| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000000 (2021) |
Alexandre Flageul [France] ; Pierrick Lucas [France] ; Edouard Hirchaud [France] ; Fabrice Touzain [France] ; Yannick Blanchard [France] ; Nicolas Eterradossi [France] ; Paul Brown [France] ; Béatrice Grasland [France] | Viral variant visualizer (VVV): A novel bioinformatic tool for rapid and simple visualization of viral genetic diversity. |
| 000012 (2021) |
Susanne Pfefferle [Allemagne] ; Thomas Günther [Allemagne] ; Robin Kobbe [Allemagne] ; Manja Czech-Sioli [Allemagne] ; Dominic Nörz [Allemagne] ; René Santer [Allemagne] ; Jun Oh [Allemagne] ; Stefan Kluge [Allemagne] ; Lisa Oestereich [Allemagne] ; Kersten Peldschus [Allemagne] ; Daniela Indenbirken [Allemagne] ; Jiabin Huang [Allemagne] ; Adam Grundhoff [Allemagne] ; Martin Aepfelbacher [Allemagne] ; Johannes K. Knobloch [Allemagne] ; Marc Lütgehetmann [Allemagne] ; Nicole Fischer [Allemagne] | SARS Coronavirus-2 variant tracing within the first Coronavirus Disease 19 clusters in northern Germany. |
| 000027 (2021) |
Richard L. Tillett [États-Unis] ; Joel R. Sevinsky [États-Unis] ; Paul D. Hartley [États-Unis] ; Heather Kerwin [États-Unis] ; Natalie Crawford [États-Unis] ; Andrew Gorzalski [États-Unis] ; Chris Laverdure [États-Unis] ; Subhash C. Verma [États-Unis] ; Cyprian C. Rossetto [États-Unis] ; David Jackson [États-Unis] ; Megan J. Farrell [États-Unis] ; Stephanie Van Hooser [États-Unis] ; Mark Pandori [États-Unis] | Genomic evidence for reinfection with SARS-CoV-2: a case study. |
| 000031 (2021) |
Erik Volz [Royaume-Uni] ; Verity Hill [Royaume-Uni] ; John T. Mccrone [Royaume-Uni] ; Anna Price [Royaume-Uni] ; David Jorgensen [Royaume-Uni] ; Áine O'Toole [Royaume-Uni] ; Joel Southgate [Royaume-Uni] ; Robert Johnson [Royaume-Uni] ; Ben Jackson [Royaume-Uni] ; Fabricia F. Nascimento [Royaume-Uni] ; Sara M. Rey [Royaume-Uni] ; Samuel M. Nicholls [Royaume-Uni] ; Rachel M. Colquhoun [Royaume-Uni] ; Ana Da Silva Filipe [Royaume-Uni] ; James Shepherd [Royaume-Uni] ; David J. Pascall [Royaume-Uni] ; Rajiv Shah [Royaume-Uni] ; Natasha Jesudason [Royaume-Uni] ; Kathy Li [Royaume-Uni] ; Ruth Jarrett [Royaume-Uni] ; Nicole Pacchiarini [Royaume-Uni] ; Matthew Bull [Royaume-Uni] ; Lily Geidelberg [Royaume-Uni] ; Igor Siveroni [Royaume-Uni] ; Ian Goodfellow [Royaume-Uni] ; Nicholas J. Loman [Royaume-Uni] ; Oliver G. Pybus [Royaume-Uni] ; David L. Robertson [Royaume-Uni] ; Emma C. Thomson [Royaume-Uni] ; Andrew Rambaut [Royaume-Uni] ; Thomas R. Connor [Royaume-Uni] | Evaluating the Effects of SARS-CoV-2 Spike Mutation D614G on Transmissibility and Pathogenicity. |
| 000035 (2021) |
Summer E. Galloway ; Prabasaj Paul ; Duncan R. Maccannell ; Michael A. Johansson ; John T. Brooks ; Adam Macneil ; Rachel B. Slayton ; Suxiang Tong ; Benjamin J. Silk ; Gregory L. Armstrong ; Matthew Biggerstaff ; Vivien G. Dugan | Emergence of SARS-CoV-2 B.1.1.7 Lineage - United States, December 29, 2020-January 12, 2021. |
| 000052 (2021) |
Anna-Lena Sander [Allemagne] ; Anges Yadouleton [Bénin] ; Andres Moreira-Soto [Allemagne] ; Carine Tchibozo [Bénin] ; Gildas Hounkanrin [Bénin] ; Yvette Badou [Bénin] ; Carlo Fischer [Allemagne] ; Nina Krause [Allemagne] ; Petas Akogbeto [Bénin] ; Edmilson F De Oliveira Filho [Allemagne] ; Anges Dossou [Bénin] ; Sebastian Brünink [Allemagne] ; Christian Drosten [Allemagne] ; Melchior A Joël Aïssi [Bénin] ; Mamoudou Harouna Djingarey ; Benjamin Hounkpatin [Bénin] ; Michael Nagel [Allemagne] ; Jan Felix Drexler [Allemagne] | An Observational Laboratory-Based Assessment of SARS-CoV-2 Molecular Diagnostics in Benin, Western Africa. |
| 000073 (2020) |
Eric C. Rouchka [États-Unis] ; Julia H. Chariker [États-Unis] ; Donghoon Chung [États-Unis] | Variant analysis of 1,040 SARS-CoV-2 genomes. |
| 000074 (2020) |
Keylie M. Gibson [États-Unis] ; Margaret C. Steiner [États-Unis] ; Uzma Rentia [États-Unis] ; Matthew L. Bendall [États-Unis] ; Marcos Pérez-Losada [États-Unis, Portugal] ; Keith A. Crandall [États-Unis] | Validation of Variant Assembly Using HAPHPIPE with Next-Generation Sequence Data from Viruses. |
| 000107 (2020) |
Jiaxin Ling [Suède] ; Rachel A. Hickman [Suède] ; Jinlin Li [Suède] ; Xi Lu [République populaire de Chine] ; Johanna F. Lindahl [Suède, Kenya] ; Ke Lundkvist [Suède] ; Josef D. J Rhult [Suède] | Spatio-Temporal Mutational Profile Appearances of Swedish SARS-CoV-2 during the Early Pandemic. |
| 000118 (2020) |
Yujiro Toyoshima [Japon] ; Kensaku Nemoto [Japon] ; Saki Matsumoto [Japon] ; Yusuke Nakamura [Japon] ; Kazuma Kiyotani [Japon] | SARS-CoV-2 genomic variations associated with mortality rate of COVID-19. |
| 000156 (2020) |
S Wesley Long [États-Unis] ; Randall J. Olsen [États-Unis] ; Paul A. Christensen [États-Unis] ; David W. Bernard [États-Unis] ; James J. Davis [États-Unis] ; Maulik Shukla [États-Unis] ; Marcus Nguyen [États-Unis] ; Matthew Ojeda Saavedra [États-Unis] ; Prasanti Yerramilli [États-Unis] ; Layne Pruitt [États-Unis] ; Sishir Subedi [États-Unis] ; Hung-Che Kuo [États-Unis] ; Heather Hendrickson [États-Unis] ; Ghazaleh Eskandari [États-Unis] ; Hoang A T. Nguyen [États-Unis] ; J Hunter Long [États-Unis] ; Muthiah Kumaraswami [États-Unis] ; Jule Goike [États-Unis] ; Daniel Boutz [États-Unis] ; Jimmy Gollihar [États-Unis] ; Jason S. Mclellan [États-Unis] ; Chia-Wei Chou [États-Unis] ; Kamyab Javanmardi [États-Unis] ; Ilya J. Finkelstein [États-Unis] ; James M. Musser [Sao Tomé-et-Principe, États-Unis] | Molecular Architecture of Early Dissemination and Massive Second Wave of the SARS-CoV-2 Virus in a Major Metropolitan Area. |
| 000165 (2020) |
Vítor Borges [Portugal] ; Joana Isidro [Portugal] ; Helena Cortes-Martins [Portugal] ; Sílvia Duarte [Portugal] ; Luís Vieira [Portugal] ; Ricardo Leite [Portugal] ; Isabel Gordo [Portugal] ; Constantino P. Caetano [Portugal] ; Baltazar Nunes [Portugal] ; Regina Sá [Portugal] ; Ana Oliveira [Portugal] ; Raquel Guiomar [Portugal] ; João Paulo Gomes [Portugal] | Massive dissemination of a SARS-CoV-2 Spike Y839 variant in Portugal. |
| 000169 (2020) |
Francisco J. Díaz [Colombie] ; Wbeimar Aguilar-Jiménez [Colombie] ; Lizdany Fl Rez-Álvarez [Colombie] ; Gladys Valencia [Colombie] ; Katherine Laiton-Donato [Colombie] ; Carlos Franco-Mu Oz [Colombie] ; Diego Álvarez-Díaz [Colombie] ; Marcela Mercado-Reyes [Colombie] ; María Teresa Rugeles [Colombie] | Isolation and characterization of an early SARS-CoV-2 isolate from the 2020 epidemic in Medellín, Colombia |
| 000170 (2020) |
Dan Yang [République populaire de Chine] ; Mingjun Su [République populaire de Chine] ; Chunqiu Li [République populaire de Chine] ; Bei Zhang [République populaire de Chine] ; Shanshan Qi [République populaire de Chine] ; Dongbo Sun [République populaire de Chine] ; Baishuang Yin [République populaire de Chine] | Isolation and characterization of a variant subgroup GII-a porcine epidemic diarrhea virus strain in China. |
| 000183 (2020) |
Zhe Liu [République populaire de Chine] ; Huanying Zheng [République populaire de Chine] ; Huifang Lin [République populaire de Chine] ; Mingyue Li [République populaire de Chine] ; Runyu Yuan [République populaire de Chine] ; Jinju Peng [République populaire de Chine] ; Qianling Xiong [République populaire de Chine] ; Jiufeng Sun [République populaire de Chine] ; Baisheng Li [République populaire de Chine] ; Jie Wu [République populaire de Chine] ; Lina Yi [République populaire de Chine] ; Xiaofang Peng [République populaire de Chine] ; Huan Zhang [République populaire de Chine] ; Wei Zhang [République populaire de Chine] ; Ruben J G. Hulswit [Royaume-Uni] ; Nick Loman [Royaume-Uni] ; Andrew Rambaut [Royaume-Uni] ; Changwen Ke [République populaire de Chine] ; Thomas A. Bowden [Royaume-Uni] ; Oliver G. Pybus [Royaume-Uni] ; Jing Lu [Royaume-Uni, République populaire de Chine] | Identification of Common Deletions in the Spike Protein of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. |
| 000209 (2020) |
Intikhab Alam [Arabie saoudite] ; Allan A. Kamau [Arabie saoudite] ; Maxat Kulmanov [Arabie saoudite] ; Łukasz Jaremko [Arabie saoudite] ; Stefan T. Arold [Arabie saoudite, France] ; Arnab Pain [Arabie saoudite, Japon] ; Takashi Gojobori [Arabie saoudite] ; Carlos M. Duarte [Arabie saoudite] | Functional Pangenome Analysis Shows Key Features of E Protein Are Preserved in SARS and SARS-CoV-2. |
| 000211 (2020) |
D. Paraskevis [Grèce] ; E G Kostaki [Grèce] ; G. Magiorkinis [Grèce] ; G. Panayiotakopoulos [Grèce] ; G. Sourvinos [Grèce] ; S. Tsiodras [Grèce] | Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-nCoV) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event. |
| 000230 (2020) |
Ralph S. Baric [États-Unis] | Emergence of a Highly Fit SARS-CoV-2 Variant. |
| 000244 (2020) |
Yvonne C F. Su [Singapour] ; Danielle E. Anderson [Singapour] ; Barnaby E. Young [Singapour] ; Martin Linster [Singapour] ; Feng Zhu [Singapour] ; Jayanthi Jayakumar [Singapour] ; Yan Zhuang [Singapour] ; Shirin Kalimuddin [Singapour] ; Jenny G H. Low [Singapour] ; Chee Wah Tan [Singapour] ; Wan Ni Chia [Singapour] ; Tze Minn Mak [Singapour] ; Sophie Octavia [Singapour] ; Jean-Marc Chavatte [Singapour] ; Raphael T C. Lee [Singapour] ; Surinder Pada [Singapour] ; Seow Yen Tan [Singapour] ; Louisa Sun [Singapour] ; Gabriel Z. Yan [Singapour] ; Sebastian Maurer-Stroh [Singapour] ; Ian H. Mendenhall [Singapour] ; Yee-Sin Leo [Singapour] ; David Chien Lye [Singapour] ; Lin-Fa Wang [Singapour, États-Unis] ; Gavin J D. Smith [Singapour, États-Unis] | Discovery and Genomic Characterization of a 382-Nucleotide Deletion in ORF7b and ORF8 during the Early Evolution of SARS-CoV-2. |
| 000263 (2020) |
Nicholas J. Dimonaco [Royaume-Uni] ; Mazdak Salavati [Royaume-Uni] ; Barbara B. Shih [Royaume-Uni] | Computational Analysis of SARS-CoV-2 and SARS-Like Coronavirus Diversity in Human, Bat and Pangolin Populations. |
| 000275 (2020) |
Jian-Tao Cui [République populaire de Chine] ; Han Qiao [République populaire de Chine] ; Cheng-Yao Hou [République populaire de Chine] ; Hui-Hua Zheng [République populaire de Chine] ; Xin-Sheng Li [République populaire de Chine] ; Lan-Lan Zheng [République populaire de Chine] ; Hong-Ying Chen [République populaire de Chine] | Characteristics of the spike and ORF3 genes of porcine epidemic diarrhea virus in Henan and Shanxi provinces of China. |
