Dilib, installation sous ScienceExplor : Différence entre versions
De Wicri Outils
imported>Jacques Ducloy (→Mise à jour de la hiérarchie Dilib) |
imported>Jacques Ducloy (→Mise à jour de la hiérarchie Dilib) |
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Ligne 90 : | Ligne 90 : | ||
cd $DILIB_BOTTOM | cd $DILIB_BOTTOM | ||
wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz | wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz | ||
+ | gunzip V0.6.35.tar.gz | ||
+ | tar -xvf V0.6.35.tar | ||
+ | Il faut maintenant remplacer init.sh (qui pointait sur V0.6.34) par la nouvelle version : | ||
− | + | rm init.sh | |
− | + | ln -s V0.6.35/Main/init.sh . | |
− | + | ||
− | + | Réinitialiser avec cette nouvelle version : | |
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+ | source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh | ||
+ | |||
+ | Verifier | ||
+ | echo $DILIB_VERSION | ||
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+ | Compiler : | ||
+ | source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh | ||
+ | Tester | ||
+ | source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh |
Version du 17 juin 2020 à 10:26
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Cette page décrit comment, téléverser, installer et compiler la Bibliothèque Dilib dans l'ensemble SienceExplor.
Liste des modules Dilib
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Hiérarchie ScienceExplor sur ordinateur personnel
Localisation recommandée
- $HOME -+ +- Documents + +- ScienceExplor + +- Dilib ... ($DILIB_BOTTOM) +- Tmp +- Wicri ...
Hiérarchie Dilib
- ScienceExplor~ + +- Dilib + $DILIB_BOTTOM + init.sh lien vers Main/init.sh + Versions anciennes éventuelles + V0.6.38 + $DILIB_ROOT | +- Import - les sources | +- Main - les commandes $DILIB
Préparation
Sous Debian
...
Installation dans un environnement ScienceExplor
Téléchargement
Vérifier la présence du répertoire Documents.
cd ls
Le créer éventuellement :
cd mkdir Documents
- Téléchargement
cd cd Documents wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/ScienceExplor.tar.gz
Compilation
gunzip ScienceExplor.tar.gz
tar -xvf ScienceExplor.tar
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh
- En cas de problème
Pour la première installation, (en cas de problème du à un module manquant), on peut repartir avec :
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibUpdate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh
Mise à jour avec la version V0.6.35
La version V0.6.35 résout un bogue de la commande NlmPubMedGetCorpus.
Préparation et téléchargement
Mise à jour de la hiérarchie Dilib
La hiérarchie visée est la suivante :
- ScienceExplor~ + +- Dilib + $DILIB_BOTTOM + init.sh lien vers Main/init.sh + V0.6.38 Version ancienne + V0.6.39 + $DILIB_ROOT +- Import - les sources +- Main - les commandes $DILIB
Il faut créer un répertoire d'accueil pour cette nouvelle version :
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh cd $DILIB_BOTTOM wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz gunzip V0.6.35.tar.gz tar -xvf V0.6.35.tar
Il faut maintenant remplacer init.sh (qui pointait sur V0.6.34) par la nouvelle version :
rm init.sh ln -s V0.6.35/Main/init.sh .
Réinitialiser avec cette nouvelle version :
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
Verifier
echo $DILIB_VERSION
Compiler :
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
Tester
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh