total bone area</json:string>
<json:string>seropositive animals</json:string>
<json:string>mazowieckie</json:string>
<json:string>highest percentage</json:string>
<json:string>reference strain</json:string>
<json:string>oocysts</json:string>
<json:string>trab_a</json:string>
<json:string>many years</json:string>
<json:string>crt_a</json:string>
<json:string>serum urea</json:string>
<json:string>mini</json:string>
<json:string>azotaemia</json:string>
<json:string>small ruminants</json:string>
<json:string>endo_c</json:string>
<json:string>european union</json:string>
<json:string>phylogenetic tree</json:string>
<json:string>colonisation</json:string>
<json:string>virulence genes</json:string>
<json:string>september</json:string>
<json:string>haematocrit</json:string>
<json:string>lubelskie province</json:string>
<json:string>rhinitis</json:string>
<json:string>bursa</json:string>
<json:string>virulence factors</json:string>
<json:string>fimbria</json:string>
<json:string>thrombocyte counts</json:string>
<json:string>ehrlichia</json:string>
<json:string>guard hairs</json:string>
<json:string>gastrointestinal tract</json:string>
<json:string>songer</json:string>
<json:string>east region</json:string>
<json:string>ciprofloxacin</json:string>
<json:string>bataviae</json:string>
<json:string>domestic turkeys</json:string>
<json:string>small ruminant lentiviruses</json:string>
<json:string>domestic duck</json:string>
<json:string>eprinomectin</json:string>
<json:string>serum</json:string>
<json:string>microorganism</json:string>
<json:string>chromium</json:string>
<json:string>amplification</json:string>
<json:string>syndrome</json:string>
<json:string>urea</json:string>
<json:string>replication</json:string>
<json:string>milk samples</json:string>
<json:string>enrofloxacin</json:string>
<json:string>large number</json:string>
<json:string>commun</json:string>
<json:string>poultry meat</json:string>
<json:string>cockle</json:string>
<json:string>trace elements</json:string>
<json:string>serological diagnosis</json:string>
<json:string>wojciech</json:string>
<json:string>michalski</json:string>
<json:string>kielce</json:string>
<json:string>multilocularis tapeworms</json:string>
<json:string>gerbier</json:string>
<json:string>serological reactions</json:string>
<json:string>positive result</json:string>
<json:string>antibacterial substances</json:string>
<json:string>contam</json:string>
<json:string>postnatal</json:string>
<json:string>nucleotide sequences</json:string>
<json:string>aoac</json:string>
<json:string>serological survey</json:string>
<json:string>perfringens type</json:string>
<json:string>thoracic limbs</json:string>
<json:string>household members</json:string>
<json:string>human health</json:string>
<json:string>vaccinated</json:string>
<json:string>cochran test</json:string>
<json:string>oxoid</json:string>
<json:string>mudzki</json:string>
<json:string>fermentas</json:string>
<json:string>nitric acid</json:string>
<json:string>azotaemic</json:string>
<json:string>metric features</json:string>
<json:string>nucleotide sequence</json:string>
<json:string>yersinia enterocolitica serotype</json:string>
<json:string>ovine</json:string>
<json:string>second examination</json:string>
<json:string>nitric</json:string>
<json:string>geometrical parameters</json:string>
<json:string>crassostrea</json:string>
<json:string>particular hair fractions</json:string>
<json:string>myfa</json:string>
<json:string>wang</json:string>
<json:string>trypanosoma</json:string>
<json:string>statistica software</json:string>
<json:string>high prevalence</json:string>
<json:string>analyser</json:string>
<json:string>biol trace elem</json:string>
<json:string>previous study</json:string>
<json:string>meth</json:string>
<json:string>hydropericardium</json:string>
<json:string>antiparasitic</json:string>
<json:string>pejsak</json:string>
<json:string>swine influenza viruses</json:string>
<json:string>serological results</json:string>
<json:string>thyreostats</json:string>
<json:string>zhang</json:string>
<json:string>wirehaired dachshund</json:string>
<json:string>hungary turkey</json:string>
<json:string>genotypic</json:string>
<json:string>analyse</json:string>
<json:string>haematological parameters</json:string>
<json:string>autopodium</json:string>
<json:string>powdered milk</json:string>
<json:string>ethidium bromide</json:string>
<json:string>heart rate</json:string>
<json:string>cuticule</json:string>
<json:string>tetracycline</json:string>
<json:string>zool</json:string>
<json:string>neuraminidase</json:string>
<json:string>significant decrease</json:string>
<json:string>herbal mixture</json:string>
<json:string>brucellae</json:string>
<json:string>haemagglutinin</json:string>
<json:string>test samples</json:string>
<json:string>elem</json:string>
<json:string>enteritis</json:string>
<json:string>mgcl2</json:string>
<json:string>celledoni</json:string>
<json:string>domestic ducks</json:string>
<json:string>leptospires</json:string>
<json:string>poznan</json:string>
<json:string>animal species</json:string>
<json:string>breeder</json:string>
<json:string>absorption spectrometry</json:string>
<json:string>heterogeneity</json:string>
<json:string>bulk containers</json:string>
<json:string>lysis</json:string>
<json:string>officinalis</json:string>
<json:string>kwiatek</json:string>
<json:string>cruciferous</json:string>
<json:string>leukocyte</json:string>
<json:string>toxin genes</json:string>
<json:string>bizec</json:string>
<json:string>herbal extracts</json:string>
<json:string>tomography</json:string>
<json:string>virulence</json:string>
<json:string>pathogenesis</json:string>
<json:string>peptide</json:string>
<json:string>dos</json:string>
<json:string>electrocardiogram</json:string>
<json:string>enumeration</json:string>
<json:string>matrix</json:string>
<json:string>lightness</json:string>
<json:string>mycoplasma bovis infection</json:string>
<json:string>genetic diversity</json:string>
<json:string>capsid protein</json:string>
<json:string>separate branch</json:string>
<json:string>competitive elisa</json:string>
<json:string>disc diffusion</json:string>
<json:string>histopathological changes</json:string>
<json:string>endocortical circumference</json:string>
<json:string>eastern poland</json:string>
<json:string>food chem toxicol</json:string>
<json:string>seropositive samples</json:string>
<json:string>babesia canis</json:string>
<json:string>different countries</json:string>
<json:string>reference materials</json:string>
<json:string>mycoplasma mycoides subsp</json:string>
<json:string>avian adenoviruses</json:string>
<json:string>histopathological examination</json:string>
<json:string>shorthaired dachshund</json:string>
<json:string>fluorescence polarization assay</json:string>
<json:string>histological structure</json:string>
<json:string>adenovirus strain</json:string>
<json:string>second elisa</json:string>
<json:string>classical swine</json:string>
<json:string>blood cells</json:string>
<json:string>adenovirus infections</json:string>
<json:string>average concentration</json:string>
<json:string>high levels</json:string>
<json:string>colour parameters</json:string>
<json:string>pfge profiles</json:string>
<json:string>potential source</json:string>
<json:string>high risk</json:string>
<json:string>blood platelets</json:string>
<json:string>immune system</json:string>
<json:string>human influenza</json:string>
<json:string>commission decision</json:string>
<json:string>poultry exudate</json:string>
<json:string>platelet aggregates</json:string>
<json:string>international trade</json:string>
<json:string>rapeseed meal</json:string>
<json:string>corpuscular volume</json:string>
<json:string>podkarpackie province</json:string>
<json:string>great britain</json:string>
<json:string>blue mussels</json:string>
<json:string>cpb2 gene</json:string>
<json:string>specific antibodies</json:string>
<json:string>positive correlation</json:string>
<json:string>vast majority</json:string>
<json:string>coxiella burnetii antibodies</json:string>
<json:string>serum concentrations</json:string>
<json:string>lineage</json:string>
<json:string>contamination</json:string>
<json:string>boar</json:string>
<json:string>spleen</json:string>
<json:string>kelly</json:string>
<json:string>amino</json:string>
<json:string>pelvis</json:string>
<json:string>sample</json:string>
<json:string>antibody</json:string>
