Dilib, installation sous ScienceExplor : Différence entre versions
De Wicri Outils
imported>Jacques Ducloy (→Mise à jour de la hiérarchie Dilib) |
imported>William Tardot |
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==Préparation== | ==Préparation== | ||
===Sous Debian=== | ===Sous Debian=== | ||
− | + | sudo apt-get update | |
+ | sudo apt-get install build-essential | ||
+ | sudo apt-get install bison | ||
+ | sudo apt-get install flex | ||
+ | sudo apt-get install emacs | ||
+ | sudo apt-get install wget | ||
+ | sudo apt-get install libcurl4-nss-dev | ||
+ | sudo apt-get install unzip | ||
+ | sudo apt-get install curl | ||
==Installation dans un environnement ScienceExplor== | ==Installation dans un environnement ScienceExplor== |
Version du 30 juin 2020 à 11:51
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Cette page décrit comment, téléverser, installer et compiler la Bibliothèque Dilib dans l'ensemble SienceExplor.
Liste des modules Dilib
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Hiérarchie ScienceExplor sur ordinateur personnel
Localisation recommandée
- $HOME -+ +- Documents + +- ScienceExplor + +- Dilib ... ($DILIB_BOTTOM) +- Tmp +- Wicri ...
Hiérarchie Dilib
- ScienceExplor~ + +- Dilib + $DILIB_BOTTOM + init.sh lien vers Main/init.sh + Versions anciennes éventuelles + V0.6.38 + $DILIB_ROOT | +- Import - les sources | +- Main - les commandes $DILIB
Préparation
Sous Debian
sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential sudo apt-get install bison sudo apt-get install flex sudo apt-get install emacs sudo apt-get install wget sudo apt-get install libcurl4-nss-dev sudo apt-get install unzip sudo apt-get install curl
Installation dans un environnement ScienceExplor
Téléchargement
Vérifier la présence du répertoire Documents.
cd ls
Le créer éventuellement :
cd mkdir Documents
- Téléchargement
cd cd Documents wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/ScienceExplor.tar.gz
Compilation
gunzip ScienceExplor.tar.gz
tar -xvf ScienceExplor.tar
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh
- En cas de problème
Pour la première installation, (en cas de problème du à un module manquant), on peut repartir avec :
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibUpdate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh
Mise à jour avec la version V0.6.35
La version V0.6.35 résout un bogue de la commande NlmPubMedGetCorpus.
Préparation et téléchargement
Mise à jour de la hiérarchie Dilib
La hiérarchie visée est la suivante :
- ScienceExplor~ + +- Dilib + $DILIB_BOTTOM + init.sh lien vers Main/init.sh + V0.6.38 Version ancienne + V0.6.39 + $DILIB_ROOT +- Import - les sources +- Main - les commandes $DILIB
Il faut mettre le répertoire de travail sur $DILIB_BOTTOM :
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh cd $DILIB_BOTTOM
On télécharge la nouvelle version :
wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz
Vérifier sa présence avec :
ls
Installer les répertoires
gunzip V0.6.35.tar.gz tar -xvf V0.6.35.tar
Il faut maintenant remplacer init.sh (qui pointait sur V0.6.34) par la nouvelle version :
rm init.sh ln -s V0.6.35/Main/init.sh .
Réinitialiser avec cette nouvelle version :
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
Verifier
echo $DILIB_VERSION
Compiler :
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
Tester
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh