Serveur d'exploration Grémille : Différence entre versions

De Wicri Eau
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[[File:Gymnocephalus cernuus Pärnu River Estonia 2010-01-06.jpg|200px|right|thumb|Une grémille]]
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Cette page introduit un [[serveur d'exploration]] associé à la [[Grémille]], un poisson de rivière.
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==Serveurs d'exploration sur la grémille==
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{{Wicri démonstration
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  |titre=Démonstration LorExplor - plateforme d'entrainement
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  |texte=Cette espèce de poisson est utilisée comme exemple d'entraînement pour la mise au point de plateformes portant sur des poissons ayant une littérature scientifique plus importante comme par exemple ''[[Lota lota]]'' ou ''[[Perca fluviatilis]]''.
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En fait deux plateformes sont en cours d'installation :
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* GremilleV2 - avec une recherche d'exhaustivité
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* GremilleV1 - avec un critère de sélection très restrictif (''cernua'') pour obtenir une faible volumétrie (300 documents - elle permet une génération de plateforme en 1'30)
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Cette section introduit le « [[Serveur d'exploration Grémille]] ».
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Il contient [[A pour volumétrie (serveur d'exploration)::{{GremilleV2, Explor size|stream=Area|step=Corpus|index=biblio}}]] documents.
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===Navigation===
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|Ce flux donne accès [[A pour taille ISTEX::{{GremilleV2, Explor size|stream=Istex|step=Corpus|index=biblio}}]] [[A pour base utilisée::ISTEX (corpus)|documents ISTEX]] (et {{GremilleV2, Explor size|stream=Istex|step=Checkpoint|index=biblio}} après curation).
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|Ce flux traite [[A pour taille Pascal::{{GremilleV2, Explor size|stream=Pascal|step=Corpus|index=biblio}}]] références extraites de [[A pour base utilisée::Pascal (base de données)|Pascal]].
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Après curation le volume est réduit à {{GremilleV2, Explor size|stream=Pascal|step=Checkpoint|index=biblio}}.
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|Ce flux traite [[A pour taille HAL::{{GremilleV2, Explor size|stream=Hal|step=Corpus|index=biblio}}]] références [[A pour base utilisée::Hyper article en ligne|téléchargées de HAL]].
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|Le corpus contient 8 documents INRA
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!{{Explor icon number|n=5}}
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|Ce flux traite [[A pour taille PubMed::28]] documents en provenance de la base [[A pour base utilisée::PubMed (MEDLINE)]].
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|Ce flux traite [[A pour taille PubMed Central:: 52]] documents en provenance de la base [[A pour base utilisée::PubMed Central]].
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!{{Explor icon number|n=5}}{{Explor icon number|n=6}}
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{{Explor bandeau flux|type=Ncbi|code=Ncbi|path=GremilleV2|link=explor}}
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|Ce flux traite {{GremilleV2, Explor size|stream=Ncbi|step=Corpus|index=biblio}} références, Après curation le volume est réduit à {{GremilleV2, Explor size|stream=Ncbi|step=Checkpoint|index=biblio}}.
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!{{Explor icon number|n=8}}Flux principal
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!{{Explor icon number|n=1}}{{Explor icon number|n=2}}{{Explor icon number|n=3}}{{Explor icon number|n=4}}{{Explor icon number|n=7}}
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|{{Explor bandeau flux|type=MainMerge|code=Main|path=GremilleV2}}
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|Ce flux fusionne {{formatnum:{{GremilleV2, Explor size|stream=Area|step=Checkpoint|index=biblio}}}} références issues des étapes précédentes.
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Ce volume est ramené à {{formatnum:{{GremilleV2, Explor size|stream=Main|step=Merge|index=biblio}}}} après dédoublonnage par [[DOI]].
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Enfin, il est réduit à {{formatnum:{{GremilleV2, Explor size|stream=Main|step=Exploration|index=biblio}}}} par [[clé de dédoublonnage IDAT]].
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|Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{GremilleV2, Explor size|stream=France|step=Analysis|index=biblio}} références ayant au moins un auteur avec une affiliation française.
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=UK|path=GremilleV2|link=explor}}
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|Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{GremilleV2, Explor size|stream=UK|step=Analysis|index=biblio}} références ayant au moins un auteur avec une affiliation du Royaume-Uni.
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Information à exploiter : [[Peter S. Maitland]] à [[Stirling (ville)|Stirling]] en [[Écosse]].
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=USA|path=GremilleV2|link=explor}}
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|Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{GremilleV2, Explor size|stream=USA|step=Analysis|index=biblio}} références ayant au moins un auteur avec une affiliation des Etats-Unis d'Amérique.
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{{Explor bandeau flux|type=zoom|code=Allemagne|path=GremilleV2|link=explor}}
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|Ce flux donne accès à une bibliographie contenant {{GremilleV2, Explor size|stream=Allemagne|step=Analysis|index=biblio}} références ayant au moins un auteur avec une affiliation allemande.
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Information à exploiter  : [[Reiner Eckmann]] à [[Constance (Allemagne)|Constance]]
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===Projections géographiques===
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{{Début 2 colonnes}}
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{{Explor plateforme GremilleV2/Carte France|taille=400}}
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{{Saut 2 colonnes}}
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{{Explor plateforme GremilleV2/Carte France Regions 2016|taille=400}}
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{{Fin 2 colonnes}}
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{{Explor plateforme GremilleV2/Carte Europe}}
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{{Explor plateforme GremilleV2/Carte Monde}}
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===Premiers résultats===
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====Listes au niveau international====
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''Attention ces données sont élaborées à partir d'un corpus qui n'a reçu qu'une faible curation spécifique''
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{{Début 2 colonnes}}
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;Auteurs:
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{{GremilleV2, include|section=auteurs}}
 +
{{Saut 2 colonnes}}
 +
;Affiliations:
 +
{{GremilleV2, include|section=org}}
 +
{{Fin 2 colonnes}}
 +
{{Début 3 colonnes}}
 +
;Pays:
 +
{{GremilleV2, include|section=pays}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Régions:
 +
{{GremilleV2, include|section=region}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Villes:
 +
{{GremilleV2, include|section=ville}}
 +
{{Fin 2 colonnes}}
 +
{{Début 3 colonnes}}
 +
;Mots-clés originaux:
 +
{{GremilleV2, include|section=KwdEn}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Mots du titre:
 +
{{GremilleV2, include|section=title}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
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;ISSN/revue:
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{{GremilleV2, include|section=ISSN}}
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{{Fin 3 colonnes}}
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====Zoom France====
 +
{{Début 3 colonnes}}
 +
;Auteurs<ref>français ou publiant en coopération avec des laboratoires français</ref>:
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{{GremilleV2, include|section=auteursFrance}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;Affiliations:
 +
{{GremilleV2, include|section=orgFrance}}
 +
{{Saut 3 colonnes}}
 +
;pays:
 +
{{GremilleV2, include|section=paysFrance}}
 +
{{Fin 3 colonnes}}
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;Dédoublonnage:
 +
Ce corpus a été notamment utilisé pour la mise au point d'outils de dédoublonnage.
 +
 