<json:string>positive animals</json:string>
<json:string>sequence analysis</json:string>
<json:string>cadf gene</json:string>
<json:string>periosteal circumference</json:string>
<json:string>optical density</json:string>
<json:string>cattle sera</json:string>
<json:string>first treatment</json:string>
<json:string>cortical thickness</json:string>
<json:string>cortical area</json:string>
<json:string>bfrz gene</json:string>
<json:string>immunodominant epitope</json:string>
<json:string>last years</json:string>
<json:string>peripheral blood</json:string>
<json:string>antimicrobial peptides</json:string>
<json:string>toxoplasma gondii</json:string>
<json:string>high degree</json:string>
<json:string>avian pathol</json:string>
<json:string>copy number</json:string>
<json:string>high percentage</json:string>
<json:string>test results</json:string>
<json:string>duration time</json:string>
<json:string>correlation coefficient</json:string>
<json:string>further studies</json:string>
<json:string>lublin province</json:string>
<json:string>seropositive results</json:string>
<json:string>drinking water</json:string>
<json:string>rural environment</json:string>
<json:string>mmmsc antibodies</json:string>
<json:string>doubtful results</json:string>
<json:string>biological samples</json:string>
<json:string>wiad parazytol</json:string>
<json:string>feed ration</json:string>
<json:string>body weight</json:string>
<json:string>horizontal method</json:string>
<json:string>rapd typing</json:string>
<json:string>laboratory test</json:string>
<json:string>larvae infection</json:string>
<json:string>high content</json:string>
<json:string>scientific opinion</json:string>
<json:string>densitometric analysis</json:string>
<json:string>hypoderma lineatum</json:string>
<json:string>individual bands</json:string>
<json:string>different subtypes</json:string>
<json:string>food chem</json:string>
<json:string>serum amyloid</json:string>
<json:string>doubtful result</json:string>
<json:string>poultry parts</json:string>
<json:string>staphylococcus aureus</json:string>
<json:string>analytical methods</json:string>
<json:string>inclusion body hepatitis</json:string>
<json:string>anaerobe bacteria</json:string>
<json:string>laboratory diagnosis</json:string>
<json:string>longhaired dachshund</json:string>
<json:string>blue mussel</json:string>
<json:string>blood cell count</json:string>
<json:string>japanese carpet shell</json:string>
<json:string>european pigs</json:string>
<json:string>antibacterial activity</json:string>
<json:string>higher number</json:string>
<json:string>fluorescence polarisation assay</json:string>
<json:string>epizootic situation</json:string>
<json:string>faecal samples</json:string>
<json:string>zoonotic agents</json:string>
<json:string>appl environ microbiol</json:string>
<json:string>higher values</json:string>
<json:string>agalactiae antibodies</json:string>
<json:string>nucleotide primers</json:string>
<json:string>hepatoma cell lines</json:string>
<json:string>swine diseases</json:string>
<json:string>food products</json:string>
<json:string>dachshund varieties</json:string>
<json:string>other studies</json:string>
<json:string>food safety</json:string>
<json:string>graphite furnace</json:string>
<json:string>chemical elements</json:string>
<json:string>skeletal muscle</json:string>
<json:string>animal feed</json:string>
<json:string>several countries</json:string>
<json:string>cadmium retention</json:string>
<json:string>human viruses</json:string>
<json:string>phylogenetic analyses</json:string>
<json:string>salmonella saintpaul</json:string>
<json:string>central part</json:string>
<json:string>decision limit</json:string>
<json:string>haemoglobin concentration</json:string>
<json:string>ictv classification</json:string>
<json:string>reference laboratory</json:string>
<json:string>endocortical circumferences</json:string>
<json:string>contagious</json:string>
<json:string>pathogenic</json:string>
<json:string>strain</json:string>
<json:string>detection</json:string>
<json:string>predominant</json:string>
<json:string>inflammation</json:string>
<json:string>chromatogram</json:string>
<json:string>methodology</json:string>
<json:string>schoolgirl</json:string>
<json:string>coefficient</json:string>
<json:string>homogeneity</json:string>
<json:string>finland</json:string>
<json:string>nasal</json:string>
<json:string>veterinary</json:string>
<json:string>poland</json:string>
<json:string>bacteria</json:string>
<json:string>subtype</json:string>
<json:string>province</json:string>
<json:string>titre</json:string>
<json:string>lymph</json:string>
<json:string>genetic</json:string>
<json:string>geometrical</json:string>
<json:string>reagent</json:string>
<json:string>hess</json:string>
<json:string>renal</json:string>
<json:string>olsen</json:string>
<json:string>poultry</json:string>
<json:string>netherlands</json:string>
<json:string>flock</json:string>
<json:string>morphology</json:string>
<json:string>reassortant viruses</json:string>
<json:string>aureus cells</json:string>
<json:string>whole blood</json:string>
<json:string>recent years</json:string>
<json:string>cpb2 genes</json:string>
<json:string>broiler parts</json:string>
<json:string>cattle population</json:string>
<json:string>entire experiment</json:string>
<json:string>platelet cytotoxicity</json:string>
<json:string>paralytic shellfish poisoning</json:string>
<json:string>arch virol</json:string>
<json:string>field strain</json:string>
<json:string>foodborne diseases</json:string>
<json:string>faecal contamination</json:string>
<json:string>domoic acid</json:string>
<json:string>central region</json:string>
<json:string>manila clams</json:string>
<json:string>slight decrease</json:string>
<json:string>wild animals</json:string>
<json:string>commission regulation</json:string>
<json:string>molecular characterization</json:string>
<json:string>leptospira serovars</json:string>
<json:string>great scallops</json:string>
<json:string>microscopic agglutination test</json:string>
<json:string>serum levels</json:string>
<json:string>nonthyroidal illness syndrome</json:string>
<json:string>simultaneous infections</json:string>
<json:string>thyroid hormones</json:string>
<json:string>pathogenic bacteria</json:string>
<json:string>foodborne pathog</json:string>
<json:string>european union summary report</json:string>
<json:string>rural community</json:string>
<json:string>european centre</json:string>
<json:string>malopolskie province</json:string>
<json:string>overall difference</json:string>
<json:string>colour changes</json:string>
<json:string>antimicrobial resistance</json:string>
<json:string>other countries</json:string>
<json:string>longissimus thoracis</json:string>
<json:string>test strips</json:string>
<json:string>rapd type</json:string>
<json:string>muscle samples</json:string>
<json:string>fever treatment</json:string>
<json:string>percentage content</json:string>
<json:string>genebank database</json:string>
<json:string>wide distribution</json:string>
<json:string>risk factors</json:string>
<json:string>environmental conditions</json:string>
<json:string>world organisation</json:string>
<json:string>pregnant women</json:string>
<json:string>congenital toxoplasmosis</json:string>
<json:string>cell lines</json:string>
<json:string>independent experiments</json:string>
<json:string>hydropericardium syndrome</json:string>
<json:string>broiler meat</json:string>
<json:string>biological materials</json:string>
<json:string>muffle furnace</json:string>
<json:string>hydrochloric acid</json:string>
<json:string>pfge typing</json:string>
<json:string>forestry workers</json:string>
<json:string>trivalent chromium</json:string>
<json:string>lymph node samples</json:string>
<json:string>standard solutions</json:string>
<json:string>disease outbreaks</json:string>
<json:string>long time</json:string>
<json:string>profile groups</json:string>
<json:string>other researchers</json:string>
<json:string>husband wife</json:string>
<json:string>total environ</json:string>
<json:string>haematocrit value</json:string>
<json:string>particular dachshund varieties</json:string>
<json:string>disease virus</json:string>
<json:string>rural population</json:string>
<json:string>nutritional status</json:string>
<json:string>magnesium supplementation</json:string>
<json:string>swine virus</json:string>
<json:string>immune parameters</json:string>
