Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis) in a fragmented landscape
Identifieur interne : 000439 ( Main/Exploration ); précédent : 000438; suivant : 000440Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis) in a fragmented landscape
Auteurs : J. Weyer [Allemagne] ; D. J Rgensen [États-Unis] ; T. Schmitt [Allemagne] ; T. J. Maxwell [États-Unis] ; C. D. Anderson [États-Unis]Source :
- Canadian journal of zoology [ 0008-4301 ] ; 2014.
Descripteurs français
- Pascal (Inist)
English descriptors
- KwdEn :
Abstract
Si de nombreuses études ont fait état de la fragmentation génétique d'espèces dont l'habitat a été modifié par des routes ou d'autres éléments d'origine humaine, la réaction de la plupart des espèces à la présence de routes n'est pas bien circonscrite, ni la question à savoir si ses effets génétiques peuvent être détectés sur un nombre restreint de générations. Nous avons utilisé des modèles de franchissement de route et l'analyse génétique des populations (basée sur les marqueurs microsatellites) pour établir des inférences concernant la connectivité fonctionnelle de populations de crotales de l'ouest (Crotalus viridis (Rafinesque, 1818)) de part et d'autre de la route Transcanadienne près de Medicine Hat (Alberta, Canada). Le modèle de franchissement de route prédisait une probabilité élevée de mortalité durant le franchissement de la Transcanadienne. Toutefois, des méthodes de regroupement génétique basées sur des modèles (STRUCTURE et BAPS) n'ont détecté aucune structure; une méthode de regroupement non basée sur un modèle (DAPC) a décelé une structure, mais la plupart des groupes étaient composés d'individus capturés dans toute la région à l'étude. Les estimations de la taille effective des populations étaient trop grandes pour être mesurées et la puissance de détection d'une éventuelle différentiation génétique se trouvait réduite si la taille effective dépassait 500. Cette réduction de la puissance était amplifiée quand le nombre de marqueurs microsatellites était réduit (de huit à cinq pour tenir compte d'allèles nuls). Nos résultats corroborent les cas signalés de migrations sur de grandes distances par cette espèce et indiquent que la fragmentation génétique peut être difficile à déceler aux échelles spatiale et temporelle considérées.
Affiliations:
Links toward previous steps (curation, corpus...)
- to stream PascalFrancis, to step Corpus: 000001
- to stream PascalFrancis, to step Curation: 000C53
- to stream PascalFrancis, to step Checkpoint: 000034
- to stream Main, to step Merge: 000440
- to stream Main, to step Curation: 000439
Le document en format XML
<record><TEI><teiHeader><fileDesc><titleStmt><title xml:lang="en" level="a">Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis) in a fragmented landscape</title><author><name sortKey="Weyer, J" sort="Weyer, J" uniqKey="Weyer J" first="J." last="Weyer">J. Weyer</name><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="01"><s1>Biogeography, Faculty VI. Trier University</s1><s2>54286 Trier</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Faculty VI. Trier University</wicri:noRegion><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion></affiliation><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="02"><s1>Senkenberg German Entomological Institute, Eberswalder Strasse 90</s1><s2>15374 Müncheberg</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Eberswalder Strasse 90</wicri:noRegion><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion></affiliation></author><author><name sortKey="J Rgensen, D" sort="J Rgensen, D" uniqKey="J Rgensen D" first="D." last="J Rgensen">D. J Rgensen</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="03"><s1>World Wildlife Fund - US, Northern Great Plains Program</s1><s2>Bozeman, MT 59771-7276</s2><s3>USA</s3><sZ>2 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Montana</region></placeName></affiliation></author><author><name sortKey="Schmitt, T" sort="Schmitt, T" uniqKey="Schmitt T" first="T." last="Schmitt">T. Schmitt</name><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="01"><s1>Biogeography, Faculty VI. Trier University</s1><s2>54286 Trier</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Faculty VI. Trier University</wicri:noRegion><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion></affiliation><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="02"><s1>Senkenberg German Entomological Institute, Eberswalder Strasse 90</s1><s2>15374 Müncheberg</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Eberswalder Strasse 90</wicri:noRegion><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion></affiliation></author><author><name sortKey="Maxwell, T J" sort="Maxwell, T J" uniqKey="Maxwell T" first="T. J." last="Maxwell">T. J. Maxwell</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="04"><s1>Computational Biology Institute, The George Washington University, Innovation Hall, 45085 University Drive, Suite 305</s1><s2>Ashburn, VA 20147</s2><s3>USA</s3><sZ>4 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Virginie</region></placeName></affiliation></author><author><name sortKey="Anderson, C D" sort="Anderson, C D" uniqKey="Anderson C" first="C. D." last="Anderson">C. D. Anderson</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="05"><s1>Valdosta State University, Department of Biology, Room 2035, 1500 North Patterson</s1><s2>Valdosta, GA 31698</s2><s3>USA</s3><sZ>5 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Géorgie (États-Unis)</region></placeName></affiliation></author></titleStmt><publicationStmt><idno type="wicri:source">INIST</idno><idno type="inist">15-0047264</idno><date when="2014">2014</date><idno type="stanalyst">PASCAL 15-0047264 INIST</idno><idno type="RBID">Pascal:15-0047264</idno><idno type="wicri:Area/PascalFrancis/Corpus">000001</idno><idno type="wicri:Area/PascalFrancis/Curation">000C53</idno><idno type="wicri:Area/PascalFrancis/Checkpoint">000034</idno><idno type="wicri:explorRef" wicri:stream="PascalFrancis" wicri:step="Checkpoint">000034</idno><idno type="wicri:doubleKey">0008-4301:2014:Weyer J:lack:of:detectable</idno><idno type="wicri:Area/Main/Merge">000440</idno><idno type="wicri:Area/Main/Curation">000439</idno><idno type="wicri:Area/Main/Exploration">000439</idno></publicationStmt><sourceDesc><biblStruct><analytic><title xml:lang="en" level="a">Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis) in a fragmented landscape</title><author><name sortKey="Weyer, J" sort="Weyer, J" uniqKey="Weyer J" first="J." last="Weyer">J. Weyer</name><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="01"><s1>Biogeography, Faculty VI. Trier University</s1><s2>54286 Trier</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Faculty VI. Trier University</wicri:noRegion><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion></affiliation><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="02"><s1>Senkenberg German Entomological Institute, Eberswalder Strasse 90</s1><s2>15374 Müncheberg</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Eberswalder Strasse 90</wicri:noRegion><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion></affiliation></author><author><name sortKey="J Rgensen, D" sort="J Rgensen, D" uniqKey="J Rgensen D" first="D." last="J Rgensen">D. J Rgensen</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="03"><s1>World Wildlife Fund - US, Northern Great Plains Program</s1><s2>Bozeman, MT 59771-7276</s2><s3>USA</s3><sZ>2 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Montana</region></placeName></affiliation></author><author><name sortKey="Schmitt, T" sort="Schmitt, T" uniqKey="Schmitt T" first="T." last="Schmitt">T. Schmitt</name><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="01"><s1>Biogeography, Faculty VI. Trier University</s1><s2>54286 Trier</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Faculty VI. Trier University</wicri:noRegion><wicri:noRegion>54286 Trier</wicri:noRegion></affiliation><affiliation wicri:level="1"><inist:fA14 i1="02"><s1>Senkenberg German Entomological Institute, Eberswalder Strasse 90</s1><s2>15374 Müncheberg</s2><s3>DEU</s3><sZ>1 aut.</sZ><sZ>3 aut.</sZ></inist:fA14><country>Allemagne</country><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion><wicri:noRegion>Eberswalder Strasse 90</wicri:noRegion><wicri:noRegion>15374 Müncheberg</wicri:noRegion></affiliation></author><author><name sortKey="Maxwell, T J" sort="Maxwell, T J" uniqKey="Maxwell T" first="T. J." last="Maxwell">T. J. Maxwell</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="04"><s1>Computational Biology Institute, The George Washington University, Innovation Hall, 45085 University Drive, Suite 305</s1><s2>Ashburn, VA 20147</s2><s3>USA</s3><sZ>4 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Virginie</region></placeName></affiliation></author><author><name sortKey="Anderson, C D" sort="Anderson, C D" uniqKey="Anderson C" first="C. D." last="Anderson">C. D. Anderson</name><affiliation wicri:level="2"><inist:fA14 i1="05"><s1>Valdosta State University, Department of Biology, Room 2035, 1500 North Patterson</s1><s2>Valdosta, GA 31698</s2><s3>USA</s3><sZ>5 aut.</sZ></inist:fA14><country>États-Unis</country><placeName><region type="state">Géorgie (États-Unis)</region></placeName></affiliation></author></analytic><series><title level="j" type="main">Canadian journal of zoology</title><title level="j" type="abbreviated">Can. j. zool.</title><idno type="ISSN">0008-4301</idno><imprint><date when="2014">2014</date></imprint></series></biblStruct></sourceDesc><seriesStmt><title level="j" type="main">Canadian journal of zoology</title><title level="j" type="abbreviated">Can. j. zool.</title><idno type="ISSN">0008-4301</idno></seriesStmt></fileDesc><profileDesc><textClass><keywords scheme="KwdEn" xml:lang="en"><term>Alberta</term><term>Animal conservation</term><term>Animal population</term><term>Crotalus viridis</term><term>Fragmentation</term><term>Fragmented habitat</term><term>Genetic variability</term><term>Highway</term><term>Landscape</term></keywords><keywords scheme="Pascal" xml:lang="fr"><term>Variabilité génétique</term><term>Population animale</term><term>Fragmentation</term><term>Paysage</term><term>Route</term><term>Protection faune</term><term>Alberta</term><term>Crotalus viridis</term><term>Tanière</term><term>Habitat fragmenté</term></keywords></textClass></profileDesc></teiHeader><front><div type="abstract" xml:lang="fr">Si de nombreuses études ont fait état de la fragmentation génétique d'espèces dont l'habitat a été modifié par des routes ou d'autres éléments d'origine humaine, la réaction de la plupart des espèces à la présence de routes n'est pas bien circonscrite, ni la question à savoir si ses effets génétiques peuvent être détectés sur un nombre restreint de générations. Nous avons utilisé des modèles de franchissement de route et l'analyse génétique des populations (basée sur les marqueurs microsatellites) pour établir des inférences concernant la connectivité fonctionnelle de populations de crotales de l'ouest (Crotalus viridis (Rafinesque, 1818)) de part et d'autre de la route Transcanadienne près de Medicine Hat (Alberta, Canada). Le modèle de franchissement de route prédisait une probabilité élevée de mortalité durant le franchissement de la Transcanadienne. Toutefois, des méthodes de regroupement génétique basées sur des modèles (STRUCTURE et BAPS) n'ont détecté aucune structure; une méthode de regroupement non basée sur un modèle (DAPC) a décelé une structure, mais la plupart des groupes étaient composés d'individus capturés dans toute la région à l'étude. Les estimations de la taille effective des populations étaient trop grandes pour être mesurées et la puissance de détection d'une éventuelle différentiation génétique se trouvait réduite si la taille effective dépassait 500. Cette réduction de la puissance était amplifiée quand le nombre de marqueurs microsatellites était réduit (de huit à cinq pour tenir compte d'allèles nuls). Nos résultats corroborent les cas signalés de migrations sur de grandes distances par cette espèce et indiquent que la fragmentation génétique peut être difficile à déceler aux échelles spatiale et temporelle considérées.</div></front></TEI><affiliations><list><country><li>Allemagne</li><li>États-Unis</li></country><region><li>Géorgie (États-Unis)</li><li>Montana</li><li>Virginie</li></region></list><tree><country name="Allemagne"><noRegion><name sortKey="Weyer, J" sort="Weyer, J" uniqKey="Weyer J" first="J." last="Weyer">J. Weyer</name></noRegion><name sortKey="Schmitt, T" sort="Schmitt, T" uniqKey="Schmitt T" first="T." last="Schmitt">T. Schmitt</name><name sortKey="Schmitt, T" sort="Schmitt, T" uniqKey="Schmitt T" first="T." last="Schmitt">T. Schmitt</name><name sortKey="Weyer, J" sort="Weyer, J" uniqKey="Weyer J" first="J." last="Weyer">J. Weyer</name></country><country name="États-Unis"><region name="Montana"><name sortKey="J Rgensen, D" sort="J Rgensen, D" uniqKey="J Rgensen D" first="D." last="J Rgensen">D. J Rgensen</name></region><name sortKey="Anderson, C D" sort="Anderson, C D" uniqKey="Anderson C" first="C. D." last="Anderson">C. D. Anderson</name><name sortKey="Maxwell, T J" sort="Maxwell, T J" uniqKey="Maxwell T" first="T. J." last="Maxwell">T. J. Maxwell</name></country></tree></affiliations></record>Pour manipuler ce document sous Unix (Dilib)
EXPLOR_STEP=$WICRI_ROOT/Wicri/Rhénanie/explor/UnivTrevesV1/Data/Main/Exploration
HfdSelect -h $EXPLOR_STEP/biblio.hfd -nk 000439 | SxmlIndent | more
Ou
HfdSelect -h $EXPLOR_AREA/Data/Main/Exploration/biblio.hfd -nk 000439 | SxmlIndent | more
Pour mettre un lien sur cette page dans le réseau Wicri
{{Explor lien
|wiki= Wicri/Rhénanie
|area= UnivTrevesV1
|flux= Main
|étape= Exploration
|type= RBID
|clé= Pascal:15-0047264
|texte= Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis) in a fragmented landscape
}}
| This area was generated with Dilib version V0.6.31. |  |