 +
===Aspects techniques===
 +
====Paramétrage====
 +
* [[Wicri:GremilleV2]] - ''introduction''
 +
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, data]] - ''génération des données''
 +
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
 +
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
 +
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, templates size]] - ''paramétrage des modèles liés aux valeurs numériques''
 +
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, templates include]]
 +
 
 +
====Eléments de curation====
 +
Personnes :
 +
* [[Wicri:Liste des spécialistes sur les poissons]]
 +
* [[Wicri:Liste de personnalités dans la thématique de l'eau]]
 +
;Problèmes relevés:
 +
* affiliation MODS {{Explor lien
 +
  |wiki=    Wicri/Eau
 +
  |area=    GremilleV2
 +
  |flux=    Istex
 +
  |étape=  Corpus
 +
  |type=    RBID
 +
  |clé=    ISTEX:8EAA002A1523C626688D4A8D3FFEB880FFC00682
 +
  |texte=  Challenges in developing fish‐based ecological assessment methods for large floodplain rivers
 +
}}
 +
;Plateforme de test:
 +
* [[Serveur de test sur la grémille]]
 +
 
 +
==Voir aussi==
 +
;Notes:
 +
<references/>
 +
{{Wicri voir|dec=Serveur d'exploration}}
 +
 
 +
Ce serveur est visible sur {{Wicri lien|wiki=Animaux}}.
 +
 
 +
[[Catégorie:Serveur d'exploration]]
 +
[[Catégorie:Serveurs d'exploration]]

Version actuelle datée du 13 février 2024 à 10:53

Une grémille

Cette page introduit un serveur d'exploration associé à la Grémille, un poisson de rivière.

Serveurs d'exploration sur la grémille

Théorème de Pythagore Démonstration LorExplor - plateforme d'entrainement
Cette espèce de poisson est utilisée comme exemple d'entraînement pour la mise au point de plateformes portant sur des poissons ayant une littérature scientifique plus importante comme par exemple Lota lota ou Perca fluviatilis.

En fait deux plateformes sont en cours d'installation :

  • GremilleV2 - avec une recherche d'exhaustivité
  • GremilleV1 - avec un critère de sélection très restrictif (cernua) pour obtenir une faible volumétrie (300 documents - elle permet une génération de plateforme en 1'30)

Cette section introduit le « Serveur d'exploration Grémille ».

Il contient 934 documents.

Navigation

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Pour aller sur le flux ISTEX

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux donne accès 768 documents ISTEX (et 768 après curation).
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Pour aller sur le flux Pascal

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 77 références extraites de Pascal.

Après curation le volume est réduit à 77.

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Pour aller sur le flux Hal Ccsd

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 1 références téléchargées de HAL.
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Pour aller sur le flux HAL INRA

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Le corpus contient 8 documents INRA
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Pour aller sur le flux PubMed/Medline

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 28 documents en provenance de la base PubMed (MEDLINE).
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Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 52 documents en provenance de la base PubMed Central.
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Pour aller sur l'étape de reformatage du corpus

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape de contrôle

Ce flux traite 80 références, Après curation le volume est réduit à 77.
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Flux principal
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Pour aller sur le flux de convergence qui donne accès au serveur

Pour aller sur l'étape de confluence / dédoublonnage

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux fusionne 931 références issues des étapes précédentes.

Ce volume est ramené à 926 après dédoublonnage par DOI. Enfin, il est réduit à 897 par clé de dédoublonnage IDAT.

Zoom France

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Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 70 références ayant au moins un auteur avec une affiliation française.
Zoom UK

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Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 115 références ayant au moins un auteur avec une affiliation du Royaume-Uni.

Information à exploiter : Peter S. Maitland à Stirling en Écosse.

Zoom USA

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Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 109 références ayant au moins un auteur avec une affiliation des Etats-Unis d'Amérique.
Zoom Allemagne

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Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur la page d'accueil du Zoom

Pour aller sur l'étape de curation

Pour aller sur l'étape d'exploration globale

Ce flux donne accès à une bibliographie contenant 111 références ayant au moins un auteur avec une affiliation allemande.

Information à exploiter  : Reiner Eckmann à Constance

Projections géographiques

  

Premiers résultats

Listes au niveau international

Attention ces données sont élaborées à partir d'un corpus qui n'a reçu qu'une faible curation spécifique

Auteurs
  1. Christian Wolter (biologiste) (15)
  2. Martti Rask (14)
  3. Reiner Eckmann (12)
  4. Thomas Mehner (biologiste) (11)
  5. W. L. T. Van Densen (10)
  6. J. Kube Ka (10)
  7. T. Penczak (9)
  8. M. Ech (8)
  9. E. Tellervo Valtonen (8)
  10. V. Draštík (7)
  11. P. S. Maitland (7)
  12. M. Kratochvíl (7)
  13. Erik Jeppesen (7)
  14. Carol A. Stepien (7)
  15. Peter S. Maitland (6)
  
Affiliations
  1. Université d'Helsinki (27)
  2. Institut Leibniz d’écologie aquatique et de la pêche en eau douce (26)
  3. Université de Jyväskylä (25)
  4. Université de Constance (16)
  5. Institut finlandais de recherche sur la chasse et la pêche (15)
  6. Station de recherche sur la chasse et la pêche d'Evo (14)
  7. Institut national de la recherche agronomique (13)
  8. Université de Wageningue (11)
  9. Université de Londres (9)
  10. Université de Turku (6)
  11. Université de Stockholm (6)
  12. Université de Lorraine (5)
  13. Université de Glasgow (5)
  14. Université d'Anvers (5)
  15. Université Toulouse III - Paul Sabatier (5)
Pays
  1. Royaume-Uni (115)
  2. Allemagne (111)
  3. États-Unis (109)
  4. Finlande (92)
  5. France (70)
  6. Pays-Bas (64)
  7. Suède (57)
  8. Canada (38)
  9. Pologne (37)
  10. République tchèque (35)
  11. Russie (27)
  12. Belgique (24)
  13. Norvège (23)
  14. Danemark (23)
  15. Hongrie (20)
  