<json:string>molecular investigations</json:string>
<json:string>adenovirus infection</json:string>
<json:string>disease virus infection</json:string>
<json:string>intracellular parasites</json:string>
<json:string>sodium chloride</json:string>
<json:string>field trial</json:string>
<json:string>serum dilutions</json:string>
<json:string>detection capability</json:string>
<json:string>national residue control plan</json:string>
<json:string>proficiency test</json:string>
<json:string>human brucellosis</json:string>
<json:string>high similarity</json:string>
<json:string>food addit contam</json:string>
<json:string>immune response</json:string>
<json:string>blank muscle sample</json:string>
<json:string>national institute</json:string>
<json:string>sufficient homogeneity test</json:string>
<json:string>melissa officinalis</json:string>
<json:string>echinococcus tapeworms</json:string>
<json:string>skeletal muscles</json:string>
<json:string>multilocularis worms</json:string>
<json:string>wroclaw university</json:string>
<json:string>copper region</json:string>
<json:string>quality control</json:string>
<json:string>blood concentrations</json:string>
<json:string>health risk</json:string>
<json:string>cortex layer</json:string>
<json:string>bovine urine samples</json:string>
<json:string>salmonella enterica serovar saintpaul</json:string>
<json:string>various kinds</json:string>
<json:string>cruciferous plants</json:string>
<json:string>host organism</json:string>
<json:string>paenibacillus larvae spores</json:string>
<json:string>respiratory tract</json:string>
<json:string>sigma aldrich</json:string>
<json:string>small rumin</json:string>
<json:string>other species</json:string>
<json:string>cell populations</json:string>
<json:string>goat sera</json:string>
<json:string>different farms</json:string>
<json:string>comp pathol</json:string>
<json:string>canonical discriminant analysis</json:string>
<json:string>bordetella pertussis</json:string>
<json:string>swine industry</json:string>
<json:string>atrophic rhinitis</json:string>
<json:string>other provinces</json:string>
<json:string>epidemiological situation</json:string>
<json:string>mycoplasma agalactiae</json:string>
<json:string>different letters</json:string>
<json:string>coxal tuber</json:string>
<json:string>significant difference</json:string>
<json:string>fowl adenovirus</json:string>
<json:string>paenibacillus larvae subsp</json:string>
<json:string>stud farm</json:string>
<json:string>hair guard hair</json:string>
<json:string>jejuni strains</json:string>
<json:string>colony variant</json:string>
<json:string>different health status</json:string>
<json:string>hypoderma bovis</json:string>
<json:string>rural communities</json:string>
<json:string>molecular methods</json:string>
<json:string>oculomotor nerve</json:string>
<json:string>highest number</json:string>
<json:string>volumetric bone mineral density</json:string>
<json:string>individual animals</json:string>
<json:string>serological examinations</json:string>
<json:string>enterocolitica strains</json:string>
<json:string>reference values</json:string>
<json:string>phase protein</json:string>
<json:string>brucella infections</json:string>
<json:string>indirect elisa</json:string>
<json:string>positiveness degree</json:string>
<json:string>bone density</json:string>
<json:string>significant effect</json:string>
<json:string>lung samples</json:string>
<json:string>significant reduction</json:string>
<json:string>vbmd tot_a</json:string>
<json:string>bone resistance</json:string>
<json:string>control animals</json:string>
<json:string>proximal metaphysis</json:string>
<json:string>methods animals</json:string>
<json:string>distal metaphysis</json:string>
<json:string>hypericum perforatum</json:string>
<json:string>poisoning</json:string>
<json:string>proficiency</json:string>
<json:string>electrophoresis</json:string>
<json:string>oxytetracycline</json:string>
<json:string>supernatant</json:string>
<json:string>worldwide</json:string>
<json:string>fabricius</json:string>
<json:string>reproducibility</json:string>
<json:string>derivative</json:string>
<json:string>embryo</json:string>
<json:string>neonatal</json:string>
<json:string>cochran</json:string>
<json:string>norway</json:string>
<json:string>marker</json:string>
<json:string>circumference</json:string>
<json:string>goat</json:string>
<json:string>protein</json:string>
<json:string>concentration</json:string>
<json:string>directive</json:string>
<json:string>centre</json:string>
<json:string>sigma</json:string>
<json:string>inflammatory</json:string>
<json:string>endogenous</json:string>
<json:string>unidentified</json:string>
<json:string>atypical</json:string>
<json:string>lamb</json:string>
<json:string>humans</json:string>
<json:string>belgium</json:string>
<json:string>parasitic</json:string>
<json:string>clams</json:string>
<json:string>unknown health status</json:string>
<json:string>additional toxins</json:string>
<json:string>serological surveys</json:string>
<json:string>triceps brachii</json:string>
<json:string>longissimus dorsi</json:string>
<json:string>serological relationship</json:string>
<json:string>different temperatures</json:string>
<json:string>probiotic paste</json:string>
<json:string>similar values</json:string>
<json:string>healthy piglets</json:string>
<json:string>veterinary practice</json:string>
<json:string>genetic heterogeneity</json:string>
<json:string>several dozen times</json:string>
<json:string>intestinal samples</json:string>
<json:string>triple reassortants</json:string>
<json:string>first part</json:string>
<json:string>sterile water</json:string>
<json:string>important role</json:string>
<json:string>pregnant ewes</json:string>
<json:string>clostridial enteric diseases</json:string>
<json:string>serum antibodies</json:string>
<json:string>same samples</json:string>
<json:string>kielce province</json:string>
<json:string>microplate reader</json:string>
<json:string>culture medium</json:string>
<json:string>natural infection</json:string>
<json:string>final volume</json:string>
<json:string>immunodominant region</json:string>
<json:string>standard procedure</json:string>
<json:string>final elongation</json:string>
<json:string>biological material</json:string>
<json:string>basic herd</json:string>
<json:string>poland goose</json:string>
<json:string>bone marrow hypoplasia</json:string>
<json:string>upper part</json:string>
<json:string>virus origin</json:string>
<json:string>pathogenic yersinia enterocolitica</json:string>
<json:string>canned meat</json:string>
<json:string>retail outlets</json:string>
<json:string>profile similarity</json:string>
<json:string>apis mellifera</json:string>
<json:string>particular emphasis</json:string>
<json:string>second sampling</json:string>
<json:string>ashing procedure</json:string>
<json:string>exudate samples</json:string>
<json:string>similar results</json:string>
<json:string>gene encoding epitopes</json:string>
<json:string>breast fillets</json:string>
<json:string>food poisoning</json:string>
<json:string>disease outbreak</json:string>
<json:string>other sources</json:string>
<json:string>boxa1r primer</json:string>
<json:string>anal chim acta</json:string>
<json:string>comparative study</json:string>
<json:string>plasmid encoding yada marker</json:string>
<json:string>high resistance</json:string>
<json:string>initial strain</json:string>
<json:string>cadmium absorption</json:string>
<json:string>bovine animals</json:string>
<json:string>active monitoring</json:string>
<json:string>potential role</json:string>
<json:string>exposure organ duodenuma kidneysb liverb heartb spleenb testiclesa</json:string>
<json:string>cadmium content</json:string>
<json:string>toxicol appl pharmacol</json:string>
<json:string>brucella melitensis</json:string>
<json:string>inflammatory mediators</json:string>
<json:string>dairy cows</json:string>
<json:string>hatching eggs</json:string>
<json:string>positive reactions</json:string>
<json:string>baseline survey</json:string>
<json:string>human salmonellosis</json:string>
<json:string>densitometric investigations</json:string>
<json:string>bovine milk</json:string>
<json:string>nalidixic acid</json:string>
<json:string>previous studies</json:string>
<json:string>solid phase extraction</json:string>
<json:string>unique rapd patterns</json:string>
<json:string>such analyses</json:string>
