Jacques Ducloy : /* Transfert vers la machine Wicti-demo */

2024-02-13T10:06:09Z

‎Transfert vers la machine Wicti-demo

Jacques Ducloy : /* Transfert vers la machine LorExplor */

2024-02-13T10:05:11Z

‎Transfert vers la machine LorExplor

imported>Jacques Ducloy : /* Transfert vers la machine LorExplor */

2017-07-20T08:55:49Z

‎Transfert vers la machine LorExplor

Nouvelle page

Cette page introduit les aspects techniques de la version [[Wicri:GremilleV2|GremilleV2]] du « [[Serveur d'exploration Grémille]] ».

Voir aussi :
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, data]] - ''génération des données''
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, fr]] - ''génération de l'interface''
*[[Wicri:GremilleV2/Paramètres, génération des cartes]] - ''génération de cartes géographiques''
==Mise en œuvre==
===Sur la machine de développement===
====Initialisations====
;Génération des pages wikis:
<source lang="sh">
source IstexGetCorpusSize -q '"gymnocephalus cernua"'
IstexGenerAreaPages \
-a GremilleV2 \
-m \
-g Gremille \
-p Wicri/Eau \
-w wicri-eau.fr \
-W Wicri/Eau \
-s PascalFrancis \
-s Hal \
-s HalInra \
-s PubMed \
-s Pmc \
-s Ncbi \
-z France \
-z UK \
-z USA \
-z Allemagne \
-t "Serveur d'exploration Grémille"

</source>
;Définition $EXPLOR_AREA:
<source lang="sh">
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
</source>
;Création des répertoires:
<source lang="sh">
mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Eau/explor/Gremille.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import
</source>
====Récupération des corpus====
;ISTEX:''En cas de reprise au niveau du téléchargement''
<source lang="sh">
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.h*

</source>
<source lang="sh">
IstexGetCorpus -q '"gymnocephalus cernua" OR "gymnocephalus cernuus"' -s 2000 -A \
| IstexToSxml \
| HfdBuild -bh $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository

</source>
Vérification
<source lang="sh">
HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd | wc

</source>
;ISTEX, création du HFD Corpus Biblio:En cas de reprise:
<source lang="sh">
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*

</source>
;Construction corpus biblio:
<source lang="sh">
time HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd \
| IstexCleanFullText \
| SgmlFast -c1 \
| IstexToTei \
| TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus -c ISTEX -s Corpus -S Istex \
| HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

</source>

====Téléchargement des autres corpus====
;PubMed:
Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Requête :
gymnocephalus cernu*
Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pubmed_result.xml
;PubMed Central:
Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

Requête :
gymnocephalus cernu*

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pmc_result.xml
;PascalFrancis:
Site :http://stan2.demo.inist.fr/fr/

Requête :

gymnocephalus et cernua

Télécharger avec les onglets : Serveur / SGML / SGML / LF
*résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistServer.txt
Télécharger avec les onglets : SGML / SGML / SGML / LF
*résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistStandard.txt
;Hal:
Sur : https://hal.archives-ouvertes.fr/
;HalInra:
Sur : http://prodinra.inra.fr/

====Génération de la plateforme====
;Importation des paramètres de génération:
<source lang="sh">
WicriGetPage -l wicri-eau.fr -p "Wicri:GremilleV2/Paramètres, data"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki
</source>
Si reprise
<source lang="sh">
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
</source>
<source lang="sh">
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
</source>
;Importation des paramètres de navigation:
<source lang="sh">
WicriGetPage -l wicri-eau.fr -p "Wicri:GremilleV2/Paramètres, fr"\
> $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
</source>
;Génération de l'interface :
<source lang="sh">
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh
</source>
====Génération des FTP====
<source lang="sh">
cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz
tar -cvf Site.tar Site
gzip Site.tar
rm Data.tar.gz
tar -cvf Data.tar Data
gzip Data.tar

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/istexMetadata.hcs Import/istexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar
</source>

===Transfert vers la machine LorExplor===
;Transfert par scp:

:<code>scp Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2.20170517</code>

===Sur la machine cible===
Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible
<source lang="sh">
. ... Dilib/init.sh
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/Gremille.storage/GremilleV2.20151226
</source>
Si nouveau code générique :
<source lang="sh">
mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Eau/corpus/Gremille.storage
</source>
Création du répertoire plateforme
<source lang="sh">
mkdir $EXPLOR_AREA
</source>
;Transfert par FileZilla:
Transférer les fichiers Site.tar.gz, Data.tar.gz de GremilleV2 (émetteur) vers GremilleV2 (cible).
;Installation:
<source lang="sh">
cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz
tar -xvf Site.tar
gzip Site.tar

gunzip Data.tar.gz
tar -xvf Data.tar
gzip Data.tar
</source>
<source lang="sh">

gunzip ImportMetadata.tar.gz
tar -xvf ImportMetadata.tar
gzip ImportMetadata.tar

cd Data/Istex/Corpus
rm biblio.hcs
rm biblio.hfd
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hcs biblio.hcs
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hfd biblio.hfd
</source>

@@ Ligne 150 : / Ligne 150 : @@
 ;Transfert par scp:
-:<code>scp Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2.new</code>
+:<code>scp $ISTEX_PAR Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2.new</code>
 ===Sur la machine cible===

@@ Ligne 147 : / Ligne 147 : @@
 </source>
-===Transfert vers la machine LorExplor===
+===Transfert vers la machine Wicti-demo===
 ;Transfert par scp:
-:<code>scp Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2.20170517</code>
+:<code>scp Site.tar.gz $ISTEX_SCP:$WICRI_TARGET_ROOT/Eau/explor/Gremille.storage/GremilleV2.new</code>
 ===Sur la machine cible===

Wicri:GremilleV2 - Historique des versions

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