Régions
  1. Berlin (47)
  2. Uusimaa (31)
  3. Finlande-Centrale (25)
  4. Angleterre (25)
  5. Bade-Wurtemberg (20)
  6. Écosse (18)
  7. Occitanie (région administrative) (17)
  8. District de Fribourg-en-Brisgau (17)
  9. Auvergne-Rhône-Alpes (16)
  10. Päijät-Häme (14)
  11. Ohio (14)
  12. Minnesota (14)
  13. Grand Londres (13)
  14. Île-de-France (11)
  15. Vienne (Autriche) (11)
  
Villes
  1. Berlin (47)
  2. Helsinki (31)
  3. Jyväskylä (25)
  4. Constance (Allemagne) (17)
  5. Evo (Finlande) (14)
  6. Londres (13)
  7. Wageningue (11)
  8. Vienne (Autriche) (11)
  9. Hambourg (11)
  10. Stockholm (9)
  11. Turku (8)
  12. Montpellier (8)
  13. Brno (8)
  14. Paris (7)
  15. Toulouse (6)
Mots-clés originaux
  1. Gymnocephalus cernuus (50)
  2. Perca fluviatilis (43)
  3. fish (33)
  4. Animals (27)
  5. Lakes (26)
  6. Freshwater environment (25)
  7. perch (22)
  8. Pisces (22)
  9. growth (21)
  10. Rutilus rutilus (21)
  11. predation (20)
  12. Ruffe (19)
  13. fish community (17)
  14. Diet (17)
  15. diet (16)
  
Mots du titre
  1. fish (289)
  2. lake (122)
  3. river (88)
  4. species (76)
  5. perch (75)
  6. ruffe (72)
  7. lakes (62)
  8. fishes (61)
  9. gymnocephalus (60)
  10. effects (51)
  11. distribution (50)
  12. perca (49)
  13. cernuus (49)
  14. fluviatilis (48)
  15. freshwater (43)
  
ISSN/revue
  1. 0022-1112 (208)
  2. 1095-8649 (205)
  3. 1600-0633 (50)
  4. 0906-6691 (50)
  5. 0018-8158 (49)
  6. 0046-5070 (42)
  7. Hydrobiologia (41)
  8. 1573-5117 (41)
  9. 1365-2427 (41)
  10. JGLR (36)
  11. 0380-1330 (36)
  12. 1439-0426 (35)
  13. 0175-8659 (35)
  14. 1365-2400 (30)
  15. 0969-997X (30)

Zoom France

Auteurs[1]
  1. Pascal Fontaine (biologiste) (5)
  2. Nicolas Lamouroux (4)
  3. Didier Pont (4)
  4. C. Argillier (4)
  5. Thierry Oberdorff (3)
  6. P. Irz (3)
  7. Sovan Lek (2)
  8. Serge Morand (2)
  9. S. Biagianti-Risbourg (2)
  10. Rémi Chappaz (2)
  11. Patrick Kestemont (2)
  12. Patricia Reyes-Marchant (2)
  13. Olivier Verneau (2)
  14. Nicole Lair (2)
  15. Nicolas Pech (2)
  
Affiliations
  1. Institut national de la recherche agronomique (13)
  2. Université de Lorraine (5)
  3. Université Toulouse III - Paul Sabatier (5)
  4. Animal et fonctionnalités des produits animaux (UR) (5)
  5. Université de Rennes 1 (3)
  6. Université Blaise-Pascal (3)
  7. Université de Savoie (2)
  8. Centre alpin de recherche sur les réseaux trophiques des écosystèmes limniques (2)
  9. Université de Londres (1)
  10. Université de Gand (1)
  11. Université de Barcelone (1)
  12. Université d'Oxford (1)
  13. Université d'Anvers (1)
  14. Université d'Aix-Marseille (1)
  15. Université Paul Verlaine - Metz (1)
  
pays
  1. France (70)
  2. Royaume-Uni (6)
  3. Belgique (5)
  4. États-Unis (2)
  5. République tchèque (2)
  6. Espagne (2)
  7. Canada (2)
  8. Suisse (1)
  9. Slovaquie (1)
  10. Russie (1)
  11. Roumanie (1)
  12. Norvège (1)
  13. Mexique (1)
  14. Lituanie (1)
  15. Italie (1)
Dédoublonnage

Ce corpus a été notamment utilisé pour la mise au point d'outils de dédoublonnage.

Aspects techniques

Paramétrage

Eléments de curation

Personnes :

Problèmes relevés
Plateforme de test

Voir aussi

Notes
  1. ↑ français ou publiant en coopération avec des laboratoires français
Dans le réseau Wicri :

Ceci est la page de référence de « Serveur d'exploration Grémille »

Ce serveur est visible sur Wicri/Animaux.

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