<json:string>positive rabbit serum</json:string>
<json:string>decimal fraction</json:string>
<json:string>study period</json:string>
<json:string>indistinguishable pfge profiles</json:string>
<json:string>macrocyclic lactone residues</json:string>
<json:string>critical value</json:string>
<json:string>frequent profiles</json:string>
<json:string>detection limits</json:string>
<json:string>standard deviations</json:string>
<json:string>high performance</json:string>
<json:string>animal products</json:string>
<json:string>council regulation</json:string>
<json:string>statistical calculations</json:string>
<json:string>calibration curves</json:string>
<json:string>important problems</json:string>
<json:string>lineatum antigen</json:string>
<json:string>intensive bands</json:string>
<json:string>epidemiological condition</json:string>
<json:string>method validation</json:string>
<json:string>stock solutions</json:string>
<json:string>preliminary results</json:string>
<json:string>economic importance</json:string>
<json:string>national committee</json:string>
<json:string>retention time</json:string>
<json:string>clinical laboratory standards</json:string>
<json:string>virus genes</json:string>
<json:string>lower silesia region</json:string>
<json:string>phase proteins</json:string>
<json:string>upper silesia</json:string>
<json:string>virus subtypes</json:string>
<json:string>small intestine</json:string>
<json:string>goose adenovirus</json:string>
<json:string>male dogs</json:string>
<json:string>same breed</json:string>
<json:string>warsaw university</json:string>
<json:string>lowest number</json:string>
<json:string>commercial elisa kits</json:string>
<json:string>postnatal development</json:string>
<json:string>thyreostatic drugs</json:string>
<json:string>different serotypes</json:string>
<json:string>different species</json:string>
<json:string>significant levels</json:string>
<json:string>clear differences</json:string>
<json:string>unidentified peak</json:string>
<json:string>different ages</json:string>
<json:string>other organs</json:string>
<json:string>white blood cell count</json:string>
<json:string>national research institute</json:string>
<json:string>animal production</json:string>
<json:string>molecular epidemiology</json:string>
<json:string>sscp analysis</json:string>
<json:string>vaccine strain</json:string>
<json:string>focal lymphoid cell infiltrations</json:string>
<json:string>rural development</json:string>
<json:string>further tests</json:string>
<json:string>first study</json:string>
<json:string>experimental animals</json:string>
<json:string>standard serum</json:string>
<json:string>jacek osek department</json:string>
<json:string>tissue sections</json:string>
<json:string>swine population</json:string>
<json:string>other groups</json:string>
<json:string>significance level</json:string>
<json:string>molecular genetics</json:string>
<json:string>nucleotide similarity</json:string>
<json:string>veterinary research institute</json:string>
<json:string>molecular markers</json:string>
<json:string>triple reassortant</json:string>
<json:string>national reference laboratory</json:string>
<json:string>epidemiological status</json:string>
<json:string>first stage</json:string>
<json:string>genetic patterns</json:string>
<json:string>bacterial infections</json:string>
<json:string>blackwell publishing</json:string>
<json:string>several studies</json:string>
<json:string>avian adenovirus</json:string>
<json:string>renal blood flow</json:string>
<json:string>homogeneity check</json:string>
<json:string>different levels</json:string>
<json:string>greater tubercle</json:string>
<json:string>ischial tuberosity</json:string>
<json:string>useful tool</json:string>
<json:string>adenovirus field strains</json:string>
<json:string>accred qual assur</json:string>
<json:string>statistical methods</json:string>
<json:string>pathogenic role</json:string>
<json:string>aetiological agent</json:string>
<json:string>arabian horse</json:string>
<json:string>human population</json:string>
<json:string>mycoplasma agalactiae antibodies</json:string>
<json:string>high iodine intake</json:string>
<json:string>inclusion body syndrome</json:string>
<json:string>virol meth</json:string>
<json:string>other microbes</json:string>
<json:string>total thyroxin concentration</json:string>
<json:string>fems immunol</json:string>
<json:string>side chain</json:string>
<json:string>multiplex assay</json:string>
<json:string>free thyroxin concentration</json:string>
<json:string>amnesic shellfish poisoning</json:string>
<json:string>plantago lanceolata</json:string>
<json:string>third examination</json:string>
<json:string>province number</json:string>
<json:string>dairy products</json:string>
<json:string>seropositive cattle</json:string>
<json:string>last decade</json:string>
<json:string>daily ration</json:string>
<json:string>goat herds</json:string>
<json:string>iodine deficiency</json:string>
<json:string>podlaskie province</json:string>
<json:string>same analysis</json:string>
<json:string>strength strain index</json:string>
<json:string>microbiological analyses</json:string>
<json:string>administrative division</json:string>
<json:string>rural households</json:string>
<json:string>faeces samples</json:string>
<json:string>physical exercise</json:string>
<json:string>rrna gene</json:string>
<json:string>bone tissue</json:string>
<json:string>high percentages</json:string>
<json:string>laboratory testing</json:string>
<json:string>great scallop</json:string>
<json:string>further analysis</json:string>
<json:string>tissue samples</json:string>
<json:string>normal distribution</json:string>
<json:string>largest distribution</json:string>
<json:string>descriptive statistics</json:string>
<json:string>bone parameter</json:string>
<json:string>poultry type</json:string>
<json:string>wild boars</json:string>
<json:string>rapd types</json:string>
<json:string>bovine sera</json:string>
<json:string>confirmatory investigations</json:string>
<json:string>manila clam</json:string>
<json:string>tapes semidecussatus</json:string>
<json:string>antibiotic resistance</json:string>
<json:string>anim health</json:string>
<json:string>lublin region</json:string>
<json:string>acute phase response</json:string>
<json:string>calendula officinalis</json:string>
<json:string>molecular evolution</json:string>
<json:string>microbiological criteria</json:string>
<json:string>chamomillae recutita anth</json:string>
<json:string>marine water</json:string>
<json:string>serum agglutination test</json:string>
<json:string>percentage contribution</json:string>
<json:string>hair keratin</json:string>
<json:string>bengal test</json:string>
<json:string>different regions</json:string>
<json:string>high seroprevalence</json:string>
<json:string>newborn lambs</json:string>
<json:string>lower prevalence</json:string>
<json:string>particular fractions</json:string>
<json:string>leptospiral antibodies</json:string>
<json:string>histological images</json:string>
<json:string>simultaneous infection</json:string>
<json:string>highest contribution</json:string>
<json:string>positive influence</json:string>
<json:string>other samples</json:string>
<json:string>highest values</json:string>
<json:string>similar relationship</json:string>
<json:string>northern poland</json:string>
<json:string>irregular scales</json:string>
<json:string>risk assessment</json:string>
<json:string>jagged margins</json:string>
<json:string>hair fraction underhair</json:string>
<json:string>inhibition zones</json:string>
<json:string>shorthaired dachshund variety</json:string>
<json:string>high titres</json:string>
<json:string>siusse zool</json:string>
<json:string>different doses</json:string>
<json:string>high numbers</json:string>
<json:string>turkey herpesvirus strain</json:string>
<json:string>antimicrobial activity</json:string>
<json:string>sheep diseases</json:string>
<json:string>marine molluscs</json:string>
<json:string>experimental infection</json:string>
<json:string>perfringens strains</json:string>
<json:string>disease prevention</json:string>
<json:string>human nutrition</json:string>
<json:string>deionised water</json:string>
<json:string>nodular form</json:string>
<json:string>iwona department</json:string>
<json:string>crucial role</json:string>
<json:string>birds vaccinated</json:string>
<json:string>adenovirus field strain</json:string>
<json:string>amino acid substitutions</json:string>
<json:string>gene expression</json:string>
<json:string>humoral response</json:string>
<json:string>particular diameter intervals</json:string>
<json:string>foodborne outbreaks</json:string>
<json:string>folia morphol</json:string>
<json:string>health problem</json:string>
<json:string>whole cell</json:string>
<json:string>urtica dioica</json:string>
<json:string>meat colour</json:string>
<json:string>lymphoid organs</json:string>
<json:string>marine invertebrates</json:string>
<json:string>calf</json:string>
<json:string>animal</json:string>
<json:string>grilled</json:string>
<json:string>genus</json:string>
<json:string>vaccination</json:string>
<json:string>duck</json:string>
<json:string>symptom</json:string>
<json:string>stud</json:string>
<json:string>thiouracil</json:string>
<json:string>variability</json:string>
<json:string>protocol</json:string>
<json:string>soybean</json:string>
<json:string>lesion</json:string>
<json:string>bacillus</json:string>
<json:string>residue</json:string>
<json:string>kidney</json:string>
<json:string>goose</json:string>
<json:string>globulin</json:string>
<json:string>fragment</json:string>
</teeft>
</keywords>
<author>
<json:item>
<name>Andrzej Kowalczyk</name>
<affiliations>
<json:string>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</json:string>
</affiliations>
</json:item>
<json:item>
<name>Kinga Urbaniak</name>
<affiliations>
<json:string>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</json:string>
</affiliations>
</json:item>
<json:item>
<name>Iwona Markowska-Daniel</name>
<affiliations>
<json:string>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</json:string>
</affiliations>
</json:item>
</author>
<subject>
<json:item>
<lang>
<json:string>eng</json:string>
</lang>
<value>H1N2 swine influenza virus</value>
</json:item>
<json:item>
<lang>
<json:string>eng</json:string>
</lang>
<value>phylogenetic analysis</value>
</json:item>
<json:item>
<lang>
<json:string>eng</json:string>
</lang>
<value>Poland</value>
</json:item>
</subject>
<articleId>
<json:string>v10213-012-0074-5</json:string>
</articleId>
<arkIstex>ark:/67375/QT4-H4193DVB-2</arkIstex>
<language>
<json:string>eng</json:string>
</language>
<originalGenre>
<json:string>research-article</json:string>
</originalGenre>
<abstract>Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.</abstract>
<qualityIndicators>
<score>8.14</score>
<pdfWordCount>112573</pdfWordCount>
<pdfCharCount>744541</pdfCharCount>
<pdfVersion>1.4</pdfVersion>
<pdfPageCount>220</pdfPageCount>
<pdfPageSize>595.32 x 841.92 pts (A4)</pdfPageSize>
<refBibsNative>true</refBibsNative>
<abstractWordCount>95</abstractWordCount>
<abstractCharCount>681</abstractCharCount>
<keywordCount>3</keywordCount>
</qualityIndicators>
<title>Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
<genre>
<json:string>research-article</json:string>
</genre>
<host>
<title>Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy</title>
<language>
<json:string>unknown</json:string>
</language>
<publicationDate>2012</publicationDate>
<copyrightDate>2012</copyrightDate>
<issn>
<json:string>0042-4870</json:string>
</issn>
<publisherId>
<json:string>bvip</json:string>
</publisherId>
<volume>56</volume>
<issue>4</issue>
<pages>
<first>419</first>
<last>662</last>
</pages>
<genre>
<json:string>journal</json:string>
</genre>
</host>
<namedEntities>
<unitex>
<date></date>
<geogName></geogName>
<orgName></orgName>
<orgName_funder></orgName_funder>
<orgName_provider></orgName_provider>
<persName></persName>
<placeName></placeName>
<ref_url></ref_url>
<ref_bibl></ref_bibl>
<bibl></bibl>
</unitex>
</namedEntities>
<ark>
<json:string>ark:/67375/QT4-H4193DVB-2</json:string>
</ark>
<categories>
<wos>
<json:string>1 - science</json:string>
<json:string>2 - veterinary sciences</json:string>
</wos>
<scienceMetrix>
<json:string>1 - applied sciences</json:string>
<json:string>2 - agriculture, fisheries & forestry</json:string>
<json:string>3 - veterinary sciences</json:string>
</scienceMetrix>
<scopus>
<json:string>1 - Health Sciences</json:string>
<json:string>2 - Veterinary</json:string>
<json:string>3 - General Veterinary</json:string>
</scopus>
<inist>
<json:string>1 - sciences appliquees, technologies et medecines</json:string>
<json:string>2 - sciences biologiques et medicales</json:string>
<json:string>3 - sciences biologiques fondamentales et appliquees. psychologie</json:string>
<json:string>4 - microbiologie</json:string>
</inist>
</categories>
<publicationDate>2012</publicationDate>
<copyrightDate>2012</copyrightDate>
<doi>
<json:string>10.2478/v10213-012-0074-5</json:string>
</doi>
<id>4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3</id>
<score>1</score>
<fulltext>
<json:item>
<extension>pdf</extension>
<original>true</original>
<mimetype>application/pdf</mimetype>
<uri>https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/fulltext.pdf</uri>
</json:item>
<json:item>
<extension>zip</extension>
<original>false</original>
<mimetype>application/zip</mimetype>
<uri>https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/bundle.zip</uri>
</json:item>
<istex:fulltextTEI uri="https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/fulltext.tei">
<teiHeader>
<fileDesc>
<titleStmt>
<title level="a" type="main">Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
</titleStmt>
<publicationStmt>
<authority>ISTEX</authority>
<publisher>Versita</publisher>
<availability status="free">
<p>This content is open access.</p>
</availability>
<date type="e-published">2013</date>
</publicationStmt>
<notesStmt>
<note type="content-type" source="research-article" scheme="https://content-type.data.istex.fr/ark:/67375/XTP-1JC4F85T-7">research-article</note>
<note type="publication-type" scheme="https://publication-type.data.istex.fr/ark:/67375/JMC-0GLKJH51-B">journal</note>
</notesStmt>
<sourceDesc>
<biblStruct type="article">
<analytic>
<title level="a" type="main">Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
<author xml:id="author-0000" role="corresp">
<persName>
<surname>Kowalczyk</surname>
<forename type="first">Andrzej</forename>
</persName>
<email>andrzej.kowalczyk@piwet.pulawy.pl</email>
<affiliation>
<orgName type="division">Department of Swine Diseases</orgName>
<orgName type="institution">National Veterinary Research Institute</orgName>
<address>
<addrLine>24-100 Pulawy</addrLine>
<country key="PL" xml:lang="en">POLAND</country>
</address>
</affiliation>
</author>
<author xml:id="author-0001">
<persName>
<surname>Urbaniak</surname>
<forename type="first">Kinga</forename>
</persName>
<affiliation>
<orgName type="division">Department of Swine Diseases</orgName>
<orgName type="institution">National Veterinary Research Institute</orgName>
<address>
<addrLine>24-100 Pulawy</addrLine>
<country key="PL" xml:lang="en">POLAND</country>
</address>
</affiliation>
</author>
<author xml:id="author-0002">
<persName>
<surname>Markowska-Daniel</surname>
<forename type="first">Iwona</forename>
</persName>
<affiliation>
<orgName type="division">Department of Swine Diseases</orgName>
<orgName type="institution">National Veterinary Research Institute</orgName>
<address>
<addrLine>24-100 Pulawy</addrLine>
<country key="PL" xml:lang="en">POLAND</country>
</address>
</affiliation>
</author>
<idno type="istex">4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3</idno>
<idno type="ark">ark:/67375/QT4-H4193DVB-2</idno>
<idno type="publisher-id">v10213-012-0074-5</idno>
<idno type="DOI">10.2478/v10213-012-0074-5</idno>
</analytic>
<monogr>
<title level="j" type="abbrev">Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy</title>
<idno type="publisher-id">bvip</idno>
<idno type="pISSN">0042-4870</idno>
<imprint>
<publisher>Versita</publisher>
<date type="published">2012</date>
<date type="e-published">2013</date>
<biblScope unit="vol">56</biblScope>
<biblScope unit="issue">4</biblScope>
<biblScope unit="page" from="419">419</biblScope>
<biblScope unit="page" to="662">662</biblScope>
</imprint>
</monogr>
</biblStruct>
</sourceDesc>
</fileDesc>
<encodingDesc>
<schemaRef type="ODD" url="https://xml-schema.delivery.istex.fr/tei-istex.odd"></schemaRef>
<appInfo>
<application ident="pub2tei" version="1.0.39" when="2020-03-12">
<label>pub2TEI-ISTEX</label>
<desc>A set of style sheets for converting XML documents encoded in various scientific publisher formats into a common TEI format.
<ref target="http://www.tei-c.org/">We use TEI</ref>
</desc>
</application>
</appInfo>
</encodingDesc>
<profileDesc>
<abstract>
<head>Abstract</head>
<p> Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.</p>
</abstract>
<textClass ana="keyword">
<keywords>
<term>H1N2 swine influenza virus</term>
<term>phylogenetic analysis</term>
<term>Poland</term>
</keywords>
</textClass>
<langUsage>
<language ident="EN"></language>
</langUsage>
</profileDesc>
<revisionDesc>
<change when="2020-03-12" who="#istex" xml:id="pub2tei">formatting</change>
</revisionDesc>
</teiHeader>
</istex:fulltextTEI>
<json:item>
<extension>txt</extension>
<original>false</original>
<mimetype>text/plain</mimetype>
<uri>https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/fulltext.txt</uri>
</json:item>
</fulltext>
<metadata>
<istex:metadataXml wicri:clean="corpus degruyter-journals, element #text not found" wicri:toSee="no header">
<istex:xmlDeclaration>version="1.0" encoding="UTF-8"</istex:xmlDeclaration>
<istex:docType PUBLIC="-//Atypon//DTD Atypon Systems Journal Archiving and Interchange NLM DTD v3.0.2 20101108//EN" URI="atypon_archive-interchange-dtd-3.0.2/atypon-archivearticle3.dtd" name="istex:docType"></istex:docType>
<istex:document>
<article article-type="research-article" dtd-version="3.0" xml:lang="EN">
<front>
<journal-meta>
<journal-id journal-id-type="publisher-id">bvip</journal-id>
<journal-title-group>
<abbrev-journal-title abbrev-type="full">Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy</abbrev-journal-title>
</journal-title-group>
<issn pub-type="ppub">0042-4870</issn>
<publisher>
<publisher-name>Versita</publisher-name>
</publisher>
</journal-meta>
<article-meta>
<article-id pub-id-type="publisher-id">v10213-012-0074-5</article-id>
<article-id pub-id-type="doi">10.2478/v10213-012-0074-5</article-id>
<article-categories></article-categories>
<title-group>
<article-title>Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</article-title>
</title-group>
<contrib-group>
<contrib contrib-type="author" corresp="yes">
<name>
<surname>Kowalczyk</surname>
<given-names>Andrzej</given-names>
</name>
<email xlink:href="mailto:andrzej.kowalczyk@piwet.pulawy.pl">andrzej.kowalczyk@piwet.pulawy.pl</email>
<xref ref-type="aff" rid="aff1">
<sup>1</sup>
</xref>
</contrib>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname>Urbaniak</surname>
<given-names>Kinga</given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="aff1">
<sup>1</sup>
</xref>
</contrib>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname>Markowska-Daniel</surname>
<given-names>Iwona</given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="aff1">
<sup>1</sup>
</xref>
</contrib>
<aff id="aff1">
<sup>1</sup>
Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</aff>
</contrib-group>
<pub-date pub-type="ppub">
<day>1</day>
<month>12</month>
<year>2012</year>
<string-date>1 December 2012</string-date>
</pub-date>
<pub-date pub-type="epub">
<day>17</day>
<month>01</month>
<year>2013</year>
<string-date>January 2013</string-date>
</pub-date>
<volume>56</volume>
<issue>4</issue>
<fpage>419</fpage>
<lpage>662</lpage>
<permissions>
<license license-type="open-access">
<license-p>This content is open access.</license-p>
</license>
</permissions>
<related-article related-article-type="pdf" xlink:href="v10213-012-0074-5.pdf"></related-article>
<abstract>
<title>Abstract</title>
<p> Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.</p>
</abstract>
<kwd-group>
<title>Keywords</title>
<kwd>H1N2 swine influenza virus</kwd>
<kwd>phylogenetic analysis</kwd>
<kwd>Poland</kwd>
</kwd-group>
</article-meta>
</front>
</article>
</istex:document>
</istex:metadataXml>
<mods version="3.6">
<titleInfo lang="en">
<title>Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
</titleInfo>
<titleInfo type="alternative" lang="en" contentType="CDATA">
<title>Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus</title>
</titleInfo>
<name type="personal" displayLabel="corresp">
<namePart type="given">Andrzej</namePart>
<namePart type="family">Kowalczyk</namePart>
<affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</affiliation>
<role>
<roleTerm type="text">author</roleTerm>
</role>
</name>
<name type="personal">
<namePart type="given">Kinga</namePart>
<namePart type="family">Urbaniak</namePart>
<affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</affiliation>
<role>
<roleTerm type="text">author</roleTerm>
</role>
</name>
<name type="personal">
<namePart type="given">Iwona</namePart>
<namePart type="family">Markowska-Daniel</namePart>
<affiliation>Department of Swine Diseases, National Veterinary Research Institute, 24-100 Pulawy, Poland</affiliation>
<role>
<roleTerm type="text">author</roleTerm>
</role>
</name>
<typeOfResource>text</typeOfResource>
<genre type="research-article" displayLabel="research-article" authority="ISTEX" authorityURI="https://content-type.data.istex.fr" valueURI="https://content-type.data.istex.fr/ark:/67375/XTP-1JC4F85T-7">research-article</genre>
<originInfo>
<publisher>Versita</publisher>
<dateIssued encoding="w3cdtf">2012-12-01</dateIssued>
<dateCreated encoding="w3cdtf">2013-01-17</dateCreated>
<copyrightDate encoding="w3cdtf">2012</copyrightDate>
</originInfo>
<language>
<languageTerm type="code" authority="iso639-2b">eng</languageTerm>
<languageTerm type="code" authority="rfc3066">en</languageTerm>
</language>
<abstract lang="en">Phylogenetic analysis of the genes determining influenza virus subtype - haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), was performed. The results showed that the Polish H1N2 isolate (A/Swine/Poland15817/2011) was reassortant of human-like swine H1N1 and human-like swine H3N2 origin. The novel isolate was presented to have a close phylogenic relationship with one of the latest European isolates of H1N2 (A/SW/Gent/102/2007 and A/SW/Hungary/13509/2007). Our evolutionary analyses also suggested that the HA and NA genes evolved in a significantly higher rate of synonymous substitutions after they were introduced from human to swine and established the European H1N2 swine lineage.</abstract>
<subject>
<genre>Keywords</genre>
<topic>H1N2 swine influenza virus</topic>
<topic>phylogenetic analysis</topic>
<topic>Poland</topic>
</subject>
<relatedItem type="host">
<titleInfo>
<title>Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy</title>
</titleInfo>
<genre type="journal" authority="ISTEX" authorityURI="https://publication-type.data.istex.fr" valueURI="https://publication-type.data.istex.fr/ark:/67375/JMC-0GLKJH51-B">journal</genre>
<originInfo>
<publisher>Versita</publisher>
<dateIssued encoding="w3cdtf">2012-12-01</dateIssued>
<dateCreated encoding="w3cdtf">2013-01-17</dateCreated>
<copyrightDate encoding="w3cdtf">2012</copyrightDate>
</originInfo>
<identifier type="ISSN">0042-4870</identifier>
<identifier type="PublisherID">bvip</identifier>
<part>
