Dilib, installation sous ScienceExplor : Différence entre versions

De Wicri Outils
imported>Jacques Ducloy
(Mise à jour de la hiérarchie Dilib)
imported>Jacques Ducloy
(Mise à jour de la hiérarchie Dilib)
Ligne 90 : Ligne 90 :
 
  cd $DILIB_BOTTOM
 
  cd $DILIB_BOTTOM
 
  wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz
 
  wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz
 +
gunzip  V0.6.35.tar.gz
 +
tar -xvf V0.6.35.tar
  
 +
Il faut maintenant remplacer init.sh (qui pointait sur V0.6.34) par la nouvelle version :
  
Vérifier avec :
+
rm init.sh
<source lang="sh">
+
ln -s V0.6.35/Main/init.sh .
pwd
+
 
</source>
+
Réinitialiser avec cette nouvelle version :
 +
 
 +
source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
 +
 
 +
Verifier
 +
echo $DILIB_VERSION
 +
 
 +
Compiler :
 +
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
 +
Tester
 +
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh

Version du 17 juin 2020 à 10:26

LogoDilib.gif
Panneau travaux.png
Bibliothèque Dilib (ressources numériques)

Cette page décrit comment, téléverser, installer et compiler la Bibliothèque Dilib dans l'ensemble SienceExplor.

 

Hiérarchie ScienceExplor sur ordinateur personnel

Localisation recommandée

- $HOME -+
         +- Documents +
                      +- ScienceExplor +
                                       +- Dilib ... ($DILIB_BOTTOM)
                                       +- Tmp
                                       +- Wicri ...

Hiérarchie Dilib

- ScienceExplor~ +         
                 +- Dilib +                                     $DILIB_BOTTOM
                          + init.sh  lien vers Main/init.sh
                          + Versions anciennes éventuelles
                          + V0.6.38 +                         $DILIB_ROOT
                          |         +- Import - les sources
                          |         +- Main   - les commandes         $DILIB

Préparation

Sous Debian

...

Installation dans un environnement ScienceExplor

Téléchargement

Vérifier la présence du répertoire Documents.

cd 
ls

Le créer éventuellement :

cd
mkdir Documents
Téléchargement
cd
cd Documents
wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/ScienceExplor.tar.gz

Compilation

gunzip  ScienceExplor.tar.gz
tar -xvf  ScienceExplor.tar

source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh
En cas de problème

Pour la première installation, (en cas de problème du à un module manquant), on peut repartir avec :

source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibUpdate.sh
source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh

Mise à jour avec la version V0.6.35

La version V0.6.35 résout un bogue de la commande NlmPubMedGetCorpus.

Préparation et téléchargement

Mise à jour de la hiérarchie Dilib

La hiérarchie visée est la suivante :

- ScienceExplor~ +         
                 +- Dilib +                                     $DILIB_BOTTOM
                          + init.sh  lien vers Main/init.sh
                          + V0.6.38  Version ancienne
                          + V0.6.39 +                         $DILIB_ROOT
                                    +- Import - les sources
                                    +- Main   - les commandes         $DILIB

Il faut créer un répertoire d'accueil pour cette nouvelle version :

source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh
cd $DILIB_BOTTOM
wget https://lorexplor.istex.fr/Dilib/V0.6.35.tar.gz
gunzip  V0.6.35.tar.gz
tar -xvf V0.6.35.tar

Il faut maintenant remplacer init.sh (qui pointait sur V0.6.34) par la nouvelle version :

rm init.sh
ln -s V0.6.35/Main/init.sh .

Réinitialiser avec cette nouvelle version :

source $HOME/Documents/ScienceExplor/Dilib/init.sh

Verifier

echo $DILIB_VERSION

Compiler :

source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibCreate.sh

Tester

source $DILIB_ROOT/Import/DilibMake/DilibTest.sh