<date>2012</date>
<detail type="volume">
<caption>vol.</caption>
<number>56</number>
</detail>
<detail type="issue">
<caption>no.</caption>
<number>4</number>
</detail>
<extent unit="pages">
<start>419</start>
<end>662</end>
</extent>
</part>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>1. Bi Y., Fu G., Chen J., Peng J., Sun Y., Wang J., Pu J., Zhang Y., Gao H., Ma G., Tian F., Brown I.H., Liu J.: Novel swine influenza virus reassortants in pigs, China. Emerg Infect Dis 2010, 16, 1162-1164.</title>
</titleInfo>
<note>1. Bi Y., Fu G., Chen J., Peng J., Sun Y., Wang J., Pu J., Zhang Y., Gao H., Ma G., Tian F., Brown I.H., Liu J.: Novel swine influenza virus reassortants in pigs, China. Emerg Infect Dis 2010, 16, 1162-1164.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>2. Brown I.H., Harris P.A., Alexander D.J.: Serological studies of influenza viruses in pigs in Great Britain 1991-2. Epidemiol Infect 1995, 114, 511-520.</title>
</titleInfo>
<note>2. Brown I.H., Harris P.A., Alexander D.J.: Serological studies of influenza viruses in pigs in Great Britain 1991-2. Epidemiol Infect 1995, 114, 511-520.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>3. Brown I.H., Ludwig S., Olsen C.W., Hannoun C., Scholtissek C., Hinshaw V.S., Harris P.A., McCauley J.W., Strong I., Alexander D.J.: Antigenic and genetic analyses of H1N1 influenza A viruses from European pigs. J Gen Virol 1997, 78, 553-562.</title>
</titleInfo>
<note>3. Brown I.H., Ludwig S., Olsen C.W., Hannoun C., Scholtissek C., Hinshaw V.S., Harris P.A., McCauley J.W., Strong I., Alexander D.J.: Antigenic and genetic analyses of H1N1 influenza A viruses from European pigs. J Gen Virol 1997, 78, 553-562.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>4. Brown I.H.: The epidemiology and evolution of influenza viruses in pigs. Vet Microbiol 2000, 74, 29-46.</title>
</titleInfo>
<note>4. Brown I.H.: The epidemiology and evolution of influenza viruses in pigs. Vet Microbiol 2000, 74, 29-46.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>5. Campitelli L., Donatelli I., Foni E., Castrucci M.R., Fabiani C., Kawaoka Y., Krauss S., Webster R.G.: Continued evolution of H1N1 and H3N2 influenza viruses in pigs in Italy. Virology 1997, 232, 310-318.</title>
</titleInfo>
<note>5. Campitelli L., Donatelli I., Foni E., Castrucci M.R., Fabiani C., Kawaoka Y., Krauss S., Webster R.G.: Continued evolution of H1N1 and H3N2 influenza viruses in pigs in Italy. Virology 1997, 232, 310-318.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>6. Castrucci M.R., Donatelli I., Sidoli L., Barigazzi G., Kawaoka Y., Webster R.G.: Genetic reassortment between avian and human influenza A viruses in Italian pigs. Virology 1993, 193, 503-506.</title>
</titleInfo>
<note>6. Castrucci M.R., Donatelli I., Sidoli L., Barigazzi G., Kawaoka Y., Webster R.G.: Genetic reassortment between avian and human influenza A viruses in Italian pigs. Virology 1993, 193, 503-506.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>7. Choi Y.K., Lee J.H., Erickson G., Goyal S.M., Joo H.S., Webster R.G., Webby R.J.: H3N2 influenza virus transmission from swine to turkeys, United States. Emerg Infect Dis 2004, 10, 2156-2160</title>
</titleInfo>
<note>7. Choi Y.K., Lee J.H., Erickson G., Goyal S.M., Joo H.S., Webster R.G., Webby R.J.: H3N2 influenza virus transmission from swine to turkeys, United States. Emerg Infect Dis 2004, 10, 2156-2160</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>8. Chutinimitkul S., Thippamom N., Damrongwatanapokin S., Payungporn S., Thanawongnuwech R., Amonsin A., Boonsuk P., Sreta D., Bunpong N., Tantilertcharoen R., Chamnanpood P., Parchariyanon S., Theamboonlers A., Poovorawan Y.: Genetic characterization of H1N1, H1N2 and H3N2 swine influenza virus in Thailand. Arch Virol 2008, 153, 1049-1056.</title>
</titleInfo>
<note>8. Chutinimitkul S., Thippamom N., Damrongwatanapokin S., Payungporn S., Thanawongnuwech R., Amonsin A., Boonsuk P., Sreta D., Bunpong N., Tantilertcharoen R., Chamnanpood P., Parchariyanon S., Theamboonlers A., Poovorawan Y.: Genetic characterization of H1N1, H1N2 and H3N2 swine influenza virus in Thailand. Arch Virol 2008, 153, 1049-1056.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>9. Dunham E.J., Dugan V.G., Kaser E.K., Perkins S.E., Brown I.H., Holmes E.C., Taubenberger J.K.: Different evolutionary trajectories of European avian-like and classical swine H1N1 influenza A viruses. J Virol 2008, 83, 5485-5494.</title>
</titleInfo>
<note>9. Dunham E.J., Dugan V.G., Kaser E.K., Perkins S.E., Brown I.H., Holmes E.C., Taubenberger J.K.: Different evolutionary trajectories of European avian-like and classical swine H1N1 influenza A viruses. J Virol 2008, 83, 5485-5494.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>10. Chiapponi C., Moreno A., Barbieri I., Merenda M., Foni E.: Multiplex RT-PCR assay for differentiating European swine influenza virus subtypes H1N1, H1N2 and H3N2. J Virol Meth 2012, 184, 117-120</title>
</titleInfo>
<note>10. Chiapponi C., Moreno A., Barbieri I., Merenda M., Foni E.: Multiplex RT-PCR assay for differentiating European swine influenza virus subtypes H1N1, H1N2 and H3N2. J Virol Meth 2012, 184, 117-120</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>11. Gregory V., Lim W., Cameron K., Bennett M., Marozin S., Klimov A., Hall H., Cox N., Hay A., Lin Y.P.: Infection of a child in Hong Kong by an influenza A H3N2 virus closely related to viruses circulating in European pigs. J Gen Virol 2001, 82, 1397-1406.</title>
</titleInfo>
<note>11. Gregory V., Lim W., Cameron K., Bennett M., Marozin S., Klimov A., Hall H., Cox N., Hay A., Lin Y.P.: Infection of a child in Hong Kong by an influenza A H3N2 virus closely related to viruses circulating in European pigs. J Gen Virol 2001, 82, 1397-1406.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>12. Hinshaw V.S., Webster R.G., Turner B.: Novel influenza A viruses isolated from Canadian feral ducks: including strains antigenically related to swine influenza (Hsw1N1) viruses. J Gen Virol 1978, 41, 115-127.</title>
</titleInfo>
<note>12. Hinshaw V.S., Webster R.G., Turner B.: Novel influenza A viruses isolated from Canadian feral ducks: including strains antigenically related to swine influenza (Hsw1N1) viruses. J Gen Virol 1978, 41, 115-127.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>13. Kong W.L., Huang L.Z., Qi H.T., Cao N., Zhang L.Q., Wang H., Guan S.S., Qi W.B., Jiao P.R., Liao M., Zhang G.H. Genetic characterization of H1N2 influenza a virus isolated from sick pigs in Southern China in 2010. Virol J 2011, 13, 469-456.</title>
</titleInfo>
<note>13. Kong W.L., Huang L.Z., Qi H.T., Cao N., Zhang L.Q., Wang H., Guan S.S., Qi W.B., Jiao P.R., Liao M., Zhang G.H. Genetic characterization of H1N2 influenza a virus isolated from sick pigs in Southern China in 2010. Virol J 2011, 13, 469-456.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>14. Ludwig S., Stitz L., Planz O., Van H., Fitch W.M., Scholtissek C.: European swine virus as a possible source for the next influenza pandemic? Virology 1995, 212, 555-561.</title>
</titleInfo>
<note>14. Ludwig S., Stitz L., Planz O., Van H., Fitch W.M., Scholtissek C.: European swine virus as a possible source for the next influenza pandemic? Virology 1995, 212, 555-561.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>15. Markowska-Daniel I., Kowalczyk A.: Prevalence of swine influenza in Poland. Medycyna Wet 2005, 61, 669-673.</title>
</titleInfo>
<note>15. Markowska-Daniel I., Kowalczyk A.: Prevalence of swine influenza in Poland. Medycyna Wet 2005, 61, 669-673.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>16. Markowska-Daniel I., Kowalczyk A., Pejsak Z.: First case of the isolation of the H3N2 swine influenza virus in Poland. Bull Vet Inst Pulawy 2009, 53, 327-331.</title>
</titleInfo>
<note>16. Markowska-Daniel I., Kowalczyk A., Pejsak Z.: First case of the isolation of the H3N2 swine influenza virus in Poland. Bull Vet Inst Pulawy 2009, 53, 327-331.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>17. Markowska-Daniel I., Pomorska-Mól M., Pejsak Z.: The influence of age and maternal antibodies on the postvaccinal response against swine influenza viruses in pigs. Vet Immunol Immunopathol 2011, 142, 81-86.</title>
</titleInfo>
<note>17. Markowska-Daniel I., Pomorska-Mól M., Pejsak Z.: The influence of age and maternal antibodies on the postvaccinal response against swine influenza viruses in pigs. Vet Immunol Immunopathol 2011, 142, 81-86.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>18. Marozin S., Gregory V., Cameron K., Bennett M., Valette M., Aymard M., Foni E., Barigazzi G., Lin Y., Hay A.: Antigenic and genetic diversity among swine influenza A H1N1 and H1N2 viruses in Europe. J Gen Virol 2002, 83, 735-745.</title>
</titleInfo>
<note>18. Marozin S., Gregory V., Cameron K., Bennett M., Valette M., Aymard M., Foni E., Barigazzi G., Lin Y., Hay A.: Antigenic and genetic diversity among swine influenza A H1N1 and H1N2 viruses in Europe. J Gen Virol 2002, 83, 735-745.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>19. Olsen C.W., Karasin A.I., Carman S., Li Y., Bastien N., Ojkic D., Alves D., Charbonneau G., Henning B.M., Low D.E., Burton L., Broukhanski G.: Triple reassortant H3N2 influenza A viruses, Canada, 2005. Emerg Infect Dis 2006, 12, 1132-1135.</title>
</titleInfo>
<note>19. Olsen C.W., Karasin A.I., Carman S., Li Y., Bastien N., Ojkic D., Alves D., Charbonneau G., Henning B.M., Low D.E., Burton L., Broukhanski G.: Triple reassortant H3N2 influenza A viruses, Canada, 2005. Emerg Infect Dis 2006, 12, 1132-1135.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>20. Van Reeth K., Brown I., Essen S., Pensaert M.: Genetic relationships, serological cross-reaction and crossprotection between H1N2 and other influenza A virus subtypes endemic in European pigs. Virus Res 2004, 103, 115-124.</title>
</titleInfo>
<note>20. Van Reeth K., Brown I., Essen S., Pensaert M.: Genetic relationships, serological cross-reaction and crossprotection between H1N2 and other influenza A virus subtypes endemic in European pigs. Virus Res 2004, 103, 115-124.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>21. Van Reeth K.: Avian and swine influenza viruses: our current understanding of the zoonotic risk. Vet Res 2007, 38, 243-260.</title>
</titleInfo>
<note>21. Van Reeth K.: Avian and swine influenza viruses: our current understanding of the zoonotic risk. Vet Res 2007, 38, 243-260.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>22. Shu L.L., Lin Y.P., Wright S.M., Shortridge K.F., Webster R.G.: Evidence for interspecies transmission and reassortment of influenza A viruses in pigs in southern China. Virology 1994, 202, 825-833.</title>
</titleInfo>
<note>22. Shu L.L., Lin Y.P., Wright S.M., Shortridge K.F., Webster R.G.: Evidence for interspecies transmission and reassortment of influenza A viruses in pigs in southern China. Virology 1994, 202, 825-833.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>23. Vincent A.L., Ma W., Lager K.M., Gramer M.R., Richt J.A., Janke B.H.: Characterization of a newly emerged genetic cluster of H1N1 and H1N2 swine influenza virus in the United States. Virus Genes 2009, 39, 176-185.</title>
</titleInfo>
<note>23. Vincent A.L., Ma W., Lager K.M., Gramer M.R., Richt J.A., Janke B.H.: Characterization of a newly emerged genetic cluster of H1N1 and H1N2 swine influenza virus in the United States. Virus Genes 2009, 39, 176-185.</note>
</relatedItem>
<relatedItem type="references">
<titleInfo>
<title>24. Webby R.J., Swenson S.L., Krauss S.L., Gerrish P.J., Goyal S.M., Webster R.G.: Evolution of swine H3N2 influenza viruses in the United States. J Virol 2000, 74, 8243-8251.</title>
</titleInfo>
<note>24. Webby R.J., Swenson S.L., Krauss S.L., Gerrish P.J., Goyal S.M., Webster R.G.: Evolution of swine H3N2 influenza viruses in the United States. J Virol 2000, 74, 8243-8251.</note>
</relatedItem>
<identifier type="istex">4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3</identifier>
<identifier type="ark">ark:/67375/QT4-H4193DVB-2</identifier>
<identifier type="DOI">10.2478/v10213-012-0074-5</identifier>
<identifier type="ArticleID">v10213-012-0074-5</identifier>
<identifier type="pdf">v10213-012-0074-5.pdf</identifier>
<accessCondition type="use and reproduction" contentType="open-access">This content is open access.</accessCondition>
<recordInfo>
<recordContentSource authority="ISTEX" authorityURI="https://loaded-corpus.data.istex.fr" valueURI="https://loaded-corpus.data.istex.fr/ark:/67375/XBH-B4QPMMZB-D">degruyter-journals</recordContentSource>
<recordOrigin>Converted from (version 1.2.10) to MODS version 3.6.</recordOrigin>
<recordCreationDate encoding="w3cdtf">2020-04-03</recordCreationDate>
</recordInfo>
</mods>
<json:item>
<extension>json</extension>
<original>false</original>
<mimetype>application/json</mimetype>
<uri>https://api.istex.fr/ark:/67375/QT4-H4193DVB-2/record.json</uri>
</json:item>
</metadata>
<serie></serie>
</istex>
</record>

Pour manipuler ce document sous Unix (Dilib)

EXPLOR_STEP=$WICRI_ROOT/Sante/explor/H2N2V1/Data/Istex/Corpus
HfdSelect -h $EXPLOR_STEP/biblio.hfd -nk 001886 | SxmlIndent | more

Ou

HfdSelect -h $EXPLOR_AREA/Data/Istex/Corpus/biblio.hfd -nk 001886 | SxmlIndent | more

Pour mettre un lien sur cette page dans le réseau Wicri

{{Explor lien
   |wiki=    Sante
   |area=    H2N2V1
   |flux=    Istex
   |étape=   Corpus
   |type=    RBID
   |clé=     ISTEX:4CDFB34C9F13234550B3B146B72D4CC7FE533BE3
   |texte=   Phylogenetic Analysis of the First Isolate of Polish H1N2 Swine Influenza Virus
}}

Wicri

This area was generated with Dilib version V0.6.33.
Data generation: Tue Apr 14 19:59:40 2020. Site generation: Thu Mar 25 15:38:26 2021